肿瘤放化疗重症感染患者病原菌分析.pdf

中国中西医结合急救杂志2 0 2 3年10 月第30 卷第5期ChinJTCMWMCritCare，O c t o b e r 2 0 2 3,Vo l.30,No.5543论著肿瘤放化疗重症感染患者病原菌分析王艳芝杨文源原唐玉天赵文学王芳彭晓晶王毅武威肿瘤医院重症医学科，甘肃武威7 330 0 0通信作者：王毅，Email：w y 0 6 6 5 16 3.c o m【摘要】目的探讨肿瘤放化疗后重症感染患者病原菌的特点及宏基因组二代测序（NGS)在病原菌检测中的应用价值。方法去选取2 0 19年10 月至2 0 2 3年8 月人住武威肿瘤医院重症医学科的恶性肿瘤放化疗后重症感染患者112 例作为研究对象。留取患者疑似感染部位标本150 份，送检传统病原学及NGS检测，分析肿瘤放化疗后重症感染患者病原菌的特点以及NGS在病原菌检测中的应用价值。结果112 例肿瘤放化疗后重症感染患者的150 份标本中，呼吸系统感染比例最高为51.7 9%（58 例),其次是血流感染为2 5.8 9%（2 9例），中枢神经系统感染比例最低为1.7 9%（2 例）。致病菌中革兰阴性菌最多NGS：35.33%（53例）,传统病原学检测：23.33%（35例）,其次为革兰阳性菌【NGS：2 0.6 7%（31例）,传统病原学检测：12.0 0%（18 例），且多重耐药菌感染率高达8 0.0 0%以上，多重耐药真菌感染率亦达到2 8.57%。对肿瘤放化疗后重症感染患者，NGS病原菌阳性率明显高于传统病原学检测【8 7.33%（131/150）比42.6 7%（6 4/150），P0.01】,革兰阴性菌、革兰阳性菌、真菌、其他病原菌阳性检出率均明显高于传统病原学检测【革兰阴性菌：35.33%（53/150）比2 3.33%（35/150）,革兰阳性菌：2 0.6 7%（31/150）比12.0 0%（18/150），真菌：2 2.6 7%（34/150）比6.6 7%（10/150），其他：8.6 7%（13/150）比0.67%（1/150),均P0.05)。结论NGS对肿瘤放化疗后重症感染患者的病原菌检出率明显高于传统病原学检测。肿瘤放化疗后重症感染的病原菌分布及耐药性具有独特性,加强对患者病原菌的检测有助于提高疗效。【关键词】肿瘤；重症感染；宏基因组二代测序；放化疗D01:10.3969/j.issn.1008-9691.2023.05.006Analysis of pathogenic bacteria of severe infection in cancer patients after chemoradiotherapyWang Yanzhi,Yang Wenyuan,Tang Yutian,Zhao Wenxue,Wang Fang,Peng Xiaojing,Wang YiDepartment of Critical Care Medicine,Wuwei Tumor Hospital,Wuwei 733000,Gansu,ChinaCorresponding author:Wang Yi,Email:Abstract Objective To investigate the characteristics of pathogenic bacteria in cancer patients with severeinfection after radiotherapy and chemotherapy and the application value of metagenomic next-generation sequencing(NCS)in the detection of pathogenic bacteria.Methods A total of 112 patients with severe infection after malignanttumor radiation and chemotherapy admitted to Department of Critical Care Medicine of Wuwei Tumor Hospital fromOctober 2019 to August 2023 were selected as the research objects.A total of 150 specimens from suspected infectionsites were collected and tested by traditional etiology and NGS.The characteristics of pathogenic bacteria in severeinfection of cancer patients after chemoradiotherapy and the application value of NGS in pathogen detection wereanalyzed.Results Among 150 samples of 112 patients with severe infection after radiotherapy and chemotherapy,thehighest proportion of respiratory system infection was 51.79%(58 cases),followed by 25.89%(29 cases)of bloodstreaminfection,the lowest central nervous system infection rate