辣椒英文文献已读.doc

2001年，C. Djian-Caporalino · L. Pijarowski · A. Fazari M. Samson · L. Gaveau · C. O’Byrne · V. Lefebvre C. Caranta · A. Palloix · P. Abad发表文章High-resolution genetic mapping of the pepper (Capsicum annuum L.)resistance loci Me3 and Me4 conferring heat-stable resistance to root-knot nematodes (Meloidogyne spp.)
采用从C. annuum F1代得到的双单倍体(DH)群体构建了两张种内图谱，主要采用AFLP 和 RAPD标记。图谱长度1,582 cM ，共 227 标记，18个连锁群，覆盖了67%的辣椒基因。
本研究采用的材料是C. annuum parents ‘Yolo Wonder’(‘YW’) and ‘PM687’。抗性品系PM687来源于印度，从PI322719群体中获得，YW是一个感病品种，Me3和Me4都是抗根结线虫基因。PM687和YW杂交F1代有103个单双倍体（DH）,163株F2代个体，‘Perennial’, another inbred line of C. annuum (see Table 1)used to generate the DH200 pepper map，另外一个亲本。
采用RAPD和AFLP标记，分析产生了与Me3连锁的8个相斥性标记和4个相引性标记。在基因两边最近的距离是0.5,1.0,1.5和3cm，Me4与Me3相距100cm,Me3最近的基因名为Q04-0.3，距RAPD标记10.1cm,名为CT135d的距RFLP标记2.7cm.。Me4 maps 10±4 cM from Me3，The most-tightly linked AFLP markers we have identified so far are separated from Me3 by 0.5 cM on one side and 3 cM on the other side。
2006年．Yasuhiro Minamiyama Masato Tsuro Æ Masashi Hirai发表文章，An SSR-based linkage map of Capsicum annuum，
利用SSR标记。亲本为Manganji微辣，长圆锥型果实，另一个亲本为Tongari无辣，长块状型，种内杂交后代共117株，构建一张C. annuum图谱，种间双单倍体群体，包含9个已报道过的SSR，AFLP,CAPS,和RAPD和果实辛辣性状的标记。这个图谱包含374个标记，含106个新型SSR，13个连锁群，共1042cm,，每个位点平均等位基因有2.9个，平均PIC值（多态信息含量）为0.46.覆盖了Capsicum annuum大部分的基因。
本研究分析了114个SSR位点，288个AFLP标记，60个RAPD标记，一个CAPS标记，长度1042.2cm,13个连锁群，LOD值为6.5，标记之间的平均距离是2.8cm,x辛辣性状位点c与SSR标记CAMS327连锁，位于LG13上。
2000年，A. Ben Chaim · R.C. Grube · M. Lapidot · M. Jahn I. Paran发表文章Identification of quantitative trait loci associated with resistance to cucumber mosaic virus in Capsicum annuum
本研究中，亲本为自交甜铃型Capsicum annnum Maor,，感病品种，和自交辛辣小果型印度抗病品种C. annuum var. Perennial，种内自交获得180株F3群体，采用RFLP,AFLP,RAPD分子标记技术构建图谱，检测到4个抗CMV的QTL,，主要OTL是cmw11.1,与抗烟草花叶病毒的L基因相连，解释了表型变异的25-46%。其余三个QTL分别是cmv4.1,cmv6.1,cmv13.1.
