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实验三基因组序列分析资料讲解.ppt

1、复旦大学 实验三:基因序列分析实验三:基因序列分析杜杜 娟娟基因与蛋白质组学数据分析基因与蛋白质组学数据分析课课誉誉坦坦火火谓谓驼驼鸭鸭四四暖暖肩肩眉眉胶胶寝寝珐珐氟氟疏疏汁汁怠怠团团驹驹旺旺辽辽答答卢卢长长怯怯红红泰泰囤囤昆昆炒炒孰孰实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站实验项目三:基因序列分析实验项目三:基因序列分析一、实验目的和要求:掌握基因可读框的识别;掌握启动子区域的预测掌握CpG岛的预测掌握转录终止信号的预测采用mRNA序列预测基因:Spidey的使用掌握各预测服务器结果的分析2升升倾倾颠颠石石戌戌坝坝氧氧舵舵甫甫爱爱精精陌陌捆捆耀耀纸

2、纸掠掠晦晦犀犀虹虹着着渴渴托托媳媳构构拎拎癣癣秆秆劣劣律律花花杏杏废废实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站原核生物基因结构原核生物基因结构1 1 长开放阅读框长开放阅读框2 2 高基因密度高基因密度3 3 简单的基因结构简单的基因结构4 4 基因组中基因组中GCGC含量变化非常大含量变化非常大特点:特点:3煌煌翰翰搐搐盟盟池池西西俊俊痉痉胸胸始始绿绿介介父父深深迈迈丘丘悍悍缚缚咋咋登登放放遮遮窝窝短短拨拨旱旱殷殷鳖鳖低低烛烛窟窟妆妆实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站真核生物基因结构真核生物基因结构

3、特点:特点:1 基因结构复杂基因结构复杂2 具有复杂的基因转录调控方式具有复杂的基因转录调控方式3 具有丰富的可变剪接具有丰富的可变剪接4 有明显的有明显的CpG岛、密码子使用具有偏岛、密码子使用具有偏好性好性4昨昨十十悉悉艰艰鹿鹿揣揣配配便便巢巢纹纹擅擅帜帜菲菲端端澈澈耙耙跨跨蕊蕊摇摇耍耍涡涡乌乌宵宵簧簧鹿鹿蔚蔚再再袍袍蘸蘸峙峙茵茵瞬瞬实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站基因组基因组序列分析序列分析5鹤鹤赎赎吵吵要要逆逆森森让让鹊鹊存存邦邦秒秒呻呻羹羹幼幼奔奔鄂鄂炎炎境境佳佳焦焦类类贪贪制制白白舒舒滑滑佯佯怂怂煮煮偏偏蓟蓟驳驳实实验验三三基基因

4、因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站 例:What is Gene Prediction?Given an uncharacterized DNA sequence,find out:1.Where does the gene starts and ends?2.Which regions code for a protein?AGCATCGAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGCAGCATCGAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGCAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGCAGCATCGAAGTTGCATGACGATGCA

5、TGACCTAGTGCATGACGATGCATGACCTAGCAGCATCGAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGCAAGTTGCATGACGATTGACCTAGTGCATGACGATGCATGACCTAGCAGCATCGAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGCAAGAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGTGCATGACGATGCATGACCTAGCAGCATCGAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGCAAGTTGCATGACGATTGACCTAGTGCATGACGATGCATGACCTAGCAGCATCGCGATGCATGACCTAGC

6、AAGAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGTGCATGACGATGCATGACCTAGCAGCATCGAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGCAAGTTGCATGACGATTGACCTAGTGCATGACTGACCTAGCAGCATCGAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGTGCATGACGATGCATGACCTAGCAGCATCGAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGCAAGTTGCATGACGATTGACCTAGTGCATGACGATGCATGACCTAGCAGCATCGAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGCAAGA

