Protege使用重点笔记专业资料.doc

用到工具：
JDK 安装及配备
Protégé 下载网址： 可视化开发平台
graphviz 图形化显示本体关系图
Mysql 及客户端工具 不用简介了吧，我用5。X
Mysql java 连接器 下载地址： mysql-connector-java-3.1.12-bin.jar文献，将其复制到protege安装目录中(注意不是插件目录)，然后将它名字变为driver.jar。
Mysql及有关工具用来将本体保存在数据库中。
beangenerator.jar 这个在JADE文档中所记载，可以将protege构建OWL本体导出为JADE本体类
使用
建立Animal工程实例
环节1 建立新项目。打开protege,然后会浮现对话框，点击Create New Project...，浮现Create New Project对话框后，选取OWL Flies(.owl or .rdf)后，点击Finish，而不选Next。
环节2 建立类。protege主页面中会浮现，OWL Classes(OWL类),Properties(属性),Forms(表单),Individuals(个体),Metedata(元类)这几种标签。咱们选取OWL Classes来编辑。在Asserted Hierarchy（添加阶层）中，会有所有类超类owl:Thing上点击Asserted Hierarchy旁边Create subclass或者在OWL:Thing,点击右键选取Create subclass。会浮现protege自动定义名为Class_1类。在右边CLASS EDITOR（类编辑器）Name选项中，输入Animal来替代自动定义名字。(建议使用英文，由于下面会用到OWLViz来生成关系图，中文话会容易浮现问题。)

环节3 建立Animal子类，在Animal点击上右键，选取Create subclass，并按照上述办法将其名字变为Herbivore(素食动物)。

环节4然后按照上面办法，建立OWL:Thing另一种子类Plant(植物)，然后建立Plant子类Tree(树)。状态如下图

环节5 由于动物和植物是不同事物，也就是说它们互相具备排她性(owl:disjointWith)，咱们来定义这个关系。在选中Animal状态下，点击右下角Disjoints第三个按钮，在浮现Add sibling to disjoints(将互为兄弟节点类设为排她)对话框中，选取Mutually between all siblings。这样动物和植物就有互相排斥属性了。

环节6 建立属性。新建一种ObjectProperty(注意不是DataProperty)选取Properties标签，Name改为is_part_of然后在右下角Transitive前面打上对号，阐明这是一种传递性属性。然后建立一种对象属性(owl:ObjectProperty)eat(吃)，在Domain（定义域）中定义该属性主体类是Animal。最后再建立一种属性eated（被吃），它是属性eat逆关系(owl:inverseOf)，在右下角Inverser框中选取eat属性。(参照图)

环节7 建立一种owl:Plant子类Branch(树枝)，并附加限制条件。在选取Branch状态下，点击中下方Asserted Conditions(添加条件)中第二个按钮(Create restrition )。在弹出对话框中，选取Restrition中allValuesFrom，然后点击下方Insert class...。最后选取Tree，这样咱们就定义了类Branch，它是树(Tree)一某些（is_part_of）。
环节8 和环节7同样，建立owl:Plant子类Leaf(树叶)类。在Asserted Conditions选取is_part_of属性，并在Restrition中选取allValuesFrom，最后选取属性类Branch(树枝)。这样咱们就定义了树叶是树枝一某些。

环节9 定义草食动物。素食动物是动物子类，并且只吃植物或是植物一某些(植物和一某些植物并集，也就是植物)。和环节7同样Create Restrition对话框中添加如下图式子。
环节10 定义类Giraffe(长颈鹿)，它是素食动物，只吃树叶。按照上面环节定义，如下图 。

环节11 查看关系图，在菜单中选取Project–>Configure在浮现对话框中，在OWLVizTab前打上对号，就会出新OWLViz标签。如果在这里浮现DOT error话请参照错误提示解决办法，然后点击OWLViz标签，选取Show all classes，就可以看到关系图。

环节12 保存项目。点击这里下载这个项目下载这个项目。解压后用菜单中File–>Open Project–>解压路经中Animal.ppjr即可。

接着基本篇，在动物本体中，建立狮子类(Lion)和肉食动物类(Carnivore)，通过推理得到狮子是肉食动物。通过这个实例来简朴理解推理机Racer用法。
基本操作办法在基本篇中有解说，如下环节中操作不清晰朋友请先看基本篇。点击这里下载到此处项目，在protege中点击Open Project打开项目。
环节1 在Animal中建立狮子类和肉食动物类。定义这两个类在同一级中，即这两个类为兄弟关系，目是推理后狮子变为肉食动物子类。
环节2 编辑狮子类属性。这里咱们定义狮子只吃素食动物。

