pubmed检索方法和技巧.ppt

单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,pubmed检索方法和技巧,主要内容,PubMed,概况,PubMed数据来源,PubMed,检索机制,PubMed,检索运算符,PubMed,检索方法,结果的显示、打印、保存,其他辅助功能,1.,PubMed,概况,创建机构：美国国家医学图书馆下设的美国生物技术信息中心,(NCBI),1997,年,6,月开始向全球开放,特色：具有收录范围广（免费）、内容全、检索途径多、检索体系完备等特点，部分文献还可在网上直接免费获得全文。,2.,PubMed,数据来源,MEDLINE,：,pubmed-indexed for medline,In Process Citations,：每天收录，尚未经规范处理的数据。,pubmed-in process,PublisherSupplied Citations,：由出版商提供的电子文献，每条记录标有,PubMed-as supplied by Publisher,。,3.PubMed,检索机制,自动转换匹配功能,(Automatic Term Mapping),Leukemia,leukaemiaAll Fields OR leukemiaMeSH Terms OR leukemiaAll Fields,对于输入的检索词，,PubMed,先按一定的词表顺序进行对照匹配和转换，再进行检索。词表匹配转换顺序是：,MeSH,表 期刊刊名表 短语表 作者索引,如果在以上,4,个表中都找不到相匹配的词，,PubMed,将把短语分开，以单词为单位，分别重复以上的过程，检索时各个词之间是,AND,逻辑关系。如果仍找不到相匹配的词，则用单个词在所有字段查找，各个词之间也是,AND,逻辑关系。,3.1,自动转换匹配功能,人重组三叶因子（,human recombinant trefoil factor,）,(humans,MeSH Terms,OR,humans,All Fields,OR,human,All Fields,),AND,recombinant,All Fields,AND,(trefoil factor,Supplementary Concept,OR,trefoil factor,All Fields,),4.PubMed,检索运算符,逻辑运算符,逻辑运算符,逻辑,“,与,”,运算,AND,：,检索式写成,A,and,B,，,表示文献中同时包含检索词,A,和检索词,B,的文献才是命中文献。,AIDS,and,therapy,逻辑,“,或,”,运算,OR,：,检索式写成,A,or,B,，,表示包含检索词,A,的文献或者包含检索词,B,的文献或者同时包含检索词,A,和,B,的文献为命中文献。,AIDS,or,Acquired Immunodeficiency Syndrome,逻辑,“,非,”,运算,NOT,：,检索式写成,A,not,B,，,表示包含检索词,A,同时不包含检索词,B,的文献为命中文献。,Hepatitis,not,Animal,IP,地址：,pubmed.gov,PubMed,网址,基本检索,高级检索,主题检索,临床咨询,临床实验,5.PubMed,检索方法,5.1,基本检索,5.2,高级检索,5.3,主题检索,5.4,临床咨询,5.1,基本检索,默认检索字段为主题、作者、期刊,关键词、词,(,词组,),或短语：,输入任意关键词：,liver cancer,、,Lung cancer,；,带有双引号,”,”,作为短语检索：,”,cancer therapy,”,；,带有连接号,”,-,”,作为一个词组检索（英文可以，中文不行）：,interleukin-6,。,限制检索字段：如,liver cancerti,作者：,Smith J,、,仅知道作者姓，则必须加上字段标识，如：,Smithau,2002,年以后的文献若文中有作者全称可用全称检索,如：,Joshua Lederberg,5.1,基本检索,期刊刊名：,可用期刊全称：,GENE THERAPYTA,；,可用期刊简称：,JAMATA,；,(,The Journal of the American Medical Association),复杂表达式：,liver cancer,AND,therapy,带有摘要文献的检索：,liver cancer,AND hasabstract,5.1,基本检索分析该检索课题，包含两个方面：,肝癌：,liver cancer,；,酒精：,alcohol,两个主题之间的逻辑关系是,AND,，即,liver cancer,AND,alcohol,基本检索举例：肝癌和酒精的关系,基本检索举例：肝癌和酒精的关系,输入：,liver cancer,AND,alcohol,“,肝癌和酒精的关系,”,的基本检索结果,5.2,高级检索,高级检索,5.2,高级检索,5.2,高级检索,分析该检索课题，包含两个方面：,作者为：马大龙（,ma dl,）；,作者单位为：,北京大学（,peking university,）。