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美国医学文献数据库2013.41大家好一、数据库概况一、数据库概况（一）编制单位：美国国立医学图书馆(NLM)（二）收录学科内容：主要收录生物医学、卫生保健以及生命科学相关文献。包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工艺学、基础研究；临床、护理、公共卫生、卫生政策发展或相关教育活动的内容。2000年起增加了生物、环境科学、海洋生物、植物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学方面的研究内容。2大家好一、数据库概况一、数据库概况（三）文献来源：70多个国家和地区；近5000种生物医学期刊美国卫生研究院文献选择技术评估委员会Literature Selection Technical Review Committee(LSTRC)评估挑选NLM和各专业协会的数据协作采集专家推荐。近年数据涉及37种语种，回溯至1949年的数据涉及60种语种。47%为美国本土出版文献，90%为英文文献，79%的文献有文摘。（以上由2009年7月数据库提供）3大家好二、二、MEDLINEMEDLINE的检索平台的检索平台广域网免费平台：广域网免费平台：NCBI-PubMedNCBI-PubMed（含非（含非MEDLINEMEDLINE数据）数据）4大家好二、二、MEDLINEMEDLINE的检索平台的检索平台校园网内可用平台（校园网内可用平台（IPIP控制）控制）Ovid SPOvid SPWeb of KnowledgeWeb of KnowledgeEBSCOEBSCOOCLC First SearchOCLC First Search5大家好校园网内可用平台的校园网内可用平台的MedlineMedline6大家好PubMedPubMed数据库数据库7大家好一、一、PubMedPubMed简介简介开发机构：开发机构：NCBINCBI（美国国立生物技术信息中心）（美国国立生物技术信息中心）任务任务:利用计算机信息处理技术，建立分子生物学、生物化利用计算机信息处理技术，建立分子生物学、生物化学、遗传学知识的自动存储和分析系统，并开展相关学、遗传学知识的自动存储和分析系统，并开展相关先进方法的研究。先进方法的研究。促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件的使用。的使用。促进全世界范围内生物技术信息收集的合作。促进全世界范围内生物技术信息收集的合作。8大家好NCBINCBI网站网站9大家好NCBINCBI提供的数据库提供的数据库检索大分子生物学数据检索大分子生物学数据获取获取GenBank,EMBLGenBank,EMBL等数据库的核酸序列；等数据库的核酸序列；获获取取Swiss-port,PIR,PRF,PDBSwiss-port,PIR,PRF,PDB等等蛋蛋白白质质序序列列，从核酸序列翻译到蛋白质的序列；从核酸序列翻译到蛋白质的序列；获获取取基基因因和和染染色色体体图图谱谱；蛋蛋白白质质三三维维结结构构数数据据及及大大分分子子模模式式（MMDBMMDB）等等其其他他生生物物信信息息数数据据库检索。库检索。PubMedPubMed等文献数据。等文献数据。10大家好（二）（二）PubMedPubMed的特点的特点广域网免费提供题录和文摘广域网免费提供题录和文摘提供与原文的网址链接提供与原文的网址链接(部分免费获取）部分免费获取）提供检索词智能转换匹配提供检索词智能转换匹配界面简洁，操作简便界面简洁，操作简便(须须IE7.0IE7.0以上版本以上版本)11大家好（三）（三）PubMedPubMed收录数据收录数据MEDLINE IndexedMEDLINE Indexed1966 to prensent 1966 to prensent 的的MEDLINEMEDLINE已标引数据，有已标引数据，有MeSHMeSH字字段和摘要，每条记录标有：段和摘要，每条记录标有：PubMed-indexed for MEDLINEPubMed-indexed for MEDLINE OldMEDLINEOldMEDLINE1949-19651949-1965年间的年间的MEDLINEMEDLINE数据，无数据，无MeSHMeSH字段和摘要，字段和摘要，每条记录标有：每条记录标有：PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966 12大家好（三）（三）PubMedPubMed收录数据收录数据MEDLINE InprocessMEDLINE Inprocess最新的最新的MEDLINEMEDLINE处理中数据，未标引，无处理中数据，未标引，无MeSHMeSH字段。