新版Pubmed检索攻略.doc

新版Pubmed检索攻略

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第一章 PubMed概述
　　笔者近来接到诸多同窗的微信，说但愿看到pubmed的搜索教程，然后就在网上进行了检索，发现网上的教程都是老版的pubmed，例如尚有limit按钮等等，其实pubmed改版之后已经变得更加简洁，就行百度搜索框同样，只有一种框和go。而此前的5个功能按钮早早已经删除，在你搜索成果中才可以显示，在我们搜索的左侧。那么下面我们就开始学习学习pubmed的搜索技巧吧！
　　我看到诸多人用了几年的PubMed，还是只懂得在检索框里输入一种核心字，然后按一下'Go'按钮这样一种单一原始的检索方式。虽然有一半左右的状况，这样的操作就足以得到令人满意的信息，但对于另一半状况，就没有那么幸运了，要么你真正所需的信息湮没在大量纷繁芜杂的'无用'信息中，要么你只得到了大量有用信息的冰山一角。
　　令人费解的是，诸多医务工作者宁可在每次检索时都花上成倍的时间，却不肯花上几种小时的时间去认真研究PubMed。'君欲善其事，必先利其器'， PubMed就仿佛一把功能强大的枪，你决不能仅仅满足于懂得扣动扳机就可以发射子弹，更重要的是，你要懂得如何运用准星瞄准，如何把这把枪的功能发挥到及至。
　　在后来的章节中，我们将逐渐进一步地理解PubMed，相信通过这些章节的学习，我们可以真正纯熟掌握PubMed，从而使自己的工作事半功倍。
第二章 PUBMED简朴检索技巧
　　一．在这一章里，我们将对如何应用PUBMED这一得力助手检索文献，作以简朴简介。
1．直接检索。　　当你打开浏览器，在地址栏内键入，就进入了PUBMED检索系统主页。在接近页面上部的地方，一方面映入我们眼帘的，即是供我们输入所需查询内容的检索框。这就是改版之后的pubmed，是不是非常简洁？　　在检索框中输入查询词，然后单击'go'按钮或按回车键，PubMed将会自动开始检索，并将检索到的有关条目显示在屏幕上。在检索框前面，你还可以选定所要检索内容的数据库范畴，除NCBI的数据库以外，可供选择的尚有：PROTEIN、STRUCTURE、POPSET等等。
　　说到这里，诸多人也许觉得只需傻瓜式的输入几种字符然后回车一敲便可万事大吉，其实否则。每个人搜索效率的高下往往存在很大差别。在这里提供如下建议仅供读者参照：
明确你索要检索的核心概念及词语，即核心字；考虑到核心字的类似说法，即有也许浮现的同义词；通过限定DATES,STUDY GROUP等，精炼你的检索范畴；多向有经验的人求教，由于不同的专业背景以及个人的差别，均有也许形成不同的措施和技巧。
2．通过布尔（BOOLEAN）运算来提高你的效率
　　最常用的三种布尔运算即是AND,OR,和NOT。
　　AND提供的运算方式即不管所输入的两个核心词语所浮现的位置在哪，只要她们都出目前索引文章的某一处，就将其列出。
　　而OR则是将浮现至少一种核心词的文章列出，这种运算在想将相似主题的文章罗列在一起时，十分有效。
　　NOT运算可以在你的检索范畴内将某些不需要的部分除去。但是在使用的时候要特别注意，会有也许将某些你所需要的文章漏掉。例如当你的检索词为LEAD POISONING NOT CHILDREN时，除了会删除掉那些仅讨论小朋友的文章，同步也会删去那些同步讨论小朋友及其她年龄组的文章。
3．PUBMED检索类型
　　一般我们所要查询的单词类型大体可以分为：
　　词语（主题）检索　这时我们在PubMed主页的检索框中键入的是英文单词或短语（大写或小写均可）。然后回车或点击'Go'， PubMed虽然用其词汇自动转换功能进行检索，并将检索成果直接显示在主页下方。例如：键入'vitamin c common cold'后回车或点击'Go'， PubMed开始检索并将检索成果显示出来。
