宏基因组二代测序在儿童骨关节感染中的临床价值.pdf

症，是肠闭锁预后最差的一型 。本研究发现型肠闭锁胎儿围产期的不良结局与新生儿窒息、多器官功能障碍、新生儿感染有关。例型肠闭锁的病例中，例围产期死亡。其中，例患儿因多器官功能障碍最终死亡；例出生后无哭声，肤色发绀、高度腹胀，重度窒息死亡；例术中探查多发性肠闭锁合并肠穿孔，放弃治疗。存活 例中，例出现胎粪性腹膜炎、多发肠闭锁、肠穿孔、脓毒血症，例出现新生儿感染、脑白质发育不良、心肌损伤。胎儿宫内缺氧是围产期不良结局的高危因素，文献报道多例肠梗阻胎儿宫内急性缺氧，出现死胎、新生儿窒息死亡等不良结局 ，我们的研究与之一致。本研究中，不良结局组中有 例宫内缺氧病例行择期剖宫产，术前麻醉达成后胎心率减慢至 次 ；胎儿大脑中动脉 值偏低、静脉导管 波反向；胎心监护基线平直。其中 例出现新生儿重度窒息、缺血缺氧性脑病。型肠闭锁的 例中，例胎动减少，胎心监护基线平直，胎儿出生后合并脓毒血症，心肌及肝功能损伤；例羊水 污染，新生儿窒息、呼吸衰竭；例胎动减少，胎心率增快至 次 ，新生儿重度窒息死亡。胎儿宫内缺氧可以通过孕期的严密监测及早识别，当胎动明显减少，胎心监护和（或）胎儿血流出现异常时，应该考虑到胎儿宫内缺氧可能，针对有高危因素的胎儿，及时终止妊娠，做好新生儿复苏的准备，有助于改善妊娠结局。有资料显示，胎儿宫内缺氧可能与羊水中胆汁酸浓度过高有关 ，其预测价值还需进一步证实。综上所述，肠梗阻胎儿在产前应规范化管理，产时需密切监测，及时发现胎儿宫内缺氧情况，选择合适的分娩时机及分娩方式，降低新生儿窒息和缺血缺氧性脑病等围产期并发症风险，对于改善肠梗阻胎儿的预后有重要临床意义。利益相关声明：本文所有作者均声明不存在任何利益冲突。作者贡献说明，苏丹：设计并起草论文，实施研究，采集并分析数据；徐一鸣：技术及材料支持，对论文作审阅；刘端：分析、解释数据。参考文献 何敏，张波，杨太珠 产前超声诊断胎儿外科相关畸形的假阳性分析 中国超声医学杂志，（）：，（）：郭卫红，陈永卫，侯大为，等先天性肠闭锁病死率 年回顾性分析 中华小儿外科杂志，（）：，（）：，（）：余克驰，吴晓娟，冯杰雄，等小儿继发性肠狭窄及闭锁诊疗分析 中华小儿外科杂志，（）：，：，（）：陈青江，楼毅，高志刚，等 新生儿先天性十二指肠梗阻 中华小儿外科杂志，（）：夏仁鹏，周崇高，王海阳，等新生儿肠闭锁 例诊治分析 中华新生儿科杂志（中英文），（）：，（）：，（）：伍颖恒，王海玉，等胎儿胎粪性腹膜炎的产前超声诊断及预后分析 中华围产医学杂志，（）：王朋朋，朱晓东，等胎粪性腹膜炎的临床特征及预后相关因素分析 上海交通大学学报（医学版），（）：，：，（）：，（）：（收稿 ）宏基因组二代测序在儿童骨关节感染中的临床价值马健高静秦攀郑州大学第一附属医院小儿外科郑州 通讯作者：秦攀，：【摘要】目的探讨宏基因组二代测序（）在儿童骨关节感染（）中的临床应用价值。方法收集 于郑州大学第一附属医院小儿外科拟诊为 的 例患儿的临床资料，其中 例送检标本为外周血标本，例为开放性手术标河南外科学杂志 年 月第 卷第 期 ，本。所有标本均进行常规培养和 检测。以最终临床诊断标准为依据，比较常规培养和 对 的诊断效能，并分析抗生素使用情况和标本类型对二者检出率的影响。结果根据最终临床诊断标准确诊为 患儿 例，例为非 。检测用时（）（范围：），常规培养为（）（范围：）。检测阳性 例，假阳性 例，敏感度为 ，特异度为 ；常规培养阳性 例，敏感度为 ，特异度为 。二者病原体检测用时、敏感度间的差异有统计学意义（），而特异度的差异无统计学意义（）。在标本送检前行抗生素治疗的 例患儿中，检出率 ，常规培养检出率为 ；在 例手术标本中，检出率为 ，常规培养检出率为 。差异均有统计学意义（）。结论在儿童 的病原体诊断中，具有较高的敏感度，检测用时短，且检出率受既往抗生素治疗的影响更小。