字段。每条记录标有：每条记录标有：PubMed-in processPubMed-in process。Publisher-SuppliedPublisher-Supplied出版商提供的电子文献题录，每条记录标有出版商提供的电子文献题录，每条记录标有:PubMed-as supplied by publisher PubMed-as supplied by publisher，分为两类：，分为两类：MEDLINE MEDLINE 收录，逐步转为收录，逐步转为In Process,IndexedIn Process,Indexed状态。状态。Not MEDLINENot MEDLINE：PubMed PubMed 收录，收录，MEDLINEMEDLINE不收录，一不收录，一直标注直标注PubMed-as supplied by publisherPubMed-as supplied by publisher或或PubMedPubMed13大家好二、二、PubMedPubMed的检索功能的检索功能基本检索输入框基本检索输入框高级检索高级检索检索指南检索指南检索工具：检索工具：特定文献检索特定文献检索临床查询临床查询专题查询专题查询其他资源：其他资源：规范词数据库规范词数据库期刊数据库期刊数据库临床试验等临床试验等个人空间个人空间14大家好检检索索栏栏可可输输入入一一个个或或多多个个检检索索词词（系系统统默默认认空空格格为为ANDAND检索）检索）如：如：stroke thrombolysisstroke thrombolysis（中风与溶栓）（中风与溶栓）三、三、PubMed 基本检索规则基本检索规则15大家好检检索索栏栏可可输输入入布布尔尔逻逻辑辑运运算算式式：（运运算算符符须须大大写写）如如：asthma AND(therapy OR treatment)asthma AND(therapy OR treatment)字段限定符：字段限定符：，空格按词组匹配，空格按词组匹配试比较：试比较：stroke AND thrombolysisti stroke AND thrombolysisti stroke thrombolysisti stroke thrombolysisti stroketi AND thrombolysisti stroketi AND thrombolysisti stroketi thrombolysisti stroketi thrombolysisti三、三、PubMed 基本检索规则基本检索规则16大家好著者检索：姓全称在前，名首字母在后，著者检索：姓全称在前，名首字母在后，auau。如如:smith abau “paulsen e”au:smith abau “paulsen e”au思考题：中国学者的名字该如何转换呢？思考题：中国学者的名字该如何转换呢？如：如：闻玉梅闻玉梅 卢正宏卢正宏三、三、PubMed 基本检索规则基本检索规则17大家好刊名检索：全称或刊名检索：全称或MEDLINEMEDLINE认可的标准缩写认可的标准缩写,so,so如：如：Journal of investigative dermatologysoJournal of investigative dermatologyso J invest dermatolso J invest dermatolso三、三、PubMed 基本检索规则基本检索规则输入刊名检索发表在该刊上输入刊名检索发表在该刊上的文献（限定出处字段的文献（限定出处字段SO）18大家好PubMedPubMed记录字段说明记录字段说明文摘文摘第一著者单位地址第一著者单位地址出版商提供文献识别号出版商提供文献识别号著者群著者群版权说明版权说明参考评论文献参考评论文献合著者合著者文献参考评论文献参考评论定稿版定稿版校样版校样版输入日期输入日期输入完成日期输入完成日期电子出版日期电子出版日期19大家好电子出版日期电子出版日期文献出版日期文献出版日期数据加入数据加入PubMed日期日期文献勘误文献勘误参考文献勘误参考文献勘误全部著者姓名全部著者姓名全部调研者姓名全部调研者姓名作为文章主题的著者全称作为文章主题的著者全称文献相关注释文献相关注释基金编号基金编号基因符号基因符号期编号期编号资助调研者资助调研者资助调研单位资助调研单位国际标准期刊号国际标准期刊号美国立医学图书馆识别号美国立医学图书馆识别号期刊全称期刊全称20大家好最后修订日期最后修订日期规范词表词规范词表词规范词确立日期规范词