2017-2021年厦门市分离的非结核分枝杆菌菌株类型及特征分析.pdf

周围软组织及股骨颈血供;采用前侧小切口切开,辅助器械顶压,受力部位精准,能达到快速复位,减少软组织损伤及破坏血供,尤其对G a r d e n、型骨折 .综上所述,半截石位辅助前侧小切口顶压复位治疗股骨颈骨折内固定手术能缩短手术时间及减少透射次数,有良好优势.术后患髋功能如何更好地恢复,推进E R A S,探索更简便有效、减少股骨头坏死几率的内固定手术方法有待临床进一步研究.参考文献陈泽铭,杨放,庞清江空心螺钉内固定治疗股骨颈骨折有限元分析 的 研 究 进 展 J现 代 实 用 医 学,():王德斌,毕郑刚内固定和关节置换治疗老年股骨颈骨折:如何体现个体化的精准治疗 J中国组织工程研究,():段明明,曹强,刘军,等 G型臂X线机在股骨颈骨折空心钉置入中的应用价值 J中国中西医结合外科杂志,():蔡乐益,郭晓山,郑文浩,等对G a r d e n指数作为股骨颈骨折复位质量评价标准的再认识 J中华创伤骨科杂志,():夏希,刘智老年人股骨颈骨折内固定治疗的研究进展 J中国骨伤,():周方股骨颈骨折治疗的热点与创新 J中华创伤骨科杂志,():L uQF,T a n gGL,Z h a oXJ,e t a l H e m i a r t h r o p l a s t yv e r s u si n t e r n a l f i x a t i o n i ns u p e r a g e dp a t i e n t sw i t hu n d i s p l a c e d f e m o r a ln e c kf r a c t u r e s:a y e a r f o l l o w u po f r a n d o m i z e dc o n t r o l l e d t r i a lJ A r c h i v e so fo r t h o p a e d i ca n dt r a u m as u r g e r y,():林振恩,郑竑,陈学生,等改良闭合复位技术治疗股骨颈骨折疗效分析 J中国骨伤,():方玮,杨文贵,韩雪昆,等半截石位经直接前入路空心钉联合内侧支撑钢板内固定治疗青壮年P a u w e l s型股骨颈骨折J中国骨与关节损伤杂志,():刘燕青,吴美珍,王建国,等无牵引床半截石位P F NA手术在股骨粗隆间骨折中的应用研究 J世界最新医学信息文摘,():牛会彬,刘中国,邓岗西 种C型臂X线机透视方法在股骨粗隆间骨折P F NA内固定术中应用比较 J中国骨与关节损伤杂志,():曾建伟,曹飞,陈鑫,等经直接前方入路切开复位与闭合复位治疗股骨颈骨折的疗效对比 J西部医学,():赵梁,郑明,林朝晖,等顶压撬拨技术在G a r d e n、型股骨颈骨折闭合复位内固定术中的应用 J中国骨与关节损伤杂志,():临床研究 年厦门市分离的非结核分枝杆菌菌株类型及特征分析厦门大学附属第一医院肺科(厦门 )陈宇翔姚向阳姜丹丹通信作者【摘要】目的研究厦门市非结核分枝杆菌(N TM)的菌种分布情况,并分析其流行特征,为临床诊疗和流行病学研究提供一定的参考依据.方法从厦门市结核病定点医院结核病实验室 年开展常规培养的菌株中,收集到 株分枝杆菌菌株,通过P N B、T CH培养基生长试验和基因芯片菌种鉴定,获得非结核分枝杆菌感染者的菌种分布数据,使用S P S S 软件对数据进行描述统计和卡方检验;对芯片结果双信号的菌株,进行G e n e X p e r t检测,获得混合感染的数据.结果非结核分枝杆菌(N TM)分离率为 ,归属于 名患者,检出共计 种非结核分枝杆菌,居前位者为胞内分枝杆菌、龟/脓肿分枝杆菌、鸟分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌;N TM患者存在与结核分枝杆菌的混合感染;N TM患者男占比 ,女占比 ,岁以上最多(),其次是 岁(),岁最少();在感染不同生长型非结核分枝杆菌上,存在性别差异(,P )和年龄差异(,P ).