1、分子生物学概述分子生物学概述郑晓飞郑晓飞放射与辐射医学研究所放射与辐射医学研究所Overview of Molecular Biology定义定义:从分子水平研究作为生命活动主要物质基础的生物从分子水平研究作为生命活动主要物质基础的生物大分子结构与功能,从而阐明生命现象本质的科学。大分子结构与功能,从而阐明生命现象本质的科学。分子生物学分子生物学(molecularbiology)广义:广义:蛋白质及核酸等生物大分子的结构与功能研究都属于分蛋白质及核酸等生物大分子的结构与功能研究都属于分子生物学的范畴,也就是从分子水平阐明生命现象与生物学规子生物学的范畴,也就是从分子水平阐明生命现象与生物学规
2、律。如蛋白质的结构、运动和功能,酶的作用机理,膜蛋白的律。如蛋白质的结构、运动和功能,酶的作用机理,膜蛋白的结构功能,跨膜运输等。结构功能,跨膜运输等。狭义:狭义:侧重于核酸侧重于核酸(或基因或基因)的分子生物学,主要研究基因或的分子生物学,主要研究基因或DNA的复制、转录、表达和调控等过程,同时涉及与这些过程有关的复制、转录、表达和调控等过程,同时涉及与这些过程有关的蛋白质和酶的结构与功能研究。的蛋白质和酶的结构与功能研究。生物化学:生物化学:从化学角度研究生命现象,着重研究生物体内各种从化学角度研究生命现象,着重研究生物体内各种生物分子的结构、转变与新陈代谢。生物分子的结构、转变与新陈代谢
3、。分子生物学:分子生物学:着重阐明生命的本质,主要研究生物大分子核酸着重阐明生命的本质,主要研究生物大分子核酸与蛋白质的结构与功能、生命信息的传递和调控与蛋白质的结构与功能、生命信息的传递和调控。分子生物学与生物化学分子生物学与生物化学生物化学与分子生物学关系最为密切生物化学与分子生物学关系最为密切核酸的结构和功能,包括遗传信息的传递核酸的结构和功能,包括遗传信息的传递蛋白质蛋白质(包括酶包括酶)的结构和功能的结构和功能生物膜的结构和功能生物膜的结构和功能生物调控的分子基础生物调控的分子基础生物进化生物进化分子生物学重点研究领域分子生物学重点研究领域分子结构生物学分子结构生物学分子发育生物学分
4、子发育生物学分子神经生物学分子神经生物学分子育种学分子育种学分子肿瘤学分子肿瘤学分子细胞生物学分子细胞生物学分子免疫学分子免疫学分子病毒学分子病毒学分子生理学分子生理学分子药理学分子药理学分子诊断学分子诊断学分子考古学分子考古学分子数量遗传学分子数量遗传学分子生态学分子生态学分子进化学分子进化学.分子生物学相关学科分子生物学相关学科分子生物学已经渗透到生物学的所有领域分子生物学已经渗透到生物学的所有领域分子生物学分子生物学分子生物学发展简史分子生物学发展简史1865年达尔文年达尔文OntheOriginofSpecies:性状可遗传。:性状可遗传。1865年孟德尔发表年孟德尔发表植物杂交实验植
5、物杂交实验,首次阐述了生物界有规律的,首次阐述了生物界有规律的遗传现象。遗传现象。“遗传因子遗传因子”。1869年年Miescher首次从莱茵河鲑鱼精子中分离到首次从莱茵河鲑鱼精子中分离到DNA.1869FriedrichMiescher从被丢弃的外科绷带上的脓细胞分离出核从被丢弃的外科绷带上的脓细胞分离出核酸,初命名为核素酸,初命名为核素(nuclein)后发现是酸性的,重命名为核酸后发现是酸性的,重命名为核酸.1879年年Flemming发现了染色体发现了染色体.1902年年Sutton提出了染色体遗传学说并认为基因是染色体的一部分提出了染色体遗传学说并认为基因是染色体的一部分.拉马克,拉
6、马克,法国法国博物学家。博物学家。生物学生物学伟大的奠基伟大的奠基人之一,生物学一词是他发明的,最先提出人之一,生物学一词是他发明的,最先提出生物进化的学说,是进化论的倡导者和先驱。生物进化的学说,是进化论的倡导者和先驱。他还是一个分类学家,他还是一个分类学家,林奈林奈(Carlvonlinne17071778)的继承人。主要著作有的继承人。主要著作有法国法国全境植物志全境植物志、无脊椎动物的系统无脊椎动物的系统、动物学哲学动物学哲学等。等。拉马克学说拉马克学说:一个是:一个是用进废退用进废退;一个是;一个是获得性遗传获得性遗传。达尔文学说达尔文学说:天择说。天择说。分子生物学发展简史分子生物