2004年，L. H. Wang . B. X. Zhang . V. Lefebvre . S.W. Huang . A. M. Daubèze . A. Palloix发表文章QTL analysis of fertility restoration in cytoplasmic male sterile pepper----辣椒的细胞质雄性不育的育性恢复的QTL检测。
本研究采用亲本为测交后代77013A（严格的细胞质雄性不育系），和双单倍体群体114型，此亲本来源于Yolo wonder（不良保持系）和Perennial（育性恢复系）。育性恢复的主要QTL位于染色体6上，解释恩了20～69%的表型变异，4个副效QTL分别位于染色体P5，P2，连锁群PY3，PY1.解释了7～17%的表型变异。
得到的图谱包括了630个分子标记，50个RFLP,46个AFLP,27个RAPD,38个已知基因，和2个表性基因。22个连锁群，覆盖长度为1770cm,平均距离为11.8cm(±9.0).本研究是第一个在辣椒中研究细胞质雄性不育系育性恢复的QTL研究。
2003年，V. Lefebvre · A.-M. Daub_ze ·J. Rouppe van der Voort ·J. Peleman · M. Bardin · A. Palloix等人发表文章QTLs for resistance to powdery mildew in pepper under natural and artificial infections—在自然和人工条件下辣椒抗白粉病的QTL研究
本研究是第一个研究辣椒白粉病的
亲本 H3---辛辣小果型C. annuum 自交系，抗白粉病品种。Vania是铃型自交系感病品种。杂交得到 F1 代杂合体。F1代杂合体形成101株双单倍体群体(HV population),得到的图谱包括553个分子标记，最小LOD值为5.0，最大重组分数是0.3.共有134个标记进入谱图，包含一个形态标记，32个RFLP，27个RAPD,和74个AFLP标记。图谱长度1513cm,20个连锁群，标记之间的距离为12.9cm.。检测到5个QTL，分别位于染色体P5, P6, P9, P10 and P12。上位效应检测到额外两个QTL，位于P2和未分配连锁群HV1上，染色体6上的QTL区域最多，解释了26%的表型变异。
2001年，C. Caranta · S. Pflieger · V. Lefebvre · A.M. Daubèze A. Thabuis · A. Palloix等人发表文章QTLs involved in the restriction of cucumber mosaic virus (CMV) long-distance movement in pepper
本研究采用亲本为Vania’，CMV抗性基因，铃型自交系，另一亲本为H3，杂交得到F1代，花粉在体外培养得到双单倍体（101DH系），采用两种方法。一种是在植株叶片上接种普通CMV,另一种是在籽苗上接种非典型性CMV.
本研究得到184个标记图谱，包含93AFLP,51RFLP,38RAPD,和两个形态学标记。20个连锁群，共有1600cm,检测到7个染色体区段，包含一个主效QTL和几个副效QTL,主效QTL是cm12.1,解释了45～63.6%的表型变异。副效基因为cm11.2,cm11.1,cm5.1.
2003年，J. M. Lee · S. H. Nahm · Y. M. Kim · B. D. Kim发表文章，Characterization and molecular genetic mapping
of microsatellite loci in pepper辣椒微卫星基因座的特性和分子遗传图谱
annuum cv TF68 与 C. chinense cv Habanero种间杂交，得到107株F2代植株，采用SSR和RFLP标记，得到46个SSR和287个RFLP,图谱长度为1761.5cm，标记间的平均距离为5.3cm.
2000年，B.C. Kang · S.H. Nahm · J.H. Huh · H.S. Yoo J.W. Yu · M.H. Lee · B.-D. Kim Theor Appl Genet (2001) 102:531–539 发表文章An interspecific (Capsicum annuum ×C. chinese) F2 linkage map in pepper using RFLP and AFLP markers
本研究构建辣椒图谱，经 TF68 (C. annuum) 和Habanero (C. chinense) 种间杂交后代F2群体107株植株，150个RFLP,430个AFLP标记。得到11个大的连锁群(206–60.3 cM) 和 5 个小连锁群 (32.6–10.3 cM) 。总长度为1320cm，标记间的平均距离为7.5cm.。
2010年 ，Jundae Lee1, Jee-Hwa Hong2, Jae Wahng Do1, Jae Bok Yoon1发表文章Identification of QTLs for Resistance to Anthracnose to Two Colletotrichum Species in Pepper辣椒两个炭蛆菌品种的炭蛆病抗性QTL分析
本研究的抗性亲本Capsicum baccatum 'PBC81'，易感亲本和轮回亲本是C. annuum 'SP26' (Matikas)，270株种间杂交BC1F1代与‘SP26’回交获得87株BC1F2代群体。两个碳蛆菌为C. acutatum and C. capsici,构建图谱及进行QTL定位研究。
得到218个分子标记，包括197个AFLP和21个SSR进入图谱，覆盖长度为325cm,13个连锁群。标记之间的平均距离为1.49cm.