结论 年厦门市临床N TM分离率较高,菌种分布多样,混合感染水平较低;不同生长型N TM感染存在性别特征和年龄特征.【关键词】非结核分枝杆菌;分离率;菌种分布;混合感染;年龄;性别【中图分类号】R 【文献标识码】B【文章编号】()福建医药杂志 年月第 卷第期F u j i a nM e dJ,J u n e ,V o l ,N o 非 结 核 分 枝 杆 菌(n o n t u b e r c u l o u s m y c o b a c t e r i a,NTM)系指除结核分枝杆菌复合群和麻风分枝杆菌以外的一大类分枝杆菌的总称.NTM作为环境微生物,普遍存在于我们生活的环境中,如水、土壤、灰尘等.迄今为止,共发现NTM菌种 余种,其中大部分为寄生菌,仅少部分对人体致病,且在易感个体中引起肺、腔窦、淋巴结、关节、中枢神经系统等以及导管相关性感染和播散性感染.近 年来,在世界范围内,NTM的检出率呈上升趋势,NTM病也逐渐受到越来越多的关注.为了解厦门市临床分离菌株中NTM的菌种类型分布情况,本研究对我院 年月至 年 月间 株分枝杆菌菌株进行菌种鉴定,以期了解厦门市临床分离菌株中NTM的流行特征.资料与方法 菌株来源及研究设计:通过收集 年间厦门市唯一结核病定点收治医院(厦门大学附属第一医院杏林院区)收治的 名结核疑似患者的B A C T E C MG I T 培养结果(份),整理得到涵盖了 名患者的 株分枝杆菌菌株(阳性率 ),对 份培养阳性菌株进行硝基苯甲酸(P N B)、噻吩 羧酸肼(T CH)培养基生长试验初步鉴定后,将分离得到的NTM菌株,进行分枝杆菌菌种芯片鉴定,获得的鉴定结果按患者进行归类整理,同时分析芯片信号,对基因芯片 结 果 含 有 结 核 分 枝 杆 菌 信 号 的 菌 株 进 行G e n e X p e r t检测,获得混合感染的数据.最后按患者感染NTM的情况,运用S P S S 软件进行统计分析.主要试剂与仪器:博奥基因芯片分枝杆菌菌种鉴定试剂(成都博奥晶芯生物科技有限公司);E x t r a c t a c t o r 核酸快速提取仪、L u x S c a n K B微阵列芯片扫描仪及配套仪器(博奥生物集团有限公司);P N B培养基及T CH培养基(珠海贝索生物技术 公 司);G e n e X p e r t MT B/R I F检 测 仪(美 国C e p h i e d公 司);X p e r t结 核 分 枝 杆 菌 测 试 剂 盒(C e p h e i d A B瑞 典 赛 沛 公 司);G e n e X p e r t MT B/R I F检测仪(美国C e p h e i d公司).实验方法:P N B和T CH生长实验:分枝杆菌培养阳性菌株经传代获得足够的活性良好菌落.按照 结核病实验室检验规程的要求运用P N B、T CH对培养阳性菌株进行菌种的初步鉴定.每周记录菌落的生长状况,缓慢生长分枝杆菌一般需要周可出现肉眼可见菌落,快速生长分枝杆菌仅需周左右便可出现肉眼可见菌落.基因芯片检测:基因的提取、扩增、杂交均严格按博奥鉴定试剂盒的操作步骤要求进行,芯片使用L u x S c a n K B微阵列芯片扫描仪和晶芯软件进行信号的读取及结果的判读.G e n e X p e r t检测:将标本与消化液以的比例加入无菌干燥离心管中,振荡,使标本充分液化,室温静置 m i n.吸取m L处理后的样品于G e n e X p e r t MT B/R I F样品盒中,将样品盒扫描二维码,录入信息,放入G e n e X p e r t MT B/R I F仪器中,h后读取记录结果.质量控制:实验人员均获得P C R检测资质并接受严格、系统的培训使其掌握实施方案,完成各项操作,进行结果判断.实验过程均做阴性、阳性质量控制.