1、单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,谢为博,Tel,:,87280350,Email:xwbmail,2016,年,04,月,生物信息学,Bioinformatics,生命科学相关专业的本科生,考研,毕业设计,工作,生命科学相关专业的研究生,课题研究,适用者,了解、掌握和利用,Internet,上,各种生物数据库,、软件,何处,查找,所需,各种,生物,数据信息,如何,分析和解释,所得,数据信息,学习本课程的目的,Sequence analysis,Genome annotation,Analysis of gene expression,An
2、alysis of regulation,Prediction of protein structure,Comparative genomics,生物信息学学科的发展和研究内容,生物数据库,关键词或词组为基础的数据库检索,核酸和蛋白质序列为基础的数据库检索,多序列对位排列分析和系谱分析,基因预测和基因结构分析,蛋白质性质和结构分析,农业类及物种专属数据库的利用,核酸序列的其他分析方法,芯片表达谱基本分析及查询,课程组成,数据库介绍及检索(,2,3,4,8,),DNA/RNA,序列,实验,两序列比对及,blast,检索(,4,),多序列比对及系谱分析(,5,),基因预测(,6,),表达谱(,1
3、0,),核酸序列的其他分析(,9,),蛋白质性质及结构分析(,7,),基因功能预测及分析,设计芯片,本课程各章的关系,W.Mount.Bioinformatics:Sequence and Genome Analysis.(2nd edition)New York:Cold Spring Harbor Laboratory Press,2004.,李霞等,生物信息学,人民卫生出版社,,2010,。,参考教材,陈铭等译,精要速览系列,-,生物信息学(第,2,版),科学出版社,,2013,。,吴祖建等,生物信息学分析实践,科学出版社,,2010,。,注意事项和要求,应用型课程,自学占很大比重,请课
4、后自觉多练习,建议注册加入,icourses,(课件、习题仅注册登录后能查看),按时上课,位置固定,课间不休(连续,3,个小时),如已掌握内容,经考察通过后可以早退,建议课前打印讲义,以便于上课时在讲义上做笔记,每,2-3,人为一组,上机练习时可以相互交流讨论,但请控制音量,请注意保持机房卫生,下机时清理自己机位,带走垃圾,共,10,次课,每次一列课后留下做清洁,不得早退,成绩及考试,课程总成绩,=,课堂练习,*28%+,课后作业,*12%+,开卷考试*,60%,课堂练习:至少完成,7,次,完成后命名为“学号,_,第,N,章,.doc,”提交到教师机(快捷键,ctrl+T,),课后作业:数据库介绍(详见第一章),考试方式:开卷(但单号做,A,卷,双号做,B,卷,,记得带笔,),凡修课者必需参加考试,否则,0,分,考试时间:一般于课程结束后,2,周内,分组情况,本课程有部分作业需要协作完成,建议大家自由组合。每,2-3,人为一组,相邻就座,上机练习时可以相互交流讨论。尽量靠前坐。,