确立日期系统组织的文摘系统组织的文摘版权拥有者版权拥有者题录提供机构的识别号题录提供机构的识别号病史相关与原始记录病史相关与原始记录其他关键词其他关键词提供其他关键词的机构提供其他关键词的机构数据提供者机构数据提供者机构文章总页数文章总页数出版商提供数据时间出版商提供数据时间期刊出版国期刊出版国数据库文献编号数据库文献编号21大家好作为主题词的个人姓名作为主题词的个人姓名出版状态出版状态文献类型文献类型出版模式（纸张或电子）出版模式（纸张或电子）参考文献数参考文献数已撤回的文献已撤回的文献酶或化学物质代码酶或化学物质代码正在撤消中的文章正在撤消中的文章初版文献初版文献修订和再版的文章修订和再版的文章子专题文档子专题文档太空署提供的数据太空署提供的数据二次文献数据库以及文章讨论的二次文献数据库以及文章讨论的分子序列访问号分子序列访问号原文来源原文来源引用了病例的文献内部处理代码引用了病例的文献内部处理代码标准期刊缩写标准期刊缩写文献标题文献标题翻译标题翻译标题更新文献更新文献文献正在更新文献正在更新期刊卷号期刊卷号22大家好三、三、PubMed PubMed 基本检索规则基本检索规则截词检索：截词检索：treat*treat*可检出：可检出：treat,treated,treatment.treat,treated,treatment.强迫短语检索：强迫短语检索：“”“”，不进行自动转换匹配和扩，不进行自动转换匹配和扩展检索展检索如：如：“acute low back pain”acute low back pain”“ang 1”“ang 1”（血管紧张素（血管紧张素1 1缩写）检出缩写）检出10851085篇篇比较：比较：ang 1 ang 1 检出检出99569956篇，误检多，其中有：篇，误检多，其中有：23大家好24大家好三、三、PubMed PubMed 基本检索规则基本检索规则自动转换匹配检索词：自动转换匹配检索词：对对常常用用医医学学名名词词自自动动在在规规范范词词索索引引（主主题题词词、副副主主题题词词、物物质质名名称称）中中转转换换、并并默默认认在在所所有有记记录录字段中匹配。字段中匹配。如如：liver liver cancer cancer liver liver neoplasmsneoplasmsMeSH MeSH TermsTerms OR OR(liverAll(liverAll Fields Fields AND AND neoplasmsAll neoplasmsAll Fields)Fields)OR OR liver liver neoplasmsAll neoplasmsAll Fields Fields OR OR(liverAll(liverAll Fields Fields AND AND cancerAll cancerAll Fields)Fields)OR OR liver cancerliver cancerAll FieldsAll Fields 25大家好结果显示页右侧结果显示页右侧Details显示系统自动匹配转换显示系统自动匹配转换的检索词的检索词26大家好四、PubMed 检索限制PubMed可以针对检索结果作进一步的限制27大家好Article types 文献类型限定 Text availability 全文、免费全文、摘要限定Publication dates 出版日期限定Species 研究对象人/动物限定Languages 语种限定Sex 性别限定Subjects 各主题领域限定Journal categories 各种专题子数据库限定Ages 年龄限定Search fields 字段限定28大家好五、PubMed 高级检索一个网页中集多种功能于一体其他检索资源其他检索资源检索历史检索历史检索式编制检索式编制检索词索引检索词索引基本检索基本检索29大家好Search BuilderSearch Builder（检索式编制）：（检索式编制）：检索框中只能输入检索词，不能输入检索式。检索框中只能输入检索词，不能输入检索式。多个字段检索要分多次输入。多个字段检索要分多次输入。Search HistorySearch History（检索历史）：（检索历史）：检索历史中显示历次检索式、时间和检出篇数。检索历史中显示历次检索式、时间和检出篇数。可组配检索式，如：可组配检索式，如：#1 OR#2#1 OR#2，#1 AND#1 AND childchild点击编号可对检索式进行删除、保存等操作。点击编号可对检索式进行删除、保存等操作。