第一性原理算例.doc

首页   |   SCI期刊点评   |   中文期刊点评   |   搜索   |   论文范文   |   小木虫论坛

首页 >> 第一原理 >> 查看话题

vasp5.2中GGA=PE，PS，B3计算晶格常数，能带（HSE06杂化）
作者: liliangfang (站内联系TA)    发布: 2011-10-20
在vasp5.2中GGA=PE，PS，B3计算晶格常数，能带（HSE06杂化）的对比
下面是其他两个，基于PAW-PBE的赝势，默认的是GGA=PE
在INCAR里要设置GGA=PS，相应的在POTCAR里LEXCH  = PS；
在INCAR里要设置GGA=B3，相应的在POTCAR里LEXCH  =B3
晶格常数     计算值     误差（实验值5.43）
PE                  5.472          0.768%
PS                  5.438          0.147%
B3                  5.445          0.275%
能带计算（HSE06）  Eg（实验值1.12）
PE                              1.26
PS                              1.28
B3                              1.60
PE                              0.61（4.6的方法）
GGA=PE

GGA=PS

GGA=B3

以前4.6的算法得到的

下面将计算晶格常数及能带各部的主要文件上传(个人计算总结）
晶格常数计算
INCAR
System =  Si 
ENCUT = 400
ISTART = 0 
ICHARG = 2
PREC = Accurate
EDIFF = 1.0E-05
EDIFFG = -0.01
NSW = 200
IBRION = 2
ISIF = 4
ISPIN = 2
GGA = PS
KOPINTS
Automatic mesh 
0 
M
5   5   5
0   0   0
POSCAR
Si:                             
   5.43   
     0.0000000000000000    0.5000000000000000    0.5000000000000000
     0.5000000000000000    0.0000000000000000    0.5000000000000000
     0.5000000000000000    0.5000000000000000    0.0000000000000000
   2
S
Direct
  0.000000000000000  0.000000000000000  0.000000000000000  T  T  T
  0.250000000000000  0.250000000000000  0.250000000000000  T  T  T
POTCAR
优化脚步jvasp
#! /bin/bash
rm -rf WAVECAR
for i in  5.437 5.438 5.439 5.440 5.441
do
cat >POSCAR < Si-Diamond:                             
   $i    
     0.0000000000000000    0.5000000000000000    0.5000000000000000
     0.5000000000000000    0.0000000000000000    0.5000000000000000
     0.5000000000000000    0.5000000000000000    0.0000000000000000
   2
S
Direct
  0.000000000000000  0.000000000000000  0.000000000000000  T  T  T
  0.250000000000000  0.250000000000000  0.250000000000000  T  T  T
!
echo "a= $i" ;mpdboot ; mpirun -np 4 vasp
E=`tail -1 OSZICAR`;
echo $i $E >>SUMMARY
cp CONTCAR CONTCAR$i
done
二次拟合出能量最低点，一般两次足够
能带计算
vasp5.2其中一个计算能带方法是，优化晶格常数后，DFT+HSE06+band计算，见附件
这是其中一个PS的步骤,注意选择POTCAR之后将其中的LEXCH 改为LEXCH  = PS
1.DFT
INCAR
SYSTEM = Si
ENCUT = 400
ISTART = 0
ISYM = 0
GGA = PS
ICHARG = 2
ISMEAR = 0
SIGMA = 0.05
NSW = 0
IBRION = -1
ISIF = 2
EDIFF = 0.00001
EDIFFG = -0.001
KPOINTS
Automatic mesh 
0 
G
4   4   4 
0   0   0
POSCAR
Si-Diamond:                             
   5.43800000000000     
     0.0000000000000000    0.5000000000000000    0.5000000000000000
     0.5000000000000000    0.0000000000000000    0.5000000000000000
     0.5000000000000000    0.5000000000000000    0.0000000000000000
   Si
   2
Selective dynamics
Direct
  0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.0000000000000000   T   T   T
  0.2500000000000000  0.2500000000000000  0.2500000000000000   T   T   T

