分子生物学细胞核基因组.pptx

1.1 核基因组大小核基因组大小1.2 重复序列重复序列1.3 基因家族基因家族1.4 真核基因的断裂结构真核基因的断裂结构1细胞核基因组1.1 核基因组大小 一一个个物物种种中中所所包包含含的的基基因因就就是是一一个个基基因因组组，确确切切地地说说，基基因因组组是是指指一一个个物物种种的的单单倍倍体体的的染染色色体体所所包包含含的的全全部部基基因因。对对于于只只有有一一个个染染色色体体的的原原核核生生物物来来说说，它它的的一一个个细细胞胞中中（一一个个染染色色体体）的的全全部部基基因因组组成成其其基基因因组组；对对于于通通常常的的二二倍倍体体生生物物来来说说，是是指指能能维维持持配配子子或或配配子子体体正正常常功功能能的的最最低低数数目目的的一一套套染染色色体体所所包包含含的的全全部部基基因因。真真核核生生物物基基因因组组包包括括核核基基因组和细胞器基因组。因组和细胞器基因组。衡量基因组大小的单位 一一个个真真核核生生物物的的核核基基因因组组的的大大小小可可以以通通过过化化学学分分析析、DNA复复性性动动力力学学等等方方法法进进行行测测定定。如如果果一一个个DNA分分子子（双双链链）重重1pg（1012g），就就意意味味着着它它长长约约31cm，含含有有10 9 bp（base pair，碱碱基基对对），分分子量为子量为6.11011道尔顿。道尔顿。C值的概念 一一个个单单倍倍体体基基因因组组的的DNA含含量量是是恒恒定定的的，它它代代表表着着一一个个生生物物种种的的特特征征，称称为为物物种种DNA的的C值值。C值值可可以以用用pg为为单单位位表表示示，也也可可以以用用bp为为单单位位表表示示。各各种种生生物物的的C值值相相差差很很大大，并并有有随随着着有有机机体体复复杂杂度度增增加加而而C值值增增大大的的趋趋势势，说说明明随随着着有有机机体体复复杂杂度度的的增增加加，对对遗遗传传物物质质DNA量量的的需需要要也也随随之之增增加加。DNA是是遗遗传传信信息息的的载载体体，较较复复杂杂的的有有机机体体需需要要较较多多的的遗遗传传信信息息是好理解的。是好理解的。表表11 一些生物物种的一些生物物种的DNA质量质量生物物种生物物种DNA质量质量（2C值）值）/pg染色体数染色体数（2n）生物物种生物物种DNA质量质量（2C值）值）/pg染色体数染色体数（2n）两栖鲵两栖鲵168.024贝母贝母196.724蝾螈蝾螈85.324百合百合72.224赤蛙赤蛙10.926小麦小麦34.614牛牛6.460玉米玉米11.020人人6.446烟草烟草7.824羊羊5.754油菜油菜3.238鼠鼠5.040水稻水稻2.024果蝇果蝇0.28亚麻亚麻1.430拟南芥拟南芥0.1410粘菌粘菌0.384（1C）7（1n）大肠杆菌大肠杆菌0.0040酵母酵母0.026（1C）15（1n）噬菌体噬菌体0.000055图图11 不同有机体的不同有机体的C值大小值大小C值悖论 一一般般来来说说，一一种种生生物物的的形形态态学学复复杂杂性性应应该该与与其其C值值的的大大小小大大致致相相关关，因因为为一一种种生生物物的的形形态态学学复复杂杂性性必必然然是是它它基基因因复复杂杂性性的的反反映映。然然而而仔仔细细研研究究有有机机体体复复杂杂度度和和C值值的的关关系系，就就会会发发现现难难以以解解释释的的问问题题。如如人人与与两两栖栖动动物物C值值的的比比较较。另另外外，一一些些密密切切相相关关的的种种属属的的C值值呈呈现现出出惊惊人人的的差差异异，如如两两栖栖类类动动物物中中C值值可可相相差差50倍倍，豆豆科科植植物物中中的的蚕蚕豆豆比比百百脉脉根根的的C值值大大100倍倍。只只有有低等生物的情况符合这种设想。这就是低等生物的情况符合这种设想。这就是C值悖论。值悖论。