基于网络药理学探究丁苯酞联合阿替普酶治疗急性脑缺血的作用机制.pdf

中国药理学与毒理学杂志2023年9月第37卷增刊1Chin J Pharmacol Toxicol，Vol 37，Suppl 1，Sep 2023内蒙古 呼和浩特 010010）摘要：目的 探索山沉香总木脂素（SPL）抗脑缺血再灌注损伤（CIRI）的作用机制并进行体外验证。方法 CNKI、NCBI Pubmed 数据库收集 SPL 活性成分，SwissTargetPrediction 预测活性成分靶点；Gene Cards、Drugbank等数据库收集CIRI疾病相关靶点。Cytoscape 3.9.1 筛选关键靶点、建立“SPL活性成分-关键靶点”网络。对关键靶点进行GO分析KEGG富集分析，Cytoscape 3.9.1软件构建“SPL活性成分-关键靶点-信号通路”网络。体外检测各实验组细胞存活率、LDH、氧化应激相关指标水平、ROS、炎症因子、通路中相关蛋白的相对表达水平。结果 SPL活性成分开环异落叶松树脂酚（SECO）、蛇菰宁、荜澄茄素等可通过 PI3K-Akt、FoxO等信号通路发挥抗CIRI的作用。体外研究显示，SECO可显著提升各组细胞存活率、降低LDH释放率、氧化应激反应、炎症反应、胱天蛋白酶3活性。显著升高Blc-2/BAX、p-PI3K/PI3K、p-Akt/Akt、p-FoxO-3a/FoxO-3a 的相对表达水平。结论SECO 或为 SPL 发挥抗 CIRI 作用的主要活性成分，其作用机制或与激活PI3K/AKT/FoxO信号通路有关。关键词：山沉香总木脂素；开环异落叶松树脂酚；脑缺血再灌注损伤；网络药理学基 金 项 目：内 蒙 古 自 治 区 自 然 科 学 基 金（2021MS08155）；内 蒙 古 医 科 大 学 面 上 项 目（YKD2021MS041）通讯作者：范 蕾，E-mail：W2-1-9基于网络药理学与实验验证探讨黄芩苷/栀子苷抗脑缺血后血管内皮功能障碍的作用及其机制张 行 行1，2，赵麓1，2，孙 欠 欠1，赵 安 东1，刘继平1，3，4，史永恒1，3，4，王 川1，3，4，王 斌1，3，4（1.陕西中医药大学，陕西 咸阳 712046；2.商洛市中医医院，陕西 商洛 726000；3.中医药脑健康产 业 陕 西 省 高 校 工 程 研 究 中 心，陕 西 咸 阳712046；4.陕西省中医药管理局中药药效机制与物质基础重点研究室，陕西 咸阳 712046）摘要：目的 通过网络药理学预测和实验验证结合，探讨黄芩苷（BC）/栀子苷（GD）能否通过抗脑缺血后血管内皮功能障碍发挥治疗作用。方法 收集BC、GD预测靶点和脑缺血后血管内皮功能障碍疾病靶点，取交集靶点进行蛋白质互作分析，并进行GO功能注释和KEGG通路富集分析。利用离体血管环与在体实验对网络药理结果进行验证。结果 共收集到 BC/GD 抗脑缺血后内皮功能障碍107 个靶基因，主要涉及 IL-17、TNF、NOD 样、MAPK 等信号通路，取 NOD 样信号通路中最具代表性 NLRP3 炎性小体进行实验验证，结果表明，BC/GD 呈部分内皮依赖性舒张脑基底血管环；MCAO大鼠神经功能评分、脑梗死体积明显降低，脑血流量增加，缺血侧皮层和脑基底动脉内皮病理状态改善，缺血侧皮层中NLRP3、胱天蛋白酶1和IL-1蛋白表达被抑制，脑基底动脉中iNOS蛋白表达下调、eNOS蛋白表达上调，皮层中ROS水平降低、NO水平升高，血清中IL-1、IL-18水平降低。结论 BC/GD可能通过下调NLRP3炎性小体的活化，抑制炎症反应，改善血管内皮功能，增加脑血流量，降低脑梗死体积，改善脑缺血损伤。关键词：网络药理学；脑缺血；黄芩苷；栀子苷；内皮障碍基 金 项 目：国 家 自 然 科 技 基 金 资 助 项 目（81473385）；中医药“双链融合”中青年科研创新团队（2022-SLRH-YQ-006）；陕西省中医药科研项目（2021-ZZ-JC023）；咸阳市重点研发科技项目（JBGS-001）通讯作者：王 斌，E-mail：W2-1-10基于网络药理学探究丁苯酞联合阿替普酶治疗急性脑缺血的作用机制张子女，李超群，刘月阳，杨静玉（沈阳药科大学生命科学与生物制药学院，辽宁沈阳 110016）摘要：目的 丁苯酞是芹菜籽中提取的左旋芹菜甲素为基础人工合成的药物，临床试验已证实其联合阿替普酶的有效性与安全性，但其作用机制仍不明确。运用网络药理学探究丁苯酞联合阿替普酶抗急性脑缺血的作用机制。