  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
运行vasp
2.HSE06
INCAR
设置ICHARG =2 ，IBRION =1 ,NELMIN =5 or 其他值如下
SYSTEM = Si
ISTART = 1
ICHARG = 2
EDIFF = 0.00001
EDIFFG = -0.001
ENCUT = 400
ENAUG = 800
GGA = PS
LREAL = .FALSE.
LWAVE = .TRUE.
LCHARG = .TRUE.
NELM = 200
NSW = 0
IBRION = -1
LMAXMIX = 4
ISMEAR = 0
SIGMA = 0.1
NSIM = 4
ISYM = 0
LHFCALC = .TRUE.
HFSCREEN = 0.2
ALGO = D
TIME = 0.4
ENCUTFOCK = 0
AEXX = 0.25 
其他文件从DFT文件夹拷贝过来，运行vasp
3.band计算
INCAR
SYSTEM = Si
ISTART = 1
ICHARG = 2
GGA = PS
EDIFF = 0.00001
EDIFFG = -0.001
ENCUT = 400
ENAUG = 800
LREAL = .FALSE.
LWAVE = .TRUE.
LCHARG = .TRUE.
NELM = 200
NSW = 0
IBRION = 1
LMAXMIX = 4
ISMEAR = 0
SIGMA = 0.1
NSIM = 4
ISYM = 0
LHFCALC = .TRUE.
HFSCREEN = 0.2
ALGO = N
TIME = 0.4
ENCUTFOCK = 0
AEXX = 0.25 
NELMIN = 5
KPOINTS
从HSE06文件夹的IBZKPT拷贝到KPOINTS,然后把高对称点拷贝在后面，权重为0
更新k点总数
Automatically generated mesh
      127（36+91后面91为高对称）Reciprocal lattice
    0.00000000000000    0.00000000000000    0.00000000000000             1
    0.25000000000000    0.00000000000000    0.00000000000000             2
    0.50000000000000    0.00000000000000    0.00000000000000             1
    0.00000000000000    0.25000000000000    0.00000000000000             2
    0.25000000000000    0.25000000000000    0.00000000000000             2
    0.50000000000000    0.25000000000000    0.00000000000000             2
   -0.25000000000000    0.25000000000000    0.00000000000000             2
    0.00000000000000    0.50000000000000    0.00000000000000             1
    0.25000000000000    0.50000000000000    0.00000000000000             2
    0.50000000000000    0.50000000000000    0.00000000000000             1
    0.00000000000000    0.00000000000000    0.25000000000000             2
    0.25000000000000    0.00000000000000    0.25000000000000             2
    0.50000000000000    0.00000000000000    0.25000000000000             2
   -0.25000000000000    0.00000000000000    0.25000000000000             2
    0.00000000000000    0.25000000000000    0.25000000000000             2
    0.25000000000000    0.25000000000000    0.25000000000000             2

    0.50000000000000    0.25000000000000    0.25000000000000             2
   -0.25000000000000    0.25000000000000    0.25000000000000             2
    0.00000000000000    0.50000000000000    0.25000000000000             2
    0.25000000000000    0.50000000000000    0.25000000000000             2
    0.50000000000000    0.50000000000000    0.25000000000000             2
   -0.25000000000000    0.50000000000000    0.25000000000000             2
    0.00000000000000   -0.25000000000000    0.25000000000000             2
    0.25000000000000   -0.25000000000000    0.25000000000000             2
    0.50000000000000   -0.25000000000000    0.25000000000000             2
   -0.25000000000000   -0.25000000000000    0.25000000000000             2
    0.00000000000000    0.00000000000000    0.50000000000000             1
    0.25000000000000    0.00000000000000    0.50000000000000             2
    0.50000000000000    0.00000000000000    0.50000000000000             1
    0.00000000000000    0.25000000000000    0.50000000000000             2
    0.25000000000000    0.25000000000000    0.50000000000000             2
    0.50000000000000    0.25000000000000    0.50000000000000             2
   -0.25000000000000    0.25000000000000    0.50000000000000             2
    0.00000000000000    0.50000000000000    0.50000000000000             1
    0.25000000000000    0.50000000000000    0.50000000000000             2
    0.50000000000000    0.50000000000000    0.50000000000000             1
  0.500000  0.000000  0.500000  0.00
  0.475000  0.000000  0.475000  0.00
  0.450000  0.000000  0.450000  0.00
。。。。。。。。。。。。。。。。。
。。。。。。。。。。。。。。。。。  
  0.093750  0.093750  0.187500  0.00
  0.075000  0.075000  0.150000  0.00
  0.056250  0.056250  0.112500  0.00
  0.037500  0.037500  0.075000  0.00
  0.018750  0.018750  0.037500  0.00
  0.000000  0.000000  0.000000  0.00
其他文件从HSE06中拷贝
运行vasp
4.从EIGENVAL中取权重为0的高对称点做能带图
EIGENVAL：
    2    2    1    1
  0.2010146E+02  0.3845247E-09  0.3845247E-09  0.3845247E-09  0.5000000E-15
  1.000000000000000E-004
  CAR 
SiDiamond                              
    8  127    8

  0.0000000E+00  0.0000000E+00  0.0000000E+00  0.1562500E-01
   1       -7.830170
   2        5.377682
   3        5.377684
   4        5.377686
   5        8.798907
   6        8.798909
   7        8.798911
   8        9.693314