,高级检索举例：北京大学医学部马大龙教授发表的文献,高级检索举例：北京大学医学部马大龙教授发表的文献,输入：,ma dl,输入：,peking university,高级检索举例：北京大学医学部马大龙教授发表的文献,5.3,主题检索,根据,medline,数据主题标引的规范性，利用主题词进行的研究，对提高查全率、查准率会有相当的帮助。,点击,MeSH Database,打开主题检索界面,高级检索,主题检索,基本检索,5.3,主题检索,主题检索举例：,长春新碱,（,Vincristine,）,治疗白血病（,leukemia,）的文献,分析该检索课题，有,2,个概念：长春新碱（,Vincristine,）、白血病,（,leukemia,）：,对长春新碱来说是利用其治疗疾病，故其应组配副主题词,“,治疗应用（,therapeutic use,）,”,；,对白血病来说是利用药物来治疗，故其应组配副主题词,“,药物疗法（,drug therapy,）,”,。,同时这两个概念之间是,AND,的关系。,主题检索举例：,长春新碱,（,Vincristine,）治疗白血病（,leukemia,）的文献,第,1,步：检索长春新碱,/,治疗应用,主题检索举例：,长春新碱,（,Vincristine,）治疗白血病（,leukemia,）的文献,第,1,步：检索长春新碱,/,治疗应用,主题检索举例：,长春新碱,（,Vincristine,）治疗白血病（,leukemia,）的文献,第,1,步：检索长春新碱,/,治疗应用,副主题词,主题检索举例：,长春新碱,（,Vincristine,）治疗白血病（,leukemia,）的文献,第,1,步：检索长春新碱,/,治疗应用,主题检索举例：,长春新碱,（,Vincristine,）治疗白血病（,leukemia,）的文献,第,1,步：检索长春新碱,/,治疗应用,主题检索举例：,长春新碱,（,Vincristine,）治疗白血病（,leukemia,）的文献,第,2,步：检索白血病,/,药物疗法,主题检索举例：,长春新碱,（,Vincristine,）治疗白血病（,leukemia,）的文献,第,2,步：检索白血病,/,药物疗法,主题检索举例：,长春新碱,（,Vincristine,）治疗白血病（,leukemia,）的文献,第,2,步：检索白血病,/,药物疗法,主题检索举例：,长春新碱,（,Vincristine,）治疗白血病（,leukemia,）的文献,第,2,步：检索白血病,/,药物疗法,主题检索举例：,长春新碱,（,Vincristine,）治疗白血病（,leukemia,）的文献,5.4,临床咨询和系统评价,可以使用户方便快捷地检索到有关临床方面的文献，如临床疾病的诊断、治疗、病因和预后等；,也可以用它来检索临床实践过程中遇到的一些具体问题，如系统性综述、元分析、临床试验、循证医学、实践指导以及有关遗传学方面的问题等。,5.4,临床咨询和系统评价,临床咨询,系统评价,检索医学遗传学研究方面的文献,6.,结果的显示、打印、保存,显示,保存、打印,6.1,结果的显示,显示格式：系统提供的显示格式很多，一般较常用的有以下,4,种：,（,1,）,Summary,：为默认显示格式。显示的信息包括文献的标题、著者、出处、,PMID,、综述出版类型、非英文文献的原文语种等。,（,2,）,Abstract,：显示信息除了文献标题、著者、出处等基本信息外，还包括摘要信息，以便用户了解文献详细内容。,（,3,）,MEDLINE,：以,MEDLINE,数据库的记录格式来显示检索结果。字段内容主要包括,PMID,、题目、摘要、作者、作者地址、语种、出版类型、出处、,MeSH,、文献,ID,、出版状态等。,6.1,结果的显示,6.1,结果的显示,6.1,结果的显示,保存记录,在,“,send to,”,下拉菜单中选择,“,File,”,，可完成将记录保存为文件。,选择,“,E-mail,”,，则可将结果发送至邮箱。,在检索结果显示页面可将某一次检索的全部记录或标记记录保存；而,“,Clipboard,”,页面可用于保存一次或多次检索的结果记录。,6.2,检索结果的保存,6.2,检索结果的保存,6.2,检索结果的保存,6.2,检索结果的保存,7,其他辅助功能,7.1,检索策略的存储和调用,7.2,全文链接,7.3,相关文献链接,7.1,检索策略的存储和调用,使用,My NCBI(Cubby),首先要登记注册,保存检索策略（,save search,）,定期浏览新的检索结果（注册时设置，自动按照检索式定期重新检索出文章）,7.2,全文链接,-,摘要格式显示,7.2,全文链接,-,打开单篇详细页面,7.3,相关文献链接,7.3,相关文献链接,Estrogen Receptors,gene polymorphism,Cardiovascular disease,Ocular tuberculosis(副主题词：并发症),Blindness（副主题词：并发症）,检索有关“医院水净化管理”方面的总数文献,Review,Water purification,（检索时两个关键词水净化和医院管理）,检索练习,眼结核（,Ocular Tuberculosis,）引起失明（,Blindness,）的文献,年代限定,1999,2008,年,检索有关“医院水净化（,Water Purification,）管理”方面的,综述文献,Questions?,Thanks!,电话：,82801292-608,liucy,