1、生物氧化过程 澜沧二中 和继荣 一、 生物氧化是指化全物失电子、得氧、脱氢。相反的过挰称为生物还原。 二、与生物氧化过程相关的脱氢酶的辅基 1、 FMN与FAD FMN与FAD的基本结构相同,都是异咯嗪环和核糖醇相与连接的结构。其活性点都是异咯嗪基上1位和10位N。下面是核黄素的结构: 核糖醇 异咯嗪基 核黄素 FMN(黄素单核苷酸)和FAD(黄素腺嘌呤二核苷酸)的结构如下: FMN的化学结构 FMN立体结构 FAD的化学结构
2、 FAD的立体结构 脱氢过程是通过FMN、FND各自氧化态和还原态之间的转换来实现的: FMN或FND的氧化态 FMN或FND的还原态 FMN和FAD的工作模式如下: SH2+E-FMN⇋S+E-FMNH2 SH2+E-FAD⇋S+E-FADH2 其中SH2是有两个可以脱去的氢的底物。有一类黄酶是需氧黄酶,其反应过程如下: 需氧黄酶 另一类是不需氧黄酶,其反应如下: 传递体 不需氧黄酶 传递体-2H 2、 NAD和NADP NAD与NADP的基本结构相同,是尼克酰胺(吡啶衍生物)和腺
3、嘌呤相连的产物。其活性位点都是尼克酰胺上的C4和N。下面是尼克酰胺的结构: 尼克酰胺的结构 NAD(烟酰胺腺嘌呤二核苷酸)的结构如下: NAD的结构 NAD的立体结构 NADP(烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸)的结构如下: NADP的结构 NADP的立体结构 以NAD、NADP为辅基的脱氢酶脱下的氢由NAD+(CoI)或NADP+(CoII)接受。NAD+或NADP+吡啶环上的N为+5价,可逆的接受电子转变成+3价
4、的N。催化代谢物分子脱下2个氢原子,其中一个氢原了加到吡啶环氮对位碳原子上,另一个氢原子裂解为H+和e-,e-和吡啶环上的5价氮结合,中和其正电荷而变为3价氮,质子留在介质中,该反应如下: NAD+或NADP+(氧化态) NADH + H+或NADPH + H+ (还原态) 它是一类需氧黄酶,其反应过程如下: 传递体 3、CoA(辅酶A) 其主要结构是泛酸和腺嘌呤相连的结构。CoA是酰化反应的辅酶。它通过自身的巯基的接受和放出酰基起转移酰基的作用。泛酸和CoASH的结构如下: β-丙氨酸 α,γ-二羟β,β-
5、二甲基丁酸 泛酸的结构 CoASH的化学结构 CoASH的立体结构 4、辅酶Q; 这是一类递氢体,它是醌的衍生物。一搬将辅酶Q写成CoQ。不同的CoQ只是R基不同。其工作原理如下: 5、还有一类是以卟啉为主要基团的细胞色素,它们构成生物氧化中的递电子体。 三、呼吸链 由供氢体、传递体、受氢体以及相应的酶组成的氧化还原链称为呼吸链。 (1)NADH氧化呼吸链: BB (2) 琥珀酸氧化呼吸链-----以FAD为辅基的氧化呼吸链: 延胡索酸 琥珀酸
6、细胞色素体系 (3) 线粒体中的氧化呼吸链: O2 aa3 c c1 b 琥珀酸 α-磷酸甘油 脂酰CoA FAD+ CoQ FMNFe-S NAD+ 丙酮酸 α-酮戊二酸 硫辛酸 β-羟丁酸 谷氨酸 异柠檬酸 苹果酸 c1 b FADFe-S FMNFe-S 其中 称为复合物II, 称为复合物I, 称为复合物III,Cyt aa3称为复合物IV. 四、糖的分解代谢 (1)糖酵解途径(EMP),该过程在细胞质的基质中。是将葡萄糖分解为丙酮酸的过程。该过
7、程不需要氧的参与。该过程包括以下几个步骤: ① 葡萄糖己糖磷酸激酶作用下形成6-磷酸葡萄糖,这是EMP的第一个限速反应: 己糖磷酸激酶 葡萄糖(G) 6-磷酸葡萄糖(G-6-P) ② G-6-P异构化为6-磷酸果糖(F-6-P),果糖在ATP作用下亦可生成F-6-P: 磷酸果糖激酶 磷酸己糖异构酶 ③ F-6-P生成1,6-二磷酸果糖(F-1,6-P),这是EMP的第二个限速反应: ④ F-1,6-P裂解为一分子磷酸二羟丙酮和一分子3-磷酸甘油醛: 3-磷酸甘油醛 磷酸二羟丙酮 缩醛酶 ⑤ 磷酸二羟丙酮和3-磷酸