  0.2500000E+00  0.0000000E+00  0.0000000E+00  0.3125000E-01
   1       -6.949546
   2        1.136336
   3        4.578605
   4        4.578607
   5        8.218893
   6        9.797289
   7        9.797292
   8       13.389561
。。。。。。。。。。。。。。。
。。。。。。。。。。。。。。。
  0.0000000E+00  0.0000000E+00  0.0000000E+00  0.0000000E+00
   1       -7.830170
   2        5.377682
   3        5.377684
   4        5.377686
   5        8.798907
   6        8.798909
   7        8.798911
   8        9.693314
去掉前面36个
  0.0000000E+00  0.0000000E+00  0.0000000E+00  0.1562500E-01
   1       -7.830170
   2        5.377682
   3        5.377684
   4        5.377686
   5        8.798907
   6        8.798909
   7        8.798911
   8        9.693314
留下后面91个高对称点，并改变高对称点数
    2    2    1    1
  0.2010146E+02  0.3845247E-09  0.3845247E-09  0.3845247E-09  0.5000000E-15
  1.000000000000000E-004
  CAR 
Si-Diamond                              
    8  91    8
。。。。。。。。。。。。
。。。。。。。。。。。。
  0.0000000E+00  0.0000000E+00  0.0000000E+00  0.0000000E+00
   1       -7.830170
   2        5.377682
   3        5.377684
   4        5.377686
   5        8.798907
   6        8.798909
   7        8.798911
   8        9.693314
然后作图
欢迎大家提意见
·  下载 GGA=B3-VASP5.2.rar
·  下载 GGA=PE-VASP5.2.rar
·  下载 GGA=PS-VASP5.2.rar
·  下载 PE-VASP4.6.rar
·  下载 Eu.rar
举报删除此信息
youzhizhe (站内联系TA)
谢谢分享。
liliangfang (站内联系TA)
2楼: Originally posted by youzhizhe at 2011-10-21 15:50:47:
谢谢分享。
谢谢 大家一起学习
kgdu (站内联系TA)
谢谢分享！！
贺仪 (站内联系TA)
很好的资源 但是有一点没太明白，为很么在算能带的时候，前面取那些权重不为零的k点呢？
一般的计算通过line模式直接得出的EIGENVAL,然后直接画图，你的权重为零的k点其实就是line模式产生的k点。能不能解释一下为什么要加那些权重不为零的点呢？
liliangfang (站内联系TA)
5楼: Originally posted by 贺仪 at 2011-10-21 18:22:54:
很好的资源 但是有一点没太明白，为很么在算能带的时候，前面取那些权重不为零的k点呢？
一般的计算通过line模式直接得出的EIGENVAL,然后直接画图，你的权重为零的k点其实就是line模式产生的k点。能不能解释一下 ...
这是我总结了很多人的计算方法，line模式HSE杂化这种方法算不了，通过各种尝试，访问vasp官网论坛和参考说明得到的。如果这些高对称点权重不为0就得不到你想要的能带图。简单的说就是不这样设置，通过杂化计算是算不动的或者是得不到结果。
schutsilang (站内联系TA)
:tiger05::tiger05::tiger05::tiger05:
tuhaidan (站内联系TA)
顶一下，感谢分享！
xx2008 (站内联系TA)
:victory::victory::victory::victory::victory::victory:
cavediger (站内联系TA)
很好，支持！
viebn (站内联系TA)
LZ您好，您用的是vasp5.2嘛？请问您能不能把vasp5.2中Eu的PBE势发给我呢？我用的是vasp4.6，计算f电子的时候我的势库好像算不出来！！谢谢楼主
liliangfang (站内联系TA)
11楼: Originally posted by viebn at 2011-10-24 11:36:19:
