医学科研与文献检索.ppt

单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,仇 晓 春,上海交通大学医学院信息资源中心,2012.10.26,太原,医学科研与文献检索,提 纲,医学科研与文献检索,医学信息资源的类型与利用,全文型、文摘型、事实,(,循证,),型,医学信息资源的评价,医学文献的管理,医学科研与文献的关系,涉及人体的医学研究必须遵从普遍接受的科学原则，应对科学文献和相关资料全面了解，并有充分的实验和动物试验（如有必要）的基础上进行。,-,世界医学协会赫尔辛基宣言,11/30,文献检索贯穿医学科研全过程,课题设计,选题、查新,科研实施,论文发表,关键技术,成果申报,医学科研与文献检索,科学性：,论文的灵魂与生命,科学的态度、科学的方法,创造性：,衡量和评价论文质量的重要标准,实用性,：理论联系实际，,解决疾病防治的实际问题,规范性：,温哥华格式,可读性：,术语规范、表达准确,医学科研论文的基本要求,把握科研课题的现状与动态，启发选 题灵感,评价课题的创新性、可行性、实用性,启发和充实自己的研究思路与方法,获得相关理论依据,收集循证研究原始材料,文献回顾的作用,医学文献检索与科研选题,Look for clues unexplained findings,controversies,Attend international meetings,Read the literature,including related fields Attend international meetings,医学文献的种类,Meta-Analysis,Systematic Review,Randomized Controlled Trial,Cohort studies,Case Control studies,Case Series/Case Reports,Animal research,全文型数据库,(,一次文献,),Elsevier,、,BMJ、EBSCO host、Springer,、,Wiley,、,BMC、PLoS,CHKD,、万方数据、维普,文摘型数据库,(,二次文献,),Medline(Pubmed,),、,Embase,、,Lilacs,、SCI,Sinomed,、,CBA,事实型数据库,(,三次文献,),Cochrane,、,Clinical,Evidence、EBMR,、,Uptodate,常用医学文献数据库的类型,Pubmed,PubMed,是美国国家医学图书馆,(NLM),下属的国家生物技术信息中心,(NCBI),开发的、基于,WWW,的医学数据库查询系统。,网址：,www.,pubmed.gov,www.,,www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed,PubMed,基本检索,自由词检索,renal stone,主题词检索,kidney calculi,布尔逻辑检索,and,or,not,字段限制检索,in Ti,.Ti,著者检索,刊名检索,日期或日期范围检索,截词检索,renal*,强制检索,“,singal,cell,”,拖曳网自然语言搜索引擎,智能信息资源整合系统,对于自然医学语汇中同义词、近义词学名与俗名的处理,例：,Cancer，Tumor *,Neoplasms,(,近义词),German Measles *Rubella (,同义词),Vitamin C *Ascorbic Acid(,学、俗名),Apoplexy *,Cerebrovascular,Disorders(,同义词),Deoxyribonucleic Acid *DNA (,繁、简称),非典 *严重急性呼吸道综合症,乙酰水杨酸，阿斯匹林,*,阿司匹林,MeSH,作用1：规范自由词,MeSH,作用2，扩展下位,词（范畴表）,等级关系,:,Diseases C,Neoplasms,C4,Neoplasms,by Site(NON,MeSH,)C4.588,Digestive System,Neoplasms,C4.588.274,Gastrointestinal,Neoplasms,C4.588.274.476,Intestinal,Neoplasms,.C4.588.274.476.411,Colonic,Neoplasms,C4.588.274.476.411.306,Colorectal,Neoplasms,C4.588.274.476.411.306.416,HereditaryNonpolyposis,.C4.588.274.476.411.306.416.250,C6.240.476,按照学科性质，词义范围的上下类属和派生关系，将字顺表中的主题词分别划分为15个大类，依次用,A-N,及,Z,代表。