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生物统计学答案--第九章-两因素及多因素方差分析.doc

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第九章 两因素及多因素方差分析 双菊饮具有很好的治疗上呼吸道感染的成效,为便于饮用,制成泡袋剂。研究不同浸泡时间与不同的浸泡温度对浸泡效果的影响,设计了一个两因素穿插分组实验,实验结果(浸出率)见下表[52]: 浸泡温度 /℃ 浸泡时间/min 10 15 20 60 80 95 对以上结果做方差分析及Duncan检验。该设计已经能充分说明问题了吗?是否还有更能说明问题的设计方案? 答:无重复二因素方差分析程序及结果如下: options linesize=76 nodate; data hermed; do temp=1 to 3; do time=1 to 3; input effect @@; output; end; end; cards; run; proc anova; class temp time; model effect=temp time; means temp time/duncan alpha=0.05; run; The SAS System Analysis of Variance Procedure Class Level Information Class Levels Values TEMP 3 1 2 3 TIME 3 1 2 3 Number of observations in data set = 9 The SAS System Analysis of Variance Procedure Dependent Variable: EFFECT Sum of Mean Source DF Squares Square F Value Pr > F R-Square C.V. Root MSE EFFECT Mean Source DF Anova SS Mean Square F Value Pr > F The SAS System Analysis of Variance Procedure Duncan's Multiple Range Test for variable: EFFECT NOTE: This test controls the type I comparisonwise error rate, not the experimentwise error rate Number of Means 2 3 Means with the same letter are not significantly different. Duncan Grouping Mean N TEMP A 31.477 3 3 B 27.570 3 2 C 24.240 3 1 The SAS System Analysis of Variance Procedure Duncan's Multiple Range Test for variable: EFFECT NOTE: This test controls the type I comparisonwise error rate, not the experimentwise error rate Number of Means 2 3 Means with the same letter are not significantly different. Duncan Grouping Mean N TIME A 28.447 3 3 A A 28.440 3 2 A A 26.400 3 1 从方差分析结果可以得知,温度是极显著的影响因素,时间是不显著因素。在Duncan检验中,温度的三个水平之间差异是显著的。时间的三个水平间差异不显著。 本实验是二因素固定模型设计,如果设置重复,会得到两个因素之间的交互作用〔如果存在的话〕,其结果能更好地说明问题。 以上方差分析的结果可以归纳成下表: 变差来源 平方与 自由度 均方 F P 温度(temp) 78.720 288 9 2 39.360 144 4 0.006 6 时间(time) 8.350 488 9 2 4.175 244 4 0.205 8 误差 6.932 177 8 4 1.733 044 4 总与 94.002 955 6 8 研究浙江蜡梅大苗移栽技术,处理方式包括移栽后的不同覆盖方式与做床方法,统计每100株移栽苗的成活率,结果见下表[53]: 做床方法 精细作床 仅挖穴 覆盖方法 遮 阴 93% 85% 未遮阴 90% 81% 根据以往经历在覆盖方法及作床方法之间不存在交互作用,对上述结果做方差分析。请注意,这里的结果是百分数。 答:本例需对数据做反正弦变换,程序与结果如下: options linesize=76 nodate; data plum; do cover=1 to 2; do seedbed=1 to 2; input y @@; surrate=arsin(sqrt(y/100))*180/3.14159265; output; end; end; cards; 93 85 90 81 run; proc anova; class cover seedbed; model surrate=cover seedbed; run; The SAS System Analysis of Variance Procedure Class Level Information Class Levels Values COVER 2 1 2 SEEDBED 2 1 2 Number of observations in data set = 4 The SAS System Analysis of Variance Procedure Dependent Variable: SURRATE Sum of Mean Source DF Squares Square F Value Pr > F R-Square C.V. Root MSE SURRATE Mean Source DF Anova SS Mean Square F Value Pr > F 从结果可以看出,覆盖方式与做床方式都是极显著因素。