　　著者检索　当我们所要查询的是著作者时，在检索框中键入著者姓氏全称和名字的首字母缩写，格式为：'著者姓空格 名字首字母缩写'，例如smith ja，然后回车或点击Go，系统会自动到著者字段去检索，并显示检索成果。
　　刊名检索　在检索框中键入刊名全称或MEDLINE形式的简称、ISSN号，例如：molecularbiology of the cell, 或mol biol cell, 或1059-1524，然后回车或点击Go,系统将在刊名字段检索，并显示检索成果。
　　日期或日期范畴检索　可以在检索框中键入日期或日期范畴，然后回车或点击Go，系统会按日期段检索，并将符合条件的记录予以显示。日期的录入格式为YYYY/MM/DD；如：1999/09/08
　　也可以不录月份和日子，如：或1999/12。　　检索期刊子集（辑） 检索的格式为　检索词ANDjsubseta,如：neoplasm AND jsubseta。可供检索的期刊子库有3种：Abridged Index Medicus（有120种重要核心期刊）、Dental和Nursing。分别使用jsubseta,jsubsetd, jsubsetn进行限定。
　　这个功能非常实用，如果想入组比较高质量额文献，例如核心期刊，这个时候实用期刊检索方式将会给你剩余诸多时间，例如，我们搜索neoplasm，直接搜索，一共出来了2692727篇文献。如果我们限定核心期刊，那么成果只有40238篇文献，这个工作量的差别对我们来说无疑是巨大的！人们一定要掌握。　　检索带文摘的记录　检索的格式为：检索词AND has abstract, 如：liver cancer ANDhas abstract。要注意的是在1975年前出版的文章，其MEDLINE记录中没有文摘。
　　布尔逻辑检索　PubMed系统容许使用布尔逻辑检索，只要在检索框中键入布尔逻辑运算符（AND，OR或NOT）。具体使用时要注意的问题，详见上第2点所述。
4．如何解决检索成果
　　当你点击GO或回车后，PubMed将会自动运营检索命令，在屏幕的下方显示出符合检索规定的项目，并且在查询框内保存原检索词。此时要注意的是符合检索规定的项目是以SUMMARY（简要格式）显示出来的，就是列出作者，文章题目，以及文章来源的某些信息。
　　在DISPLAY键后还可以选择别的显示格式，点击DISPLAY键后，系统按所选格式所有检索成果。
　　那么如何批量保存文献呢？打开Summary下拉菜单选择其中一种格式，然后点击Save键；要保存特定记录时，点击记录左边的选择框予以标记后，再点击Save键。
　　使用浏览器的打印功能，即可把感爱好的内容打印出来。系统容许每页最多显示500条记录。如果想打印成文本格式，请先点击Text键，然后再打印。第三章 PUBMED简朴检索实例
　　在上一章里，我们已经对如何用PUBMED来查询我们感爱好问题的文献。在这一章，我们可以通过几种简朴的实例来具体熟悉PUBMED的用法。
　　1．明确所要检索的内容。如果我们要查询的问题是'维生素C对于一般感冒的防治作用'。一方面我们应分析这一问题中的核心词语，重要由'维生素C'，和'一般感冒'构成。即'VITAMIN C'和'COMMON COLD'。
　　2．分析所要检索的两个有关词语的关系。根据我们的平常生活经验，可以将两个核心词之间的关系定义为'AND',于是我们可以在检索框内键入'VITAMINC AND COMMON COLD'.，然后点击'GO'，进行检索。下面的画面即为通过上面检索过程后所得到的有关文章。　　3．以上初步检索后所显示的成果都以默认的SUMMER格式显示出来，在通过对SUMMER的阅读后，我们可以进一步筛选文献的内容。如我们感爱好的是第二、三、五篇的话，选中这几篇文献左侧的方框。如果我们想要同步看到这几篇的ABSTRACT，在Display Settings键后的下拉菜单选择ABSTRACT，然后点击DISPLAY。即可看到所要成果。查当作果：第四章 PUBMED高档检索技巧
