酶或代谢途径数据库.doc

酶/代谢途径数据库

PDB生物大分子结构数据库
PDB是RCSB于1971年建立的全世界最完整的包括蛋白质，核酸，蛋白质-核酸复合物及病毒等生物大分子的三维结构数据库。数据库中的数据类型包括生物大分子的原子坐标，注释，一级结构，二级结构，晶体结构因子......
http://www.pdb.org/

PLMItRNA数据库
数据库中的每个条目包含一个信息的和一多序列联配的部分。第一部分报告了tRNA分子或基因的特征。在多序列联配部分，所有检测的同源的序列都被联配。绿色植物、隐藻门、 红藻、Stramenopiles（包括褐藻、黄藻、硅藻、.....
r.it/PLMItRNA/

氨酰基tRNA合成酶数据库
此是波兰超级计算和网络中心的关于氨酰基tRNA合成酶的数据库。数据库是以氨基酸残基和有机体的一览表为搜索导航。
http://rose.man.poznan.pl/aars/

斯坦福HIV 逆转录酶和蛋白酶序列数据库
斯坦福HIV 逆转录酶和蛋白酶序列数据库包含几乎全部已发表的HIV 逆转录酶和蛋白酶序列。其是研究抗HIV药物靶分子演化和与药物有关变化的原始资料。它包含资源有数据库查询、序列分析工具、出版物、统计、资源和链接..
http://hivdb.stanford.edu/

明尼苏达大学生物催化和生物降解数据库
这是明尼苏达大学生物催化和生物降解数据库。它主要包括基本异型生物质及化学物质的微生物生物催化反应和生物降解途径的内容，其主要目的是为生物技术提供一些重要的微生物酶催化反应方面的信息。该数据库全部免费。
http://umbbd.ahc.umn.edu/index.html

MEROPS
MEROPS是蛋白酶数据库。它提供蛋白酶（包括肽酶）的目录和基于结构的分类以及一些它们的附加信息。此网页描述的蛋白酶可以在三个索引之一的任一个以它的名字、MEROPS的标识符或来源有机体找到。然后，它提供分类和命.....
http://merops.sanger.ac.uk/

生物酶检索系统
这是生物酶检索系统的网页。该检索系统是一个整合了3500多种不同酶的大量信息的数据库，它收集了《Springer酶学手册》（第二版）中几乎所有的内容，同时还包括一些有关酶的动力学、热力学及参考文献等信息。非赢利..........
http://www.biosino.org/BioEnzymes/index.htm

MetaCyc代谢途径数据库
MetaCyc代谢途径数据库是以微生物为主的多个物种的酶和代谢途径数据库，涵盖150个不同的有机体。它描述代谢途径、反应、酶和底物化合物等的信息。其使用和EcoCyc相同的数据库计划。有些途径包含大量注释和文献引用。
http://biocyc.org/metacyc/

HIV蛋白酶结构数据库
这是HIV蛋白酶结构数据库的网站，该数据库收录SIV蛋白酶结构和HIV复合物以及HIV-2三维结构的生物数据库，为全球的科研者，教育工作者和学生提供信息服务。该网站免费提供服务，即结构信息，分析和图片库。
http://srdata.nist.gov/hivdb/

蛋白激酶资源库
这是蛋白激酶资源库的网页。该网页反对目的是使之成为一个易于接近的有关酶中蛋白激酶家族信息纲要的网。该网页提供可以直接链接到相关网站并提供许多结构与计算分析工具，它是蛋白激酶研究者与数理统计研究者合作创...
http://pkr.sdsc.edu/html/index.shtml

脂肪酶工程数据库
这是脂肪酶工程数据库的网站。该网站主要是整合脂肪酶的结构与序列的信息，从而推动蛋白质工程的发展。它主要包括脂肪酶超家族和环氧化物水解酶/卤烷脱卤酶两个超家族，其中在脂肪酶超家族中主要包括芽孢杆菌脂肪酶..
http://www.led.uni-stuttgart.de/

酶和代谢途径数据库项目
这是酶和代谢途径数据库项目的网站。该项目是唯一的、综合性强的的生物化学数据电子资源。它涵盖所有酶学、新陈代谢以及该领域的原创性期刊出版物的内容。该数据库由50位科学家、目录学家和程序编制员...

限制酶数据库
这是限制酶数据库的网站。该数据库是有关限制酶和相关蛋白质信息的集合。它包含发表和未发表的参考文献、公认的和剪切位点、同裂酶、商品可供性、甲基灵敏度、结晶和序列数据。还包括DNA甲基转移酶、趋巢性内切核酸.........

酶命名数据库
酶学数据库包括所有的已命名酶的集合，它记录了所有酶学委员会已给予酶学编号的酶的信息，包含了以下有关信息，酶编号，推荐名称，其他名称，催化活性，辅助因子，与SWISS-PROT相对应的条目链接和与酶缺失造成...........
http://us.expasy.org/enzyme

LIGAND数据库
LIGAND数据库由三部分组成：有关化合物信息和其他与各种细胞处理有关的化学化合物；搜集的各种化合物的催化反应，主要为酶催化反应；有关酶分子的信息。数据库采用关键词查找，同时提供下载。
http://www.genome.ad.jp/dbget/ligand.html

代谢途径数据库
代谢途径数据库是由NCGR发展和维护的生物化学和代谢途径数据库，搜集了丰富的有关酶、生化反应、代谢途径、运输步骤和化合物的信息。所有数据库按物种分类组织，可以通过网页访问。
http://www.ncgr.org/pathdb/