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生命科学检索方法.ppt

1、LOGO,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,知识的一半,是知道到哪里去寻找它。,明日的文盲,不是不能阅读的人,而是缺乏检索能力的人。,-,美国文献家赫伯特,知识分成两类,一类是我们要掌握的学科知识,另一类是,要知道在哪儿可以找到有关知识的知识,。,-,英国,Samuel Johnson,生命科学文献的来源,图书,生命科学图书是对已发表的科研成果、研究手段、经验和某一子学科领域的论述和概括。主要包括阅览性图书(教科书、专著、文集等)和参考工具书(辞典、百科全书、年鉴、手册等),期刊,期刊是有统一名称、定期或不定期连续出版物的刊物的总称。期刊大

2、多是本领域专家、学者的最新研究成果,未经别人的加工整理,是第一手资料。期刊有多种类型,如学术杂志、大学学报、公报、回顾、文摘等。,会议和学位论文,其他,包括各种资料汇编、最新进展、报纸、网站等。,不同类型文献信息给我们提供不同帮助!,文献信息,思考,获得,文献题名、关键词、摘要,该文献在研究什么问题?,研究基本信息,作者信息,谁在进行该领域的研究?,研究背景,出版物信息,谁?什么时候?出版了该文献?,研究所属领域、影响力、出版时间,引文信息,引用了哪些文献?,研究基础和起源,被哪些文献引用?,研究发展趋势及谁在延续并从事该领域研究,引用了多少次?,研究价值和热度,被哪些领域的文献引用?,研究的

3、学科交叉趋势,文献全文,理论构建、研究过程、研究方法,到哪里找资料呢?-,1.宝山校区图书馆:,一楼:中文报刊阅览室;保存本阅览室,二楼:电子阅览室;中图法库,三楼:工具书阅览室,四楼:中文期刊(过刊)阅览室;过刊过报查询室;大学学报阅览室,五楼:外文阅览室;数字化教室,2.善于利用学院资料室,3.足不出户做学问电子资源,我们的纸质图书、期刊有哪些?,图书:,中图法分类,类别,中文图书(本),外文2005年后版图书(本),总数,2005年后版,Q14,生态学,216,164,Q2,细胞生物学,122,21,2,Q3,遗传学,226,24,3,Q4,生理学,86,10,0,Q5,生物化学,427

4、52,6,Q6,生物物理学,63,11,0,Q7,分子生物学,243,85,5,Q81,生物工程学、生物技术,165,58,2,Q-9,生物资源调查,10,1,0,Q91,古生物学,218,8,0,Q93,微生物学,254,43,4,Q94,植物学,917,133,2,Q95,动物学,473,49,2,Q96,昆虫学,168,19,0,Q98,人类学,183,37,7,期刊:共89种,与我校生命科学学院相关如下:,中图法分类,类别,中文期刊,外文期刊,Q,生物科学,7,Q1,普通生物学,26,1,Q3,遗传学,1,1,Q7,分子生物学,1,Q81,生物工程学、生物技术,5,Q91,古生物学,

5、7,Q93,微生物学,2,Q94,植物学,17,3,Q95,动物学,13,Q96,昆虫学,4,Q98,人类学,1,部分相关外文期刊Q 类,Theoretical and applied genetics:,理论与应用遗传学,Q3 我馆外文阅览室,Bryologist苔藓植物学家,Q94 我馆外文阅览室,Evolutionary Ecology进化生态学,Q1 我馆外文阅览室,Journal of Bryology苔藓杂志,Q94 我馆外文阅览室,Cell Calcium细胞钙,Q7 生命科学学院资料室,Ecological Monographs生态学论丛,Q1生命科学学院资料室,Ecology

6、生态学,Q1生命科学学院资料室,Annual Review of Biochemistry,生物化学年评,Q7 生命科学学院资料室,Plant Biotechnology Journal,植物生物技术杂志,Q8,生命科学学院资料室,Ecological Applications,生态应用,Q1 生命科学学院资料室,Biomacromolecules,生物大分子,Q62,生命科学学院资料室,BioScience,生物科学,Q,生命科学学院资料室,Biotechnology Progress,生物技术进展,Q7,生命科学学院资料室,Estonian Journal of Ecology,爱沙尼亚生