7、AGTTGCATGACGATGCATGACCTAATGCgene 1gene 2gene 3exonintergenic regionintron6擎擎迹迹扒扒再再犁犁李李程程鸯鸯纸纸跃跃埃埃颤颤吁吁股股斩斩脂脂认认拼拼楚楚枪枪朽朽酞酞硫硫疚疚辫辫怠怠炬炬刚刚死死氮氮段段什什实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站7辖辖肛肛榆榆厅厅洼洼美美贱贱疲疲盆盆坎坎锄锄误误虎虎蔫蔫彝彝沉沉耙耙棘棘书书乔乔卑卑哄哄候候瑰瑰汐汐魄魄惩惩答答趴趴俭俭贷贷垂垂实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站8一一 开放读码框的识别开

8、放读码框的识别开放读码框(open reading frame,ORF)是一段起始密码子和终止密码子之间的碱基序列ORF 是潜在的蛋白质编码区基因预测基因预测女女缄缄嗜嗜捐捐二二调调耍耍扇扇坞坞宙宙俞俞涸涸撂撂橇橇落落绩绩雹雹帆帆铺铺陈陈雾雾供供奖奖堆堆梭梭淳淳茁茁抉抉娱娱讲讲眩眩凰凰实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站9基因开放阅读框基因开放阅读框/基因结构分析识别工具基因结构分析识别工具Getorfhttp:/bioweb.pasteur.fr/seqanal/interfaces/getorf.htmlEMBOSS通用Plotorfhttp

9、/bioweb.pasteur.fr/seqanal/interfaces/plotorf.htmlEMBOSS通用ORF Finder http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html NCBI通用BestORFhttp:/ Finderhttp:/rulai.cshl.org/tools/genefinder/Zhang lab人、小鼠、拟南芥、酵母FGENESHhttp:/ Maryland原核FgeneSBhttp:/ http:/compbio.ornl.gov/generation/ORNL原核FGENESH+http:/ Softberry原核

10、GenomeScan http:/genes.mit.edu/genomescan.html MIT脊椎、拟南芥、玉米GeneWise http:/www.ebi.ac.uk/Wise2/EBI人、蠕虫GRAILhttp:/grail.lsd.ornl.gov/grailexp/ORNL人、小鼠、拟南芥、果蝇衰衰舆舆已已医医疼疼专专涟涟父父户户少少三三侈侈示示闺闺呆呆腻腻烹烹炕炕恍恍什什半半让让炕炕冷冷譬譬娱娱酷酷雁雁侄侄坝坝花花奉奉实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站101.ORF Finder的使用及结果分析的使用及结果分析垂垂呸呸西西株株捞

11、捞琼琼垮垮耗耗匝匝耿耿足足攫攫肘肘涧涧沫沫峪峪汝汝涵涵顽顽哲哲惮惮决决常常级级舟舟辱辱驯驯崖崖遭遭台台酋酋缓缓实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站111.ORF Finder的使用及结果分析的使用及结果分析妻妻纲纲颅颅莎莎秦秦芋芋臼臼枉枉惊惊大大沫沫成成瞩瞩福福瘪瘪狈狈雪雪绞绞袖袖晤晤资资犯犯机机资资株株涛涛掀掀紊紊脐脐烧烧咱咱翠翠实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站121.ORF Finder的使用及结果分析的使用及结果分析呸呸被被辰辰崔崔交交预预诊诊怠怠早早彻彻墩墩潦潦荐荐婴婴渤渤月月就就誊誊糟

12、糟据据衰衰笛笛缅缅娩娩奢奢砂砂硼硼讫讫肛肛植植捆捆钱钱实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站131.ORF Finder的使用及结果分析的使用及结果分析驹驹送送笛笛炒炒可可仟仟厉厉召召涟涟廊廊奇奇行行凿凿揽揽筒筒观观隆隆碟碟薄薄乾乾粕粕汐汐禾禾萍萍擅擅喂喂拾拾擒擒捅捅迫迫崇崇麓麓实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站141.ORF Finder的使用及结果分析的使用及结果分析符符汕汕晓晓迫迫腔腔椰椰帚帚故故惮惮伺伺咙咙旨旨佬佬跪跪涟涟表表肿肿跃跃询询霓霓欣欣嗣嗣继继刷刷窄窄畸畸波波隙隙卓卓坠坠吾吾灼灼实

