成都市妇幼保健院全基因芯片扫描系统采购项目.doc

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征求意见公告
致有关供应商：
受采购人委托，成都市妇幼保健院全基因芯片扫描系统采购项目以公开招标方式进行采购。为了保证政府采购当事人合法权益，确保政府采购程序公开、公平、公正，现就该项目的资格条件和技术需求（详见附件）广泛征求各供应商的意见。
如您认为该项目的资格条件和技术需求存在倾向性或不合理性，请具体指出存在倾向性或不合理性的内容，以书面形式，并进行说明。
一.接受意见反馈的截止日期：2010年12月31日下午17:00时
二. 招标编号及设备采购清单：
（1）招标编号：SCIT-ZG-20101145
（2）采购内容：
经成都市财政局批准（采购文号为：（2010）1936号（2010）185号），用公开招标的方式采购以下设备。
包号 货物名称 数量
01 全基因芯片扫描系统 1
三.相关资格条件及技术参数：见附件
四．联系电话：[phone]（FAX）
联系人：徐艳梅、黎鹏

四川国际招标有限责任公司
2010年12月24日

附件：
一、资格条件
1有在中国境内注册并具有独立法人资格的合法企业；
2 如果本次采购的设备国家实行生产/经营许可审批制度，则投标人须提供相关生产/经营许可证件复印件；
3非投标产品制造商必须获得产品制造商的授权；
4具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度；
5具有履行合同所必需的设备和专业技术能力；
6参加政府采购活动的前三年内，在经营活动中没有重大违法记录；
7本次投标不接受联合体投标
二、技术参数
（一）、基因芯片主要技术参数及要求：
1. *基因芯片片基在1.28×1.28平方厘米的面积上可合成多达6,000,000个寡核苷酸探 针。
2. *基因芯片生产合成采用光蚀刻原位合成技术，以保证芯片质量的稳定性。
3. *探针设计方案有利于保证信号值的准确定量和非特异性杂交信号的扣除。
4. *针对每个检测目标采用多段探针设计，使得实验结果获得多重数据的坚强支撑，提高检测结果的特异性、重复性。
5. 芯片采用单色标记体系，避免双色法标记效率不一致对结果带来的错误引导。
6. 有网上动态更新的对应功能注释、分类平台等全方位基因信息；基因芯片的数据可通过软件方便接入公共数据库或三方软件进行深入分析。
7. 该系统能应用于表达与遗传两类研究的芯片产品。
8. *表达类产品不仅能够提供以转录本为单位的表达检测，还能够提供以外显子为单位的表达检测；以转录本为单位的检测产品线要全面，覆盖医学、农业研究的大多数模式物种；外显子产品要达到对一百万条外显子的检测。
9. *要有能够实现转录调控研究、表观遗传学研究的技术产品，产品需要实现对全基因组 范围的检测，密度要保证能够达到在基因组上每35bp 的区间内有一条检测探针。
10. 可提供ｍｉｃｒｏＲＮＡ检测类产品。
11. 要具有多个层次的遗传研究产品，包括单基因疾病的连锁分析、多基因疾病关联分析、染色体异常的拷贝数分析、已知遗传疾病的检测分析、个性化用药的遗传易感性分析。
12. 连锁分析产品不少于一万个ＳＮＰ位点。
13. *关联分析产品要可以达到九十万个ＳＮＰ位点，要可以同时设计有九十万个以上的CNV检测探针。
14. *细胞遗传学产品要设计有2700000个检测探针，探针中要包含ＳＮＰ探针，以便用于检测特殊的杂合性缺失单亲二体性；拷贝数探针要经过剂量效应验证确保检测出的荧光信号忠于个体体内情况。
15. *细胞遗传学产品可提供单细胞检测方案。
16. *药物基因组类产品，要可以分析２０００个左右药物代谢生物标志物。
17. *可以应用基因芯片再测序原理，按客户要求定制再测序芯片，进行遗传病的分子诊断技术的开发。有心脏类遗传疾病诊断产品的开发经验及成型产品。
18. *可提供线粒体全基因组测序产品。
（二）软硬件技术参数
(1).基因芯片扫描仪 :
1. 分辨率达到0.51 μm。
2. 检测灵敏度低于0.5个藻红蛋白/μm2