对基因数目的估计 通通过过估估计计不不同同种种类类mRNA的的数数目目，可可以以估估计计出出一一个个特特定定哺哺乳乳动动物物细细胞胞中中能能表表达达的的基基因因总总数数约约为为10,000个个，考考虑虑到到不不同同细细胞胞类类型型有有些些不不同同的的基基因因表表达达，我我们们可可以以认认为为哺哺乳乳动动物物细细胞胞基基因因组组有有功功能能的的基基因因数数目目在在30,00040,000个个之之间间。假假设设哺哺乳乳类类基基因因的的平平均均大大小小为为5,0008,000bp（它它们们实实际际上上比比大大多多数数已已知知的的基基因因要要长长些些），根根据据C值值计计算算，哺哺乳乳类类基基因因组组中的基因数目理论上应在中的基因数目理论上应在40万万60万个之间。万个之间。对基因数目的估计 果果蝇蝇必必需需的的基基因因总总数数约约为为5000个个，由由于于对对昆昆虫虫基基因因大大小小的的合合理理估估计计为为2,000bp，那那么么，5,000个个基基因因的的总总长长度度为为107bp，而而果果蝇蝇的的C值值为为108bp。这这些分析说明，基因组中大部分些分析说明，基因组中大部分DNA是不表达的。是不表达的。DNA变性 在在受受到到加加热热、高高浓浓度度盐盐处处理理时时，DNA双双螺螺旋旋碱碱基基配配对对结结合合的的氢氢键键会会断断裂裂，双双螺螺旋旋链链分分开开成成单单链链，这这个个过过程程称称为为变变性性（denaturation）或或解解链链作作用用（melting）。）。DNA的热变性增色效应 核核酸酸中中的的碱碱基基有有很很强强的的紫紫外外吸吸收收，它它的的吸吸收收峰峰在在260nm。当当DNA以以双双螺螺旋旋形形式式存存在在时时，浓浓度度为为50g/ml的的A260=1.00（光光径径1cm），变变性性成成单单链链后后，同同样样浓浓度度的的核核酸酸溶溶液液的的A260=1.37，这就是增色效应。，这就是增色效应。影响Tm值的因素 G-C对对含含量量越越高高，Tm就就越越高高，G-C对对含含量量每每增增加加1%，Tm大大约约增增加加0.4。在在近近似似生生理理条条件件下下，DNA的的Tm一一般般在在8595之之间间。溶溶液液中中的的离离子子强强度度对对Tm有有很很大大影影响响，在在一一定定的的范范围围内内，一一价价阳阳离离子子浓浓度度每每增增加加10倍倍，Tm增增加加16.6。若若要要降降低低Tm，可可加加入入甲甲酰酰胺胺，因因为为甲甲酰胺能降低氢键的稳定性。酰胺能降低氢键的稳定性。复性与杂交 在在适适宜宜的的条条件件下下，两两条条分分开开的的互互补补链链可可重重新新形形成成双双螺螺旋旋，这这个个反反应应称称为为复复性性（renaturation）。使使两两条条互互补补的的单单链链形形成成双双螺螺旋旋的的过过程程称称为为退退火火（anneal）。两两条条不不同同来来源源的的互互补补单单链链经经退退火火形形成成双双链链的的反反应应称称为为杂杂交交（hybridization），杂杂交交可可以以在在DNA单单链链之之间间进进行行，也也可可以以在在DNA单单链链和和RNA单链之间进行。单链之间进行。复性动力学 复复性性动动力力学学指指的的是是复复性性核核酸酸的的量量随随着着时时间间变变化化的的情情况况。它它可可以以用用来来检检测测DNA的的复复杂杂性性。高高度度重重复复序序列列多多则则复复杂杂性性低低，单单一一序序列列多则复杂性高。多则复杂性高。复性动力学的测定 首首先先将将纯纯化化的的DNA通通过过高高速速搅搅拌拌或或小小孔孔喷喷射射，以以取取得得大大小小均均匀匀的的片片段段；100瞬瞬间间处处理理后后（使使其其变变性性）迅迅速速冷冷却却到到适适当当温温度度复复性性，如如温温度度控控制制在在低低于于Tm 20左左右右，在在标标准准的的磷磷酸酸缓缓冲冲液液中中保保温温，每每隔隔一一定定时时间间测测定定DNA复复性性的的数数量。量。复性动力学的测定 测测DNA复复性性的的方方法法有有两两种种，一一种种是是测测A260的的变变化化，另另一一种种是是用用羟羟基基磷磷灰灰石石柱柱分分离离双双链链和和单单链链DNA，双双链链DNA吸吸附附而而单单链链DNA流流出出，再测定流出单链再测定流出单链DNA的量。