1、对于小分子量的蛋白:可以考虑一下Tricine-SDS-PAGE,即用三羟甲基甘氨酸(tricine)代替甘氨酸作为终止离子。Tricine-SDS-PAGE可以有效地分离1-100 kDa的蛋白样品: 下面推荐两个Tricine-SDS-PAGE电泳的protocol,供参考。 推荐I 首先是Nature Protocol上的一篇专门介绍Tricine-SDS-PAGE的文章,作者是该领域的专家——Schǎgger。 Nature Protocols 1, - 16 - 22 (2006) Published online: 12 May 2006 | Corrected o
2、nline: 10 August 2006 | doi:10.1038/nprot.2006.4 Tricine-SDS-PAGE要与小蛋白打很多交道的同志们可以仔细研读一下这篇文章,总结整理出适合你的具体方案。 推荐II 只是想看看Tricine胶的分离效果,偶尔一试,可以参考下面这个具体的protocol。 Tricine胶的配方 阴极、阳极缓冲液的配方 介绍:常规的Tris-SDS-PAGE电泳的只能分辨大分子物质的,而对了相对分子量小的,尤其是10kD以下的蛋白分辨率极低。本人用Tris-SDS-PAGE做一个20
3、KD以下的蛋白结果不是很理想,而且重现性差,因为在这种不连续的缓冲系统中,低分子量的常常堆积在浓缩胶中。而Tricine-SDS-PAGE 可以很好的分离30KD以下的蛋白,而且本人还发现它同样对大蛋白也适用,我用它做过45KD,90KD,120KD左右的蛋白,而且每次上样3uL的Marker跑出来的10条带清清楚楚,几乎是平行的跑下来,常规的Tris-SDS-PAGE加了10uL的效果也没它好,有时越大下面越不清楚,也越窄。如果,有战友做小蛋白的话不妨试试看,下面是实验配方和步骤。 一、缓冲液的配置: 1.正极缓冲液anode buffer(2X): 0.1M Tris(pH 8.9)
4、12.114g加H20定容至500ml, 4℃保存。 2.负极缓冲液 cathode buffer (1X): 0.1M Tris +0.1M Tricine+0.1%SDS 不用调pH: 6.057gTris+8.96gTricine+0.5g SDS 加H20定容至500ml, 4℃保存。 3. 凝胶缓冲液 gel buffer(G-B, 3X): 36.342gTris+0.3gSDS加H20定容至100ml H20,HCL调pH=8.45,过滤4℃保存。 4. AB-3 储存液(49.5%T,3%Cmixture): 24g丙烯酰胺+0.75g甲叉双丙烯酰胺 加H20定
5、容至50ml,过滤4℃保存。 5.AB-6储存液(49.5%T,6%Cmixture): 23.25g丙烯酰胺+1.5g甲叉双丙烯酰胺 加H20定容至50ml,过滤4℃保存。 二、具体的步骤: 1.按如下配方制备分离胶和积层胶: 4 % 积层胶(3ml) 10%分离胶(8ml) AB-3(mL) 0.25 -- AB-6(mL) -- 1.6 3×gel buffer(mL) 0.75
6、 2.67 甘油(mL) -- 0.63 H20(mL) 2 3.1 10% APS(uL) 22.5 40 TEMED(uL) 2.25 4 先注入分离胶,待分离胶凝固后(0.5-1小时),注入积层胶。待积层胶凝固后(0.5-1小时)。 2. 上样电泳: 总蛋白取25uL,细胞组分蛋白根据BCA定量后取75ug,加入6×SDS上
7、样缓冲液煮沸5 分钟,12000rpm离心2分钟,取上清进行蛋白电泳。准备电泳时,在电泳槽底部加入正极缓冲液,将制好的胶连同其装置放入电泳槽内,在两块胶之间注入负极缓冲液,用30V的电压预电泳10分钟,然后上样。当染料从积层胶进入分离胶后,电压加到90V,继续电泳直到溴酚蓝抵达分离胶底部,断开电源停止电泳。整个电泳过程在冰上或4℃进行。 3. 转膜和抗体孵育 1) 电泳近结束时,将裁好的与凝胶尺寸相当的PVDF膜先用甲醇浸透活化后,用去离子水漂洗,然后浸泡在转移缓冲液中。另外,裁剪六张尺寸一致的滤纸连同海绵垫一起置于转移缓冲液中浸泡。 2) 电泳结束后,小心取出凝胶,浸泡于转移缓冲液