7、态学杂志,Q,生命科学学院资料室,AnnualReview of Cell and Developmental Biology,细胞与发育生物学年评,Q1 生命科学学院资料室,AnnualReview of Plant Biology,植物生物学年评,Q94生命科学学院资料室,Bioconjugate Chemistry,生物共轭化学,Q7 生命科学学院资料室,Bilolgy letters,生物学通信,生命科学学院资料室,Geobiology,地球生物学,Q 生命科学学院资料室,Frontiers in Ecology and the Environment,生态学与环境新领域,Q1 生命科

8、学学院资料室,Proceedings of the Royal Society B:Biological Sciences,英国皇家学会会志B辑:生物科学,Q,生命科学学院资料室,部分相关外文期刊R类,Planta Medica(Text in English),药用植物,R9 生命科学学院资料室,Journal of Biomedicine and biotechnology,生物医学与生物技术杂志,R3,生命科学学院资料室,Wilderness&Environmental Medicine,野外与环境医学,R 生命科学学院资料室,Journal of Bioactive and Compa

9、tible Polymers,生物活性与相容性聚合物杂志,TQ31,Journal of Food Biochemistry,食品生物化学杂志,TS2,Journal of Food Lipids,食物脂类杂志,TS2,Journal of the Energy Institute,能源学会志,TQ51,部分相关外文期刊-,TQ类,TS类,部分相关外文期刊S、N类,Landscape Ecology园林生态学,S6 我馆外文阅览室,Nature:自然界,N 我馆外文阅览室,相关核心期刊能否在我馆查阅到呢?-,中文核心期刊导航(中文核心期刊要目总览(2004年版)-北大),核心期刊:综合性生物类

10、核心期刊表(24),以下期刊维普、CNKI均有电子版,期刊名,索取号,期刊名,索取号,生态学报,X17/3(ShTXB),古生物学报,Q91/1(GShWX),生物化学与生物物理学报,Q/6(ShWHX),微生物学报,Q91/3(WShWX),遗传学报,Q1/5(YChXB),水生生物学报,Q1/8(ShShShW),中国生物化学与分子生物学报,Q1/7(ZhGShW),菌物系统改名为:菌物学报,Q1/1(JWXB),生物化学与生物物理进展,Q1/6(ShWHX),生物多样性,微生物学报,Q91/3(WShWX),生物工程进展改名中国生物工程杂志,Q81/4(ZhGShW)(Q1/18),生物

11、物理学报,Q1/16,实验生物学报,遗传,Q3/1(YCh),生命的化学:生物化学通讯,Q1/12(ShMDH),生物工程学报,Q1/13(ShWGCh),古脊椎动物学报,Q95/4(GJZhD),应用生态学报,X17/4(YYShT),微体古生物学报,Q91/2(WTGSh),生理学报,R3/2(ShLXB),生态学杂志,X17/2(ShTXZ),中国科学.C辑,生命科学,N1/46(ZhGKX),生物数学学报,Q/7(ShWShX),核心期刊:植物学类核心期刊表(10),以下期刊维普、CNKI均有电子版,期刊名,索取号,植物生理与分子生物学学报,Q94/4(ZhWShL),植物生理学通讯,

12、Q94/5(ZhWShL),云南植物研究,Q94/10(YNZhW),植物分类学报,Q94/1(ZhWFL),西北植物学报,Q94/9(XBZhW),植物学通报,Q94/14(ZhWXT),广西植物,Q94/8(GXZhW),热带亚热带植物学报,植物研究,Q94/6(ZhWYJ),武汉植物学研究,Q94/12(WHZhW),核心期刊:动物学/昆虫学类核心期刊表(9),以下期刊维普、CNKI均有电子版,期刊名,索取号,动物学报,Q95/3(DWXB),昆虫学报,Q96/2(KChXB),动物学研究,Q95/6(DWXY),动物学杂志,Q95/2(DWXZ),动物分类学报,Q95/1(DWFL),