的量。复性动力学方程的推导 DNA复复性性取取决决于于两两条条单单链链的的随随机机碰碰撞撞，因因此此它它遵循二级反应动力学，其反应符合下列方程式：遵循二级反应动力学，其反应符合下列方程式：式式中中C为为时时间间t t时时，单单链链DNA的的浓浓度度；k k为为反反应应速速度常数。度常数。，（2），（1）当复性完成一半时，当复性完成一半时，带入（，带入（1 1）式得）式得 ，复性动力学方程的推导复性动力学方程的意义 从从（1）式式和和（2）式式可可以以看看出出，控控制制复复性性反反应应的的参参数数是是单单链链DNA初初始始浓浓度度 和和复复性性时时间间 的的乘积，称为乘积，称为 。越大，越大，越小。越小。（1）（2）简单基因组的Co o t曲线横坐标横坐标C 0 0 tC0t1/2值与基因组大小的比例关系 可可以以作作为为衡衡量量一一个个基基因因组组大大小小的的尺尺度度，但但必必须注意前提条件须注意前提条件（非重复序列）（非重复序列）。真核生物基因组的单一序列和重复序列 当当基基因因组组中中存存在在有有重重复复序序列列时时，情情况况就就复复杂杂了了。由由于于重重复复序序列列相相互互碰碰撞撞的的几几率率较较高高，复复性性速速率率也也就就较较快快。既既有有单单一一序序列列又又有有重重复复序序列列的的基基因因组的组的 曲线会出现若干个拐点。曲线会出现若干个拐点。假设的真核基因组的Cot曲线 三三个个部部分分的的表表观观 分分别别为为0.0013、1.9和和630，分别占基因组的百分数为分别占基因组的百分数为25%、30%和和45%。高度重复序列高度重复序列中度重复序列中度重复序列单一序列单一序列重复序列单位长度的计算 为为了了推推算算每每一一部部分分DNA所所对对应应的的bp数数，必必须须把把每每一部分当成独立的组成来考虑。三个部分的实际一部分当成独立的组成来考虑。三个部分的实际应应 为为 0.001325%=0.00033，1.930%=0.57，63045%=283。以以大大肠肠杆杆菌菌的的 =4.0作作为为标标准准，则三个部分的则三个部分的bp数应为（视作单一序列）：数应为（视作单一序列）：重复频率的计算 以以上上三三个个结结果果为为动动力力学学复复杂杂长长度度。此此模模式式基基因因组的复杂度记为组的复杂度记为“3.01086.0105340 bp”重复频率（重复频率（f）=化学复杂长度化学复杂长度动力学复杂长度动力学复杂长度 用用化化学学法法测测得得的的DNA总总长长度度为为7.0108 bp，其其中中25%为为1.75108 bp，30%为为2.1108 bp，45%为为3.15108 bp。这这三三个个结结果果为为化化学学复复杂杂长长度度。代代入入上上式式可可以以计计算算出出三三部部分分的的重重复复频频率率分分别别为为500,000、350、1。重复频率的计算 在在同同一一条条复复性性曲曲线线中中，任任何何两两个个组组分分的的重重复复频频率率和和它它们们的的表表观观 成成反反比比关关系系。因因此此，如如果果我我们们假假设设非非重重复复组组分分DNA确确实实是是单单拷拷贝贝的的（f=1），那那么可以用下式计算其它重复组分的重复频率。么可以用下式计算其它重复组分的重复频率。（这里的（这里的 应为表观应为表观 ）非重复序列 在在基基因因组组中中只只有有一一个个拷拷贝贝的的序序列列称称为为单单一一序序列列或或非非重重复复序序列列。在在原原核核细细胞胞基基因因组组中中，都都是是非非重重复复序序列列；而而在在真真核核细细胞胞基基因因组组中中，非非重重复复序序列列占占有有不不同同的的比比例例。用用从从烟烟草草叶叶子子mRNA制制备备的的cDNA与与不不同同 部部分分的的烟烟草草基基因因组组变变性性DNA杂杂交交试试验验观观察察到到，杂杂交交只只在在单单一一序序列列DNA组组分分中中形形成成，这这表表明明烟烟草草叶叶子子中中表达的基因大部分是单一序列基因。