五、五、PubMed PubMed 高级检索高级检索30大家好六、六、PubMedPubMed其他资源其他资源1.Mesh Database1.Mesh Database（规范化医学主题词表）（规范化医学主题词表）功能：功能：确定规范化主题词确定规范化主题词查看主题词词义注释、树状结构表查看主题词词义注释、树状结构表选择副主题词、扩展下位主题词、指定主要主题词选择副主题词、扩展下位主题词、指定主要主题词进入途径：进入途径：MeSH DatabaseMeSH Database链接：链接：PubMedPubMed主页，主页，Advanced Advanced SearchSearch界面界面MeSHMeSH选项：基本检索框前选项：基本检索框前SearchSearch下拉菜单的下拉菜单的31大家好文章文章A A著者用词：著者用词：Liver cancerLiver cancer 规范主题词规范主题词 MeSHMeSH：Liver neoplasmsLiver neoplasms词表中：词表中：liver cancer See liver neoplasms （2）医学主题词表（）医学主题词表（MeSH）用规范词查找用规范词查找“肝肿瘤肝肿瘤”的文献的文献文章文章B B著者用词：著者用词：Liver tumorLiver tumor 规范主题词规范主题词 MeSHMeSH：Liver neoplasmsLiver neoplasms32大家好进入进入 MeSHMeSH33大家好MeSH MeSH 注释界面注释界面34大家好MeSHMeSH详细注释界面详细注释界面35大家好MeSH词检索例例1 1：检索：检索2009-20132009-2013年关于舌根癌治疗的文献。年关于舌根癌治疗的文献。课题分析：课题分析：舌根癌的不同表达形式（舌根癌的不同表达形式（OROR）：）：tongue base cancertongue base cancer、cancer/carcinoma/tumor of tongue basecancer/carcinoma/tumor of tongue base、cancer of cancer of the base of tonguethe base of tongue治疗的不同表达形式（治疗的不同表达形式（OROR）：therapy/treat/treatment,surgery,radiotherapytherapy/treat/treatment,surgery,radiotherapy两个概念之间：舌根癌两个概念之间：舌根癌 AND AND 治疗治疗36大家好输入检索词，输入检索词，查找规范词查找规范词未匹配到规范词未匹配到规范词改用上级概念改用上级概念“舌癌舌癌”匹配匹配37大家好输入自由词，输入自由词，查找规范词查找规范词规范词规范词同义词同义词副主题词副主题词副主题词副主题词规范词隶属关系树规范词隶属关系树规范词隶属关系树规范词隶属关系树38大家好选择副主题词选择副主题词建构检索语句建构检索语句限定检索主要主题词，只限定检索主要主题词，只查重点论述的文献查重点论述的文献39大家好输入舌根的自由词检索式，进行AND运算。40大家好初步结果，初步结果，未限定年份未限定年份41大家好设定的限制设定的限制42大家好自由词检索最新文献自由词检索最新文献输入输入(tongueti AND baseti AND(tongueti AND baseti AND(cancerti OR carcinomati OR(cancerti OR carcinomati OR tumorti)AND(therapy OR treat OR tumorti)AND(therapy OR treat OR surgery OR radiotherap*OR surgery OR radiotherap*OR rehabilitat*)rehabilitat*)加工中，无加工中，无MeSH词词43大家好合并两次检索结果合并两次检索结果44大家好文献归类功能文献归类功能Abstract格式提供全文格式提供全文链接、规范词等信息链接、规范词等信息排序方式选择排序方式选择免费全文链接免费全文链接点击标题显示点击标题显示文摘增强格式文摘增强格式45大家好文摘增强格式文摘增强格式相关论文相关论文MeSH词、物质名、词、物质名、文献类型等信息文献类型等信息LinkOut外部资源链接外部资源链接全文链接，我校订购的数据库可链全全文链接，我校订购的数据库可链全文，需在校园网内设免费代理文，需在校园网内设免费代理相关的网上免费医学指南信息相关的网上免费医学指南信息全文链接全文链接46大家好47大家好输出方式选择输出方式选择48大家好八八.