光合细菌分类、鉴定及保存.ppt

单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,光合细菌分类、鉴定及保存,张德民,宁波大学生命科学与生物工程学院,光合细菌应用中存在的问题,光合细菌分类学进展,宁波大学在光合细菌方面的研究,第二届分子微生物生态研讨班,光合细菌应用中存在的问题,菌种不纯,菌种鉴定不准,实验环境因子复杂，实验数据缺乏统计学分析,应用效果评价困难,光合细菌分类学进展,宁波大学在光合细菌方面的研究,中国生态学会微生物生态专业委员会宁波大学培训基地,光合细菌分类鉴定研究进展,伯杰细菌鉴定手册,Bergey,s Manual of Determinative,Bacteriology,1923,年第,1,版,1974,年第,8,版,1994,年第,9,版,都停留在对光合细菌的形态生理描述上，所有的光合细菌都被单独放到红螺菌目,1,个目中,红螺菌目,红螺菌科,外硫红螺菌科,绿硫菌科,绿色丝状细菌,伯杰氏系统细菌学手册,近年的分子系统学研究表明，紫色非硫细菌的系统发育是多起源的，分散在变形菌门,和,两个纲的多个科中，与非光合细菌的系统发育混杂在一起。现在认为，光合器官的性质对种的鉴定还是重要的，但对较高分类阶元，如科、目等则没有太大意义。,伯杰氏系统细菌学手册,Bergeys,Manual,of Systematic Bacteriology,1989,年，第,1,版,2001,年，第,1,版,以后的国际分类学权威书籍中，光合细菌的分类采用了完全不同的分类系统。,产氧光合细菌 蓝细菌门,（产氧光养细菌）,光合细菌,绿曲挠菌门：绿曲挠菌纲,绿菌门,不产氧光合细菌 厚壁菌门：螺旋杆菌科,（不产氧光养细菌）,着色杆菌科,紫色硫细菌,变形菌门,外硫红螺科,（紫色细菌）好氧不产氧光养细菌,紫色非硫细菌,所有的紫色非硫细菌分属于变形菌门的,、,两个纲的,5,个目,8,个科中，共,21,个属：,红假单胞菌属（,Rhodopseudomonas,）：,沼泽红假单胞菌,（,Rps,.,palustris,）,荚膜红假单胞菌,（,Rps,.,capsulata,）,球形红假单胞菌,Rps,.,sphaeroides,）,胶质红假单胞菌,（,Rps,.,geletinosa,）,绿色红假单胞菌,（,Rps,.,viridis,）,嗜酸红假单胞菌,（,Rps,.,acidophila,）,粪红,假单胞菌,（,Rps,.,faecalis,）,Rps,.,Rhenobacensis,红长命菌属,（,Rubrivivax,）,红细菌属,(,Rhodobacter,),红芽生菌属,（,Rhodoblastus,）,芽生绿菌属,(,Blastochloris,),红螺菌属,(,Rhodospirillum,),深红红螺菌,(,Rsp,.,rubrum,),度光红螺菌,（,Rspphotometricum,）,黄褐红螺菌,（,Rsp,.,fulvum,）,莫氏红螺菌,（,Rsp,.,molischianum,）,中盐红螺菌,(,Rsp,.,mediosalina,),Phaeospirillum,（,褐螺菌属）,Roseospira,(,玫瑰螺菌属,),1999.3.,中国科学院微生物研究所博士论文：紫色非硫细菌资源分类学研究,.,2001.,第一章，光合细菌,.,东秀珠、蔡妙英主编。常见细菌鉴定手册。,2004.,第一章，光合细菌的培养,.,成永旭主编，饵料培养学。,2009.,杨素萍。微生物学报。,宁波大学在光合细菌方面的研究,中国科学院微生物菌种保藏中心的绝大多数光合细菌菌种,发表,2,个新种，有,4,个可能新种待发表,应用,DGGE,跟踪确定单菌落的纯培养,应用分子指纹技术标记重要光合细菌菌种,应用分子指纹技术检测养殖水体种光合细菌群落演替,光合细菌菌种质量及应用效果评价体系,环境细菌菌种资源库,养殖废水和河道废水处理菌剂开发,第二届分子微生物生态研讨班,中国生态学会微生物生态专业委员会宁波大学培训基地,第二届分子微生物生态研讨班,主要培训研讨内容：,原位杂交（,FISH,）,环境样品,DNA,提取及其杂质去除,定量,PCR,技术及其应用,变形菌纲,红螺菌目,（,Rhodospirillales,）,该目有,2,科,7,属。,红螺菌科（,Rhodospirillaceae,）,6,个属,醋酸杆菌科（,Acetobacteraceae,）,1,个属,红细菌目（,Rhodobacterales,）,有,1,科,4,属,红细菌科，（,Rhodobacteraceae,）,根瘤菌目（,Rhizobiales,）,有,3,科,7,属,慢生根瘤菌科（,Bradyrhizobiaceae,）,2,个属,生丝微菌科（,Hyphomicrobiaceae,）,3,个属,红游动菌科,（,Rhodobiaceae,）,2,个属,变形菌纲（,Betaproteobacteria,）,伯克霍尔德氏菌目（,Burkholderiales,）,1,科,丛毛单胞菌科,Comamonadaceae,2,个属,红环菌目（,Rhodocyclales,）,1,科,红环菌科,Rhodocyclaceae,变形菌纲,3,个目,6,个科,(1),红螺菌目,（,Rhodospirillales,）,该目有,2,科,7,属。,红螺菌科（,Rhodospirillaceae,）,红螺菌属（,Rhodospirillum,）,褐螺菌属,(,Phaeospirillum,),红螺细菌属（,Rhodospira,）,红弧菌属（,Rhodovibrio,）,玫瑰螺菌属（,Roseospira,）,红篓菌属（,Rhodocista,）,醋酸杆菌科（,Acetobacteraceae,）,只有,红球形菌属（,Rhodopila,）,1,个属。,（,2,）红细菌目（,Rhodobacterales,）,有,1,科（红细菌科，,Rhodobacteraceae,）,4,属：,红细菌属,(,Rhodobacter,),、,红海菌属（,Rhodothalassium,）、,小红卵菌属,(,Rhodovulum,),和最近才发现的,Rhodobaca,。,（,3,）,根瘤菌目（,Rhizobiales,）,有,3,科,7,属。,慢生根瘤菌科（,Bradyrhizobiaceae,）,有红假单胞菌属（,Rhodopseudomonas,）、,红芽生菌属（,Rhodoblastus2,个属。,生丝微菌科（,Hyphomicrobiaceae,）,有,芽生绿菌属,(,Blastochloris,),、,红微菌属（,Rhodomicrobium,）、,红菌属（,Rhodobium,）,3,个属。,红游动菌科,（,Rhodobiaceae,）,有,红游动菌属（,Rhodoplanes,）和,Roseospirillum,2,个属,。,2,变形菌纲（,Betaproteobacteria,）,（,1,）,伯克霍尔德氏菌目（,Burkholderiales,）,1,科（丛毛单胞菌科,Comamonadaceae,）,2,个属：红长命菌属（,Rubrivivax,）、,红育菌属（,Rhodoferax,）。,（,2,）,红环菌目（,Rhodocyclales,）,1,科（红环菌科,Rhodocyclaceae,）,红环菌属（,Rhodocyclus,）。,