环节3 编辑肉食动物属性。这里咱们需要建立一种eat子属性maineat(重要吃是)，由于肉食性动物可以吃植物，因此咱们无法单纯靠eat来推理出Lion是不是肉食性动物。这里咱们定义肉食性动物maineat值域是所有动物。如下图

环节4 将肉食动物maineat属性变为充分必要条件。由于在当前逻辑模型中咱们原则是开放世界假说，也就是说在没有成功证明某个陈述之前，咱们将这个陈述定义为未知事实而不是假。由于咱们没有明确指出肉食动物不能重要吃植物，因此肉食动物重要吃植物这个陈述是未知，而不是假。这样就给咱们推理导致了影响，因此咱们需要明确指出肉食动物重要吃动物。也就是充分必要条件。做法是双击NECESSARY(必要条件)中 将其拖拽到上方NECECSSARY & SUFFICIENT(充分必要条件)中。同样办法将Animal也拖拽到充分必要条件中。状态如下图

环节5 启动RacerPro推理机进行推论。如果没有朋友请到RacerPro官方网站下载。需要注册一下，然后在发给你邮件中，点击链接就可如下载。安装选默认途径即可，否则还需要设立途径。

环节6 运用推理机进行推理。选取菜单中OWL–>Classify taxonomy..(也可以点击标签上方Classify taxonomy..图标)。这时protege会连接RacerPro，然后推理机将做出推理。这时将推理机弹出信息关闭，protege中间会浮现新类阶层图，这里狮子类已经变为肉食动物子类。并在信息对话框中Lion Moved from Animal to Carnivore。
环节7 确认关系图。在OWLViz中Asserted Model是推理前关系图，Inferred Model是推理后关系图。可以看到狮子类已经成为肉食动物子类。
环节8 保存项目。点击下载该项目。

如下教程接着基本篇和推理篇，对于基本篇和推理篇解释环节这里不在重复解释。不懂得朋友请先看基本篇和推理篇来熟悉基本操作环节。点击这里参照新手入门基本篇和推理篇 在本篇进阶片教程中重要是简介个体编辑(Individuals)，查询插件(QueriesTab)用法以及将编辑好本体存储到数据库中(Owl Database)。对于Owl数据库我这里采用Mysql(对于其她数据库请到官方网站查询)。
环节1：这里要用到推理篇中保存项目。没有朋友请点击这里下载。打开推理篇中保存newAnimal。依照推理机推理咱们懂得了Lion是肉食动物，因此咱们将其移到Carnivore肉食动物下面作为它子类

环节2：建立动物园类Zoo。然后在属性编辑器中编辑一种新datatype property(数据性属性)Address,设它定义域是类Zoo，设它值域是xsd:string,在rdfs:comment中注释该属性表达地址。同样咱们编辑一种新datatype property(数据性属性)Tel,设它定义域是类Zoo，设它值域是xsd:string。在rdfs:comment中注释该属性表达电话号码。注意给定义域添加类时候是用Add named Class(es),Domain背面第2个按钮，而不是第一种。第一种按钮是新建一种类并给作为定义域时用。

环节3：建立类Zoo个体。选取Individuals编辑器。在选取左边Zoo类状况下，点击INSTANCE BROWSER中按钮，浮现了一种个体实例，在INSTANCE EDITOR中将它名字变为Beijing_Zoo。在下方属性Address中点击加号，输入地址。这里作为例子输入Beijing Xizhimen Road，并选取en。属性Tel中输入，并选取en。同样办法，创立此外2个个体实例Shanghai_Zoo和Tianjin_Zoo。属性Address和Tel请任意输入。这样咱们就创立了3个Zoo个体实例。

环节4：建立动物个体。在建立动物个体之前，前建立一种对象性属性Belonging，它定义域是Animal，值域是Zoo。回到Individuals编辑器中，在选取类Giaffe状况下，建立一种个体实例，命名为Lanlan。在下方Belonging属性中点击加号，在弹出对话框中选取Beijing_zoo。同样办法，建立2个个体实例让它们本别属于Shanghai_zoo和Tianjin_zoo。然后在建立3个Lion类个体实例,BeiLion,ShangLion,TianLion让它们分别属于3个动物园。这样咱们就可以进行下一步，用查询表单来查询。

环节5：使用查询插件。点击菜单中Project–>Configure 在浮现对话框中选取QueriesTab前加上对勾。然后就会浮现Queries标签，选取这个标签就会浮现查询界面。最初咱们只在Class中加入Animal然后点击Find。查询成果会在右边Search Results中浮现，如下图。然后将这个查询保存，可以在后来运用。咱们点击在下方Query Name中输入?Animal然后点击Add to Query Library按钮。这样这个查询方式就被储存到Query Library中。