7、学发展简史1869年年Miescher从被丢弃的外科绷带上的脓细胞分离出核酸,初命名为核从被丢弃的外科绷带上的脓细胞分离出核酸,初命名为核素素(nuclein)后发现是酸性的,重命名为核酸。后发现是酸性的,重命名为核酸。1879年弗莱明年弗莱明(WalterFlemming)发现染色体,并描述了细胞分裂过程中染发现染色体,并描述了细胞分裂过程中染色体的行为。色体的行为。1888Waldeyer创造染色体创造染色体(Chromosome)一词。一词。1900年孟德尔的成果被重新发现。年孟德尔的成果被重新发现。24岁的瑞士医生 FriedrichMiescher分子生物学发展简史分子生物学发展简史
8、1902年萨顿年萨顿(WalterSutton)发现染色体是成对的,并携带遗传信息。发现染色体是成对的,并携带遗传信息。1909年年丹丹麦麦生生物物学学家家WilhelmJohannsen(18571927)创创造造“基基因因”(gene)一词,用来表达一个可遗传的因子。)一词,用来表达一个可遗传的因子。1911年摩尔根年摩尔根(ThomasHuntMorgan)提出基因学说,阐释基因在提出基因学说,阐释基因在染色体上的分布,以及繁殖过程中染色体重组形成独特新个体过程。染色体上的分布,以及繁殖过程中染色体重组形成独特新个体过程。分子生物学发展简史分子生物学发展简史1911年荷兰植物学家遗传学家
9、年荷兰植物学家遗传学家H.DeVries(1848-1935)根据月见草的遗根据月见草的遗传试验结果传试验结果,发表突变学说发表突变学说,认为生物的进化起因于突变认为生物的进化起因于突变(mutation)。1912年英国布喇格父子建立了年英国布喇格父子建立了X射线晶体学,成功地测定了一些复杂射线晶体学,成功地测定了一些复杂的分子以及蛋白质的结构。的分子以及蛋白质的结构。1913年斯特提万特年斯特提万特(AlfredHenrySturtevant)绘制出第一张线式基因图谱。绘制出第一张线式基因图谱。分子生物学发展简史分子生物学发展简史1927年年H.J.Muller测定了果蝇中的自发突变率,并
10、证明突变可被测定了果蝇中的自发突变率,并证明突变可被X线线诱导;诱导;C.Auerbach、J.M.Robson及及F.Oehlkers分别于分别于1941、1943先后独立观察到某些化学物质亦能诱导突变,但是突变本质为何仍不先后独立观察到某些化学物质亦能诱导突变,但是突变本质为何仍不清楚。清楚。1928年格里菲斯年格里菲斯(FrederickGriffith)报道了两株肺炎球菌有毒株报道了两株肺炎球菌有毒株(S)注射小鼠可致死注射小鼠可致死,而无毒株而无毒株(R)不致死小鼠。将热处理杀死的有毒株和不致死小鼠。将热处理杀死的有毒株和不经处理的无毒株分别注射不经处理的无毒株分别注射,不致死小鼠不
11、致死小鼠;但一起注射则导致小鼠死亡。但一起注射则导致小鼠死亡。死去的毒性菌株如何将致死因子传到无毒株上死去的毒性菌株如何将致死因子传到无毒株上?格里菲斯格里菲斯发现了一种发现了一种可以在细菌之间转移的遗传分子可以在细菌之间转移的遗传分子。分子生物学发展简史分子生物学发展简史1929年列文年列文(PhoebusLevene)提出提出DNA化学成分和基本结构。化学成分和基本结构。1931年麦克林托克(年麦克林托克(McClintock)指导)指导她的女博士生克莱顿(她的女博士生克莱顿(Creighton,B)证实重组是由交换引起的。证实重组是由交换引起的。分子生物学发展简史分子生物学发展简史194
12、1年年Beadle和和Tatum“一基因一基因一酶学说一酶学说”在链孢霉中被证明在链孢霉中被证明,使使遗传学与生物化学之间的关系得以阐明。遗传学与生物化学之间的关系得以阐明。The One Gene-One Enzyme Theory分子生物学发展简史分子生物学发展简史1943年年OswaldAvery等在用了约等在用了约76升的细菌后终于得到了不含其他升的细菌后终于得到了不含其他物质的纯化物质的纯化DNA,并证明只有并证明只有DNA在转化中起作用。在转化中起作用。1944年,三名科学家:年,三名科学家:OswaldT.Avery,ColinMacLeod与与MaclynMcCarty联名发表
13、联名发表了一篇划时代的论文,他们通过一系列用肺炎病毒进行的实验,推导出了一个与长久以来了一篇划时代的论文,他们通过一系列用肺炎病毒进行的实验,推导出了一个与长久以来的假说相悖的结论:的假说相悖的结论:DNA,而非蛋白质,是遗传信息的物质载体!,而非蛋白质,是遗传信息的物质载体!AveryOT,MacLeodCM,McCartyM(1944)Studiesofthechemicalnatureofthesubstanceinducingtransformationofpneumococcaltypes.Inductionoftransformationbyadesoxyribonucleicac