统计学方法:应用S P S S 软件对收集的实验数据进行描述统计和卡方检验,P 表示差异有统计学意义.结果 分枝杆菌鉴定结果:年,从我院由 男 性 名()和 女 性 名()组成的 名疑似结核患者的 份标本培养中,得到 名(男性 名,女性 名)患者的 株分枝杆菌菌株,培养阳性率为 (阳性标本数/标本数).经鉴定,有 株为N TM,分离率为 (/).这些菌株归属于 名患者,占分枝杆菌培养阳性患者的 (/).其中,分枝杆菌培养阳性患者中,女性检出率 ,男性检出率 .名患者中,NTM的 感 染 率 (/);其中 名患者存在与结核分枝杆菌的混合感染,占NTM患者的 .例N TM患者的基本情况:例NTM患者 中,男 性 例(),女 性 例(),患 者 年 龄 ()岁,男女患者平均年龄分别为()岁和()岁.从表可以看出,以 岁为间隔,对年龄进行分组,显示 岁以上老年人最多,其次是 岁的中年人,岁的青年人最少,NTM患者中以中老年人多见.福建医药杂志 年月第 卷第期F u j i a nM e dJ,J u n e ,V o l ,N o 表不同性别N TM患者的年龄分布情况 例()性别 岁 岁 岁以上总计男()()()()女()()()()总计()()()()N TM菌种分布基本情况:在 例NTM患者中,共检出 种非结核分支杆菌.根据 伯杰细菌鉴定手册的分类标准,将分枝杆菌菌种分成快速生长非结核分枝杆菌(R GM)和缓慢生长非结核分枝杆菌(S GM)两大类,对数据进行描述统计,从表可以看出,S GM占比 ,R GM占比 .居前位的有胞内分枝杆菌、龟/脓肿分枝杆菌、鸟分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌.表 例N TM患者的菌种分布菌种类型例数构成比/快速生长非结核分枝杆菌 龟/脓肿分枝杆菌 偶然分枝杆菌 草分枝杆菌 耻垢分枝杆菌 缓慢生长非结核分枝杆菌 胞内分枝杆菌 鸟分枝杆菌 堪萨斯分枝杆菌 瘰疬分枝杆菌 土分枝杆菌 不产色分枝杆菌 戈登分枝杆菌 海/溃疡分枝杆菌 蟾蜍分枝杆菌 未定型分枝杆菌 总计 注:未定型分枝杆菌 为 未 在 试 剂 盒 检 测 范 围 的 非 结 核 分 枝杆菌.此外,实验获得胞内分枝杆菌和结核分枝杆菌混合感染例(),龟/脓肿分枝杆菌和结核分枝杆菌混合感染例(),鸟分枝杆菌和结核菌混合感染例(),戈登分枝杆菌和结核分枝杆菌混合感染例(),的NTM病患检出混合感染的情况.不同性别、年龄感染N TM菌种的差异情况:采用卡方检验,对不同年龄段、不同性别在感染不同生长型非结核分枝杆菌中的差异进行分析.从表可以看出,名NTM患者除去名未定型患者后,在感染不同生长型非结核分枝杆菌上,存在性别差异和年龄差异.就S GM而言,男性感染人数明显多于女性感染人数,岁感染人数和 岁以上感染人数均明显多于 岁感染人数;就R GM而言,女性感染人数明显多于男性感染R GM人数,岁感染人数和 岁以上感染人数均明显多于 岁感染人数.另外,经统计,岁以上S GM感染者占总S GM感染者的 ,岁以上R GM感染者也占到总R GM感染者的 .表不同生长型N TM在性别、年龄上的差异项目S GMR GM值P值性别 男例数 ()a()aA R 女例数 ()b()bA R 年龄 岁例数()a()aA R 岁例数 ()b()bA R 岁以上例数 ()b()bA R 注:A R为调整后的残差.表格中以字母上标标注出各组两两比较的结果,如果上标字母相同,则表示类别列比例相互之间差异无统计学意义;如果字母不同,则表示类别列比例之间差异有统计学意义.讨论本研究采用的博奥基因芯片分枝杆菌菌种鉴定试剂,是被临床较普遍使用的商品化鉴定试剂.与传统的表型和生化实验方法相比,基因芯片鉴定可在较短时间内鉴定结核分枝杆菌复合群和常见非结核分枝杆菌致病菌,且具有较高的特异度和敏感度.本研究通过此鉴定方法,获得患者的NTM感染的菌种或群数据,发现如下特点.