方法 通过 PubChem 及 SwissTargetPrediction 数据库寻找丁苯酞作用靶点；利用 GeneCards、OMIM、TTD、DisGeNET 数据库获取脑缺血相关靶点；使用生物分子功能注释系统 STRING 对丁苯酞抗脑缺血靶点集合进行GO富集、KEGG通路富集分析和PPI网络分析，构建丁苯酞抗脑缺血的“药物-靶点-通路”网络。根据|log FC|1且 P值0.05筛选条件分 19中国药理学与毒理学杂志2023年9月第37卷增刊1Chin J Pharmacol Toxicol，Vol 37，Suppl 1,Sep 2023析GSE21136基因芯片获取阿替普酶作用靶点，最终得到丁苯酞联合阿替普酶治疗急性脑缺血的作用靶点。结果 丁苯酞可通过106个关键靶点作用于AGE-RAGE、HIF1等关键通路抗脑缺血；丁苯酞联合阿替普酶通过NLRP3、IL1B、VEGF等10个关键靶点作用于NLRP3-MMP9等通路治疗急性脑缺血。结论 网络药理学能够揭示丁苯酞联合阿替普酶治疗急性脑缺血的作用机制，为进一步的机制研究提供借鉴。关键词：丁苯酞；溶栓药物；联合给药；潜在靶点基金项目：国家自然科学基金（82074056）通讯作者：杨静玉，E-mail：yangjingyu2006 ；刘月阳，E-mail：W2-1-11基于网络药理学探讨清热类中药治疗缺血性脑病的物质基础和作用机制赵安东1，孙欠欠1，张嘉豪1，呼 田1，周雪薇1，王 斌1，2，3（1.陕西中医药大学，陕西 咸阳 712046；2.中医药脑健康产业陕西省高校工程研究中心，陕西 咸阳712046；3.陕西省中医药管理局中药药效机制与物质基础重点研究室，陕西 咸阳 712046）摘要：目的 基于信息定量统计方法和网络药理学探讨清热类中药抗缺血性脑病的活性成分以及作用机制。方法 在PubMed、CNKI、https：/ 获取成分-疾病靶点交集，Cytoscape 构建“药物-活性成分-靶点网络图”，DAVID进行GO和KEGG富集分析。结果 文献和数据库筛选后涉及处方149条，共有中药269味，单味清热类中药20味，用药频率排在前5的是赤芍、黄芩、黄连、地黄、栀子；网络药理学所得主要成分有-谷甾醇、汉黄芩素、小檗碱、柳杉酚、黄芩苷等，富集分析得到PI3K-AKT、Ca2+、cAMP、MAPK、Relaxin等信号通路。结论 清热类中药抗缺血性脑病的主要成分包括黄酮类、生物碱类、萜类、苯丙素类和挥发油类；其作用机制主要有抑制兴奋性氨基酸毒性、减轻炎症、抗氧化应激、抗神经细胞凋亡以及保护血脑屏障。关键词：缺血性脑病；清热类中药；网络药理学；活性成分；信号通路基金项目：中医药“双链融合”中青年科研创新团队（2022-SLRH-YQ-006）；陕西省中医药科研项目（2021-ZZ-JC023）；咸阳市重点研发科技项目（JBGS-001）通讯作者：王 斌，E-mail：W2-2 阿尔茨海默病W2-2-1基于大规模比较蛋白质组学的内表型网络揭示阿尔茨海默病的血管功能障碍特征蔡垂浦1，代 朝2，方坚松2（1.汕头大学工学院，广东 汕头 515000；2.广州中医药大学科技创新中心，广东 广州 510700）摘要：目的 基于大规模比较蛋白质组学的内表型网络识别特异性、敏感性、可靠性高的阿尔茨海默病（AD）蛋白标志物，揭示AD的血管功能障碍特征。方法 我们提出一种新颖的基于网络的框架，通过大规模比较蛋白质组学分析来识别五种AD病理的内表型特征。首先通过分析来自AD患者和转基因小鼠模型的23套蛋白质组学数据集，揭示了AD内表型的蛋白质组学景观。利用网络近邻法测量AD内表型模块与AD患者皮质、血清和脑脊液的整合蛋白质组学数据集中差异表达蛋白（DEP）的距离显著性，识别AD病理中不同内表型的潜在生物标志物。结果 通过整合基因型-脑组织表达RNA-seq数据、全基因组关联研究、单细胞转录组数据和文献证据，重点探讨了包含21个DEP的AD血管功能障碍内表型特征。APP/PS1和MCAO小鼠动物模型实验进一步验证了SEPT5、SNAP25和STXBP1可能作为AD血管功能障碍内表型的候选生物标志物。结论 本研究展示了一种有效的网络策略，用于从整合的蛋白质组学数据中推测新的AD标志物，以期揭示AD的不同内表型特征。关键词：网络药理学；内表型网络；阿尔茨海默病；蛋白质组学；生物标志物基 金 项 目：国 家 自 然 科 学 基 金 面 上 项 目（82074278）；广东省基础与应用基础研究基金自然科学基金面上项目（2023A1515012148）；汕头大学科研启动经费（NTF21034）作者简介：蔡垂浦，E-mail：通讯作者：方坚松，E-mail： 20