14、idfractionisolatedfromPneumococcusTypeIII.JExpMed79:137158分子生物学发展简史分子生物学发展简史1944年麦克林托克(年麦克林托克(19021992)在玉米中发现并提出了)在玉米中发现并提出了“可移动基因学可移动基因学说说”转座子。转座子。n n19831983年度诺贝尔生理学医学奖。年度诺贝尔生理学医学奖。年度诺贝尔生理学医学奖。年度诺贝尔生理学医学奖。真核生物中的转座因子颇为广泛,如玉米色斑的产生,果蝇复眼颜色的变异真核生物中的转座因子颇为广泛,如玉米色斑的产生,果蝇复眼颜色的变异等现象都与转座因子的移动有关。转座的效应是多种多样的。
15、诸如引发基因等现象都与转座因子的移动有关。转座的效应是多种多样的。诸如引发基因突变;或造成碱基的缺失或重组;或导致启动或关闭其他基因等。而这些均突变;或造成碱基的缺失或重组;或导致启动或关闭其他基因等。而这些均与个体发育、进化和个体的抗药性的变化等相关。与个体发育、进化和个体的抗药性的变化等相关。分子生物学发展简史分子生物学发展简史1948年鲍林年鲍林(LinusPauling)提出蛋白质为螺旋形的理论。提出蛋白质为螺旋形的理论。1949年年E.Chargaff定定则则的的提提出出,A=TG=C(AT)(GC)的比值因生物来源不同而不同。的比值因生物来源不同而不同。1951年富兰克林年富兰克林
16、(RosalindFranklin)拍摄到了核酸的拍摄到了核酸的X射线衍射照片。射线衍射照片。分子生物学发展简史分子生物学发展简史1952年年AlfredHershey和和MarthaChase利用病毒证实,传递遗传信利用病毒证实,传递遗传信息的是息的是DNA而不是蛋白质。而不是蛋白质。1952 Alfred Hershey&Martha Chase 用放射性磷和硫标记噬菌体,分别感染不同的细菌菌落,追踪放射性的位置.结果放射性硫(即蛋白质)留在细菌外,放射性磷(即DNA)则进入细菌里.而且新产生的噬菌体含有放射性磷,这些结果有力的证明了DNA是遗传物质。基因基因则是遗传的基本单位,它是位于链
17、特定位置的一段序列,携带有形成特定蛋白的信息。分子生物学发展简史分子生物学发展简史1953年年Linus Pauling(1901-1994)(莱莱纳纳斯斯.鲍鲍林林博博士士)提提出出著著名名的的DNA三三螺螺旋旋模模型型。Pauling是是有有史史以以来来唯唯一一两两次次独独自自获获得得诺诺贝贝尔尔奖奖的的科科学学家家。1954化化学学奖奖,1962和和平平奖奖。他他是是20世世纪纪最最重重要要的的化化学学家家之之一一。他他描描述述了了化化学学键键的的本本质质,并并对对阐阐明明蛋蛋白白质质结结构构作作出出划划时时代代的的贡贡献献。他他既既是是一一位位声声名名卓卓著著的的科科学学家家又又是是一
18、一位位献献身身和和平平事事业业的的活活动动家家。他他的的科学发现和为中止战争而作出的努力将对全人类产生深远的影响。科学发现和为中止战争而作出的努力将对全人类产生深远的影响。分子生物学发展简史分子生物学发展简史1953年年J.Watson(1928)&F.H.C.Crick(1916)提出)提出DNA双螺双螺旋模型,旋模型,AT,GC碱基按碱基按Chargaff规律配对,规律配对,DNA中储存的信息中储存的信息可精确复制,提出中心法则。可精确复制,提出中心法则。DNA双螺旋结构的建立,标志着分子生双螺旋结构的建立,标志着分子生物学的诞生,对以后分子生物学发展具有极其重要的指导作用。奠定物学的诞生
19、,对以后分子生物学发展具有极其重要的指导作用。奠定了分子生物学的理论基础,开创了分子生物学时代。了分子生物学的理论基础,开创了分子生物学时代。ZAB1962年Watson、Crick与Wilkins共享诺贝尔生理或医学奖分子生物学发展简史分子生物学发展简史1956年年JoeHinTjio和和AlbertLevan确定人类共有确定人类共有23对染色体。对染色体。分子生物学发展简史分子生物学发展简史1956A.Kornberg(1918)分分离离出出E.coli DNAPolymeraseI并并在在DNA模模板板指指导导下下,利利用用4dNTPs合合成成了了DNA,获获得得1959年年度度诺贝尔医