【关键词】宏基因组二代测序；骨髓炎；化脓性关节炎；金黄色葡萄球菌【中图分类号】【文献标识码】【文章编号】（），【】（），（），（），（），（），（），（），【】；儿童骨关节感染（，）的发病率高于成人，多见于 岁以下的儿童 。延误诊治可引发脓毒血症、深静脉血栓形成、骨破坏、骨吸收、骨生长板受损，以及肢体畸形等并发症或后遗症 。常规病原微生物培养对 的病原学诊断用时较长、阳性率较低，且受限于入院前是否使用过抗生素。宏基因组二代测序技术（，）的优势在于其检测用时较短、检出率较高，可识别细菌、病毒、真菌等多种类型微生物，甚至发现新的微生物；并可提供菌株鉴定、耐药性预测的基因组信息 。本研究对我院拟诊为 的 例患儿的临床资料进行回顾性分析，探讨 在病原体检测中的临床价值。资料与方法 研究对象收集我院 拟诊为 且进行 检测的 例患儿的一般临床资料和病原体检测结果。均符合有关专家共识 中 的诊断标准，同时具有以下 条者：（）体温 ，局部出现红、肿、热、痛症状，怀疑骨关节感染、活动能力下降（跛行、僵硬、肢体或关节活动范围缩小），关节肿胀中的至少 项。（）血培养阳性，骨组织或关节抽吸物培养阳性，化脓性关节液，成像结果符合骨或关节感染中的至少 项者。排除应用免疫抑制、白血病、恶性疾病合并感染，以及骨科固定装置感染、创伤相关感染的患儿 。本研究已获本院科研和临床试验伦理委员会批准（审批号：）。研究方法收集患儿的一般资料，包括性别、年龄、白细胞计数（正常值为 ）、反应蛋白（正常值为 ）、红细胞沉降率（正常值为 ）、送检前抗生素使用情况等。收集的标本类型包括外周血、病灶标本。同时进行 检测和常规培养。比较两种检测方法的结果。统计学分析应用统计软件 进行统计学分析。计算敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值。计量资料若符合正态性分布，采用均数 标准差（珋 ）表示，组间比较采用 检验，偏态分布计量资料以中位数（四分位数间距）（，）表示；计数资料以 （）或构成比表示。敏感度、特异度及率的比较采用卡方检验或 确切概率法。为差异有统计学意义。河南外科学杂志 年 月第 卷第 期 ，结果 一般情况本研究共纳入 例患儿，根据最终临床诊断标准，例患儿被诊断为 ，例患儿为非 （骨肿瘤 例，髋关节滑膜炎 例，未明确 例）。例 患儿中，男 例（），标本采集前使用抗生素患儿占 （）；手术干 预 患 儿 占 （）。见表 。表 例 患儿的临床特征一般资料患儿（例）年龄 岁，（，）（，）性别（男 女，）白细胞计数 ，（，）（，）反应蛋白 ，（，）（，）红细胞沉降率 ，（，）（，）标本采集前使用抗生素人数 （）（）手术患儿 （）（）常规培养和 结果 例微生物培养标本中，常规培养结果 例阳性，均为金黄色葡萄球菌；检测结果 例阳性，其中 患儿标本中 份阳性，非 患儿 份阳性（结合临床及病理考虑为污染）。共检出病原微生物 株，其中细菌 株，占 （）；病毒 株，占 （）。见表 。检测用时（）（范围：），常规培养为（）（范围：）。差异有统计学意义（，）。常规培养和 结果以最终临床诊断为依据，检测与常规培养的敏感度分别为 （）、（），特异度分别为 （）、（），阳性预测值分别为 （）、（），阴 性 预 测 值 分 别 为 （）、（），指 数 分 别 为 、。检测与常规培养的敏感度差异有统计学意义（，），但特异度的差异无统计学意义（）。其中，份标本 检出种以上病原体，而相应的常规培养 份阴性，份检出病原体少于 。送检前抗生素使用和不同标本类型对病原体检测的影响本研究 例 患儿中，例标本送检前接受抗 生 素 治 疗，检 测 的 阳 性 率 为 （），常规培养为 （），差异有统计学意义（）；例标本送检前未接受抗生素治疗，检测的阳性率为 （），常规培养为 （），差异无统计学意义（）。例外周血标本中，检测的阳性率为 （），常规培养为 （），差异有统计学意义（）；在 例手术标本中，检测的阳性率为 （），常规培养为 （），差异有统计学意义（）。