13、人类学学报,Q98/1(RLXX),昆虫分类学报,Q96/4(KChFL),四川动物,Q95/13,兽类学报,Q95/8,核心期刊查询系统,Digital Dissertation,简称PQDD文摘库)收集有160万篇国外高校博硕士论文的文摘索引。,学科范围:,自然科学、社会科学,13万篇博硕士论文,Science Direct,(厦大),cell、cell等生命科学相关高水平期刊,可免费获取摘要!,Wiley InterScince,(厦大),InterScince包含了John Wiley的约600种全文学术期刊和Blackwell的880多种全文学术期刊,其中很多为国际权威学会会刊和优秀

14、期刊,被SCI和SSCI收录的核心期刊所占比例很高,读者可通过专线访问。,在2007年ISI期刊摘引报告中,有913种Wiley-Blackwell期刊被摘引,平均影响因子为1.86。在2006至2007年间,Wiley-Blackwell期刊的影响因子提升了8%。,可免费获取摘要!,SpringerLink,(厦大),Sciences、医学、Biochemistry,general、地球和环境科学、Cell Biology、生态、Biomedicine general,是重要的综合数据库之一,可免费获取摘要!,BIOSIS Previews(厦大),ISI提供,由美国生物科学信息服务社(BI

15、OSIS)出版,是世界上最大的关于生命科学的,文摘索引数据库,。,该库包括生物学文摘Biological-Abstracts所收录期刊以及Biological-Abstracts/RRM所收录的会议、报告、评论、图书、专论等多种文献。,学科覆盖:生物学、生物化学、生物技术、植物学、医学、药理学、动物学、农业、兽医学等领域。,其中的期刊论文来源于100多个国家的5000多种期刊。基于Web-of-Science平台的BIOSIS-Previews提供1969年以来的650多万篇文献,年更新54万个记录。数据每月更新。,Nature(厦大),英国著名杂志Nature是世界上最早的国际性科技期刊,自

16、从1869年创刊以来,始终如一地报道和评论全球科技领域里最重要的突破。,Nature网站涵盖的内容包括1997年6月到最新出版的Nature杂志,而且可以查阅其36种姊妹刊物。,全文均为PDF格式。,Science online,科学在线,www.scienceonline.org/,科学在线Science Online是由AAAS美国科学促进会出版的综合性电子出版物平台,,每周五出版,。,内容包括:,科学周刊,创建于1880年的综合性科学周刊,今日科学,科研成果和政策最新消息及相关报道,科学快讯,及时报道研究文章的网上预先出版服务,信号转导知识环境,有关细胞信号路径的构成与关系的数据库,可免

17、费获取摘要!,OA资源导航-基于,权威学术期刊,植物细胞;植物生理;自然科学会报:生物学;环境科学评论;美国冷泉港实验室期刊;会志:生物学;基因组研究;生物科学;基因与发展;国际生物多样性科学与管理杂志;核糖核酸;国际可持续发展与全球生态学杂志;蛋白质科学,其他期刊,苔藓学期刊;美国植物生物学家学会;ASA-CSSA-SSSA;生态学专论;生物学通讯;加拿大植物学杂志;生态与环境前沿;加拿大微生物学杂志;加拿大动物学杂志;生态学应用;生物化学与细胞生物学;环境工程学与环境科学杂志;美国生态学会简报;美国科学院期刊;应用地球科学;生态学;环境与历史 基因组;内毒素研究期刊;环境价值;美国生态学会

18、期刊;美国冷泉港实验室实验方案,NSTL(,国家科技文献资源网络服务系统,),出版社,登陆网址,用户名,密码,EDP Sciences出版社,nstl2009,swets2009,The MIT Press,麻省理工学院出版社,www.mitpressjournals.org登陆后点击“my online account”即可查看全文,nstl2009,swets2009,美国微生物学学会,www.journals.asm.org,cwg2009,trial2009,美国生理学会,www.physiology.org,cwg2009,trial2009,美国动物科学学会,jas.fass.or