20、学或生理学奖。诺贝尔医学或生理学奖。分子生物学发展简史分子生物学发展简史1957年年FrancisCrick发表发表论蛋白质合成论蛋白质合成的演讲,提出的演讲,提出DNA制造蛋白质的概念。制造蛋白质的概念。1958M.Meselson(1930)&Stahl证明了证明了DNA半保留复制。半保留复制。分子生物学发展简史分子生物学发展简史1958年年Crick提出中心法则。提出中心法则。Genes Dev.2007,21:1190-1203分子生物学发展简史分子生物学发展简史1960年年SydneyBrenner,FrancisCrick,FrancoisJacob和和JaqueMonod发现信使
21、发现信使RNA(mRNA)。1961Yanofsky&Brener提出三联体设想提出三联体设想:4364三联体三联体(triplet),三个碱基编码一个氨基酸。,三个碱基编码一个氨基酸。1961年年Jacob和和Monod提出在分子水平上特定基因被激活或抑制的提出在分子水平上特定基因被激活或抑制的机制。操纵子的概念,解释了原核基因表达的调控。机制。操纵子的概念,解释了原核基因表达的调控。分子生物学发展简史分子生物学发展简史Jacob Monod 1965年获得诺贝尔生理或医学奖分子生物学发展简史分子生物学发展简史1961年年Marmur&Doty发现发现DNA复性复性(renaturation
22、,annealing),确认了核,确认了核酸杂交反应的特异性和可行性。酸杂交反应的特异性和可行性。分子生物学发展简史分子生物学发展简史1962年年W.Arber提出限制性核酸酶提出限制性核酸酶(R.E.)存在的第一个证据,导致存在的第一个证据,导致1970H.O.Smith(1931)纯化了第一个)纯化了第一个DNAR.E.可在特定位点切割可在特定位点切割DNA。科学。科学家已从不同的细菌中分离出家已从不同的细菌中分离出3000多种限制性核酸内切酶,通常识别多种限制性核酸内切酶,通常识别48个碱个碱基。基。1978H.O.Smith,W.Arber,D.Nathans因为发现限制酶因为发现限制
23、酶并用于分子生物学领域而获诺贝尔奖。并用于分子生物学领域而获诺贝尔奖。分子生物学发展简史分子生物学发展简史1963M.W.Nirenberg(美(美1927)&H.Matthai(德)(德)破译了遗传密码破译了遗传密码:在在无细胞系统无细胞系统(cell-freesystem)加入人工合成的多核苷酸,指导合成了一定序加入人工合成的多核苷酸,指导合成了一定序列的多肽链,充分证明了列的多肽链,充分证明了20种氨基酸的遗传密码。种氨基酸的遗传密码。分子生物学发展简史分子生物学发展简史1966年年Khorana证证明明了了Nirenberg提提出出的的遗遗传传密密码码,有有机机化化学学方方法法合合成成
24、多多聚聚脱脱氧氧核核糖糖核核酸酸,以以其其为为模模板板在在DNAPolI催催化化下下合合成成DNA链链;再再以以DNA为为模模板板合合成成RNA。蛋蛋白白质质的的分分子子生生物物合合成成,特别是与其密不可分的特别是与其密不可分的RNA合成,经历了漫长的发展历程。合成,经历了漫长的发展历程。rRNA:蛋白质的合成场所蛋白质的合成场所,占总占总RNA的的85%RNAtRNA转移氨基酸转移氨基酸10%mRNA编码多肽编码多肽4%snRNA协助拼接反应协助拼接反应1%分子生物学发展简史分子生物学发展简史1967年年Gellent发现发现DNA连接酶用来连接连接酶用来连接DNA片段。片段。DNAliga
25、se是基因拼接或基因工程必不可缺的工具酶。是基因拼接或基因工程必不可缺的工具酶。1970年年Temin&Boltimore发现反转录酶。提出以发现反转录酶。提出以RNA为模板为模板合成合成cDNA,使中心法则更为完全,导致,使中心法则更为完全,导致cDNA文库构建。为钓文库构建。为钓取特定的蛋白编码片段提供了不可或缺的手段。取特定的蛋白编码片段提供了不可或缺的手段。1975年获诺贝尔生理或医学奖年获诺贝尔生理或医学奖分子生物学发展简史分子生物学发展简史1972年年H.Boyer,S.Cohen,P.Berg及其同事发展了克隆技术。及其同事发展了克隆技术。1972PaulBerg&Herbert