（表示精确概率法）表 检出 株病原菌情况病原体检出株数构成比（）细菌 金黄色葡萄球菌 铜绿假单胞菌中间链球菌鲍曼不动杆菌痤疮丙酸杆菌纹带棒杆菌恶臭假单胞菌密歇根克雷伯氏菌嗜麦芽窄食单胞菌产黑色普雷沃菌黏质沙雷菌人葡萄球菌贝纳氏柯克斯体幽门螺杆菌副流感嗜血杆菌口腔链球菌脆弱拟杆菌空肠普雷沃菌病毒 巨细胞病毒人多瘤病毒 型 病毒细环病毒注：示补充目录，指排除了实验室污染后所检测出的、具有致病可能的微生物。（包括样本采集或分装过程中引入的、具有可能致病性的环境机会致病菌或其核酸，来自患儿或样本采集人员的人体共生条件致病菌或其核酸，以及定植于病人特定身体部位的微生物）讨论本研究结果显示，在 患儿诊断中的敏感度高于常规培养，差异有统计学意义；但特异度的差异无统计学意义。阳性预测值为 ，阴性预测值为 。等 的研究显示，诊断人工关节感染的敏感性为 ，显著高于综合培养的 ，差异有统计学意义，但两者的特异性相似。等 一项纳入 例的研究中，对成人关节感染的敏感度为 ，特异度为 ；而常规培养的敏感度为 ，特异度为 。有关儿童骨关节感染的一系列回顾性研究结果显示 ，在纳入 项研究的汇总分析中，共计 例确诊为骨髓炎患儿血培养的中位阳性率为 ；另一个 项研究的汇总分析河南外科学杂志 年 月第 卷第 期 ，中，名确诊为骨髓炎患儿的血培养阳性率为 ，在结合血培养与骨 组织培养后的阳性率为 ，原体检出率增加了 。一项纳入 例化脓性关节炎患儿的研究中，外周血或关节液培养阳性率为 。本研究常规培养阳性率仅为 ，与相关研究结果对比，可能与纳入患儿包含骨髓炎和化脓性髋关节炎、行常规培养的标本类型不一，以及受培养前抗生素使用情况的影响有关。本研究中，检出率在既往使用过抗生素的标本中高于常规培养，与石仕元等 的一项纳入 例的研究结果类似。与常规细菌培养（）比较，诊断非结核脊柱感染性疾病有更高的敏感度（），差异有统计学意义；而不同标本获取方法对 检测结果的影响无统计学意义。另一项纳入 例患者的研究中，样本涵盖各种标本类型研究，在抗生素暴露的病例中，阳性率（）亦优于常规培养（）。此外，检测用时明显短于常规培养，在 内即可获取检测结果。本研究中，检出菌种以金黄色葡萄球菌最为常见，其他还有铜绿假单胞菌、中间链球菌、人葡萄球菌、病毒等少见的细菌及病毒；而常规培养仅检出部分金黄色葡萄球菌。虽然 可检测出多种病原体，但除导致感染的重点微生物外，也包括一些正常菌群和标本采集、运输过程导致污染的微生物；还可能检测出一些未知新发病原体、特殊病原体等 。如何确定其与临床感染的相关性，还需要综合患者临床信息等进行多维度判断。本研究中 例两种检测均为金黄色葡萄球菌感染患儿的耐药结果显示，均未检出耐药基因；而常规药敏发现 感染 例，其中青霉素均耐药，克林霉素耐药 例，万古霉素及利奈唑胺均敏感。目前 可报告的耐药基因型与表型包括甲氧西林（）、克 林 霉 素（）、万 古 霉 素（）等 ，但暂时没有关于 检测耐药基因型与表型的临床数据，因此耐药基因检测在临床的意义还需要进一步研究及证据支撑。本研究的局限性在于，是单中心研究，样本量较小，重点是急性 患者，在进行临床分析时可能导致一些偏倚；对检出多种病原体的研究对象，未分析其与感染的相关性，确认真正致病菌。由于 检测费用偏高，应根据患儿的临床表现、实验室指标、影像学检查，以及经验性治疗来选择 检测。同时还需要更多研究证明其在临床实践中的价值。综上所述，对儿童 病原体诊断有较高的灵敏度，且不受抗生素使用及标本类型的影响，能为儿童 的临床早期诊治提供助力。参考文献 ，（）：，（），（）：，（）：，（）：，：，（）：，：，（）：，（）：，：，（）：，：，（）：，：，（）：石仕元，胡胜平，费骏等 宏基因组二代测序技术在脊柱非结核感染性疾病诊断中的应用价值 中华骨科杂志，（）：，（）：，：，（）：，：，（）：，（）：（收稿 ）河南外科学杂志 年 月第 卷第 期 ，