表达的基因大部分是单一序列基因。表达基因的比例 比比较较单单一一序序列列的的总总bp数数和和表表达达的的bp数数可可以以发发现现，表表达达的的基基因因只只占占单单一一序序列列总总量量的的很很少少一一部部分分，在在烟烟草草中中这这个个比比例例为为5%。单单一一序序列列中中有有很很多多是是非非编编码码序序列列，如如调调控控序序列列、内内含含子子等等，还还有有沉沉默默基基因。因。1.2 重复序列 基基因因组组中中具具有有2个个以以上上拷拷贝贝数数的的序序列列称称为为重重复复序序列列，其其中中有有些些重重复复序序列列是是有有编编码码功功能能的的，如如rRNA基基因因、tRNA基基因因、人人的的珠珠蛋蛋白白基基因因、组组蛋蛋白白基基因因等等。大大部部分分重重复复序序列列是是没没有有编编码码功功能能的的。根根据据重重复复频频率率的的大大小小，又又将将重重复复序序列列分分为为中中度度重重复复序序列列和高度重复序列。和高度重复序列。图图14 不同生物基因组中不同生物基因组中 不同序列组分的比例不同序列组分的比例重复序列家族 基基因因组组中中（真真核核细细胞胞）含含有有许许多多重重复复序序列列家家族族，每每个个家家族族含含有有数数目目不不等等的的成成员员，各各个个家家族族之之间间成成员员的的大大小小也也不不一一样样。要要注注意意的的是是。同同一一家家族族成成员员之之间间的的序序列列不不一一定定完完全全一一样样，可可以以是是具具有有很很高高的的同同源源性性、并并具具有有某某些些共共同同特特点点的的序序列列。人人类类基基因因组组中中有有一一个个Alu序序列列家家族族，它它有有3105个个成成员员，每每个个成成员员长长300bp；在在170bp处处均均有有AGCT序序列列，此此序序列列是是Alu内内切切酶酶的的识识别别序序列列，经经Alu内内切切酶酶可可切切割割成成170bp和和130bp两两个个片片段段；各各成成员员之之间间有有87%的的同同源源性性。在在人人类类基基因因组组中中它它散散布布在在非非重复序列之间重复序列之间（散布重复）（散布重复），它有什么功能还不清楚。，它有什么功能还不清楚。串联重复序列图图15 小麦小麦rRNA基因大转录单位的基因大转录单位的 串联重复排列串联重复排列rRNA基因大转录单位的数目和分布 在在典典型型的的作作物物中中，每每个个基基因因组组含含有有5000个个这这样样的的成成员员；而而在在大大多多数数动动物物基基因因组组中中，含含有有100200个个这这样样的的成成员员。这这些些串串联联的的成成员员可可以以只只存存在在于于一一个个染染色色体体上上，也也可可以以存存在在于于两两个个染染色色体体上上。如如拟拟南南芥芥中中rDNA串串联联重重复复存存在在于于2号号和和4号号染染色色体体上上，占占核核基基因因组组的的8%；而而玉玉米米中中只只存存在在于于1个个染染色色体体上上。转转录录时时三三个个编编码码基基因因合合在在一一起起，转转录录出出一一个个45S的的前前体体rRNA，然然后后从从中中剪剪切切出出5.8S、18S和和25S rRNA，所所以以三三者者是是等等当当量产生的。量产生的。卫星DNA 当当把把生生物物体体中中提提取取的的DNA进进行行氯氯化化铯铯密密度度梯梯度度离离心心，达达到到平平衡衡时时，不不同同浮浮力力密密度度的的DNA形形成成不不同同的的区区带带。DNA所所含含的的G+C对对比比例例越越高高，则则浮浮力力密密度度越越大大；A+T对对比比例例越越高高，则则浮浮力力密密度度越越小小。核核基基因因组组DNA的的氯氯化化铯铯密密度度梯梯度度离离心心结结果果显显示示，在在某某一一浮浮力力密密度度处处有有一一条条DNA的的主主带带，在在其其上上下下有有一一条条或或几几条条次次带带，这这些些次次带带称称为为卫卫星星DNA。对对卫卫星星DNA进进行行复性动力学分析表明，它们是高度重复序列。复性动力学分析表明，它们是高度重复序列。