以上结果可以归纳成下表: 变差来源 平方与 自由度 均方 F P 覆盖方法(cover) 9.451 551 2 1 9.451 551 2 0.003 9 做床方法(seedbed) 55.143 793 3 1 55.143 793 3 0.000 1 误 差 0.000 357 3 1 0.000 357 3 总 与 64.595 701 8 3 为了研究不同NaCl质量浓度对小麦愈伤组织生长的影响。 配制质量浓度分别为0、%、%与%的NaCl MS培养基,接种15天后,测定每块愈伤组织平均增重百分率,结果见下表[54]: 材料名称 NaCl质量浓度 /%/ H8706-34/% G8901/% 极早熟/% 中国春/% 0 对上述结果进展方差分析。作者已经给出四种实验材料都是盐敏感型小麦,但是不同的小麦品种必定对盐的抗性不同。也就是说,品种及盐浓度之间存在交互作用,更完善的实验应当怎样设计? 答:这是一个固定模型设计,程序不再给出,结果如下。 The SAS System Analysis of Variance Procedure Class Level Information Class Levels Values CONCEN 4 1 2 3 4 MATERIAL 4 1 2 3 4 Number of observations in data set = 16 The SAS System Analysis of Variance Procedure Dependent Variable: INCREASE Sum of Mean Source DF Squares Square F Value Pr > F R-Square C.V. Root MSE INCREASE Mean Source DF Anova SS Mean Square F Value Pr > F 方差分析结果指出,盐浓度是极显著的影响因素,不同基因型的愈伤组织是显著影响因素。根据以往的研究工作的经历,盐浓度及基因型之间可能存在交互作用,最理想的设计应当设置重复,从总平方与中别离出交互作用平方与,问题可以说明得更确切。以上结果可以归纳成下表。 变差来源 平方与 自由度 均方 F P 浓度间 8 374.158 7 3 2 791.386 2 0.000 2 品系间 2 037.749 4 3 679.249 8 0.019 6 误 差 1 101.604 6 9 122.400 5 总 与 11 513.512 7 15 为了研究植物的光合作用,设计了一个实验。将烟草的两个变种种植在田间,利用CO2-depletion技术检测单位叶面积捕获CO2的比率。实验共涉及两个因素:一个是变种,选用了两个变种;另一个是抽样时期,在整个生长季共进展40次田间抽样。这是一个无重复两因素实验设计,方差分析表如下[55]: 变差来源 平方与 自由度 均方 F 抽样时期 39 0.060 4 * 变 种 0.015 7 1 0.015 7 * 误 差 0.071 1 39 0.001 82 总 与 79 注:*P。 根据实验设计,该设计是一种什么模型?实验所涉及的两个因素属于哪一种类型的因素?为什么? 答:这是一个混合模型实验。变种是固定因素,抽样时期是随机因素。因为实验没有设置重复,在无重复的情况下,三种模型的检验统计量是一样的,不知作者为什么不考虑设置重复。两个变种是人为选定的,是固定因素。田间抽样是随机抽取的,是随机因素。 野生型C57BL/6及STAT-1-/-型小鼠胰岛,在移入四氧嘧啶糖尿病的BALB/c小鼠中之后的存活天数见下表[56]: 实验材料 养 生 处 理 未 处 理 IL-1ra* IL-1ra+CsA 野生型C57BL/6 6 11 11 11 12 12 13 13 13 14 14 14 15 15 17 10 14 12 14 14 15 15 16 21 STAT-1–/–型 11 12 13 13 13 10 14 10 12 14 17 17 23 注:*IL-1ra:interleukin-1 receptor antagonist〔白介素-1受体拮抗物〕。 **CsA:cyclosporine A〔环孢菌素A〕。 对上述结果进展方差分析,判断两种类型小鼠的胰岛存活天数差异是否显著?不同养生处理对移植的胰岛存活天数的影响是否显著?不同养生处理及不同型小鼠之间是否存在交互作用? 答:这是一个重复数不等的两因素固定模型实验,所用程序及计算结果如下。 options linesize=76 nodate; data mouse; infile 'e:\data\exr9-5e.dat'; do treat=1 to 3; do type=1 to 2; input n @@; do repetit=1 to n; input days @@; output; end; end; end; run; proc glm; class treat type; model days=treat type treat*type ; run; The SAS System General Linear Models Procedure Class Level Information Class Levels Values TREAT 3 1 2 3 TYPE 2 1 2 Number of observations in data set = 37 The SAS System General Linear Models Procedure Dependent Variable: DAYS Sum of Mean Source DF Squares Square F Value Pr > F R-Square C.V. Root MSE DAYS Mean Source DF Type I SS Mean Square F Value Pr > F Source DF Type III SS Mean Square F Value Pr > F 在方差分析表中我们选用I型可估函数,从F的显著性概率可以得出,不管是养生处理、小鼠类型还是两者的交互作用都是不显著因素。