8、中,在转移缓冲液中安装转移装置,从负极到正极按如下顺序装置:海绵垫、三层滤纸、凝胶、PVDF膜、三层滤纸、海绵垫。注意清除各层之间的气泡。转移装置放在搅拌器上并冰浴。连接好电源后,调整电压100V,湿转1-1.5小时。 3) 转膜结束后,用TBST缓冲液漂洗PVDF膜2次,每次5分钟,之后加入20mL封闭液完全浸泡膜,室温平摇2小时。 4) 根据预染Marker显示的分子量,在相应的范围内,将含有目的蛋白的区域剪下,放入预先准备好的含一抗的封闭液中,用塑料袋封好,4℃缓慢侧摇过夜。 5) 取出PVDF膜浸入TBST缓冲液,平摇洗膜三次,每次10分钟。 6) 在封闭液中按1:10
9、000~20000比例加入辣根过氧化物酶标记的二抗,将膜置于其中,室温侧摇0.5-1小时。 7) 取出PVDF膜浸入TBST缓冲液,平摇洗膜四次,每次10分钟。 4. 化学发光显色: 1) 在暗室中,取等量的Stable Peroxide Solution和Luminiol/Enhancer Solution混匀后,将PVDF膜浸泡其中,轻轻晃动,直至可以看到荧光,一般3~5分钟。 2) 将膜取出,用滤纸吸干多余的液体,放入塑料保护膜中。 3) 将封好的膜放入暗盒中,加入X光片,根据荧光的强弱,曝光5秒~1分钟不等。 4) 取出X光片,放入显影液中,直至条带出现,这时可
10、以根据条带的效果,再次调整曝光的时间。 5) 将显影后的X光片用自来水清洗后,放入定影液中定影5~10分钟,再用自来水后晾干、拍照。 tricine sds page电泳原理: 电泳是电泳涂料在阴阳两极,施加于电压作用下,带电荷之涂料离子移动到阴极, 并与阴极表面所产生之碱性作用形成不溶解物,沉积于工件表面。 它包括四个过程: 1 )电解(分解) 在阴极反应最初为电解反应,生成氢气及氢氧根离子 OH ,此反应造成阴极面形成 一高碱性边界层,当阳离子与氢氧根作用成为不溶于水的物质,涂膜沉积,方程式 为: H2O→OH+H
11、 2 )电泳动(泳动、迁移) 阳离子树脂及 H+ 在电场作用下,向阴极移动,而阴离子向阳极移动过程。 3 )电沉积(析出) 在被涂工件表面,阳离子树脂与阴极表面碱性作用,中和而析出不沉积物,沉 积于被涂工件上。 4 )电渗(脱水) 涂料固体与工件表面上的涂膜为半透明性的,具有多数毛细孔,水被从阴极涂 膜中排渗出来,在电场作用下,引起涂膜脱水,而涂膜则吸附于工件表面,而 完成整个电泳过程。 • 电泳表面处理工艺的特点: 电泳漆膜具有涂层丰满、均匀、平整、光滑的优点,电泳漆膜的硬度、附着力、 耐腐、冲击性能、渗透性能明显优于其它涂装工艺。
12、 Tricine SDS-PAGE实用方案 Tricine-SDS-PAGE是用于分离分子量在1-10kD的肽类用的。 一、 试剂配配制: 1. Low Bis acrylamide(49.5% T, 3% C) Acylamide 48.0g Bis 1.5g Water make up to 100ml 2. High Bis acrylamide (49.5% T, 6% C) Acrylamide 46.5g Bis 3.0g Water make up to100ml 3. Gel Buffer (3M Tris/cl, PH8.45, 0.3% SDS)
13、 SDS 0.3g Tris 36.4g Water make up to 100ml PH to 8.45 with HCL 注: 3M Tris 配制时不容易溶解,因此配制时我配制了2M Tris,配方如下: Tris 36.4g SDS 0.3g Water make up to 150ml 4. Anode (Lower) buffer 阳极缓冲液 (0.2M Tris/cl, PH8.9) Tris 12.11g Water make up to 500ml PH to 8.9 with HCL 5. Cathode (Upper) buffer 阴极缓冲液