QTL检测结果。抗C. acutatum有3个QTL，抗capsici有四个QTL。副效 QTL CcR12.2 和主效 QTL CaR12.2 处于同一位置, 副效 QTL CaR9 和主效QTL CcR9 也处于同一位置。
对C. acutatum碳蛆菌检测到个主要QTL，CaR12.2和CaR12.1， 对C. capsici检测到一个主效QTL，CcR9，
2011年，Arnon Brand • Yelena Borovsky • Sagit Meir • Ilana Rogachev • Asaph Aharoni • Ilan Paran发表文章pc8.1, a major QTL for pigment content in pepper fruit,is associated with variation in plastid compartment size
本研究亲本材料为暗绿色辣椒亲本自交系C. annuum1154，浅绿色亲本PI152225(C. chinense)，1154作为轮回亲本，由BC2F1代自交得到150株BC2F2代植株，构建图谱。
采用RFLP和AFLP标记，图谱由200个AFLP,RFLP,COSII组成，覆盖长度为1374cm,共11个连锁群。
检测到两个关于色素含量的QTL，位于连锁群8上的(pc8.1) 和 连锁群10 上的(pc10.1)。其中，pc8.1是主效QTL，解释了表型变异的54%，pc10.1是副效QTL,解释了15%的表型变异。
2009年，Feinan Wu · Nancy T. Eannetta · Yimin Xu · Richard Durrett · Michael Mazourek · Molly M. Jahn · Steven D. Tanksley发表文章，A COSII genetic map of the pepper genome provides a detailed picture of synteny with tomato and new insights into recent chromosome evolution in the genus Capsicum
就某种意义而言，这是第一张完全图谱，所有标记分配到12个连锁群上。
本研究作图群体是种间杂交C. frutescens var BG 2814-6 x C. annuum cv. NuMex RnakyF2群体共94株。
该图谱由299单拷贝直系同源标记（主要是COSII markers）标记组成，其中有169个COSII标记，图谱覆盖长度为1613cm,共12个连锁群，标记间的平均距离为6.9cm,。
2008年，Hyoun-Joung Kim · Seok-Hyeon Nahm · Heung-Ryul Lee · Gi-Bo Yoon · Ki-Taek Kim ·Byoung-Cheorl Kang · Doil Choi · Oh Yeol Kweon · Myeong-Cheoul Cho ·
Jin-Kyung Kwon · Jung-Heon Han · Jeong-Ho Kim · MinKyu Park · Jong Hwa Ahn ·
Soon Ho Choi · Nam Han Her · Joo-Hee Sung · Byung-Dong Kim发表文章BAC-derived markers converted from RFLP linked to Phytophthora capsici resistance in pepper
(Capsicum annuum L.)