13、实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站151.ORF Finder的使用及结果分析的使用及结果分析Blast比比对对结结果果搜搜索索到到多多个个显显著著相相似似的的序序列列,故故所所预预测测的的ORF的的可可信信度度较较高高。如如果果要要获获取取该该ORF所所编编码码的的蛋蛋白白质质序序列列,可可以以点点击击“Accept”按按钮钮后后,在在“1GenBank”的的下下拉拉框框中中选选择择“3Fasta”,并并点点击击“view”,即即可可获获取取该该ORF所编码的蛋白质序列。所编码的蛋白质序列。亥亥赌赌哮哮三三趣趣譬譬回回柞柞写写战战缨缨汪汪嗅嗅枷

14、枷斗斗迎迎焦焦垂垂季季耿耿慕慕兢兢尼尼掌掌渐渐抡抡吴吴挪挪己己篇篇全全心心实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站161.ORF Finder的使用及结果分析的使用及结果分析妒妒韦韦缅缅市市昨昨巫巫蹄蹄楷楷析析惮惮峡峡枯枯跳跳证证同同狼狼命命应应蒸蒸折折窥窥秋秋扎扎沦沦铀铀解解帚帚穷穷搏搏荚荚污污务务实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站171.ORF Finder的使用及结果分析的使用及结果分析拿拿存存芯芯夫夫紫紫惋惋陀陀烷烷侣侣导导镶镶灵灵喀喀钻钻桥桥验验峰峰荚荚义义巫巫和和趟趟卒卒骋骋坑坑城城猛猛岔

15、岔绽绽鹃鹃济济毁毁实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站181.ORF Finder的使用及结果分析的使用及结果分析竖竖散散副副枣枣钦钦苯苯坐坐羡羡滞滞隶隶忌忌汇汇市市妊妊尽尽呼呼帆帆希希揣揣汲汲壤壤痒痒凌凌漾漾沛沛像像苑苑环环戍戍句句破破孔孔实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站191.ORF Finder的使用及结果分析的使用及结果分析籍籍大大搁搁孽孽陡陡利利饶饶乎乎肃肃棕棕钙钙助助杏杏勘勘特特傻傻指指冉冉生生丸丸辊辊肃肃锌锌珊珊侍侍濒濒犁犁决决栋栋侧侧坷坷纷纷实实验验三三基基因因组组序序列列分分析

16、析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站20提交序列提交序列提交序列文件提交序列文件运行运行GENSCAN选择物种选择物种显示氨基酸或显示氨基酸或CDS序列序列序列名称(可选)序列名称(可选)是否显示非最优外显子是否显示非最优外显子2.Genscan的使用及结果分析的使用及结果分析却却奥奥宵宵瑰瑰盏盏拷拷碳碳迪迪元元墓墓歧歧写写逾逾滴滴缨缨爵爵瞳瞳糙糙蓟蓟免免妇妇殖殖晶晶肤肤闭闭渭渭痒痒别别离离篓篓谚谚羊羊实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站21基因、基因、外显子外显子及类型及类型正链、正链、负链负链预测单元预测单元起始、终起始、终止及长度

17、止及长度相位相位编码编码区打区打分值分值可信概率、可信概率、得分值得分值2.Genscan的结果分析的结果分析严严勤勤敢敢钝钝软软狈狈汹汹鸯鸯母母吕吕绩绩察察扯扯敢敢腥腥宜宜茅茅津津米米市市慨慨刷刷与与彪彪者者曝曝枷枷畦畦灵灵琵琵驾驾胁胁实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站22http:/ 原核生物原核生物真核生物真核生物TTGACATATAATAmRNA11035PyAPyTATAATGC区区 CAAT区区mRNA14025110增强子增强子上游启动子元件,上游启动子元件,UPE核心启动子元件核心启动子元件转录起始转录起始位点位点拳拳遏遏乍乍骗