,代表疾病类,Diseases,肿瘤,消化系统疾病,检索限定选择,款目词,主题词树状结构,副主题词,Ovary cancer,例,:,卵巢癌放疗文献的主题词检索,主题词的转换与副主题词的选择,MeSH,树形结构表,检索策略修正,Ovarian,Neoplasms/radiographyMesh,检索结果与过滤,(Limit),文献过滤器,检索结果,高级检索,:,布尔逻辑运算,#22 and#18,例,:,环磷酰胺联合放射治疗卵巢癌,GoPubM,GoPubMed,统计分析功能具有对所有检索结果或单独对分类类目中的术语在,PubMed,中检索得到的文献进行的统计分析，包括对检索到文献从年代、主题、核心著者、核心期刊、地区分布可视化地图。,What,Who,Where,When,GoPubM,Induced Pluripotent Stem Cells (IPs cells),E,(,),Lilacs,（,lilacs.bvsalud.org/en/,）,中国生物医学文摘数据库,（,Sinomed,）,,BiosisPreview,简介,Biological,Abstracts,BA,美国,生物学文摘,创刊于,1926,年,是世界最主要生物学文摘期刊之一。,BIOSIS Previews(BP),是世界上最全面的,生命科学,研究参考文献数据库。它涵盖了传统生物学和生物医学领域的原始研究报告和综述。还包含了有关重大的生物学研究、医学研究发现和新生物体发现的主要期刊文献的参考文献。,BP,包括：,Biological Abstracts,BA,和,姐妹刊,Biological Abstracts/RRM,(Reports,Review,Meetings),实验室指南,(Protocols),SpringerP,是全球最大的经同行评议的在线实验室指南库，同时它也是全球引用量最高的在线实验室指南库。该数据库包含超过,18,000,条分子生物学及生物医学的可在线检索的实验室指南。,Springer Protocols,数据库收集大量原创、可靠、标准化的实验室指南，拥有,165,000,余页的内容，可供用户检索、阅览和下载，其杰出的实用性和省时性优势，让科研人员大大受益。,SpringerP,内容来自以下著名丛书：,Methods in Molecular Biology,分子生物学方法,Methods in Molecular Medicine,分子医学方法,Methods in Biotechnology,生物技术方法,Methods in Pharmacology and Toxicology,药理学与毒物学方法,Neuromethods,神经方法,Springer,P,TAYLOR&,FRANCIS,SPRINGER,WILEY,ELSEVIER,CABi,Annual,Reviews,LAWRENCE,ERLBAUM,SIAM,NATURE,PALGRAVE,Karger,THIEME,ACS;RSC,KLUWER,BLACKWELL,AIP;APS,IOP,IEEE CS,IEEE;ASCE;,ASME;PEP,AAAS,SPIE,MIT,CORNELL,(EUCLID),ROCKEFELLER,OUP,PROJECT,MUSE,BIG FIVE,Mediums,University Press,Societies,FASEB,SWETS,OViD,EBSCO,ProQuest,Databases,西文全文型数据库：,检索结果与全文库的链结,IPs,cellstitle,Publisher,Free,Use,Manuscript,Only those who can afford expensive subscriptions or licences have access,Result:,Author transfers copyright,or exclusive publishing rights,传统期刊的出版模式,Publisher,Everyone has access,All use is fair use,Result:,$,Author pays small amount of money,or rather,institution pays on authors behalf,Manuscript,开放存取期刊的出版,模式,OA Journal Successes:,PLoS,Biology,features works of exceptional significance in all areas of biological science,from molecules to ecosystems,including works at the interface with other disciplines,such as chemistry,medicine,and mathematics,Public Library of Science,impact factor:14.7,网上免费医学全文,,www.doaj.org,BioMed,Central(BMC),中文全文型检索工具,中国医院知识仓库,（,CHKD,）,万方全文期刊数据库,维普全文期刊数据库,本位词检索：,不包括下位词的检索主题词,循证医学与医学文献,有益处,可能有益处,利弊相当,可能无益处,未知有效性,可能无效或有害,循证文献,按资源内容分：,S,tudies、,S,yntheses、,S,ynopses、,S,ystems,Cochrane,系统评价：,Cochrane,系统评价是以某一具体临床问题（如疾病的治疗、诊断）为基础，系统、全面地收集全世界所有已发表或未发表的临床研究结果，采用临床流行病学严格评价文献的原则和方法，筛选出符合质量标准的文献，进行定性或定量合成（,Meta-analysis,），去粗取精，去伪存真，得出综合可靠的结论。