8、甘油醛在磷酸丙酮异构酶的作用下互变,完成第五步反应。 经过以上五步EMP完成第一阶段的反应。总的来说这是个耗能的过程,肖耗了2ATP。 ⑥ 1,3-二磷酸甘油酸(1,3-DPG)的生成: 磷酸甘油酸 脱氢酶 ⑦ 1,3-DPG转为3-PGA(3-磷酸甘油酸): 磷酸甘油酸激酶 ⑧ 3-PGA转为2-PGA: 磷酸甘油酸变位酶 ⑨ 2-PGA转为PEP(磷酸烯醇式丙酮酸): 丙酮酸激酶 烯醇化酶 ⑩ 醇式丙酮酸的生成,这是EMP的第三个限速步骤: 以上便是EMP的第二阶段,这是个产能反应。在有氧和无氧的条件下丙酮酸的去路是不同的
9、 在无氧的条件下丙酮酸变为乙醇: 净反应为: G+2Pi+2ADPàEtOH+2ATP+2H2O 在有些生物体内无氧呼吸的产物是乳酸: 净反应为: G+2Pi+2ADPà 2乳酸+2ATP+2H2O 在有氧的条件下丙酮酸和CoA结合,生成乙酰CoA进入TCA。 (2)TCA循环 三羧酸循环(英语:Tricarboxylic acid cycle;TCA cycle),或柠檬酸循环(Citric acid cycle),是需氧生物体内普遍存在的代谢途径,因为在这个循环中几个主要的中间代谢物是含有三个羧基
10、的柠檬酸,因此得名;或者以发现者汉斯·阿道夫·克雷伯命名为克雷伯氏循环,简称克氏循环(Krebs cycle)。三羧酸循环是三大营养素(糖类、脂类、氨基酸)的最终代谢通路,又是糖类、脂类、氨基酸代谢联系的枢纽。 在三羧酸循环中,反应物葡萄糖或者脂肪酸会变成乙酰辅酶A。这种“活化醋酸”(一分子辅酶和一个乙酰基相连),会在循环中分解生成最终产物二氧化碳并脱氢,质子将传递给辅酶烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+)和黄素腺嘌呤(FAD),使之成为NADH + H+和FADH2。NADH + H+和FADH2会继续在呼吸链中被氧化成NAD+和FAD,并生成水。这种受调节的“燃烧”会生成ATP,提供能量。
11、 真核生物的线粒体和原核生物的细胞质是三羧酸循环的场所。它是呼吸作用过程中的一步,但在需氧型生物中,它先于呼吸链发生。厌氧型生物则首先遵循同样的途径分解高能有机化合物,例如糖酵解,但之后并不进行三羧酸循环,而是进行不需要氧气参与的发酵过程。 三羧酸循环是四步糖代谢(高能量碳键的断裂)中的第三步。 其它三步是糖酵解、丙酮酸氧化脱羧和呼吸链(电子传递链):糖酵解→丙酮酸氧化脱羧→三羧酸循环→呼吸链 ① 乙酰CoA与草酰乙酸结合生成柠檬酸: 柠檬酸 草酰乙酸 柠檬酸合成酶 这是TCA的第一个限速反应。 ② 柠檬酸异构化为异柠檬酸。这个反应包括脱水和加水两步,都是由顺乌头酸酶
12、acnotiase)崔化的。 异柠檬酸 顺乌头酸 ③ 异柠檬酸被氧化为α—酮戊二酸。异柠檬酸脱氢酶崔化这个反应。这是TCA的第二个限速反应。 异柠檬酸 α—酮戊二酸 草酰琥珀酸 ④ α—酮戊二酸氧化脱羧形成琥珀酰辅酶A.该反应由α—酮戊二酸酶系催化,有三个酶,六种辅因子. 琥珀酰CoA α—酮戊二酸 α—酮戊二酸氧化脱羧酶系 这是TCA的第三个限速反应,也是第二个氧化反应. ⑤ 琥珀酰辅酶A变为琥珀酸. 这个反应是TCA中唯一的底物水平磷酸化反应.生成的GTP在二磷酸核苷激酶催化下生成ATP. 琥珀酸 琥珀酸脱氢酶 琥珀酸硫激酶 琥珀酸 琥珀酰CoA ⑥ 琥珀酸被氧化为延胡索酸. 这是TCA的第三个氧化反应, 受氢体是FAD,不是NAD+. 延胡索酸 ⑦ 延胡索酸水化为苹果酸: 延胡索酸酶 ⑧ 苹果酸氧化为草酰乙酸:这是TCA的第四个氧化反应。产物草酰乙酸要可以与另一分子乙酰CoA缩合生成柠檬酸,进入下一轮TCA。 苹果酸脱氢酶 草酰乙酸 苹果酸