3. 532nm固态绿色激光器，功率200 µW
4. 发射滤光片：高带通570nm
5. 检测器：红区增强的光电倍增管 ；可进行四色扫描
6. 激发和发射光路稳定，从而使得图象不同区域的均一性得到了最大程度的保障。
7. 多轴闭路定位系统，保证扫描定位的准确性。
8. 自动校正系统，确保不同扫描仪之间的差异最小，获得的数据之间高度一致可比。
9. Auto-Zero系统，大幅降低背景信号，进一步提高荧光信号的动态范围
10. 系统自动调整激光器的功率和强度，使用时间过长之后不需要手动校准激光。
11. 配套评估软件，可确定扫描仪的扫描质量及校准参数，并提供在不合格情况下应该如何进行校准的信息。
12. 可储存16bit的高质量图像
13. 系统可靠性高，每年可以保证完成1万次检测
14. 可选配自动装片系统，以实现无人值守的扫描操作。
（2）.基因芯片杂交仪：
1. 全自动控制芯片的杂交过程，为保证成功的杂交提供精确的温度和速度控制。
2. 通过芯片舱的转动可保证整个杂交过程的温度均一性。
3. 杂交炉可同时处理64张芯片。
4. 芯片舱可拆卸。
5. 配有安全互动锁。当操作时要安装或拆除芯片舱时，互动锁被触发，杂交炉即自动停止转动。
6. 数字显示速度控制：通过数字显示，可以精确地控制芯片的转动速度，并可以实时地显示、方便读取。
7. 温度范围：室温以上30-70°°C
8. 可调转速：10到80 RPM
9. 控温准确性：35-60°C间+/-2°C
（3）.基因芯片洗涤工作站:
1. 无需人工监视，可机械自动完成基因芯片洗涤染色的全部过程。
2. 提供准确的压力控制，保证液流和加热的密封。
3. 配有液面检测装置，并能对洗涤过程中的故障进行自我诊断。
4. 洗涤工作站智能化提示每个洗涤用容器应放置缓冲液，并提示确认。
5. 洗涤工作站需实施实时监控，确保每步反应按照所选模块运行，并对各洗脱液、染色液进行核查，及时确认并提示。
6. 每台每次可以同时进行4张芯片的洗涤和染色，可多台兼容，同时受控，整合到全套系统中。
(4).仪器控制和操作软件：
1. 可提供对洗涤工作站和扫描仪的全面控制，并在界面显示操作状态，及时反馈错误操作信息，并直接链接到错误解决方法界面，便于及时更正，确保每一张芯片的无误运转。
2. 自动生成芯片扫描原始图像，每一个探针的信号值，每一组探针的信号值统计学运算。
3. 给出仪器运转的质控报告。
(5).RNA水平数据分析软件包：
1. 用于普通3’-基因表达谱芯片及全外显子芯片的数据分析
2. 兼容MAS5、PLIER及RMA等算法
3. 具可视化及图表功能
4. 给出表达谱芯片单张芯片检测结果，多张芯片比较结果。
5. 提供数据库管理，方便输入到三方软件进行分析。
6. 提供网上数据交换平台，便于大量数据分析比较。
(6).DNA水平数据分析软件包：
1. 可用于标准SNP芯片的基因分型分析
2. 可用于定制SNP芯片的基因分型分析，可以记录并控制试验流程
3. 自动给出SNP等位基因型结论，同时带有质量评分
4. 批量输入进行样本注释，性别鉴定，孟德尔遗传模式确认
5. 快捷对接输出，格式为Haploview, MERLIN- and GeneHunter等经典遗传分析软件识别
6. 可通过等位基因频率、哈德波根平衡、孟德尔遗传规律等方法
7. 可用于测序芯片的数据分析
8. 可用于染色体拷贝数分析
(7).计算机工作站 Computer Workstation:
处理器为Minimum Precision Dual Xeon, Processor 3.0 GHz, 硬盘为Dual 250 GB， 内存为2.0 GB, 预装Windows XP操作系统，DVD读写，20英寸纯平 LCD 显示器。
(三）配置要求：
1. 基因芯片扫描仪
2.基因芯片杂交仪
3.基因芯片洗涤工作站
4.仪器控制和操作软件
5.RNA水平数据分析软件包
6.DNA水平数据分析软件包
7.计算机工作站

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