输出方式选择（输出方式选择（send tosend to）FileFile：保存检索结果为文本文件：保存检索结果为文本文件Clipboard Clipboard 剪贴板，多次检索，可暂存每次检剪贴板，多次检索，可暂存每次检索需下载的记录，最后一起保存。索需下载的记录，最后一起保存。最多允许存最多允许存储储500500条，保留条，保留8 8小时。小时。Email:Email:通过邮件发送通过邮件发送CollectionsCollections：将检索结果存到：将检索结果存到My NCBIMy NCBI中中OrderOrder：全文传递服务，需帐号、收费。：全文传递服务，需帐号、收费。49大家好订阅最新结果订阅最新结果点击后点点击后点“XML”按钮按钮50大家好需需IE7.0以上版本以上版本51大家好定期点击链接，接收课定期点击链接，接收课题最新相关论文题最新相关论文52大家好MeSHMeSH词检索词检索例例2 2：用：用MeSHMeSH检索检索2003-092003-09年期间关于霉酚酸酯在肾衰竭年期间关于霉酚酸酯在肾衰竭治疗中疗效观察的文献。治疗中疗效观察的文献。课题分析：课题分析：匹配物质名称：匹配物质名称：mycophenolate mofetilmycophenolate mofetil匹配主题词：匹配主题词：renal failure,treatment effectrenal failure,treatment effect（ANDAND）匹配副主题词：匹配副主题词：drug therapy,surgery,therapy,rehabilitationdrug therapy,surgery,therapy,rehabilitation53大家好药物名称药物名称MeSHMeSH检索检索54大家好疾病概念疾病概念MeSH检索检索55大家好56大家好疗效观察疗效观察MeSH检索检索57大家好58大家好MeSHMeSH检索的优点检索的优点查全同义词查全同义词:如：如：renal/kidney insufficiency;renal/kidney insufficiency;tongue cancer/tumor tongue cancer/tumor查全子概念查全子概念:如：如：acute kidney injury;acute kidney injury;ATN;ATN;chronic kidney insufficiency;chronic kidney insufficiency;59大家好查全子概念：查全子概念：自动扩展检索下位词自动扩展检索下位词勾选后不扩展勾选后不扩展下位词下位词树树形形结结构构上位词上位词MeSH检索的优点检索的优点查全同义词查全同义词60大家好MeSHMeSH检索的优点检索的优点根据树形结构调整检索词根据树形结构调整检索词缩小：不扩展下位词，或选用某个下位词；缩小：不扩展下位词，或选用某个下位词；扩大：选用上位词，或选用多个同位词；扩大：选用上位词，或选用多个同位词；了解同一概念的同义词、近义词，供自由词检索参考了解同一概念的同义词、近义词，供自由词检索参考款目词：规范词所替代的款目词：规范词所替代的不同表达形式的自由词不同表达形式的自由词61大家好MeSHMeSH检索的优点检索的优点提高文献相关度提高文献相关度标有标有MeSHMeSH词的都是文章的主题，筛去非主题的文章词的都是文章的主题，筛去非主题的文章Major Topic HeadingsMajor Topic Headings（加权，重点论述的主题）（加权，重点论述的主题）带带*的是文献的是文献重点论述的主题重点论述的主题62大家好MeSHMeSH检索的缺陷检索的缺陷人工标引费时，最新论文还未标人工标引费时，最新论文还未标MeSHMeSH词（词（In ProcessIn Process），用），用MeSHMeSH会漏检。会漏检。MedlineMedline不收录的文献，不收录的文献，Supplied by Supplied by publisherpublisher的文献，不标的文献，不标MeSHMeSH词。词。新词、一些很专指的概念没有对应的规范词。新词、一些很专指的概念没有对应的规范词。如：如：SARSSARS（0303年词表中没有），舌根癌年词表中没有），舌根癌查上述类型的文献需结合自由词检索查上述类型的文献需结合自由词检索63大家好九、九、PubMedPubMed其他资源其他资源2.Journal in NCBI Database2.Journal in NCBI Database（期刊信息库）（期刊信息库）通过输入刊名全称或缩写、通过输入刊名全称或缩写、ISSNISSN号等浏览期刊出号等浏览期刊出版社等详细信息。版社等详细信息。提供期刊：提供期刊：在在PMCPMC中的免费全文链接中的免费全文链接在在NucleotideNucleotide，ProteinProtein，PubmedPubmed等库中的记录链接。