较高的分离率及低水平的混合感染:本研究显示,厦门市 年NTM菌株的分离率为 ,与黄明翔等报道的 年福建省NTM分离率 相近,与处于北方地区的 年 北 京 的 分 离 率和 年 安 徽 的分离率相比则较高.第次结核病流行病学调查显示:NTM感染存在地域差异,且与气候环境相关,呈现东部沿海地区高于内地,南方地区高于北方地区,气候温和地区高于寒冷地区的流福建医药杂志 年月第 卷第期F u j i a nM e dJ,J u n e ,V o l ,N o 行特点.厦门位处东南沿海,气候温暖湿润,符合上述特征.厦门地区较高的分离率应该引起我们的足够重视.本研究 NTM患者存在非结核分枝杆菌与结核分枝杆菌混合感染的情况,这与此前林建等报道的福建 和陈晓红等报道的福州的混合感染率相近.虽然混合感染率不高,但值得注意的是,混合感染在临床治疗中难度较大,不可轻视.临床医生与实验室工作人员应紧密合作,灵活运用多种检测手段,多次检测,去及时发现、分析感染的真实情况,以便能及时调整用药,避免诊治的延误.N TM菌种呈多样性分布:本研究鉴定出了 个菌种,主要优势菌种有胞内分枝杆菌、龟/脓肿分枝杆菌、鸟分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌和偶然分枝杆菌;缓慢生长菌是主要的生长型,群鸟分枝杆菌复合群(MA C)占 ,为厦门市的主要感染菌.S i m o u s等对 篇关于亚洲分离株的流行病学和临床相关性英文文献进行汇总分析,发现亚洲MA C肺病占,为最常见;其次为R GM病,占.可见,厦门地区MA C、R GM为主要感染菌的研究结果与亚洲的主要特征相符.我国也有很多关于NTM的研究,在与厦门气候相近的中国台湾台北市,主要 菌种包括MA C 、脓肿 分 枝 杆 菌 、偶 然 分 枝 杆 菌 、堪萨斯分枝杆菌 .详细对比发现,中国台湾的主要菌种也为MA C和R GM,但是R GM排在MA C之前,为主要感染菌群,且偶然分枝杆菌占比较厦门()高得多.张洁等 报道北京的情况,MA C ,虽然仍然排第位,但是R GM却排在堪萨斯之后,仅 .对比陈忠南等 报道 年湖南主要的NTM,发现湖南虽然以MA C为主,但是胞内分枝杆菌的感染占比少了 .对比洪创跃等 报道的深圳市NTM菌种情况,深圳检出的菌种数量较少,以R GM()为主要感染菌,MA C则仅为 ,厦门则呈现菌种分布广的特点.以上研究反映了,NTM的流行有明显的区域差异.林建等 年间做了福建NTM多样性分布的研究,笔者对比后发现:其优势菌中的胞内分枝杆菌()、鸟分枝杆菌()在感染中的占比与本研究有较大差异.由于林建等人的研究未提及其菌种的各地市抽样数据,是否闽南NTM的菌种分布具有显著区域特征,有待研 究明确.N TM感染存在年龄、性别差异:本研究发现我市NTM的感染以中老年为主,且存在年龄和性别差异.聂琦等 对NTM病流行病学方面的研究进展进行综述后提出,NTM感染发病与年龄和性别关系密切,老年人发病率明显升高,S GM感染与年龄呈现正相关,其中一半患者年龄在 岁以上.这一表述与本研究结果相一致.另外,广州胸科医院的研究显示女性更容易感染R GM,也与本研究结果也相一致.NTM感染的年龄差异,与免疫系统随着年龄的改变有关.先天免疫系统中,从T o l l样受体功能到中性粒细胞胞外诱捕形成的过程通常在老年人中减少,同时在适应性免疫中,T细胞和B细胞亚群构成与功能也随年龄而改变.此外,呼吸系统在吸烟、环境和其他病理因素的作用下,随着年龄增加逐渐发生结构改变,使得人体对NTM更为易感.再有,老年人可能更多地接受支气管插管等介入性操作,更多地接触到被NTM污染的水源,增加了被感染的几率.NTM生长型在性别上的差异可能与S GM和R GM感染过程中免疫应答的差异有关,女性对感染和疫苗接种表现出比男性更强的细胞介导的免疫反应,这种免疫差异可能对S GM感染的影响大于R GM感染,.