19、g,cwg2009,trial2009,美国冷泉港实验室评论集,symposium.cshlp.org,cwg20091(从1到25),trial20091(从1到25),美国实验生物学学会联合会,www.fasebj.org,cwg2009,trial2009,美国家禽学会,ps.fass.org,japr.fass.org,cwg2009,trial2009,白细胞生物学会,www.jleukbio.org/,cwg2009,trial2009,加州大学出版社,cwg2009,trial2009,免费数据库,免费数据库名称,范围,DOAJ,收录3587 种期刊,1239种期刊全文免费,Hi

20、ghWire Press,收录1168多种期刊,部分全文免费,Free Medical Journals,提供460多种免费医学期刊全文,Socolar,提供6273种开放获取期刊,Openj-gate,提供3000多种开放期刊链接,部分全文免费,socolr开放资源检索数据库,1)常用需授权的全文数据库,综合性期刊,全文数据库,外文,Elsevier,Springer,Science online,博硕士论文、期刊全文数据库,Nature系列,Blackwell,Wiley InterScience,EBSCO,Cell Press,ProQuest,中文,维普,CNKI,万方学位论文,如何

21、获取检索到的文献的全文,2)FMIF&读秀,FMIF:,一站式原文传送服务,方便快捷。,FMIF,能保障,90%,的外刊原文传送,其中,30%,的文献通过原文自动推送系统即时获取,,40%,左右的外刊原文,8-24,小时传送,其余则在,48,小时内传送,。,对外文文献的题名、文摘字段提供,“参考中文译文”,功能,结合数十个专业词典,人工对刊名、关键词字段进行翻译,大大提高翻译质量。同时建立中文索引数据,提供,双语检索能力,,大大降低外刊利用难度,帮助检索者获取和理解外文文献,有效提高外刊利用效率。,FMIF期刊分布和文献分布,专 辑,核心期刊,SCI期刊,SSCI期刊,全部期刊,文献量,健康科

22、学,1179,1844,236,3438,339.93万篇,生命科学,965,1081,47,2553,231.00万篇,自然科学,和工程技术,人文科学,与社会科学,2156,2294,117,6509,531.72 万篇,798,179,564,2236,86.37万篇,读秀文献传递,2008 duxiu.All rights reserved,.,读秀的文献传递不同于图书馆所说的文献传递,读秀文献传递是通过机器自动进行,可以立即获取所需要的资料,读秀的多面搜索,检索任何词时,同时得到相关的人物、工具书、图书、期刊、报纸、会议论文、学位论文、网页、图片、视频、专利、标准等,多面搜索,免费数据

23、库:,Highwire、Biomed(BMC),PLos、DOAJ,OMIM:,人的孟德尔遗传网。一款公布在公众医学(PUBMED)上的资料库,支持在线搜索。主要内容是遗传和变异的基因的相关信息。,CSHL(Cold Spring Harbor Laboratory)学、协会专业期刊全文,搜索引擎,论坛,如何获取检索到的文献全文 3)开放获取资源,Highwire press,highwire.stanford.edu/cgi/search/,HighWire Press 是全球最大的提供免费全文的学术文献出版商,于1995年由美国斯坦福大学图书馆创立。,目前已收录电子期刊710多种,文章总数

24、已达230多万篇,其中超过77万篇文章可免费获得全文;这些数据仍在不断增加。,通过该界面还可以检索Medline收录的4500种期刊中的1200多万篇文章,可看到文摘题录。,部分全文可免费获取!,Biomed(BMC):生物医学中心,是一家独立的学术出版机构,致力于提供生物医学研究成果的开放获取。,目前共出版了 187 多种生物医学期刊(涵盖了生物学和医学的各个主要领域。,所有期刊都通过充分、严格的同行评审保持高水平,被,Citebase,、,Google,、,Google Scholar,、,OAIster,、,PubMed,、,PubMed Central,、,Scirus,、,SOCOL

25、AR,、,Zetoc,等检索系统广为收录,所以用户可以通过这些系统检索到。,Thomson Scientific(ISI)数据库收录了 BMC 的部分期刊,2008 年 5 月统计为 65 种,有可能还会增加。应该说这是 BMC 期刊质量的一个参考证明。,PLoS:公共科学图书馆,www.plos.org/,公共科学图书馆(Public Library of Science,简称PLoS)是一个由科学家和医生组成的非营利机构,致力于把世界上科学和医学的文献作为免费资源向公众开放。,DOAJ:开放存取期刊目录,www.doaj.org/,开放存取期刊目录 DOAJ(Directory of Op