上述结果可以归纳成下表: 变差来源 平方与 自由度 均方 F P 处理间 26.515 169 6 2 13.257 584 8 0.223 3 类型间 3.219 122 7 1 3.219 122 7 0.540 9 处理×类型 40.392 992 1 2 20.196 496 1 0.107 5 误 差 261.061 904 8 31 8.421 351 8 总 与 331.189 189 2 36 野生型C57BL/6及STAT-1-/-型小鼠胰岛,在移入自发糖尿病的NOD#小鼠中之后的存活天数见下表[56]: 实验材料 养生处理 未处理 IL-1ra* CsA** IL-1ra+CsA 野生型C57BL/6 0 0 2 5 5 11 11 12 13 13 15 17 0 5 8 12 12 15 8 8 8 10 10 11 18 5 10 11 11 12 16 20 STAT-1–/–型 6 10 10 13 10 12 5 13 14 10 11 11 12 12 13 注:# NOD:nonobese diabetic〔非肥胖糖尿病〕。 * IL-1ra:interleukin-1 receptor antagonist〔白介素-1受体拮抗物〕。 ** CsA:cyclosporine A〔环孢菌素 A〕。 对上述结果进展方差分析,判断两种类型小鼠的胰岛存活天数差异是否显著?不同养生处理对移植的胰岛存活天数的影响是否显著?不同养生处理及不同型小鼠之间是否存在交互作用? 答:此题及第5题的程序根本一样,下面只给出计算的结果。 The SAS System General Linear Models Procedure Dependent Variable: DAYS Sum of Mean Source DF Squares Square F Value Pr > F R-Square C.V. Root MSE DAYS Mean Source DF Type I SS Mean Square F Value Pr > F Source DF Type III SS Mean Square F Value Pr > F 此题的两个主效应与它们的交互作用都是不显著因素。以上结果可以归纳成下表: 变差来源 平方与 自由度 均方 F P 处理间 67.988 010 8 3 22.662 670 3 0.337 0 类型间 8.041 025 6 1 8.041 025 6 0.543 2 处理×类型 5.716 910 9 3 1.905 637 0 0.965 6 误 差 833.488 095 2 39 21.371 489 6 总 与 915.234 042 6 46 一项音乐心理学研究,实验是这样设计的:为了防止熟悉的音乐环境,实验安排在两种非典型的音乐练习与演出环境中进展。一种环境是在剧场底层敞开的大厅中〔环境A〕,另一种是在办公室中〔环境B〕。要求实验参及者学习并回忆所学习的练习曲。学习与回忆包括在一样环境中〔AA,BB〕与不同环境中〔AB,BA〕,评判学习与回忆的得分,从而判断得分及环境之间的关系[57]。该实验是一个典型的两因素穿插分组实验设计,方差分析表如下: 变差来源 平方与 自由度 均方 F P 学习环境 1 回忆环境 1 学习环境×回忆环境 1 误差 6 总与 9 问:〔1〕本实验共有几次重复?为什么? 〔2〕本实验属于哪一种模型?为什么? 〔3〕本实验的两个因素中哪些因素是显著因素?在本实验中显著因素的意义是什么?你可以得到什么结论? 答:(1) 因为本实验共有4种条件组合,df误差=(组合1重复数-1)+(组合2重复数-1)+( 组合3重复数-1)+( 组合4重复数-1)=重复数-4=6。因此,重复数=6+4=10。 (2) 属固定模型。因为:①根据作者所用的检验统计量,②由①推断,环境的水平是人为选定的。 (3) 只有交互作用是显著的。说明音乐的学习是及环境的两种特定水平有关的。结论:音乐的学习属本例的两种特定环境依赖型记忆。 作者的结论是:音乐的学习属环境依赖型记忆。这样的表达不够严格,只有随机模型才能够得到这样的结论,固定模型只能说“音乐的学习属本例的两种特定环境依赖型记忆〞。 及上一实验类似,这次是记忆一段16小节的钢琴曲。在同一房间中放置两台钢琴,一台是平台式大钢琴〔环境A〕,一台是播音室钢琴〔环境B〕。参及者在一台钢琴上学习这段曲谱之后,在同一台钢琴上〔AA,BB〕或不同钢琴上〔AB,BA〕,回忆这段曲子。根据回忆的正确性获得评分[57]。 变差来源 平方与 自由度 均方 F P 学习环境 1 回忆环境 1 学习环境×回忆环境 1 误差 28 总与 31 问:〔1〕本实验共有几次重复?为什么? 〔2〕本实验及上一实验比拟有什么不同,可以改变结论的性质吗? 答:(1) 总的重复数为32次。 (2) 结论及上一实验结果类似,只能说不同钢琴的这一环境所产生的交互作用更显著。同样不能把这一结论推广到水平总体。 研究3~18岁安康个体尿中Adrenarche标记物的值。其中两性24小时尿样中DHEA*的平均含量**如下[58]: 年龄/a 性 别 男孩/〔mg ·d-1〕 女孩/〔mg ·d-1〕 3~4 5~6 7~8 9~10 11~12 13~14 15~16 17~18 注:* DHEA:Dehydroepiandrosterone〔脱氢表雄酮〕,是合成人体雌激素,雄激素,以及其他一些人体激素的最根本物质。 **该值已经过对数变换。 用两因素方差分析判断不同年龄组与不同性别的DHEA差异是否显著? 答:结果如下表: The SAS System Analysis of Variance Procedure Class Level Information Class Levels Values AGE 8 1 2 3 4 5 6 7 8 SEX 2 1 2 Number of observations in data set = 16 The SAS System Analysis of Variance Procedure Dependent Variable: DHEA Sum of Mean Source DF Squares Square F Value Pr > F R-Square C.V. Root MSE DHEA Mean Source DF Anova SS Mean Square F Value Pr > F 从计算结果可以得知,年龄是极显著因素,性别是不显著因素。以上结果可以归纳成下表。 变差来源 平方与 自由度 均方 F P 年龄间 4.846 543 75 7 0.692 363 39 0.000 1 性别间 0.056 406 25 1 0.056 406 25 0.113 9 误 差 0.121 043 75 7 0.017 291 96 总 与 5.023 993 75 15 嗜乳酸杆菌在体内处于一种酸性环境,一项关于嗜乳酸杆菌(Lactobacillus acidophilus) Ind-I在体外模拟环境中,在不同pH与不同时间的活菌数〔活菌数/mL〕变化情况如下表[59]: 时间/ h pH 2 ×109 ×109 ×108 ×108 ×108 ×108 ×104 ×104 4 ×109 ×108 ×109 ×109 ×107 ×107 ×103 ×103 6 ×1010 ×109 ×108 ×109 ×107 ×107 ×103 ×103 对表中的数据进展方差分析,数据是服从泊松分布的。 答:对于服从泊松分布的数据,应进展平方根变换。程序及结果如下: options linesize=76 nodate; data lacto; infile 'E:\data\exr9-10e.dat'; do time=1 to 3; do pH=1 to 4; do n=1 to 2; input y @@; number=sqrt(y); output; end; end; end; run; proc anova; class time pH; model number=time pH time*pH; run; The SAS System Analysis of Variance Procedure Class Level Information Class Levels Values TIME 3 1 2 3 PH 4 1 2 3 4 Number of observations in data set = 24 The SAS System Analysis of Variance Procedure Dependent Variable: NUMBER Sum of Mean Source DF Squares Square F Value Pr > F Error 12 7.7030E+09 6.4191E+08 Corrected Total 23 2.7869E+10 R-Square C.V. Root MSE NUMBER Mean Source DF Anova SS Mean Square F Value Pr > F 只有“pH〞是极显著因素,“时间〞与“时间×pH〞都是不显著因素。以上结果可以归纳成下表。 变差来源 平方与 自由度 均方 F P 时 间 9 2 8 pH 9 3 9 时间×pH 9 6 8 误 差 9 12 8 总 与 10 23 布氏轮藻〔Chara braunii Gm.〕的托叶长度及生态环境的状况有密切关系。实验选择4种药物〔A:Cd2+,B:Hg2+,C:Cr6+,D:敌枯双 〕,每种药物〔因素〕选择4个水平,两次重复。加药培养5个月后,托叶的长度〔mm〕如下[60]: 因 素 水 平 1 2 3 4 A 624 260 300 1 207 637 702 1 300 722 B 190 400 780 1 092 250 500 858 2 210 C 650 600 410 1 040 1 040 480 910 1 300 D 780 947 650 300 832 1 248 1 820 1 300 这是一个有重复的两因素穿插分组实验设计,对上述数据进展分析,并解释为什么会得到这样的结果? 答:结果如下: The SAS System Analysis of Variance Procedure Class Level Information Class Levels Values DRUG 4 1 2 3 4 LEVEL 4 1 2 3 4 Number of observations in data set = 32 The SAS System Analysis of Variance Procedure Dependent Variable: LENGTH Sum of Mean Source DF Squares Square F Value Pr > F R-Square C.V. Root MSE LENGTH Mean Source DF Anova SS Mean Square F Value Pr > F 根据以往的经历,重金属与农药对植物的生长应当有影响。然而,实验结果却是药物、水平及药物×水平三个因素都是不显著因素。造成这种结果的原因是实验的误差平方与过大。我们知道,误差平方与是重复间的平方与。