26、Boyer第一次实现了用两个第一次实现了用两个DNA分分子建立重组子建立重组DNA分子,随后几年分子,随后几年Boyer通过将构建的重组质粒通过将构建的重组质粒转化细菌而构建了第一个重组微生物。接着陆续构建了青蛙核转化细菌而构建了第一个重组微生物。接着陆续构建了青蛙核糖体糖体RNA的的重组菌。重组菌。1977 Boyer1977 Boyer参与建立第一家基因工程公司参与建立第一家基因工程公司Genetech,Genetech,将生长抑将生长抑素(素(somatostatinsomatostatin)基因导入细菌,首次在人以外的生物中产)基因导入细菌,首次在人以外的生物中产生人类蛋白。生人类蛋白
27、。19921992克隆人胰岛素基因产物上市,成为第一个克隆人胰岛素基因产物上市,成为第一个DNADNA重组药物。重组药物。1972年,Boyer获得第一个重组DNA分子1972-BergEcoRI recognition sites phage DNAEcoRI cuts DNA into fragmentsSticky endSV40 DNAThe two fragments stick together by base pairingDNA ligaseRecombinant DNA分子生物学发展简史分子生物学发展简史1974年美国发表年美国发表Belmont报告,确立科研中进行人体实验的
28、政报告,确立科研中进行人体实验的政策。策。1975年年Mary-ClaireKing和和AllanC.Wilson发现,人类和猩猩发现,人类和猩猩的基因相似度达到的基因相似度达到99%。1975年年GeorgesKohler和和CesarMilstein开发出生产单克隆开发出生产单克隆抗体的技术。抗体的技术。杰尼杰尼科勒科勒米尔斯坦米尔斯坦1984年获诺贝尔生理或医学奖年获诺贝尔生理或医学奖分子生物学发展简史分子生物学发展简史1975F.Sanger&Barrell及及Maxam&W.Gilbert发展了快速发展了快速DNA测序方法。前者为双脱氧终止法,后者为化学法。测序方法。前者为双脱氧终止
29、法,后者为化学法。伯格伯格 Berg桑格桑格 Sanger吉尔伯特吉尔伯特 GilbertDNA重组重组在细菌中表在细菌中表达胰岛素达胰岛素Sanger还由于测定了牛胰岛素的一级结构而获得还由于测定了牛胰岛素的一级结构而获得1958年诺贝尔化学奖。年诺贝尔化学奖。1984年获诺贝尔化学奖年获诺贝尔化学奖分子生物学发展简史分子生物学发展简史1978年年DavidBotstein开创核酸限制性片段长度多态性分析技开创核酸限制性片段长度多态性分析技术,用于标志不同个体间的基因差别。术,用于标志不同个体间的基因差别。1978年美国开始借助基因技术用大肠杆菌批量生产人类胰岛素。年美国开始借助基因技术用大
30、肠杆菌批量生产人类胰岛素。1981年年Palmiter&Brinster研制出转基因小鼠;研制出转基因小鼠;Spradling&Rubin研制出转基因果蝇。研制出转基因果蝇。分子生物学发展简史分子生物学发展简史1982年年GeneBank数据库建立。数据库建立。1985年年KaryMullis等发明了聚合酶链反应等发明了聚合酶链反应(PCR)方法。方法。1995年获得诺贝尔化学奖 分子生物学发展简史分子生物学发展简史1984年年AlecJeffreys发明了基因指纹技术,可以用人的头发、发明了基因指纹技术,可以用人的头发、血液和精液等来鉴定身份。血液和精液等来鉴定身份。1984年关于人类基因组
31、测序的第一次公开讨论开始。年关于人类基因组测序的第一次公开讨论开始。1986年年LeroyHood开发自动测序仪。开发自动测序仪。1988年人类基因组组织年人类基因组组织(HUGO)成立。成立。1989年年Altman因因Ribozyme研究获诺贝尔化学奖。研究获诺贝尔化学奖。分子生物学发展简史分子生物学发展简史1990年美国正式启动人类基因组计划。随后,德国、日本、英年美国正式启动人类基因组计划。随后,德国、日本、英国、法国和中国也相继加入该计划。国、法国和中国也相继加入该计划。1991年年CraigVenter开发出新的测序技术。开发出新的测序技术。第1 代测序技术荧光标记的Sanger