Satellite DNA卫星DNA 卫卫星星DNA一一般般是是串串联联的的重重复复序序列列，而而中中度度重重复复序序列列（转转座座子子和和逆逆转转录录转转座座子子）一一般般是是散散在在分分布布序序列列。用用原原位位杂杂交交和和放放射射自自显显影影，发发现现大大部部分分卫卫星星DNA位位于于染染色色体体着着丝丝粒粒附附近近或或其其端端粒粒区区。卫卫星星DNA常常位位于于分分裂裂间间期期核核的的异异染染色色质质区区，而而异异染染色色质质区区是是不表达的区域。不表达的区域。卫星DNA举例 鼠鼠富富含含A+T的的卫卫星星DNA，占占鼠鼠总总核核DNA的的10%左右，它由左右，它由20bp长的重复单位组成，其序列为长的重复单位组成，其序列为AAATTGCATAGATTTTGAATT TTAACGTATC TAAAACTTA 甜甜瓜瓜卫卫星星DNA由由基基本本的的400bp序序列列组组成成，重重复复次数约次数约10 6。从从 拟拟 南南 芥芥 中中 分分 离离 到到 3个个 卫卫 星星 DNA，即即180bp（3100-5600拷拷贝贝）、500bp（280-560拷拷贝贝）、160bp（875-1750拷贝）。拷贝）。Mouse satellite DNA forms a distinct band 小卫星DNA 小小卫卫星星DNA是是更更短短的的串串联联重重复复序序列列，其其重重复复单单位位的的长长度度为为数数十十个个bp，重重复复次次数数在在相相同同物物种种不不同同个个体体中中是是可可变变的的。如如人人类类中中存存在在15-100bp的的重重复复序序列列，重复次数重复次数20-50次。次。微微卫卫星星DNA的的重重复复单单位位更更短短，为为1-3个个bp，重重复次数从数十到数千。复次数从数十到数千。微卫星DNA复制滑动改变重复次数端粒重复序列 真真核核细细胞胞染染色色体体的的末末端端具具有有端端粒粒重重复复序序列列，其其重复单位的长度为重复单位的长度为67个个bp，可重复上千次。，可重复上千次。人人 类类 TTAGGG TTAGGG TTAGGG 锥锥 虫虫 TTAGGG TTAGGG TTAGGG 拟南芥拟南芥 TTTAGGG TTTAGGG TTTAGGG 小小 麦麦 TTTAGGG TTTAGGG TTTAGGG 染染色色体体的的两两端端是是端端粒粒，端端粒粒是是高高度度重重复复序序列列。端端粒粒的的作作用用是是维维持持基基因因组组的的正正常常复复制制，在在基基因因组组复复制制时时，染染色色体体的的末末端端会会缩缩短短，通通过过端端粒粒酶酶的的反反转转录录作用，可维持染色体末端的长度。作用，可维持染色体末端的长度。散布重复序列 散散布布重重复复序序列列主主要要是是一一些些可可移移位位的的遗遗传传因因子子，也也称称为为转转座座子子。它它们们是是一一些些可可以以在在染染色色体体上上移移动动位位置置的的DNA片片段段。不不同同的的转转座座子子的的长长度度不不同同，重重复复次次数数也也有有很很大大差差异异。如如拟拟南南芥芥基基因因组组中中的的Tal因因子子只只有有约约10个个拷拷贝贝，而而百百合合的的del 2因因子子约约有有240,000个拷贝。个拷贝。1.3 基因家族 在在真真核核生生物物中中，相相关关的的基基因因可可以以归归在在基基因因家家族族中中。具具体体地地说说，基基因因家家族族是是指指基基因因组组中中许许多多来来源源相相同同、结结构构相相似似、功功能能相相关关的的一一套套基基因因。基基因因家家族族的的成成员员是是从从某某个个原原祖祖基基因因通通过过倍倍增增和和突突变变而而遗遗传传下下来来的的，它它们们可可以以分分散散在在不不同同的的染染色色体体上上，也也可可以以成成簇簇地地排排列列在在一一起起，形形成成基基因因簇簇（gene cluster）。各各基基因因家家族族所所拥拥有有的的成成员员数数目目不不等等，如如大大豆豆球球蛋蛋白白基基因因家家族族有有5个个成成员员，玉米醇溶蛋白基因家族有玉米醇溶蛋白基因家族有100个左右的成员。