,Cochrane,系统评价是对多个同类独立研究的结果（采用同一种设计、针对同一个问题所得到的研究结果）进行汇总和合并分析，以达到增大样本含量，减少了各种偏倚和随机误差，提高检验效能，得出真实可靠的结论。,Cochrane library,(,),Cochrane,图书馆由六个主数据库组成。,包括：,Cochrane,系统评价数据库,(CDSR),Cochrane,疗效评价数据库,(DARE),Cochrane,临床对照实验登记数据库,(CENTRAL),Cochrane,系统评价方法综述数据库,(CDMR),卫生技术评估信息数据库,(HTA),英国国家卫生服务系统经济评价数据库。,(NHS EED),(,),Cochrane library,Cochrane library,(,www.cochrane.org,),UpToDate,(,),DynaMed,MD Consult,(First Consult),电子病历与循证文献系统,医学文献资源的评价,（,SCI、F1000),2004,Cited References,2000,1998,2001,1993,2003,Times Cited,Related Records,2003,2004,1999,2002,1994,2004,Citing,从一篇高质量的文献出发,沿着科学研究的发展道路,Cited References,越查越旧,Times Cited,越查越新,Related Records,越查越深,2002,期刊影响因子,期刊影响因子,（,Impact Factor,IF,）,指期刊近两年的平均被引用率，最早是由美国情报学家,SCI,创始人尤金加菲尔德,(Eugene Garfield),博士在,1972,年提出来的。,IF=(C2+C3)/(A2+A3),以,1996,年,Science,杂志为例：,A2,1995,年出版的文献数,1037,（篇），,A3,1994,年出版的文献数,1054(,篇,),，,C2,1995,年出版的文献在,1996,年被引用的次数,24189(,次,),，,C3,1994,年出版的文献在,1996,年被引用的次数,25170(,次,),。,IF,23.605(,次篇,),。,Web of Science,检索,IPs Cells,Web of Science,检索,F1000:,医学科研中新的学术评价指标,包括两个数据库，“,Faculty of 1000 Biology,”,和“,Faculty of 1000 Medicine,”,F1000B,：,根据,1400,多位专家学者的建议，提供目前世界上最重要的生物学论文信息及研究趋势,F1000M,（,2006,年推出）：由来自全球的（包括美国哈佛大学和英国剑桥大学等著名学府）约,2500,名顶级医学专家组成顾问团，每日将最近,1,个月可能改变医学实践的极少数优秀论文,F1000,推荐等级与评分:,“推荐”,:,3,分，指论文本身专业性比较强，可能仅对某一学科或主题感兴趣的研究者有用；,“必须阅读”,:,6,分，是对一般读者均有益的论文,“杰出”,:,9,分，指里程碑性质的论文,两个以上推荐人推荐的论文，,F1000,因子是两个最高评分的均值加上所有评分之和除以,30,后得的商,F1000M,评价委员会,每一主题又划分为不同的部分，由,2,3,人负责，成员包括来自全球的,6,30,名研究人员或医生，成员必须在该领域发表过相当数量的论文，得到同行的尊重和认可，同时应兼顾不同国家、种族和资历。,目前共有来自全球近,2500,名领先的研究者和临床专家,组成评价委员会，涵盖了医学的各个专业。,F1000M,常用文献管理工具,Endnote,主要功能,在线搜索文献：直接从,网络搜索,相关文献并导入到,Endnote,的文献库内,并实现去重等功能,;,建立文献库和图片库：收藏，管理和搜索个人文献和图片、表格,;,定制文稿：直接在,Word,中格式化引文和图形，利用文稿模板直接书写合乎杂志社要求的文章,运用,Endnote,论文母板,选择模版，,EndNote,提供,187,种模版,在,Word,中应用,Endnote,查找待引用文献,引用文献格式转换,插入选定文献,查找图片,生成图片列表,使用偏好设置,导出文档中文献信息,去除,Endnote,标记,取消自动格式转换,编辑插入文献,插入备注,编辑资料库数据,帮助信息,跳至,Endnote,界面,让内容创造价值！,仇 晓 春,上海交通大学医学院,信息资源中心,Tel:[phone],Email:tsg2,