等库中的记录链接。相关的其他期刊相关的其他期刊64大家好输入待检期刊名输入待检期刊名期刊详细信息期刊详细信息全文等链接全文等链接65大家好十、十、PMC(PubMed Central)PMC(PubMed Central)生命科学免费期刊资源中心生命科学免费期刊资源中心免费提供免费提供900900多种期刊的多种期刊的1010多万篇全文多万篇全文其中部分文献被其中部分文献被PubMedPubMed涵盖涵盖66大家好进入进入PubMed CentralPubMed Central下拉主页滚动条下拉主页滚动条至底至底67大家好PMCPMC首页进入高级检索首页进入高级检索68大家好查找肾衰竭的药物疗法查找肾衰竭的药物疗法2024/4/19 周五复旦大学图书馆文献检索教研室69全文链接69大家好 GoPubmedGoPubmed文献分析文献分析70大家好GoPubmedGoPubmedPubMedPubMed文献分析工具文献分析工具lGoPubMedGoPubMed是是德德国国TransinsightTransinsight公公司司和和德德国国德德累累斯斯顿顿大大学学合合作作开开发发，对对PubMedPubMed检检索索结结果果进进行行筛筛选、分析的工具。选、分析的工具。l智能搜索、交互式筛选找出重要论文。智能搜索、交互式筛选找出重要论文。71大家好为什么为什么GoPubMed有如此大的功能？有如此大的功能？包括生物医学包括生物医学所有概念及其所有概念及其语义关系语义关系GO 基因词库基因词库MeSH主题词表主题词表PRO 蛋白质词库蛋白质词库72大家好GoPubMedGoPubMed可以告诉我们可以告诉我们4 4WWWhatWhoWhere When73大家好74大家好自动显示备选主自动显示备选主题词题词鼠标移动至主题鼠标移动至主题词可显示注解、词可显示注解、同义词等同义词等75大家好统计顶尖作者76大家好案 例 分 析v H1N1流感的研究进展1.利用GoPubMed查找相关文献，并了解以下四个“W”：What What，WhoWho，WhereWhere，WhenWhen；2.了解涉及甲流病毒研究甲流病毒研究甲流病毒研究甲流病毒研究的文章；3.查找中国内地（不含省港澳）关于达菲达菲达菲达菲治疗甲流甲流甲流甲流influenza A virus H1N1influenza A virus H1N1的研究文章77大家好自动显示备选主题词自动显示备选主题词鼠标移动至主题词可显示鼠标移动至主题词可显示注解、同义词等注解、同义词等78大家好时间分析时间分析国家分析国家分析城市分析城市分析刊物分析刊物分析79大家好地区分布图地区分布图80大家好主题分析主题分析作者分析作者分析81大家好研究人员关系网研究人员关系网线条越多，线形越多，地位越重要82大家好课题发展趋势课题发展趋势83大家好高频词列表高频词列表按研究领域分类按研究领域分类What84大家好What 文献按研究领域分类文献按研究领域分类85大家好了解专家们的研究了解专家们的研究Who86大家好了解研究的地理分布了解研究的地理分布Where87大家好用稿期刊分析用稿期刊分析88大家好按时间分析按时间分析89大家好找寻最新文献，找寻最新文献，了解研究进展了解研究进展90大家好了解抗病毒药物应用于甲流了解抗病毒药物应用于甲流的情况的情况Antiviral Agents 382 91大家好相关的相关的Mesh词词链接到维基百科链接到维基百科摘要摘要期刊信息期刊信息92大家好查找中国内地使用达菲查找中国内地使用达菲治疗甲流的研究文章治疗甲流的研究文章点击知识点选择框+表示逻辑与AND-表示逻辑非NOT空白表示无限制自动同步生成检索式，点击“Find it”检索即可93大家好检索结果处理显示所有记录的摘要打开结果输出菜单显示文献统计分析显示当前记录显示当前记录摘要摘要将当前记录加将当前记录加入剪贴板入剪贴板管理者模式管理者模式管理者模式管理者模式用户可以以管理者的角度对计算出来的相关概念进行评价。+表示高度相关表示高度相关表示高度相关表示高度相关o o表示相关性弱表示相关性弱表示相关性弱表示相关性弱-表示不相关表示不相关表示不相关表示不相关不正确不正确不正确不正确还可以进行概念检索评价的时候用鼠标点击即可评价的时候用鼠标点击即可从本记录中从本记录中计算出来的计算出来的相关概念相关概念94大家好检索结果处理显示文摘输出文件（Endnote）显示统计数据输出记录输出记录可以链接可以链接到全文到全文95大家好挑选文献并添加至剪贴板将记录从剪贴板中去除将记录从剪贴板中去除96大家好获取全文获取全文97大家好结束98大家好