个左右的成员。图图110 与油菜茉莉酸诱导蛋白基因与油菜茉莉酸诱导蛋白基因相似的基因家族相似的基因家族kb简单的多基因家族 简简单单的的多多基基因因家家族族是是指指在在家家族族中中有有一一个个或或几几个个基基因因以以串串联联排排列列的的方方式式重重复复，每每一一个个重重复复由由一一个个启启动动子子控控制制转转录录，如如前前述述18S、5.8S、25S rRNA基基因因，以以及及5S rRNA基基因因都都是是这这样样。5S rRNA基基因因之之间间有有间间隔隔序序列列隔隔开开，这这些些间间隔隔序序列列也也是是重重复复序序列列。每每一一个个5S rRNA基因单独进行转录。基因单独进行转录。图图111 简单的多基因家族简单的多基因家族复杂的多基因家族 复复杂杂的的多多基基因因家家族族由由几几个个相相关关的的基基因因组组成成基基因因簇簇，也也就就是是一一个个重重复复单单位位。在在这这个个重重复复单单位位中中，基基因因之之间间被被间间隔隔序序列列隔隔开开。一一个个重重复复单单位位中中的的各各个个基基因因有有各各自自的的启启动动子子，分分别别转转录录出出各各自自的的mRNA。组组蛋蛋白白基基因因和和tRNA基因就属于这种类型。基因就属于这种类型。一一个个基基因因簇簇中中的的不不同同基基因因可可以以是是按按同同一一方方向向转转录录，也也可可以以是是按按两两个个方方向向转转录录（图图1-12）。一一个个基基因因簇簇中中的的某某个个基基因因也也可可以以有有若若干干个个拷拷贝贝，如如果果蝇蝇tRNA基基因因簇，但不是所有的簇，但不是所有的tRNA基因都在一个基因簇中。基因都在一个基因簇中。图图112 复杂的多基因家族复杂的多基因家族DNA上的基因 在在DNA长链上，排列着许多基因长链上，排列着许多基因 基因之间往往有间隔序列基因之间往往有间隔序列 基因之间也有重叠的现象基因之间也有重叠的现象 就就一一个个基基因因而而言言，DNA双双链链的的一一条条链链为为模模板板链链，另另一一条条链链为为编编码码链链（意意义义链链），但但我我们们不不能能说说基基因位于某一条链上。因位于某一条链上。在一个在一个DNA长链上，不同基因的编码链可以位长链上，不同基因的编码链可以位于不同的单链上于不同的单链上 描述一个基因的结构是描述其编码链描述一个基因的结构是描述其编码链DNA链上基因的排列模板链、编码链与RNA的关系受发育控制的复杂多基因家族 人人及及珠蛋白基因簇珠蛋白基因簇The two g g genes differ in their coding sequence in only one amino acid;the G variant has glycine at position 136,where the A variant has alanine.不同发育阶段的血红蛋白亚型发育阶段发育阶段血红蛋白亚基组成血红蛋白亚基组成胚胎期（胚胎期（8周以前）周以前）22、2 2、2 2 胎儿期（胎儿期（841周）周）22成人期（出生以后）成人期（出生以后）22、22 有有许许多多基基因因家家族族成成员员是是随随发发育育阶阶段段变变化化而而先先后后表表达达的的。珠珠蛋蛋白白（脱脱辅辅基基血血红红蛋蛋白白）由由4个个亚亚基基组组成成，两两个个类类亚亚基基和和两两个个类类亚亚基基，在在人人的的不不同同发发育育阶阶段段中中有不同的亚基组合。有不同的亚基组合。不同发育阶段的血红蛋白亚型图图114 人体发育过程中不同类型人体发育过程中不同类型珠蛋白的浓度变化珠蛋白的浓度变化假基因的产生1.4 真核基因的断裂结构 1977年年，当当时时在在纽纽约约冷冷泉泉港港实实验验室室从从事事研研究究工工作作的的Richard Roberts发发现现，单单个个基基因因不不仅仅可可以以由由一一个个DNA片片段段组组成成，而而且且可可以以由由数数个个受受到到不不相相干干DNA片片段段隔隔离离的的DNA片片段段组组成成。