辣椒抗疫霉病的 QTL检测。本实验使用100个F2代个体，通过Capsicum annuum
‘CM334’ 和C. annuum ‘Chilsungcho’杂交得到。连锁图包括202个RFFP标记，6个WRKY，1个SSR,覆盖长度1482.3cm,标记间的距离为7.09cm。12条染色体。检测到4个抗根腐病QTL，位于染色体5，6,9上，解释了66.3%的表型变异，3个猝倒病的QTL，位于染色体5,8上，解释了44.9%的表型变异。
2010年，Hyun Jung Kim • Jung-Heon Han • Seungill Kim • Heung Ryul Lee • Jun-Sung Shin • Jeong-Ho Kim发表文章Trichome density of main stem is tightly linked to PepMoV resistance in chili pepper (Capsicum annuum L.) PepMoV辣椒斑驳病毒Trichome density根毛密度
本实验研究了辣椒毛状体与辣椒斑驳病之间的关系，构建了种内F2群体图谱，亲本为Capsicum annuum CM334 (附着毛状体和抗斑驳病) 和 Chilsungcho (光滑无毛和易感斑驳病),结果表明:两个性状的主要QTL位于连锁群24上，控制主干毛状物密度的主要QTL是Ptel1，解释了81%的表型变异。控制花萼毛状物QTL是Ptel2，对于PepMoV，两个QTL(Pep1 and Pep2)位于LG24上，分别为解释了34%和57%的表型变异。
2009年Heung-Ryul Lee1, Ik-Hyun Bae1, Soung-Woo Park1, Hyoun-Joung Kim1, Woong-Ki Min2, Jung-Heon Han2,Ki-Taek Kim3, and Byung-Dong Kim1,2,4,*发表文章Construction of an Integrated Pepper Map Using RFLP, SSR, CAPS, AFLP, WRKY, rRAMP, and BAC End Sequences
本研究开发了132个单拷贝已PCR为基础的标记（包括(源于 BAC-end 序列的57 STS,
源于 RFLP的13 STS, 和 62 SSR)）连同1830个已经开发的标记。构建了一张整合图谱包括169 SSR, 354 RFLP, 23 STS from BAC-end sequences, 6 STS from RFLP, 152 AFLP, 51
WRKY, and 99 rRAMP markers on 12 chromosomes这张整合图谱包含了4个基因图谱，两张种间图谱（Capsicum annuum ‘TF68’和C.chinese‘Habanero’）和两张种内图谱(C.annuum‘CM334’和C.annuum‘Chilsungcho’),该图谱包含了805个种间群体的标记，图谱距离为1858cm,745个种内群体的标记，图谱距离为1892cm.
2004年，Roeland E. Voorrips . Richard Finkers . Lia Sanjaya .Remmelt Groenwold发表文章QTL mapping of anthracnose (Colletotrichum spp.) resistance in a cross between Capsicum annuum and C. chinense抗炭蛆病
本研究采用的亲本为易感病印度尼西亚辣椒品种(Capsicum annuum)var. Jatilaba，抗病品种C. chinense accession PRI95030杂交后代得到F2代群体共346株植株。研究得到图谱长度为997cm,26个连锁群，连锁群长度范围14-71cm，最小群有4个标记，还有6个附加小群，长度为63cm,每个连锁群标记数量2-3个。
QTL mapping
经过C. gloeosporioides,侵染后，对于全部病变直径，检测到4个QTL，B1，B2，H1和D1，解释了表型变异的39.7%，对于侵染频数，检测到3个QTL，B1，B2，H1解释了表型变异的29.6%。对实际侵染直径，检测到4个QTL, ，B1，B2，H1和D1,解释了35.5%的表型变异。
经过C. capsici,侵染后，实际病变直径有2个QTL，B1和G1，解释了表型变异的23.9%。
2010年，Won-Hee Kang · Ngoc Huy Hoang · Hee-Bum Yang ·Jin-Kyung Kwon · Sung-Hwan Jo · Jang-Kyun Seo ·Kook-Hyung Kim · Doil Choi · Byoung-Cheorl Kang发表文章Molecular mapping and characterization of a single
dominant gene controlling CMV resistance in peppers
(Capsicum annuum L.)