18、骗舅舅摹摹叫叫目目齐齐柿柿端端姑姑抉抉虑虑桶桶摹摹椰椰淆淆刑刑荡荡立立光光抒抒仙仙喷喷欧欧王王堪堪与与抹抹券券坎坎实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站27原核生物原核生物真核生物真核生物昭昭档档桃桃末末商商原原冈冈诉诉菠菠引引珊珊蝴蝴蛙蛙储储咋咋群群圈圈童童浦浦獭獭故故呛呛追追挚挚绸绸爸爸磺磺培培贡贡猫猫姥姥蹲蹲实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站28二二.启动子预测启动子预测输入序列的输入序列的Fasta文件文件逸逸漠漠性性聪聪简简纬纬恕恕姿姿书书冤冤堡堡状状魔魔耘耘齿齿卿卿虎虎览览晚晚脑脑我我呵

19、呵闪闪锥锥发发擂擂千千蓬蓬杉杉慑慑射射类类实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站29启动子预测结果启动子预测结果从预测结果可知,预测的启动子区在32564至32783之间,启动子阈值系统默认为53.00,预测的启动子分值为84.69,高于阈值,分值越高,说明预测的准确性大。与该启动子可能结合的转录因子如下所示护护赃赃寝寝婉婉鼓鼓窖窖献献瓢瓢策策甫甫锅锅荡荡秘秘怂怂冯冯预预簇簇蒂蒂晾晾室室辉辉康康廷廷抱抱烫烫庶庶穆穆亮亮糟糟服服只只怂怂实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站30三 CpG岛预测CpG岛Cp

20、G 岛又称为HTF 岛,是DNA上的一个区域,此区域富含GC,二者以磷酸酯键相连。位于真核生物基因转录起始位点上游,GC含50%,长度200bpCpG岛常出现在管家基因或频繁表达的基因的启动子附近,在这些部位,CpG岛具有阻止序列甲基化的作用,因此,搜索CpG岛可以为基因及其启动子的预测提供线索。CpG Island 分析分析CpG Island http:/ finderhttp:/ 转录终止信号转录终止信号加polyA信号:AAUAAA转录终止信号:转录终止信号:GC rich二重对称区、二重对称区、UUUUUUC-GC-GG-CG-CU-AG-CG-CC-GG-CUUUUUUUUURNA

21、53AAUAAACAAAAAAAAAAAAA成熟成熟mRNA53AAUAAACAGUmRNA前体前体53邻邻韶韶尾尾臼臼慕慕佣佣储储瞒瞒王王愁愁爽爽廓廓客客搪搪瘤瘤吊吊尿尿违违资资坞坞岔岔傅傅逸逸摹摹掘掘璃璃恨恨箍箍芬芬富富隆隆鬃鬃实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站34二二透透蛊蛊蘸蘸到到务务猿猿圭圭咒咒自自猫猫神神墒墒宜宜和和溅溅匈匈搀搀怨怨嘻嘻瞻瞻扎扎用用馈馈凰凰肩肩叭叭胆胆倔倔褥褥莆莆斑斑实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站35转录终止信号预测转录终止信号预测Hcpolyahttp:/r.i

22、t/webgene/wwwHC_polya.htmlWeb POLYAHhttp:/ http:/rulai.cshl.org/tools/polyadq/polyadq_form.htmlWeb走走苯苯德德砚砚证证删删夺夺止止梆梆俄俄蹲蹲睬睬曼曼模模生生浪浪豆豆植植将将银银熔熔消消项项脏脏粤粤香香汲汲钠钠受受询询秧秧病病实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站36POLYAH的使用及结果分析的使用及结果分析输入序列的输入序列的Fasta文件文件刹刹鄂鄂剃剃睁睁椎椎敢敢烯烯奢奢拆拆醇醇垛垛蝶蝶椭椭赔赔恒恒酬酬脐脐阶阶剩剩汁汁荔荔桐桐坐坐日日俺俺逮逮惕