32、法第2 代测序技术循环阵列合成测序法 SangerSanger法测序法测序 2001年第一个人类全基因组图谱花费年第一个人类全基因组图谱花费30亿美元亿美元第第2 2 代测序技术工作流程代测序技术工作流程Illumina Solexa、ABI SOLiD,ABI 3730 xl、Roche 454等多种测序仪器等多种测序仪器 美国美国454 Life Sciences 新技术测序新技术测序目前人类基因组测序费用低于目前人类基因组测序费用低于5000美元美元目标是目标是100美元以下美元以下微乳液微乳液PCR扩增扩增焦磷酸测序焦磷酸测序焦磷酸测序焦磷酸测序Illumina Solexa测序测序桥
33、式桥式PCR扩增扩增瞬时测序新技术瞬时测序新技术 对单个聚合酶进行成像的系统对单个聚合酶进行成像的系统康奈尔大学(康奈尔大学(CornellUniversity)研究生研究生SteveTurner和和JonasKorlach24个碱基个碱基/每秒的测序速度每秒的测序速度测序片段长度达到测序片段长度达到4000个碱基个碱基Eid,J.etal.Real-timeDNAsequencingfromsinglepolymerasemolecules.Science323,133138(2009).纳米测序技术纳米测序技术石墨烯石墨烯仅一个原子厚度的仅一个原子厚度的非晶体碳复合薄膜有可能制成非晶体碳复
34、合薄膜有可能制成人工膜用于人工膜用于DNA测序测序。基于纳电子技术的基于纳电子技术的DNA测序构想,即利用测序构想,即利用核苷酸上不同碱基的电子结构不同。核苷酸上不同碱基的电子结构不同。DNA分子是带电的大分子,在纵向电场的驱动分子是带电的大分子,在纵向电场的驱动下,将游动通过纳米孔。在此期间,同时下,将游动通过纳米孔。在此期间,同时测量纳米孔里横向的隧穿电流,不同核苷测量纳米孔里横向的隧穿电流,不同核苷酸的碱基电子结构不同,由此导致的横向酸的碱基电子结构不同,由此导致的横向电学特性也不同,据此可以判断出正在通电学特性也不同,据此可以判断出正在通过的是哪一种核苷酸。过的是哪一种核苷酸。石墨烯量
35、子晶体管可用作石墨烯量子晶体管可用作DNA感测器感测器PNAS October 15,2013;doi:10.1073/pnas.1308885110 伊利诺斯大学厄本那香槟分校研究人员开发一种新奇的方法:把石墨烯纳米伊利诺斯大学厄本那香槟分校研究人员开发一种新奇的方法:把石墨烯纳米带(带(GNR)夹在两层有纳米孔(内径约)夹在两层有纳米孔(内径约1纳米)的固体膜中间,再让纳米)的固体膜中间,再让DNA分分子穿过这种子穿过这种“三明治三明治”设备,以此来感知辨认所通过的设备,以此来感知辨认所通过的DNA碱基对。碱基对。测序技术发展路线测序技术发展路线分子生物学发展简史分子生物学发展简史1994
36、年美国一公司推出新的转基因西红柿罐头,其保质期比普通西红年美国一公司推出新的转基因西红柿罐头,其保质期比普通西红柿更长,成为人类历史上第一个转基因食品。柿更长,成为人类历史上第一个转基因食品。1995年年7美国人类基因组研究所绘出了流感嗜血杆菌的基因图谱;美国人类基因组研究所绘出了流感嗜血杆菌的基因图谱;3个个月后,科学家又绘制出了生殖器支原体的基因图谱。月后,科学家又绘制出了生殖器支原体的基因图谱。1996年酵母基因组测序完成。年酵母基因组测序完成。分子生物学发展简史分子生物学发展简史1997年苏格兰罗斯林研究所培育出世界上第一例体细胞克隆动物小羊年苏格兰罗斯林研究所培育出世界上第一例体细胞
37、克隆动物小羊“多利多利”。分子生物学发展简史分子生物学发展简史1997年大肠杆菌基因组测序完成。年大肠杆菌基因组测序完成。1997年参加人类基因组计划的科学家决定将研究成果无偿向全世界公年参加人类基因组计划的科学家决定将研究成果无偿向全世界公开。开。1998年结核性分枝杆菌以及梅毒螺旋体基因组测序完成。年结核性分枝杆菌以及梅毒螺旋体基因组测序完成。1998年线虫基因组测序完成。年线虫基因组测序完成。1998年日本科学家用一头成年牛的体细胞克隆出年日本科学家用一头成年牛的体细胞克隆出8头克隆牛犊。头克隆牛犊。1999年人类第年人类第22号染色体测序完成,这是第一个完成测序的人类染色号染色体测序完
38、成,这是第一个完成测序的人类染色体。体。2000年果蝇和拟南芥的基因组测序完成。年果蝇和拟南芥的基因组测序完成。2000年年CraigVenter和和Celera公司和人类基因组计划相继宣布,人类公司和人类基因组计划相继宣布,人类基因组草图完成。基因组草图完成。2001年年CraigVenter公布了绘制人类蛋白质组图谱的计划。公布了绘制人类蛋白质组图谱的计划。2002年水稻、小鼠、疟原虫和按蚊基因组测序完成。年水稻、小鼠、疟原虫和按蚊基因组测序完成。分子生物学发展简史分子生物学发展简史2003年人类基因组计划宣布,人类基因组序列图绘制成功,人类基因年人类基因组计划宣布,人类基因组序列图绘制成