在原始数据中,有些重复的数据相差甚大,例如,A3与D4的两次重复间竟然相差4倍有余,相差2~3倍的也有不少。重复间存在如此之大的偏差,说明实验材料、实验环境〔条件〕或实验操作存在不一致性。重复间过大的偏差,造成过大的误差均方,使本来存在的效应被误差掩盖,而不能被检验出来。在设计实验时,除所研究的因素外,一定要保证各方面的均一性。这一点在设计实验与完成实验的过程中是至关重要的,一定要特别注意。人们在承受误差很大的背景下所得到的结论时,会持保存态度的。以上数据可以归纳成下表: 变差来源 平方与 自由度 均方 F P 药 物 3 0.633 1 水 平 3 0.079 6 药物×水平 9 0.351 9 误 差 16 总 与 31 六味木香袋泡剂是一种中药新剂型。药物的浸出率及粒度的大小、浸泡时间、浸泡水温等因素有关。以下数据是不同粒度及不同水量的浸出率〔%〕[61],对这些数据进展分析,推断因素的显著性。 粒 度/目 10 20 30 40 加水量 / mL 100 150 200 答:这里的因变量是浸出率,它不是二项分布数据,不需做变换。结果如下: The SAS System Analysis of Variance Procedure Class Level Information Class Levels Values WATER 3 1 2 3 GRANULE 4 1 2 3 4 Number of observations in data set = 24 The SAS System Analysis of Variance Procedure Dependent Variable: PERCENT Sum of Mean Source DF Squares Square F Value Pr > F R-Square C.V. Root MSE PERCENT Mean Source DF Anova SS Mean Square F Value Pr > F 结果指出,加水量与粒度都是极显著因素,但两者的交互作用是不显著的。交互作用不显著的含义是,不是只有在特定的加水量与特定的粒度下才有最正确的浸出率。以上结果可以归纳成下表: 变差来源 平方与 自由度 均方 F P 加水量 126.373 908 2 63.186 954 0.000 1 粒 度 118.520 600 3 39.506 867 0.000 2 加水量×粒度 34.007 425 6 5.667 904 0.103 7 误 差 29.604 000 12 2.467 000 总 与 308.505 933 23 长沙市2005年7月份不同地点、不同日期与每一天三个时间的空气温度测量结果列在下表中[62]: 地点 日期/日 温度/℃ 8:00 14:00 20:00 长沙汽车西站 4 6 16 18 27 29 岳麓金峰小区 4 6 16 18 27 29 五一中路袁家岭 4 6 16 18 27 29 解放中路浏城桥 4 6 16 18 27 29 马坡岭 4 6 16 18 27 29 首先判断这是一个什么模型,然后对上述记录结果,做无重复三因素穿插分组方差分析。 答:程序与结果如下: options linesize=76 nodate; data changsha; infile 'e:\data\exr9-13e.dat'; do place=1 to 5; do date=1 to 6; do time=1 to 3; input temp @@; output; end; end; end; run; proc anova; class place date time; model temp=place date time; run; The SAS System Analysis of Variance Procedure Class Level Information Class Levels Values PLACE 5 1 2 3 4 5 DATE 6 1 2 3 4 5 6 TIME 3 1 2 3 Number of observations in data set = 90 The SAS System Analysis of Variance Procedure Dependent Variable: TEMP Sum of Mean Source DF Squares Square F Value Pr > F R-Square C.V. Root MSE TEMP Mean Source DF Anova SS Mean Square F Value Pr > F 从结果来看,地点、日期与时间都是极显著因素。以上结果可以归纳成下表: 变差来源 平方与 自由度 均方 F P 地 点 15.761 556 4 3.940 389 0.000 1 日 期 22.024 000 5 4.404 800 0.000 1 时 间 703.466 000 2 351.733 000 0.000 1 误 差 35.424 444 78 0.454 160 总 与 776.676 000 89 一个有重复二因素固定模型方差分析表如下: 变差来源 平方与 自由度 均方 F A因素 114 3 38 4.75* B因素 108 3 36 4.50* A×B 378 9 42 5.25** 误 差 128 16 8 总 与 728 31 注:*α=。**α=。 假设由于实验者缺乏足够的生物统计学知识,错误地使用了重复平均数做无重复的方差分析,上述方差分析表中的各项值有何变化?说明什么问题? 答:如果用重复的平均数计算,将得到以下方差分析表: 变差来源 平方与 自由度 均方 F A因素 57 3 19 B因素 54 3 18 误 差 189 9 21 总 与 300 15 这样计算会产生以下后果:
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