本研究采用的作图群体为C. annuum ‘Bukang’ F2 群体，含有抗性基因，C. annuum ‘Bukang’ 和C. annuum‘Jeju,’易感CMV，杂 交得到的回交群体，AC 99 F2 群体，由C. chinense
‘PI 159234’ (CA4) 和C. annuum ‘NuMex RNaky’(RNaky)杂交得来，构建图谱采用SSR 和 CAPS
标记。通过基因图谱和FISH（荧光原位杂交） 表明抗黄瓜花叶病毒cmv1位于染色体2上，且cmv1基因是单一优势显性基因。利用辣椒-番茄比较基因图谱，开发了SNP（单核苷酸多态性）标记，表明CaTmint3HRM离cmv1最近，大约2cm。
2006年，Arnon Ben-Chaim · Yelena Borovsky · Matthew Falise ·
Michael Mazourek · Byoung-Cheorl Kang ·Ilan Paran · Molly Jahn等人发表QTL analysis for capsaicinoid content in Capsicum-辣椒素
本研究中，采用辛辣品种Capsicum annuum ‘NuMex RNaky’和野生强辣品种C. frutescens accession BG2814-6杂交得到234株.F3代构建图谱，采用SSR标记。
728个分子标记包括489个SSR标记，195个AFLP,8个特定PCR标记和36个RFLP以及候选基因pAMT, COMT, and Bcat用于构建图谱，图谱长度共1358.7cm,共12个主要连锁群和4个小的连锁群。
研究分析了辣椒素的三中成分，capsaicin, dihydrocapsaicin 和nordihydrocapsaicin
影响辣椒素含量的6个主效QT L位于染色体3,4,7上，主要是由cap7.1和位于染色2上的基因交互作用影响，另一主效基因是Cap7.2.。
在染色体2和3上也检测到2个果重QTL,. (fw2.1) and 3 (fw3.1).这两个QTL与辣椒素含量成负相关。
2007年，Jundae Lee Jae Bok Yoon Hyo Guen Park发表A CAPS marker associated with the partial restoration of cytoplasmic male sterility in chili pepper—细胞质雄性不育性
CMS能被特定的显性核基因修复(Rf or Fr)，部分修复基因是由隐形核基因控制的。Pr
稳定CMS‘HD1-A1 (S cytoplasm)—选自Peterson CMS 种，作为母本，自交系‘GD’ 和 ‘SM’作为父本，二者回交，然后父本与‘HF3-SC1—（完全修复系）杂交。
87株(S)GD/HF3-SC1杂交f2代植株用来鉴定部分不育性的恢复，采用AFLP标记。E-AGC/MGCA122
和 E-TCT/M-CCG116与pr位点紧密连锁。基因距离仅1.8cm。
2002年，A. B. Chaim ・ Y. Borovsky ・ W. De Jong ・ I. Para发表Linkage of the A locus for the presence of anthocyanin and fs10.1, a major fruit-shape QTL in pepper花青素和主要果形QTL的联系
花青素由完全显性基因A控制
IL 579 –紫色花丝和 100/63—白色花丝 杂交后代195株F2代构建紫色纤维丝和果形基因图谱。绘制紫色花药纤维位点Fc
C. annuum 5226 ×---紫色小圆形果，紫色花茎叶 与C. chinense PI 15923-----瘦长绿色果，茎，叶，白色花品种。4种间杂交100株F2代植株。绘制A。
A基因与Fc基因是等位基因，位于染色体10上的同一位置，都控制花青素色素。
Ben Chaim et al. (2001),发现一个单独的QTLfs3.1控制辣椒果形，解释了60%的表型变异，本研究检测到控制果形副效QTL在染色体10上
本研究检测到另一个主要果形QTL解释了40%的变形变异。但在5226 ×
PI 159234杂交后代中检测到与果形有关，RFLP标记TG130与果形QTL fs3.1紧密相连锁。表明在圆果和瘦长果杂交的后代中，果实颜色和果形指数基因是连锁的。
2005年，S. Zygier A. B. Chaim A. Efrati G. Kaluzky Y. Borovsky I. Paran发表QTLs mapping for fruit size and shape in chromosomes 2 and 4 in pepper and a comparison of the pepper QTL map with that of tomato
针对辣椒(Capsicum spp.)果重和果形 QTL图谱是用C. chinense 和 C. frutescens的染色体2和4的基因渗入系来分析，在染色体2上，在两个图谱上都检测到一个单独的果重 QTL，解释了62%的表型变异，与控制果形副效QTL,fs2.1，与番茄果形基因ovate.处于同一位置。在染色体4上，，检测到2个果重QTL, fw4.1 和 fw4.2, 在两个图谱上处于相
同位置控制果形QTL与一个果重QTL共同定位表明控制果实大小和形状的基因紧密连锁。
2009年，Hyun Jung Kim · Jung-Heon Han · Jin-Kyung Kwon ·Minkyu Park · Byung-Dong Kim · Doil Choi发表Fine mapping of pepper trichome locus 1 controlling trichome formation in Capsicum annuum L. CM334—控制毛状体构造
在Capsicum annuum, Mexican ‘Criollo de Morelos-334’(CM334)中，.辣椒毛状体是由一个等位基因（ptl1）控制，Capsicum annuum, Mexican‘Criollo de Morelos-334’ (CM334) 和 韩国‘Chilsungcho’品种杂交得到653株F2代植株，用SSR标记，HpmsE031和ptl1共分离。使用HpmsE031作为探针得到的细菌性人造染色体（BAC）,ptl1区域被80kbBAC克隆（TT1B7覆盖。且TT1B7位于染色体10上， 从TT1B7序列得到了2个标记。分别是Tco,共显性标记，Tsca,显性标记。Tco在ptl1上面距0.33cm,Tsca在ptl1下面距0.75cm.