39、功,人类基因组计划的所有目标全部实现。组计划的所有目标全部实现。20032003年年4 4月月1414日,中、美、日、德、法、英等日,中、美、日、德、法、英等6 6国科学家宣布人类基因组序列图绘国科学家宣布人类基因组序列图绘制成功,人类基因组计划的所有目标全部实现。已完成的序列图覆盖人类基因组制成功,人类基因组计划的所有目标全部实现。已完成的序列图覆盖人类基因组所含基因区域的所含基因区域的9999,精确率达到,精确率达到99.9999.99,这一进度比原计划提前两年多。,这一进度比原计划提前两年多。HumanGenomeProject,HGP 首先由R.Dulbecco(1914)在1985年
40、提出。用15年时间(19902005)30亿USD,测定32亿碱基对序列。2000年6月完成框架图,中国测定了3#染色体三千万碱基序列,精确度达99.99%,成为参与该计划的六大国之一。人类基因组计划人类基因组计划编码蛋白质基因数编码蛋白质基因数 人类基因组中有31000个蛋白质编码基因 Celera公司发现了约26000个基因 一个酵母细胞有6000个 一个苍蝇有13000个 一个蠕虫有18000个 一种植物有26000个编码基因 这些多细胞生物的基因数受基因搜索程序的限制,没有一个是高度精确的。Genes VIII估计人类基因组含有30,000-40,000条基因。ELISI计划计划人类基
41、因组计划的设计师们已认识到在对人类基因组进行测序的过程中,一方面致力于发展科技目标,另一方面必须强调这一新科学对个人、家庭和社会的影响。1990年设立了伦理、法律和社会影响研究项目(ELISI,Ethical,Legal,and Social Implications)得到美国能源部和国家人类基因组研究所人类基因组计划年度预算的3%5%,这是世界上最大的生物伦理学计划。关于ELISI的信息可从国家人类基因组研究所和能源部的网站获得:www.nhgri.gov 或www.ornl.gov/hgmias 科学家正朝着破解每个染色体遗传信息的目标而努力。2003年元旦法国基因测序中心科学家破译了人类
42、第14号染色体的遗传密码。2003 年4月美国华盛顿大学医学院的科研小组又破译了人类第7号染色体,这一成果有助于对囊状纤维化、遗传性耳聋和癌症等多种疾病的研究。2003 年美国科学家6月完成了人类Y染色体的测序工作。基因测序发现,Y染色体包含约78个基因。重要的是Y染色体的5000万个硷基对中,约有600万个处于回文结构(Palindrome)中,这种结构有修复基因的作用。2003年10月23日,英国威康信托桑格研究所的科学家经过8年的努力,破译了人类第6号染色体。继第22、21、20、14、7和Y染色体之后,6号染色体成为第7个被排序的人类染色体。在已发现的2190个基因结构中,有1557个
43、功能基因,约占人类基因总数的6%;另有633个处于休眠状态,属非功能基因。这些基因约半数以前从未描述过。6号染色体中包含了一些与免疫反应相关的基因,统称为“主要组织相容性复合体(MHC)”染色体遗传信息的破解染色体遗传信息的破解一号染色体基因测序完成一号染色体基因测序完成2006年年5月月17日:英国日:英国Nature杂志今天公布了杂志今天公布了1号号染色体的基因测序,这是破解人类遗传密码的染色体的基因测序,这是破解人类遗传密码的“生命生命之书之书”中最长也是最后的一章。确定了中最长也是最后的一章。确定了1号染色体中号染色体中3141个基因,这些基因发生缺陷与个基因,这些基因发生缺陷与350
44、种疾病有关种疾病有关,其中包括癌症、帕金森氏病、早老性痴呆、高胆固醇其中包括癌症、帕金森氏病、早老性痴呆、高胆固醇血症、弱智和噗啉症等。血症、弱智和噗啉症等。1号染色体中共有号染色体中共有2.23亿个碱亿个碱基,占人基因组中基,占人基因组中30亿个碱基对的亿个碱基对的8。人类有人类有22对常染色体,最大者为对常染色体,最大者为1号染色体,最小的是号染色体,最小的是22号染色体。另外还有号染色体。另外还有X或或Y染色体决定人的性别。公染色体决定人的性别。公布布1号染色体的基因测序结果为人类基因组计划号染色体的基因测序结果为人类基因组计划16年来年来的努力划上了句号。的努力划上了句号。人类基因组计