LZ您好，您用的是vasp5.2嘛？请问您能不能把vasp5.2中Eu的PBE势发给我呢？我用的是vasp4.6，计算f电子的时候我的势库好像算不出来！！谢谢楼主
据我所知没有改变的吧
viebn (站内联系TA)
12楼: Originally posted by liliangfang at 2011-10-24 14:58:56:
据我所知没有改变的吧
谢谢了哈~~~:hand:
NKDMS (站内联系TA)
:victory::victory:
ppwzq (站内联系TA)
顶一下，感谢分享！
ppwzq (站内联系TA)
顶一下，感谢分享！
ppwzq (站内联系TA)
顶一下，感谢分享！
ppwzq (站内联系TA)
顶一下，感谢分享！
xiaowenzhi16 (站内联系TA)
EVERY WEEL
whw19850730 (站内联系TA)
6楼: Originally posted by liliangfang at 2011-10-21 18:48:44:
这是我总结了很多人的计算方法，line模式HSE杂化这种方法算不了，通过各种尝试，访问vasp官网论坛和参考说明得到的。如果这些高对称点权重不为0就得不到你想要的能带图。简单的说就是不这样设置，通过杂化计算是 ...
你好很高兴遇到一个也会使用杂化泛函的，有几个问题要问你
ENCUTFOCK和NKRED这两个参数什么物理意义，说明书说高精度计算可以省略，是不是省略了可定不出错，还有看你附件里文件使用杂化泛函时候ISYM = 0
为什么去消对称性，还有kpoints文件为什么用G点，我看过一个资料好像不用G发散，想确定一下
Automatic mesh 
0 
G
4   4   4
0   0   0
还有ENAUG = 800这个参数必须设定吗？期待回复谢谢。
>> 查看全部评论
相关推荐
 材料计算模拟实用技巧
淘贴专辑
 VASP and MS
淘贴专辑
 第一性原理
淘贴专辑
 VASP
淘贴专辑
 第一性原理相关文档
淘贴专辑
 第一性原理计算经验
淘贴专辑
 VASP算例
淘贴专辑
 @个人收集@
淘贴专辑
 VASP
淘贴专辑
 vasp
淘贴专辑
 计算-vasp
淘贴专辑
 纳米及第一性原理方向
淘贴专辑
 HSE & 杂化函数
淘贴专辑
 ms and vasp学习
淘贴专辑
 第一性&纳米&code
淘贴专辑
 第一性
淘贴专辑
 vasp
淘贴专辑
 杂化泛函方面的研究
淘贴专辑
 第一性
淘贴专辑
 VASP 新计算方法
淘贴专辑
 第一性原理和电化学
淘贴专辑
 VASP-study
淘贴专辑
 vasp
淘贴专辑
 个人收藏
淘贴专辑
 vasp
淘贴专辑
 请教如何用VASP计算氧化物的晶格常数？以alpha-Al2O3为例
天棚元帅 发表于2013-02-17
 参杂后，晶格常数发生变化，那么计算出来的形成能准确吗
xiaoboy185 发表于2013-01-17
 VASP计算单胞GdN的能带结构
gougou531 发表于2013-01-10
 各位大侠，vasp下计算完能带如何作图
lzlgcdc 发表于2012-12-13
 VASP +U 计算能带
redsnowolf 发表于2012-12-06
 HSE计算能带经验小总结
WDD880227 发表于2012-03-12
 HSE能带计算中ISYM参数的问题
lascqy 发表于2012-03-05
 HSE06计算突然停止？
xiaoboy185 发表于2011-11-26
 vasp计算出错mpirun
jiagx 发表于2011-11-25
 在vasp计算里，有没有好的只优化原子位置和晶胞体积的方法？
wang-lf09 发表于2011-11-23
 vasp5.2计算误差太大
sunxuancheng 发表于2011-10-28
 GW计算能带总结
liliangfang 发表于2011-09-19
 ENCUT测试脚本
butterflyyh 发表于2011-08-13
 能带图，晶格常数的问题
李佳佳佳 发表于2011-04-18
 【求助】Diamond 3.2中原子选择问题
ling0302 发表于2011-04-11
 【求助】Jade5中计算出的晶格常数能用吗
吃饱了干啥呢 发表于2011-01-08
 【求助】vasp优化时选择了isif=3 怎么限制晶格的一个维度呢？
贺仪 发表于2010-12-20
 【求助】vasp 5.2中用HSE06计算不能进入主循环
bananawuzhu 发表于2010-11-26
 【求助】晶格常数大了以后 VASP的计算值准确吗
尹晓 发表于2010-11-01
 【求助】关于杂化泛函HSE计算
zw_tju 发表于2010-05-19
 【讨论】用vasp计算过弹性常数的请进！！更新中！！
yangfangwi 发表于2009-12-06
欢迎监督和反馈：
本帖内容由 liliangfang 提供，小木虫为个人免费站点，仅提供交流平台，不对该内容负责。
欢迎协助我们监督管理，共同维护互联网健康，如果您对该内容有异议，请立即发邮件到 emuch@ 联系通知管理员，也可以通过QQ周知，我们的QQ号为：8835100 
我们保证在1个工作日内给予处理和答复，谢谢您的监督。

小木虫，学术科研第一站，为中国学术科研研究提供免费动力
欢迎监督，发现不妥请立即联系管理员
E-mail：emuch@   QQ：8835100
京ICP备05001187号-1 
关闭
关闭