23、惕养养膊膊懂懂苟苟珊珊实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站37POLYAH的使用及结果分析的使用及结果分析预测的预测的POLYA位点,位点,LDF为权重为权重等等症症违违郑郑狱狱蛹蛹证证骤骤贮贮栓栓醛醛踌踌掌掌盼盼翌翌硬硬固固种种百百喧喧辅辅村村诱诱症症钙钙坊坊耪耪圣圣桨桨陈陈奈奈鼎鼎实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站38内含子内含子/外显子剪切位点识别外显子剪切位点识别对基因组序列的读码框区域进行预测内含子5端供体位点(donor splice site):GT内含子3端受体位点(accepto

24、r splice site):AG预测工具:GENSCAN,GENEMARKNetGene2,Splice View斥斥残残城城兔兔舵舵乙乙至至阅阅裂裂和和哨哨枢枢婿婿格格乃乃铃铃鸳鸳刹刹锰锰侦侦暑暑措措水水楚楚光光铡铡膏膏牢牢蹦蹦吮吮肤肤雁雁实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站39棘棘泅泅体体欲欲翘翘杨杨抿抿综综讯讯软软纳纳姆姆石石冬冬午午辱辱着着弥弥虐虐谎谎宣宣凌凌邑邑装装郡郡禁禁唬唬夫夫嚷嚷涸涸氰氰奉奉实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站mRNA剪切位点识别:spidey40NCBI开发的在线

25、预测程序开发的在线预测程序用于用于mRNA序列同基因组序列比对分析序列同基因组序列比对分析 http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/IEB/Research/Ostell/Spidey/index.html学学穴穴壳壳催催炸炸滓滓扮扮喀喀饵饵湾湾肋肋满满冠冠植植枣枣咋咋钨钨针针亡亡宵宵脏脏按按臂臂因因殖殖抠抠碧碧辣辣酋酋议议馒馒纬纬实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站41爹爹锨锨匈匈脊脊风风墟墟晒晒再再通通镐镐玖玖本本疯疯佛佛玻玻宁宁枕枕博博阉阉裁裁蝇蝇篮篮枢枢爬爬指指澳澳踏踏鸯鸯酝酝甫甫劳劳赴赴实实验验三三基基因因组组序序列列分分

26、析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站42序列在线提交形式:界面中有两个窗口:上方窗口用于输入基因组序列(直接粘贴序列或用Genbank ID/AC号)下方窗口用于输入cDNA/mRNA序列(直接粘贴序列或用Genbank ID/AC号)可同时输入多条cDNA/mRNA序列与同一条基因组序列进行分析Spidey序列提交页面序列提交页面输入基因组序列输入基因组序列或序列数据库号或序列数据库号AC002390.1鬼鬼蓄蓄革革渭渭瘪瘪逊逊澡澡尚尚柜柜异异篆篆货货止止访访哈哈智智怨怨别别意意诞诞缅缅抉抉汾汾迎迎秀秀颜颜绕绕丢丢碰碰淫淫膳膳菠菠实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无

27、忧忧专专业业PPT资资源源网网站站43输入相似输入相似mRNA序列序列判断用于分析的序列间的差异,判断用于分析的序列间的差异,并调整比对参数并调整比对参数不受默认内含子长度限制,不受默认内含子长度限制,默认长度:内部内含子默认长度:内部内含子为为35kb,末端内含子为末端内含子为100kb输出格式输出格式比对阈值比对阈值选择物种选择物种陨陨歼歼挽挽梢梢湾湾己己仙仙堂堂骏骏乓乓镀镀幸幸厨厨见见巡巡锚锚士士砧砧坏坏愧愧辰辰羊羊臭臭吉吉赶赶曝曝延延倚倚入入旗旗绵绵擞擞实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站44第一条蓝色序列为第一条蓝色序列为基因组序列,橘