45、划人类基因组计划16年努力终成正果年努力终成正果ENCODE Project Writes Eulogy For Junk DNASCIENCE,2012,337:1159-1160Encyclopedia of DNA Elements(ENCODE),ENCODE网址(http:/www.encodeproject.org/)DNA元件百科全书计划元件百科全书计划(encode)encyclopediaofDNAelementsEncyclopediaofDNAElements(ENCODE)2003年启动,主要目的是建立人类基因组中生物功能关键性元素目录。美国国家基因组研究院NHGRI,
46、欧洲生物信息学研究所EMBL-EBI领导的研究,32个实验室中442名科学家,获得并分析超过15兆兆字节(15万亿字节)原始数据,花费约300年的计算机时间,对147个组织类型进行了分析,公布了一份详细的基因组功能图谱,包含有四百万基因的“开关”,以确定哪些能打开和关闭特定的基因,以及不同类型细胞之间的“开关”存在什么差异。这一重要的参考数据将有助于研究人员找到与人类疾病密切相关的区域。人类基因组计划HGP证明基因组中2%包含有基因,ENCODE表明基因组中剩余的80%的区域调控了蛋白何时和何地生成。ENCODE网址(http:/www.encodeproject.org/)分子生物学发展简史
47、分子生物学发展简史2006年美国科学家安德鲁年美国科学家安德鲁法尔和克雷格法尔和克雷格梅洛获诺贝尔生梅洛获诺贝尔生理或医学奖,以表彰他们发现了(核糖核酸)干扰理或医学奖,以表彰他们发现了(核糖核酸)干扰机制。机制。分子生物学发展简史分子生物学发展简史2007年美国科学家马里奥年美国科学家马里奥-卡佩奇和奥利弗卡佩奇和奥利弗-史密西斯、英史密西斯、英国科学家马丁国科学家马丁-埃文斯获诺贝尔生理学或医学奖,以表彰埃文斯获诺贝尔生理学或医学奖,以表彰他们在干细胞研究方面所作的贡献。他们在干细胞研究方面所作的贡献。2013年诺贝尔生理学或医学奖年诺贝尔生理学或医学奖美国科学家詹姆斯美国科学家詹姆斯罗思
48、曼、兰迪罗思曼、兰迪谢克曼以及德国科学家托马斯谢克曼以及德国科学家托马斯祖德霍夫,祖德霍夫,以表彰他们发现细胞的囊泡运输调控机制。以表彰他们发现细胞的囊泡运输调控机制。他们让经典物理学与迥然不同的量子物理学在化学研究中他们让经典物理学与迥然不同的量子物理学在化学研究中“并肩作战并肩作战”。以前,。以前,化学家必须二选其一。依靠用塑料棒和杆创建模型的经典物理学方法的优势在化学家必须二选其一。依靠用塑料棒和杆创建模型的经典物理学方法的优势在于计算简单且能为大分子建模,但其无法模拟化学反应。而如果化学家选择使于计算简单且能为大分子建模,但其无法模拟化学反应。而如果化学家选择使用量子物理学计算化学反应
49、过程,但巨大的计算量使得其只能应付小分子。为用量子物理学计算化学反应过程,但巨大的计算量使得其只能应付小分子。为此,在此,在20世纪世纪70年代,这三位科学家设计出这种多尺度模型,让传统的化学实年代,这三位科学家设计出这种多尺度模型,让传统的化学实验走上了信息化的快车道。验走上了信息化的快车道。2013年诺贝尔化学奖年诺贝尔化学奖“他们让经典物理学与迥然不同的量子物理学在化学研究中他们让经典物理学与迥然不同的量子物理学在化学研究中“并肩作战并肩作战”。以。以前,化学家必须二选其一。依靠用塑料棒和杆创建模型的经典物理学方法的优前,化学家必须二选其一。依靠用塑料棒和杆创建模型的经典物理学方法的优势
50、在于计算简单且能为大分子建模,但其无法模拟化学反应。而如果化学家选势在于计算简单且能为大分子建模,但其无法模拟化学反应。而如果化学家选择使用量子物理学计算化学反应过程,但巨大的计算量使得其只能应付小分子。择使用量子物理学计算化学反应过程,但巨大的计算量使得其只能应付小分子。为此,在为此,在20世纪世纪70年代,这三位科学家设计出这种多尺度模型,让传统的化学年代,这三位科学家设计出这种多尺度模型,让传统的化学实验走上了信息化的快车道。实验走上了信息化的快车道。”美国三位科学家美国三位科学家MartinKarplus,MichaelLevitt和和AriehWarshel获奖。获奖。获奖理由是获奖
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