26、en Access Journal)收录的均为学术性、研究性期刊,具有免费、全文、高质量的特点。,其质量源于所收录的期刊实行同行评审,或者有编辑作质量控制,故而对学术研究有很高的参考价值。,遵循创作共用约定(署名、保持一致),该目录及其收录期刊、论文可自由存取,任何人可以使用,不反对商业用途,目的也是为了改善学术期刊的可见性与可用性,增加学术文章的影响力。,Search Engine,Scirus,Scholar,从一个位置方便地搜索各种资源,查找报告、摘要及引用内容,通过您的图书馆或在 Web 上查找完整的论文,了解任何科研领域的重要论文,Google scholar高级搜索,社区及论坛:,

27、其他,如何获取检索到的文献的全文 4)原文传递,如何获取检索到的文献的全文 5)其他途径,Email author,同学、朋友帮忙,找图书馆员,遇到问题?耗费大量时间,想节省时间?找图书馆员,知识的另一类:,知道谁会告诉你,三.,如何了解课题研究背景?,引文数据库,学科信息门户,学协会及科研机构的网站及其出版物,各大数据库,如何了解课题研究背景,-,引文数据库,学科上的相关性,理论与方法:借鉴与利用,技术与手段:应用与发展,横向上的对应性,实验或方法:互相参照与借鉴,结果与讨论:比较与应用,纵向上的继承性,课题的基础与起源,发展与进步,反引:学术争鸣,文献的相互引证-学术研究之间的交流与联系:

28、引文之间分析-了解一个idea 的提出、形成、发展,科研好帮手,将过去、现在以至将来的相关文献信息连接起来;,-“越查越新”和“越查越旧”,将不同学科、不同领域的相关研究连接起来,,-“科学发展的生长点”和“知识创新”,研究人员由此可以发现许多过去不知道然而却非常重要的信息,,从而产生许多,新的创见与发现,。这也正是引文索引数据库中作为研究数据库的巨大价值所在。,引文索引 不仅仅提供资料信息,更重要的是提供研究的思路,这篇论文有没有被别人引用过?,这一理论有没有得到进一步的证实?,这项研究的最新进展和延伸?,这个方法有没有得到改进?,这个概念是如何提出来的?,对于某个问题后来有没有勘误和修正

29、说明?,这个理论或概念有没有应用到新的领域中去?,Citation Index,能够解决哪些问题?,Web of Science,(厦大),Web of Science 是全球最大、覆盖学科最多的综合性学术信息资源,提供了良好的引文分析功能,是非常强大的检索数据库之一。,包括自然科学、社会科学、艺术及人文科学等多学科领域具有高影响力的 10,000 多种期刊,以及包含有超过 120,000 个会议的国际会议录。,Web of Science 提供了被引参考文献检索、引证关系图和分析等强大的工具。,SCI,科学引文索引(Science Citation Index,简称SCI)是一种综合性的引文

30、检索工具,由美国科学技术信息研究所(Institute For Scientific Information,简称ISI)编制。是通过引文链检索有关文献,以及评价期刊质量的工具。,包括1997年以来SCI的全部数据,是我国科学界进行科学研究的重要数据库,也是进行科研成果评价的权威工具。,是针对科学期刊文献的多学科索引。它为跨 150 个自然科学学科的 6,650 多种主要期刊编制了全面索引,并包括从索引文章中收录的所有引用的参考文献。,例:ISI 引文分析,Title:,Soil biota and exotic plant invasion,Author(s):,Callaway RM,Th

31、elen GC,Rodriguez A,Holben WE,Source:,NATURE 427(6976):731-733 FEB 19 2004,-,Who?Where?What?,引用,文献,(Cited References),越查越旧,相关文献(Related Records),越查越深,引证文献(Times Cited),越查越新,ISI Web of Science,对使用General search 和advanced search 检索到的文献进行分析(CCC),对使用Cited reference search 检索到的文献引用的结果进行分析,Time cited(施引文献