本研究虽然将厦门近年NTM患者的菌株进行了研究分析,获得了本地区NTM分离率、NTM患者的菌种分布和年龄、性别特征等流行病学资料,但是仍然存在以下不足:)受实验室条件所限,没能开展更多可鉴定菌种的检测方法,来对芯片鉴定结果进行对照分析,并且本研究尚有株NTM在试剂盒鉴定范围之外,未明确具体为何种NTM菌,后续将寻求解决方案;)本研究纳入分析的NTM患者,鉴定结果存在跨年度情况,分析年度分离率变化和感染特征较为困难,后续笔者计划拉长时间间隔,进行研究分析;)通过菌株来分析NTM的感染情况,不可避免地存在极少数病例培养阴性而漏诊的情况,后续将增加临床标本的直接鉴定,补充不足,为本地区NTM流行病学研究提供更多基础数据.参考文献中华医学会结核病学分会非结核分枝杆菌病诊断与治疗指南(年版)J中 华 结 核 和 呼 吸 杂 志,():中华医学会结核病学分会,中华结核和呼吸杂志编委会非结核分枝杆菌病诊断与治疗专家共识 J中华结核和呼吸杂福建医药杂志 年月第 卷第期F u j i a nM e dJ,J u n e ,V o l ,N o 志,():赵雁林,逄宇结核病实验室检验规程 M北京:人民卫生出版社,:黄明翔,万康林,陈力舟,等福建省临床分离非结核分枝杆菌菌种分布研究 J中国人兽共患病学报,():杨新宇,张洁,易俊莉,等 和 年北京市非结核分枝杆菌流行特征比较 J首 都 公 共 卫 生,():包训迪,江跃,梁锁,等安徽省非结核分枝杆菌临床分离率及人群分 布 和 耐 药 性 分 析 J中 国 防 痨 杂 志,():林建,林淑芳,赵永,等福建省 株非结核分枝杆菌的菌种鉴定分析 J中国防痨杂志,():陈晓红,廖小琴,吴迪,等福州地区非结核分枝杆菌肺病临床特征 J中国感染控制杂志,():S i m o n s,S,V a nI n g e nJ,H s u e hPRN o n t u b e r c u l o u sm y c o b a c t e r i ai nr e s p i r a t o r yt r a c ti n f e c t i o n s,e a s t e r n A s i aJE m e r g i n gI n f e c t i o u sD i s e a s e s,():陈盟勋,郭金龙,王筱筠,等以D 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m【摘要】目的分析儿童细菌性腹泻常见病原菌临床特征及耐药性差异,为临床抗感染治疗提供依据.方法收集 例感染性腹泻儿童粪培养分离的病原菌及临床资料,法国梅里埃V I T E K 全自动微生物鉴定及药敏分析仪行鉴定和药敏试验,WHON E T 软件进行耐药性分析.结果感染沙门菌和致病性大肠埃希菌的患者都出现发热、呼吸道感染和胃肠道症状;感染沙门菌的患者病程长,排便次数多,粪常规脓球比例增加,血常规白细胞和C反应蛋白(C R P)明显升高;而感染致病性大肠埃希菌的患者病程短,排便次数少,血常规白细胞和C R P轻度升高,气单胞菌无明显症状且病程短,血常规白细胞明显升高但C R P正常.沙门菌和致病性大肠埃希菌耐药性明显高于气单胞菌,种菌对碳青霉烯类和头孢哌酮/舒巴坦都 敏感.结论医师可根据临床症状和快速实验室检查大致判断腹泻感染病原菌类型,在培养结果未出来之前根据以往的耐药监测数据经验用药.【关键词】儿童细菌性腹泻;临床特征;耐药性【中图分类号】R 【文献标识码】B【文章编号】()腹泻在全球造成 多万人死亡,在岁以下儿童死亡原因中排第位,细菌感染占据,是儿童腹泻最常见的病因.儿童细菌性腹泻的金标准是细菌培养,但培养时间较长,而严重的腹泻会引起脱水,危及儿童生命,所以需要比较快速地临床初步诊断并进行经验用药.目前对临床常见致泻病原菌的临床症状、实验室检查、药敏情况进行综合分析和鉴别诊断的研究较少.本文对我院收治的 例感染性腹泻儿童常见的种病原菌的临床特征及耐药性差异进行回顾性分析,为临床感染性腹福建医药杂志 年月第 卷第期F u j i a nM e dJ,J u n e ,V o l ,N o