14、 (0.1M Tris/cl, 0.1M Tricine, 0.1% SDS, PH 8.25) Tris 6.06g Tricine 8.96g SDS 0.5g Water make up to 500ml 注:不用调PH值 6. 4×Tricine SDS Sample buffer 4×上样缓冲液 (Final concentration: 0.05M Tris/cl, 4% SDS, 12% glycerol, 200mM DTT, 0.01% Commasie G 250) 8×Tris.cl/SDS PH 6.8 2ml Glycerol 4.8ml SDS
15、1.6g Commasie Blue G 250 4mg Water make up to 10ml 注:8×Tris.cl/SDS PH 6.8配方 Tris 6.05g SDS 0.4g Water make up to 100ml PH to 6.8 with HCL 二、 胶的配制 1. 16.5% T 6% C separating gel 30ml 49.5% T 6% C 10ml Gel buffer 15ml Glycerol 3.2ml Water 1.8ml 2. 10% T 3% C spacer gel 30ml 49.5% T 3% C
16、 6.1ml Gel buffer 15ml Water 8.9ml 3. 4% T 3% C stacking gel 12.5ml 49.5% T 3% C 1ml Gel buffer 4.65ml Water 6.85ml 注: 用Bio-Rad系统, 0.75mm的胶,separating gel 配3ml, 加2.5ml; Spacer gel 配1ml,加0.7ml; Stacking gel 配1.25ml. 灌胶前临时加10%AP(过硫酸铵)和TEMED. 胶配制的通用配方: 三、电泳参数及染色脱色 1. 用Bio-Rad mini 电泳装置进行电泳
17、 30V 电泳1hr, 100V至电泳结束 2. 固定, 染色及脱色: 小分子量肽类在SDS-PAGE胶中容易扩散,因此电泳结束后, 有时需要固定20min (固定液: 0.5% 戊二醛, 30% 乙醇), 再进行染色20-30min (染色液: 50% 甲醇, 10% 乙醇, 0.2% G-250), 在脱色液 (45% 甲醇, 10% 冰醋酸)脱色20-30min; 脱色完毕,把胶放在水中或10%甘油中. 四、电泳示例照片 Tricine-SDS-PAGE电泳分析小分子多肽、 摘要:研究旨在解决常规SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)对一些小分子多肽进行
18、电泳分析过程中极易扩散丢失,常无着色带显示等问题。实验采用不同类型胶来电泳分析低分子量多肽,比较Tficine-SDS-PAGE电泳分析小分子多肽时的聚丙烯酰胺浓度和交联度,为小分子多肽的分析与鉴定提供快速准确的条件。 关键词:Tricine-SDS-PAGE;小分子多肽;蛋白质 常规Tris.甘氨酸.SDS-PAGE电泳分析分辨大分子物质的相对分子质量范围在10~200 kDa,对于相对分子质量小于10 kDa的多肽分辨率低u J。Swank 等在含有SDS的凝胶中加人8 mol·LI1的脲,但分离效果不甚理想,且重现性较差。Lanzillo等发现在 Laemmli系统和仅在样品和电
19、极缓冲液中有SDS的不连续缓冲系统中,低分子量多肽常常堆积在浓缩胶中【2l,之后Scba~ r等【3]又进行了系统地研究和探索,能够分离较大相对分子质量范围内的蛋白质。随着生物技术的飞速发展和基因工程药物的大量涌现,具有高生物活性的小分子多肽的分离、纯化和鉴定技术极为重要。本文报道采用Tris.Tricine缓冲体系,对SDS-PAGE方法的各个环节进行了改进,在较低的丙烯酰胺浓度下取得了较理想的结果。 1 材料和方法. 1 试剂和仪器 SDS为华美生物工程公司产品;丙烯酰胺(分析纯)为上海绿鸟科技发展有限公司产品;N—N’甲叉双丙烯酰胺(分析纯)为Fluka公司产品;Tris为 PI'咖e 公司产品;Tricine、TEMED、过硫酸铵均为上海生工AMRKSCO分装产品;脲(分析纯)为无锡市民丰试剂厂产品;肽分子量标准的分子量范围1 060 ~ 26 6OO为美国Sigma公司产品。EPS604稳压稳流电泳仪(南京科宝仪器研究所);小型垂直电泳附件模具为北京六一仪器厂生产。 1.2 方法 1.2.1 电泳贮存液的配制见表1和表2。






