1、1. 二十种氨基酸单字母缩写及分类。
2. 以CDK2说明蛋白质柔性
这样大的集合性运动在X-射线晶体学研究中所表现出来的是电子密度的水平低，甚至在某些情况下看不到电子密度的存在。产生这样的运动的区域通常在晶体学中被表述为柔性(flexibility)运动或无序(disorder)。
cyclin A依赖型激酶CDK2 有两个结构域，N-端结构域由一段α螺旋β折叠片组成，在α螺旋中PSTAIRE的氨基酸顺序（红色）在所有的CDKs 蛋白激酶中都是高度保守的；C-端结构域主要由α螺旋组成，并含有一段柔性的环区域称作T-loop （黄色）环区域，含有一个苏氨酸残基，在完全活性的酶中该
2、苏氨酸残基被磷酸化。
左图：在非活性态，PSTAIRE 螺旋红色的取向使Glu 51 指向远离ATP 的结合部位，而T-loop 封住了与底物的结合部位，以阻止蛋白结合到CDK2 上。
右图： 在活性的cyclin A-CDK2 复合物结构中，PSTAIRE 螺旋发生了重新定向以使得Glu 51 残基指向活性部位并与另一个与催化有关的残基Lys 33 形成盐键，T-loop改变了构象并与另一个残基Asp 145 一起与活性部位中的镁离子配位，此时底物的结合部位被打开，蛋白可以结合底物。cyclin-CDK2 复合物可以磷酸化Ser/Thr 残基并进而激活所结合的蛋白。
3. MHC分
3、子结构特征，其如何发挥功能。
4. PPIase的催化机制。
5. 病毒的结构，假二对称的作用。
最简单的病毒中心是核酸(DNA或RNA)，外面包被着1层有规律地排列的蛋白亚单位，称为衣壳。构成衣壳的形态亚单位称为壳粒，由核酸和衣壳蛋白所构成的粒子称为核衣壳。较复杂的病毒外边还有由脂质和糖蛋白构成包膜。核壳按壳粒的排列方式不同而分为3种模式：二十面体对称，如脊髓灰质炎病毒；螺旋对称，如烟草花叶病毒；复合对称，如 T偶数噬菌体。
6. GPCR如何实现信号转导？
胞内部分有G蛋白结合区。G蛋白α，β，γ三种亚单位组成的三聚体，静息状态时与GDP结合．当受体激活时GDP－αβγ复合物在Mg2+参与下，结合的GDP与胞质中GTP交换，GTP－α与βγ分离并激活效应器蛋白，同时配体与受体分离。α亚单位本身具有GTP酶活性，促使GTP水解为GDP，在与βγ亚单位形成G蛋白三聚体恢复原来的静息状态。
7. 略。
8. 真核生物中特殊的转录花样。
9. 原核与真核中结合DNA的蛋白花样的区别。
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