was 1.79%(2 cases).Gram-negative bacteria were the mostcommon pathogenic bacteria NCS 35.33%(53 cases),traditional pathogen detection 23.33%(35 cases),followed byGram-positive bacteria NGS 20.67%(31 cases),traditional pathogen detection 12.00%(18 cases),and muli-drugresistant bacteria infection rate was more than 80.00%,multi-drug resistant fungal infection rate also reached 28.57%.In the patients with severe infection after radiotherapy and chemotherapy,the positive rate of pathogenic bacteria ofNGS was significantly higher than that of traditional pathogen detection 87.33%(131/150)vs.42.67%(64/150),PO.o1j,and the positive detection rate of Gram-negative bacteria,Gram-positive bacteria,fungi and other pathogens wassignificantly higher than that of traditional pathogen detection Gram-negative bacteria:35.33%(53/150)vs.23.33%(35/150),Gram-positive bacteria:20.67%(31/150)vs.12.00%(18/150),fungi:22.67%(34/150)vs.6.67%(10/150),others:8.67%(13/150)vs.0.67%(1/150),both P38 或 2 0 次/min，心率 90/min，白细胞计数410%L或 12 10 L，伴或不伴血流动力学异常。1.1.2排除标准：放化疗前已存在感染；放化疗结束1个月后发生的等与放化疗无关的严重感染。1.1.3伦理学：本研究符合医学伦理学标准，并已获得本院医学伦理委员会审核批准（审批号：2 0 2 3-伦理审查-32)。对患者采取的治疗或检测均获得患者或家属同意并签署知情同意书。1.2研究方法：留取患者疑似感染部位标本，包括痰液、肺泡灌洗液、动静脉血液、中心静脉导管尖端血、尿液、脑脊液、引流液等标本共150 份，送检传统病原学检测及NGS,收集患者的基本信息,分析肿瘤患者放化疗后重症感染病原菌的特点以及NGS在病原菌检测中的价值。1.3统计学分析：使用SPSS26.0统计软件分析数据，符合正态分布的计量资料以均数土标准差（土s）表示，采用t检验；计数资料以例（百分比）表示，组间比较采用检验。P0.05为差异有统计学意义。2结果2.1标本来源（表1)：112 例患者的150 份标本来源于呼吸道的最多，其中痰液7 1例（47.33%），肺泡灌洗液14例（9.33%）；其次为血液，动静脉血液34例(2 2.6 7%)。表1112 例肿瘤放化疗后重症感染患者的150份样本来源例数百分比标本（例）痰液71腹腔引流液18动静脉血液34肺泡灌洗液142.2病原学检测结果：150 份标本中，NCS阳性者131例（8 7.33%），传统病原学检测阳性者64例（42.6 7%）,其中两种检测方法均阳性者59例（39.33%），仅NGS阳性者7 2 例（48.0 0%），仅传统病原学检测阳性者5例（3.34%），两种检测方法均阴性者14例(9.33%）。例数百分比标本(%）47.3312.0022.679.33（例）尿液6中心静脉导管5脑脊液2(%）4.003.331.33中国中西医结合急救杂志2 0 2 3年10 月第30 卷第5期ChinJTCMWMCritCare，O c t o b e r 2 0 2 3，Vo l.30，No.55452.3两种检测方法的病原菌诊断分析（表2 3）：150份标本中，NGS与传统病原学检测提示革兰阴性菌最多,其次为革兰阳性菌,真菌及其他致病菌较少见。150 份标本中，NGS病原菌阳性率明显高于传统病原学检测（P0.01),革兰阴性菌、革兰阳性菌、真菌、其他病原菌检出率均明显高于传统病原学检测（均P0.05)。表2 两种不同方法分析150 份标本中阳性病原菌分布病原菌传统病原学检测例(%)例(%)革兰阴性菌53(35.33)大肠埃希菌19(12.67)肺炎克雷伯杆菌10(6.67)鲍曼不动杆菌6(4.00)铜绿假单胞菌13(8.67)阴沟肠杆菌2(1.33)其他3(2.00)革兰阳性菌31(20.67)金黄色葡萄球菌14(9.33)屎肠球菌2(1.33)肺炎链球菌2(1.33)表皮葡萄球菌11(7.33)其他2(1.33)真菌34(22.67)白假丝酵母菌14(9.33)热带假丝酵母菌11(7.33)曲霉菌5(3.33)毛霉菌4(2.67)支原体8(5.33)衣原体4(2.67)军团菌1(0.67)表3NGS与传统病原学检测肿瘤放化疗后重症感染患者150份样本中病原菌阳性率比较NGS阳性率传统病原学检测病原菌值P值【%(例)阳性率%(例)革兰阴性菌35.33(53)革兰阳性菌20.67(.31)真菌22.67(34)其他8.67(13)合计87.33(131)2.4多重耐药病原菌分析（表4）：112 例肿瘤放化疗后重症感染患者多重耐药菌感染较高,其中革兰阴性菌、革兰阳性菌多重耐药菌感染率高达8 0.0 0%以上，多重耐药真菌感染亦达到2 8.57%。