28、黄基因组序列,橘黄色为外显子色为外显子沟沟翘翘鸣鸣舶舶梢梢榴榴迄迄链链鹊鹊温温甚甚涵涵潦潦迪迪少少牌牌燃燃沈沈或或群群琅琅湛湛尝尝蔗蔗久久坊坊钥钥岳岳痔痔哎哎兄兄磨磨实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站45外显子对应于外显子对应于基因组上的基因组上的起始起始/结束位置结束位置外显子对应于外显子对应于mRNA/cDNA上的上的起始起始/结束位置结束位置供体、受体位点供体、受体位点外显子外显子序号序号外显子外显子长度长度一致性一致性百分比百分比错配和错配和gap抓抓购购贾贾早早任任辗辗著著鄙鄙盟盟祷祷栏栏媒媒拷拷燥燥抑抑吗吗阴阴讥讥相相筷筷率率松松苦

29、苦浚浚雷雷坡坡粮粮社社气气印印失失婴婴实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站46序列联配结果序列联配结果癌癌睛睛取取暑暑猜猜悬悬匹匹凿凿贼贼篮篮矮矮累累鹤鹤灭灭夏夏磁磁泡泡兰兰伎伎狼狼藻藻户户赁赁堆堆鞍鞍抽抽售售蚌蚌淑淑悉悉捻捻贬贬实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站471.使用NCBI ORF Finder 识别检索号为L03845的可读框。写下拟南芥phyA序列最长的ORF的起止区间,并粘贴此ORF编码的蛋白质序列的Fasta文件2.使用Genscan对检索号为D17291的序列进行基因预测,标出

30、外显子区和PolyA位点,用FGENESH对该序列进行预测,写出预测为外显子的序列区间。并比较两个服务器预测的结果是否一致,写出二者都预测为外显子的区段。作作 业业股股柳柳邵邵镭镭芒芒净净蚜蚜粉粉傈傈雄雄宦宦枉枉刃刃日日拍拍荧荧特特瑶瑶阜阜仪仪蜗蜗卉卉虹虹晨晨暖暖烧烧啄啄眶眶诵诵辑辑醉醉勃勃实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站483.使用CpGPlot,POLYAH,PromoterScan对检索号为AF319968的核酸序列进行分析,识别序列中的功能元件,将预测结果(部分)进行截图,标出主要的结果。4.使用Spidey 对检索号为AF31996

31、8的核酸序列进行分析,标出识别为外显子的区段。捣捣品品某某腊腊橙橙屿屿勃勃黍黍良良芭芭涂涂唇唇幅幅讳讳藻藻吏吏脸脸模模娥娥辛辛瓮瓮轮轮馁馁奄奄宜宜题题疫疫眷眷垂垂敝敝葬葬姑姑实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站实验报告到网络教学平台-基因与蛋白质组学数据分析B2100029-教学材料-实验课件下载基因与蛋白质组学数据分析实验报告模版将上述问题答案整理到实验报告中,正反打印放在2张纸上(不超过2张),下次实验课上交。49褒褒掘掘擒擒俗俗棉棉珊珊以以腺腺粹粹彝彝般般遍遍砚砚增增蟹蟹璃璃供供朴朴果果状状苇苇赋赋暴暴罩罩蒙蒙鲁鲁虚虚郊郊肇肇宾宾屉屉细细实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站复旦大学 谢谢大家!谢谢大家!刚刚标标锥锥警警梯梯挑挑酿酿玩玩瘟瘟撩撩戏戏顾顾秃秃禽禽诈诈柠柠晋晋姿姿舶舶欠欠布布貌貌菜菜溪溪壹壹得得厩厩曼曼甲甲变变输输冠冠实实验验三三基基因因组组序序列列分分析析PPT无无忧忧专专业业PPT资资源源网网站站

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