32、对引用callaway 这篇文献的文献进行分析(对引用信息的分析):分析检索结果,可从以下几点进行结果分析:,作者、会议标题、国家/地区、,文献类型、机构名称、语种、,出版年、来源出版物、学科类别,以作者:callaway发表的文章引用callaway这篇文献的最多(16篇),同样的点击view record(查看记录)也可以查看详细的记录。,以作者分析:,以来源期刊:BIOLOGICAL INVASIONS杂志中发表的文章引用callaway这篇文献的最多(17篇),同样的点击view record 也可以查看详细的记录。,以来源期刊分析:,分析后会得到什么信息?,1.,Who:,谁引用

33、了callaway的论文的次数最多?从而确定谁在延续并从事该领域研究。,2.,Where:,什么机构最经常引用您感兴趣的研究论文?,When,:,引证文献主要发表什么时间?,-,被引用的时间趋势。,Type,:,引用了,callaway,这篇文章的文献主要以什么文献类型发表?,Language,:,引用,callaway,这篇文献的主要语种是什么?,Journal-source title:,Callaway,这篇文章经常被哪些杂志所引用?,-,发表论文的投稿方向,Subject category,:,Callaway,这篇文章被不同领域的研究论文引用的状况?了解该课题研究的学科交叉趋势,CS

34、CD:中国科学引文数据库,中国科学文献数据库服务系统(Science China)是国家科学数字图书馆(China Science Digital Library,简称CSDL)资助的项目,建设目标是建立中文科技期刊的基于web的科技文献文摘、引文、联合目录馆藏的科技知识服务体系,面向广大机构和个人用户提供,中文科技期刊文献资源,的有效发现和评价服务。,中国科学引文数据库(Chinese Science Citation Database,简称CSCD)创建于1989年,收录我国数学、物理、化学、天文学、地学、,生物学,、农林科学、医药卫生、工程技术、环境科学和管理科学等领域出版的中英文科技核

35、心期刊和优秀期刊千余种,目前已积累从 1989 年到现在的论文记录300万条,引文记录近1700万条。,?Where?What?,引文索引数据库:,为您提供研究的思路,2004,Cited References,2000,1998,2001,1993,2003,Times Cited,Related Records,2003,2004,1999,2002,1994,2004,Citing,从一篇高质量的文献出发,沿着科学研究的发展道路,Cited References,越查越旧,Times Cited,越查越新,Related Records,越查越深,“,科学研究人员不应消极地用资料充斥头脑

36、而应该寻找现有知识上的空档、不同作者报告中的差别、,自己观察到的现象与原先报告之间的矛盾、与有关课题相,似的地方以及自己在实际工作中发现的线索。”,-W.I.B.Beveridge,“the Art of Scientific Research”,陈 捷 译,1984,科学出版社,引文检索与科学研究的艺术,推荐3个学科信息门户:,1、资源环境学科信息门户,如何了解学科信息和研究背景 (2)学科信息门户:,Intute:网络资源发现门户,intute是英国七所大学合作构建的网络资源发现门户(RDN)整合了Altis、Artifact、BIOME、EEVL、GEsource、Humbul、PS

37、Igate、SOSIG八个非常有名的学科信息资源门户,分为科学技术、人文艺术、社会科学、健康与生命科学四个服务模块,提供由学科馆员选择和评价的高质量教育和研究方面的网络资源(英文)。,这是英国的一项免费为讲师、研究人员和学生们提供发现和获取高质量网络资源的国内服务,它以提供最高效的因特网资源来支持教育与科研活动。,3 如何了解学科信息和研究背景,(3)协会及科研机构的网站及其出版物,(4)各大数据库,厦大图书馆资源专用检索机,开放时间:周一至周五,8:30-12:00,14:30-18:00,开放地点:宝山图书馆五楼信息检索室,张敏,图书馆信息技术部,Email:,tsginfo,Tel:6700915/6702294-8311,谢谢聆听!,欢迎与我联系,

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