1、
人造海水的配方*
(引自Chemical Oceanography ,Second Edition , Millero F J,1996)
名称
质量(×10-3kg)
氯化钠
氯化镁
硫酸钠
氯化钙
氯化钾
重碳酸钠
溴化钾
硼酸
氯化锶
氟化钠
23.98
5.029
4.01
1.14
0.699
0.172
0.100
0.0254
0.0143
0.0029
*:水&化合物的总重量为1kg.
《海洋微生物及其代谢产物》 -林永成主编 2003
细菌的分离:
牛肉膏蛋白胨琼脂、营养琼脂等是分离细菌的常用培养基,前
2、苏联细菌学家设计的ZOBELL 2216E培养基是培养好气性异养细菌较好的培养基,可培养多种细菌,SIMIDU培养基也常用于海洋好气性异养细菌的分离,PFENNIGS培养基适用于海洋光合细菌的分离,分离海洋弧菌可采用TCBS培养基,培养基PH一般为7.2-7.6,盐度为28到30,培养温度28到37, 培养时间1到7天,注意观察平板菌落变化,1到2天先挑取大菌落,5到7天后再挑取小菌落,为防止真菌的污染,常在培养基中添加一定的抗真菌抗生素,如制霉菌素、两性霉素、放线菌酮等。放线菌因生长缓慢且菌落不大,一般不会对细菌的分离产生影响。
放线菌的分离:
1 放线菌是数量最多、最常分离到的G+,
3、JENSEN的研究表明,离海岸越近,在0到1米水深的底泥样本中,链霉菌占分离的放线菌总数的86%,小单孢菌占12%,其他占2%。
2 分离培养基
多采用合成培养基(高氏合成一号、精氨酸、天门冬素培养基)和有机培养基(HV、YE、WAKSMAN、bennett),高氏合成一号是分离的常用培养基,适合尤其是链霉菌的生长,但细菌和真菌也大量生长。HV是以腐植酸为唯一碳、氮源的培养基,对小单孢菌、小双孢菌、指孢囊菌、链孢囊菌的选择性高,但是生长的放线菌形态不完整,难以观察,给挑菌工作带来困难。
3 抑制剂
放线菌酮、制霉菌素可抑制真菌,青霉素、链霉素可抑制细菌,重铬酸钾对真菌和细菌均可抑制,
4、0·005%-0·01%是较理想的分离抑制剂,有三个特点:抑制细菌和真菌的生长,不影响放线菌的正常生长,还可促进一些放线菌孢子的萌发,价格低廉。
4 样品预处理
120干热处理样品1小时能大大减少细菌和链霉菌的数量,而对稀有放线菌影响较少,甚至能利于孢子萌发,由于海洋样品多潮湿,同时孢子对湿热敏感,故采用50到55度的热处理会促使大部分孢子萌发。
化学杀菌剂法
杀菌剂 苯酚 SDS 葡萄糖酸洗必泰CG 苄索氯氨BC 碳酸钙 氯化钙
富集的放线菌 非链霉菌属 小单孢菌 智囊孢菌
5、 小双孢菌 非链霉菌属 小四孢菌 所有放线菌 放线双孢菌
小四孢菌 链孢囊菌
差速离心 浓缩
真菌的分离:
到2000年止已认知的海洋真菌仅仅444种,包括177属360种的子囊菌(占81·1%),51属74种半知菌(占16·7%)和7属10种的担子菌(占2·2%)
选择性富集
海水样品可通过浓缩或过滤,用无菌的0·45µm孔径的硝酸纤维素滤膜过滤海水,然后直接把
6、滤膜放在培养基上培养。
分离酵母菌时,可将含50-200㎎/L氯霉素的分离培养基用浓盐酸调PH值至3·4酸性条件下可抑制很多细菌生长。
植物内生真菌分离方法:
进行分离前,对植物材料表面进行彻底消毒非常必要,典型的消毒剂有70%-90%的乙醇、漂白剂、1%的过氧乙酸和3%-30%的过氧化氢,多采用PDA培养基,并加入庆大霉素、氯霉素、链霉素等抗生素,抑制细菌和放线菌的生长。
鉴定:
16S rRNA相对分子量适中,易于进行序列测定和分析比较,可以为细菌鉴定提供相对稳定可靠的信息,广泛用于评价生物遗传多态性和系统发生关系。18S rRNA成为目前研究真菌属物种多样性的分析比较。原核微生
7、物rRNA包含23S、16S、5S,真核微生物转录区包含5S、18S、5·8S、28S。
(C+G)mol%在种内不超过4%,属内不超过10%。低于2%没有分内学意义。只具有否定价值,需与表型特征相结合。
16S rDNA成为细菌种属鉴定和分类的标准方法,适用种及种以上的分类单位。
同源性≥95%的菌可归为同一属,≥97%可视为同一种,大于97%时必须测定DNA-DNA杂交率是否大于70%才能确定是否为新种。由于对同种内的不同菌株分辨力较差,更适合研究属及属以上的菌株。
18S rDNA普遍用于真菌物种的鉴定分析。
植物内生真菌的分离 叶、叶脉、茎、树皮(韧皮部)等样品用自来水
8、冲洗掉泥土,然后进行严格的表面消毒程序:依次浸泡在75%酒精lmin,3%一5%有效氯的次氯酸钠溶液3 min。75%的酒精O.5 min,然后再用无菌水冲洗3遍。晾干后,在超静台将其剪成约O.5 cm×0.5 cm左右小片。将处理好后剪成的小片铺于PDA平板上,加入氯霉素与链霉素各50斗g/mL抑制细菌的生长,在26℃培养培养2—3周分离内生真菌。这些平板在第1周要每天检查1次,然后可以3、4 d检查1次。一旦发现有菌丝从组织小块长出,应马上将其转接到另一新的平板上,经几次纯化保存于PDA斜面。
植物组织样品处理: 将采集的红树林植物样品先用流动的清水冲洗干净,再超声清洗彻底去除植物组织表面的杂质, 把植物样品剪切成15 cm 左右长度的节段进行表面消毒。样品依次用次氯酸钠(含5%有效氯量)浸泡5 min,无菌水清洗3 次, 75%酒精浸泡3 min, 无菌水清洗3次, 晾干, 用粉碎机把植物组织粉碎备