环节6：运用Query Library中保存查询方式进行进一步查询。点击Query Library中?Animal并点击按钮。可以调用这个查询方式，在这里由于咱们刚刚存储了这个方式，因此上面Query中不会有变化。咱们在Slot中选取Belonging然后选取contains最后选取Beijing_zoo。点击Find 就会浮现咱们查找成果。可以将这个查询方式存储为?Animal_belong_BeijingZoo。固然并非每个查询方式都需要储存，实际操作中按照自己需要存储即可。

环节6：将本体存储到数据库中。这里咱们使用Mysql。先做准备工作，由于需要Mysql因此没有朋友请先安装。Mysql在Windows，linux等安装办法在许多网站均有十分详细简介，我在这里就不再重复了，请到网上查询一下，最佳安装官方推荐版本。安装完后一方面建立一种protege数据库，环节如下
Welcome to the MySQL monitor. Commands end with ；or \g.
Your MySQL connection id is 10 to server version：3.23.55-max
Type 'help;' or '\h' for help. Type '\c' to clear the buffer.
//建立一种名字叫protege_db数据库。
mysql> create database protege_db；
Query OK，1 row affected (0.00 sec)
//建立一种在localhost顾客protegeuser，密码为protegeuserpwd。并把protege_db所有权限给她。
mysql> grant all privileges on protege_db.* to protegeuser@localhost identified by 'protegeuserpwd';
//使上述变更在服务器上有效。
mysql> flush privileges;
Query OK，0 rows affected (0.07 sec)
//退出mysql
mysql> exit
这里不用创立表格，protege会自动创立。请确认你mysql服务是运营，否则将不能储存到数据库。接下来还需要下载JDBC驱动程序，它作用是将protege和数据库连接起来。点击这里下载JDBC驱动程序。下载完后展开，其中有一种mysql-connector-java-3.1.12-bin.jar文献，将其复制到protege安装目录中(注意不是插件目录)，然后将它名字变为driver.jar。然后回到protege中，选取菜单File–>Convert Project to Format...在弹出对话框中选取OWL Database。

弹出Owl Database对话框中按照下面规定填写。
Project 项目名称。可以任意取。这里用newAnimalok.pprj
Driver Class Name 中添入 com.mysql.jdbc.Driver
JDBC URL 添入jdbc:mysql://+mysql服务器地址+数据库名称 这里用是本地机，因此使用localhost
数据库为刚才创立protege_db。因此添入jdbc:mysql://localhost/protege_db
Table 数据库中表格名，可任意填写但不能与相似数据库中表格重名，否则覆盖。这里用Animal
Username 数据库顾客名。这里用protegeuser
Password 数据库顾客密码。这里用protegeuserpwd
然后点击OK。如果浮现错误，请参见The JDBC driver is not on the Classpath错误，请参见错误提示解决办法

确认mysql
//用protegeuser登陆数据库，在Enter password:后输入密码
mysql -u protegeuser -p
Enter password：
Welcome to the MySQL monitor. Commands end with ；or \g.
Your MySQL connection id is 14 to server version：3.23.55-max

Type 'help;' or '\h' for help. Type '\c' to clear the buffer.
//使用protege_db数据库
mysql> use protege_db;
Reading table information for completion of table and column names
You can turn off this feature to get a quicker startup with -A

Database changed
//查看Animal表格
mysql> select * from Animal;
+-------+------------+-------+-------+-------------+-------------+------------+
| frame | frame_type | slot | facet | is_template | value_index | value_type |
+-------+------
| 13373 | 5 | 13296 | 0 | 0 | 0 | 3 |
可以看到owl本体已经存储到了数据库中。其中各个参数均为protege预定义，点击这里查看各个参数详情 通过以上做法可以将咱们做本体储存到数据库中。然后通过数据库来访问本体数据。Owl Database配备一次后下一次就可以直接使用，只要使用命名为别表格即可。

附错误解决办法：
OWLVizDOT error
先到到此处下载GraphViz tool，然后安装。在OWLViz设立中指定对的DOT application途径。默认状况下是(Linux和Unix下/usr/local/bin ，或者是windows下C:\Program Files\ATT\GraphViz\bin\DOT.exe) Max OS X到此处下载graphviz 并指定DOTapplication途径:Graphviz软件途径+/Graphviz.app/Contents/MacOS/dot
The JDBC driver is not on the Classpath或者JDBC driver not found
请确认你protege安装目录下与否有driver.jar。没有话请点击这里下载，然后展开将其中mysql-connector-java-3.1.12-bin.jar文献，将其复制到protege安装目录中(注意不是插件目录)，然后将它名字变为driver.jar。如果还是不行，那么请确认你是以protege.exe启动protege。而不是protege.jar启动protege。如果是以protege.jar启动protege，那么还需要设立CLASSPATH。因此请用protege.exe启动试一下。