2.5月肿瘤放化疗后重症感染患者感染部位分布（表5）：112 例肿瘤放化疗后重症感染患者中，呼吸系统感染比例最高为51.7 8%，其次是血流感染为25.89%，中枢神经系统感染比例最低。表4112 例肿瘤放化疗后重症感染患者多重耐药菌分布例数多重耐药菌病原菌（例）【例(%)革兰阴性菌5647(83.93)大肠埃希菌2119(90.48)肺炎克雷伯杆菌10鲍曼不动杆菌76(85.71)铜绿假单胞菌1311(84.62)革兰阳性菌3226(81.25)金黄色葡萄球菌1412(85.71)NGS表5112 例肿瘤放化疗后重症感染患者感染部位分布感染例数百分比35(23.33)部位（例）17(11.33)5(3.33)3(2.00)9(6.00)0(0.00)1(0.67)18(12.00)9(6.00)1(0.67)1(0.67)7(4.67)0(0.00)10(6.67)6(4.00)4(2.67)0(0.00)0(0.00)1(0.67)0(0.00)0(0.00)23.33(35)5.7670.01612.00(18)4.1220.0426.67(10)15.3410.0000.67(1)10.78942.67(64)65.7730.000例数多多重耐药菌病原菌（例）【例（%)表皮葡萄球菌1110(90.91)其他21(50.00)8(80.00)真菌曲霉菌毛霉菌支原体衣原体感染(%）部位呼吸系统58血流29腹腔153讨论目前肿瘤的治疗多以放疗、化疗或同步放化疗为主，而放化疗在杀伤肿瘤细胞的同时，会导致组织器官损伤，化疗药物通过免疫应答引起免疫功能紊乱，使患者本身低下的免疫力再次下降，导致人体处于细菌易感状态，从而造成感染，且化疗患者中心静脉导管的置人进一步增加感染风险；因此,肿瘤放化疗后极易发生感染1-15。肿瘤放化疗后严重感染可引起脓毒性休克以及多器官功能障碍综合征(multiple organ dysfunction syndrome，M O D S）等并发症,可使患者病情急剧恶化,甚至死亡16 。因此及早判断致病菌并给予抗感染治疗对于肿瘤放化疗后重症感染患者至关重要。已有多项研究探讨了NGS在检测病原体和在没有病原学证据的情况下缩短经验治疗时间中的价值17-18 ,NGS已用于检测脑脊液、血液、尿液、痰液、关节腔积液和支气管肺泡灌洗液中的病原体，且敏0.001感性明显高于传统病原学检测方法17.19-2 0 1。本研究对肿瘤放化疗后重症感染患者进行病原学检测，结果显示，NGS阳性率为8 7.33%，传统病原学检测阳性率为42.6 7%,其中两种检测方法均阳性者占39.33%，仅NGS阳性者占48.0 0%，仅传统病原学检测阳性者占3.33%，两种检测方法均阴性者占9.33%。NG S与传统病原学检测提示革兰阴性菌最多,其次为革兰阳性菌，真菌及其他致病菌较少见；且多重耐药菌感染率较高，其中革兰阴性菌、革兰阳性菌多重耐药菌感染率高达8 0.0 0%以上，多重耐药真菌感染率亦达到2 8.57%。NGS病原菌阳性3510(28.57)52(40.00)43(75.00)81(12.50)41(25.00)例数百分比（例）(%）51.79泌尿系统25.89中心静脉导管13.39中枢神经系统5324.462.681.79546中国中西医结合急救杂志2 0 2 3年10 月第30 卷第5期ChinJTCMWMCritCare，O c t o b e r 2 0 2 3，Vo l.30，No.5率明显高于传统病原学检测,革兰阴性菌及革兰阳性菌检出率亦明显高于传统病原学检测，真菌检及其他病原菌检出率明显高于传统病原学检测。因此，对于肿瘤放化疗后重症感染患者在未获得病原学检测结果之前，可给予抗菌谱涵盖此类病原菌的抗菌药物抗感染治疗，但真菌及其他少见病原菌感染仍不能忽略。本研究显示，肿瘤放化疗后重症感染患者多以呼吸系统感染为主，与既往研究结果一致，主要考虑肿瘤放化疗患者自身免疫功能低下，呼吸道分泌物清除能力下降，长时间停留在呼吸道，从而增加感染风险2 1。肿瘤放化疗后重症感染患者血流感染次之（2 5.8 9%）,放化疗后免疫功能损害、骨髓抑制、中心静脉置管等因素可导致血流感染发生率较高15.2 。因此，肿瘤患者放化疗时应注意气道及中心静脉导管的管理，若发生感染，及时进行呼吸系统及血流标本检测并给予积极治疗。在病原菌的检测中，NCS阳性率明显高于传统病原学检测，与传统病原菌检测技术比较，NGS不仅可识别常见细菌、真菌、病毒及特殊病原体，在识别新的或不常见的致病菌、诊断混合性感染以及寻找经验性抗感染治疗欠敏感患者的致病病原体方面均有较高的应用价值【2 3-2 51。本研究结果也提示，NGS不仅对革兰阴性菌和革兰阳性菌的诊断率高于传统病原学检测方法，在真菌和不典型病原菌方面的诊断率也明显高于传统病原学检测综上所述，肿瘤放化疗患者易发生呼吸道及血流感染，病原菌以革兰阴性菌为主，多重耐药菌感染率也较高。NGS对于病原菌的判断较传统病原学检测具有突出的优势。利益冲突所有作者均声明不存在利益冲突参考文献【1彭敏，马丽娟，孙志伟，等.宫颈癌术后同步放化疗患者医院感染炎性因子与T淋巴细胞亚群研究J.中华医院感染学杂志,2 0 19,2 9(19):30 2 2-30 2 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9-14)（责任编辑：邸美仙）