　　高档检索技巧有两个入口：一是通过搜索前的advanced进入，就在pubmed首页搜索框的下面。这里三个高档搜索选型：　　1、是左侧的and or not选项，很简朴，具体见简朴搜索环节2.　　2、是搜索框选型，fieids，选择你需要选择的搜索范畴。　　3、是index索引，以cancer为例，点击list，浮现下图内容，可以很以便的选择子方向，这个选项可以大大的提高我们的检索效率，缩小工作范畴。
第二个功能入口就是我们搜索之后的界面，在左侧的选项。　　还是以cancer为例，左侧浮现了additional filter，这里我们可以把我们需要的内容进行筛选，例如我需要找到临床实验类型的文章，就在article types 中点击clinical trial，需要查看近来5年的文章，就选择publication data 5 years，等等。这个功能可以协助我们迅速的筛选出我们需要的文章类型，实在是好用的没话说啊！
　　同步对于高档玩家来说，如果想要查看pubmed的检索的具体内容，可以点击右下侧的search details，点击see more，你将会看到pubmed的所有搜索信息，同步提供修改。
　　以上就是pubmed常用的高档搜索技巧了，同步某些基本的内容例如如何把文献导出txt，如何只查看title就比较简朴了，不再赘述。第五章谈MeSH Browser（医学主题词浏览器）
【何为MeSH】
　　MeSH其实是Medical Subject Headings的缩略词，即医学主题词，是用规范化的医学术语来描述生物医学概念。NIH的工作人员按MeSH词表规定，浏览生物医学期刊全文后标引出每篇文献中的MeSH主题词，其中论述文献中心的主题词称重要主题词（major topic headings），论述主题某一方面的内容的词称为副主题词。
【那么为什么要使用医学主题词呢？】
　　我们先来看个比方，如果有人问你感冒了吗？你会不会回答'没有啦，我只是有点着凉发热而已'呢？固然不会，由于你懂得感冒就是着凉发热。　　　但一种检索系统，如果你不告诉它的话，它就有也许不懂得这一点。在期刊中，对于同一种概念往往也许有不同的描述形式，如Tumor和Neoplasm都是指肿瘤。当一种查询者但愿查阅肿瘤和diet(饮食)有关的文献时，她也许会输入Tumor，也也许输入Neoplasm作为核心字，但其实这两者之间是没有区别的。一种愚蠢的检索系统也许就结识不到这点，而像PubMed这样的'智能化'检索系统就可以精确的意识到这点，从而不会导致检索成果的漏掉。如何使用
　　如果你但愿使用医学主题词进行检索，同样有两个入口。
　　1、可以从PubMed首页上点击PubMed Services下方的MeSH Browser即可进入如下界面。　　2.直接从搜索框内进入。把pubmed的下拉框打开，在里面直接找到mesh的选项。
　　举例阐明，如果你想要检索Neoplasms和bone的有关文献，一方面在MeSHBrowser的检索框内输入检索词Neoplasms，然后点击Browse按钮。
　　然后，我们再在MeSH浏览器内输入bone，按检索按钮，系统会告诉你bone不是一种主题词，但它会自动将其转换成主题词Bone and Bones，同样，其下方也会显示出其定义及在树状级别构造中的位置。你同样可以选择Detailed display以便进行更为精细的选择，选择完毕后，点击'Add'按钮，则进入下面的界面。这时，你只需点击PubMed Search按钮即开始检索，查询出用这两个主题词为核心字以及所选择的相应逻辑关系的文献检索成果。
　　综上所述，主题词检索法虽然稍嫌繁琐，但其检索成果的精确性高，漏掉率低，是最佳的检索措施，一旦纯熟掌握，将使得我们的检索工作事半功倍。
　　以上就是pubmed检索的技巧，但愿可以协助到您们，如果感觉有用请分享给更多的人，谢谢。