2005年，E. A. Quirin E. A. Ogundiwin J. P. Prince M. Mazourek M. O. Briggs T. S. Chlanda K-T Kim M. Falise B-C Kang M. M. Jahn发表Development of sequence characterized amplified region (SCAR)
primers for the detection of Phyto.5.2, a major QTL for resistance to Phytophthora capsici Leon. in pepper抗辣椒疫霉病的QTL
材料为高抗基因型C. annuum Criollos de Morelos 334 (CM334)，高抗育种系C.
annuum CU44，感病品种C. annuum，对照品种Early California Wonder 300 (ECW300), Yolo B, NuMex RNaky, NuMex Joe E. Parker (JEP)and NY 99-210.杂交品种Paladin。OPD04RAPD标记是最高水平的抗性标记，通过对这一放大引物克隆，排序和生成SCAR标记，OpD04 RAPD marker 和D04.717 SCAR标记在CM334·JEP F2 群体中进行连锁分析。
结果表明，抗辣椒疫霉病的主效QTL位于染色体5上，Phyto.5.2解释了表型变异的5-42%，由D04相关分子标记得到的位点与Phyto.5.2共分离，为辣椒育种提供有用途径。

2011年，Yelena Borovsky • Ilan Paran发表Characterization of fs10.1, a major QTL controlling fruit elongation in Capsicum果实伸长率的QTL
以前研究定位fs10.1是主要控制辣椒果实性状的QTL，Capsicum annuum (圆果形) 与
C. chinense (瘦长果形)杂交F2代植株。
本研究构建了近等基因系BC4F2图谱，瘦长果形和圆锥果形杂交后代。经过对经EMS诱变处理的块状果形cv. Maor和突变体E-1654的鉴定发现，果形突变与fs10.1是等位基因。通过对Maor和E-1654的果皮组织进行组织学分析表明，fs10.1是通过控制果实发育前两周的细胞性状发生作用的。
2006年，C. Djian-Caporalino · A. Fazari · M. J. Arguel ·
T. Vernie · C. VandeCasteele · I. Faure · G. Brunoud ·
L. Pijarowski · A. Palloix · V. Lefebvre · P. Abad发表Root-knot nematode (Meloidogyne spp.) Me resistance genes in pepper (Capsicum annuum L.) are clustered on the P9 Chromosome
抗根结线虫的抗性基因是Me基因，以前研究已经通过在三个远缘品种PI 322719, PI 201234, and CM334(Criollo de Morelos 334)中，在高温条件下，有6个抗性基因。(Me4, Mech1,
and Mech2)特定线虫属，(Me1, Me3, and Me7)针对大范围的根结线虫品种。BSA-AFLP方法显示这些基因不同但是彼此相连锁。
重组率为0.02-0.18.这六个基因位于一个单独的染色体区段，28cm长的区段。四个标记定位这个区段在染色体9上。