生生物物体体内内存存在在的的这这种种间间断断的的基基因因，比比早早期期研研究究的的那那些些基基因因更更加加复复杂杂，从从而而使使上上述述有有关关遗遗传传物物质质及及其其功功能能的的流流行行概念发生了彻底的改变。概念发生了彻底的改变。断裂基因的发现断裂基因的发现断裂基因的发现 同同年年，Phillip Sharp在在研研究究腺腺病病毒毒时时，发发现现腺腺病病毒毒的的基基因因组组由由一一条条很很长长的的DNA分分子子组组成成；在在DNA分分子子中中，至至少少有有4个个完完全全间间断断的的DNA片片段段与与1个个RNA分分子子相相对对应应。由由此此得得出出结结论论认认为为，基基因因遗遗传传信信息息在在基基因因组组内内是是间间断断编编码码的的。这这一一科科学学发发现现激激励励了了科科研研人人员员的的深深入入研研究究，不不久久便便证证实实断断裂裂的的基因结构事实上是高等生物最常见的基因结构。基因结构事实上是高等生物最常见的基因结构。The Nobel Prize in Physiology or Medicine 1993for their discoveries of split genesRichard J.RobertsNew England Biolabs Beverly,MA,USAb.1943Phillip A.SharpMIT,Center for Cancer Research Cambridge,MA,USAb.1944断裂基因的外显子和内含子 我我们们把把一一个个基基因因中中最最终终出出现现在在成成熟熟的的RNA中中的的序序列列称称为为外外显显子子（extron or exon），而而把把转转录录后后 从从 原原 初初 转转 录录 本本 中中 去去 掉掉 的的 序序 列列 称称 为为 内内 含含 子子（intron）。）。断断裂裂基基因因可可以以通通过过异异源源双双链链分分析析得得到到检检测测，即即把把克克隆隆了了的的基基因因组组DNA与与mRNA杂杂交交，电电镜镜观观察未互补的环。察未互补的环。真核基因的断裂结构鸡卵清蛋白鸡卵清蛋白mRNA与其基因与其基因DNA杂交形杂交形成的异源双链产物的电镜照片成的异源双链产物的电镜照片鸡卵清蛋白鸡卵清蛋白mRNA与与DNA杂交形成的异杂交形成的异源双链产物的模式图源双链产物的模式图外显子、内含子分析法内含子的特点 在在一一个个基基因因中中，内内含含子子的的位位置置和和数数目目往往往往是是保保守守的的，但但内内含含子子的的序序列列十十分分不不同同。也也有有许许多多真真核核细细胞胞基基因因没没有有内内含含子子。内内含含子子的的功功能能和和存存在在的的意意义义还还不不清清楚楚。真真核核生生物物编编码码蛋蛋白白质质的的核核基基因因内内含含子子的的两两端端具具有有保保守守的的5GTAG3序序列列，称称为为GT-AG法法则则。另另外外还还有有tRNA基基因因、rRNA基基因因、线线粒粒体体、叶叶绿绿体体以以及及酵酵母母的的 一一 些些 蛋蛋 白白 质质 基基 因因 的的 内内 含含 子子，它它 们们 不不 具具 有有 5GTAG3序序列列，而而是是具具有有其其他他一一些些特特点点，其其中中的的类内含子和类内含子和类内含子能够自我剪接。类内含子能够自我剪接。同源基因举例 类类珠珠蛋蛋白白基基因因和和类类珠珠蛋蛋白白基基因因都都是是由由3个个外外显显子子和和2个个内内含含子子组组成成。脊脊椎椎动动物物肌肌红红蛋蛋白白（只只有有一一个个亚亚基基）的的结结构构与与血血红红蛋蛋白白亚亚基基结结构构很很相相似似，它它们们可可能能有有着着相相同同的的来来源源。豆豆科科植植物物中中的的豆豆血血红红蛋蛋白白，从从蛋蛋白白质质一一级级结结构构、内内含含子子数数目目和和位位置置上上看看，似乎与珠蛋白起源于同一祖先基因。似乎与珠蛋白起源于同一祖先基因。珠蛋白基因与豆血红蛋白基因内含子位置的比较两种玉米乙醇脱氢酶内含子的比较