Agilent 6500系列LC-MSD QTOF 现场培训教材.pdf

Agilent LC-MSD QTOF现场培训教材现场培训教材2一、仪器硬件概览一、仪器硬件概览LAN SwitchLAN1.典型配置图典型配置图192.168.254.1192.168.254.11192.168.254.123一、仪器硬件概览一、仪器硬件概览2.仪器原理简介仪器原理简介Quad2.1 四极杆分析器由四根棒状电极组成。相对两根电极间加有电压（四极杆分析器由四根棒状电极组成。相对两根电极间加有电压（Vdc+Vrf），另外两根电极间加有），另外两根电极间加有-（Vdc+Vrf）。其中）。其中Vdc 为直流电压，为直流电压，Vrf 为射频电压。四个棒状电极形成一个四极电场。右图是这种分析器的示意图：为射频电压。四个棒状电极形成一个四极电场。右图是这种分析器的示意图：2.2 离子从离子源进入四极场后，在场的作用下产生振动，如果质量为离子从离子源进入四极场后，在场的作用下产生振动，如果质量为m，电荷为，电荷为e 的离子从的离子从Z 方向进入四极场，在电场作用下其运动方程是：方向进入四极场，在电场作用下其运动方程是：2.3 离子运动轨迹可由马修方程的解描述，右图是马修稳定图。这是一张离子运动轨迹可由马修方程的解描述，右图是马修稳定图。这是一张RF 和和DC 电压结合图。这张图可以预测给定的离子在四级杆场中是否稳定。对于特定的电压结合图。这张图可以预测给定的离子在四级杆场中是否稳定。对于特定的RF 和和DC 电压，包含这个点的在质谱区域内的离子将会通过进入四级杆进入检测器。这条扫描线由调谐文件中设置的宽度增益和宽度补偿决定。如果降低宽度补偿，扫描线将会下降，峰宽度将会加宽。如果扫描线被提高，峰宽度将会变窄。电压，包含这个点的在质谱区域内的离子将会通过进入四级杆进入检测器。这条扫描线由调谐文件中设置的宽度增益和宽度补偿决定。如果降低宽度补偿，扫描线将会下降，峰宽度将会加宽。如果扫描线被提高，峰宽度将会变窄。4一、仪器硬件概览一、仪器硬件概览2.仪器原理简介仪器原理简介TOF离子离开离子源的动能离子离开离子源的动能 T离子飞行的线速度离子飞行的线速度v等于飞行距离等于飞行距离L除以飞行时间除以飞行时间t离子飞行的时间正比于离子质荷比的均方根离子质荷比正比于飞行时间的平方离子飞行的时间正比于离子质荷比的均方根离子质荷比正比于飞行时间的平方5一、仪器硬件概览一、仪器硬件概览2.仪器原理简介仪器原理简介QTOFTTI Mode（TOF Mode）、（）、（MS Mode）MS/MS Mode6一、仪器硬件概览一、仪器硬件概览3.仪器构造仪器构造离子源离子源A.Dual ESIB.APCIC.APPID.MMIE.Dual NanoESIF.PDF MALDIG.Chip-Cube分析用雾化器分析用雾化器I-Button参比用雾化器参比用雾化器7一、仪器硬件概览一、仪器硬件概览3.仪器构造仪器构造示意图示意图8一、仪器硬件概览一、仪器硬件概览3.仪器构造仪器构造实物实物四级杆四级杆9一、仪器硬件概览一、仪器硬件概览3.仪器构造仪器构造实物实物10一、仪器硬件概览一、仪器硬件概览3.仪器构造仪器构造录像（录像（TOF）11二、软件概览二、软件概览1.软件结构软件结构定性软件定量软件定性软件定量软件采集软件采集软件仪器配置诊断软件进程终结记录本仪器配置诊断软件进程终结记录本TOF数据转换软件数据转换软件采集软件进程管理器采集软件进程管理器12二、软件概览二、软件概览2.数据采集软件数据采集软件MassHunter Workstation打开打开保存方法打开保存方法打开保存序列序列编辑工具记录本隐藏保存序列序列编辑工具记录本隐藏显示功能区运行及序列控制菜单栏复合栏工具栏显示功能区运行及序列控制菜单栏复合栏工具栏状态栏状态栏13二、软件概览二、软件概览2.数据采集软件数据采集软件MassHunter Workstation仪器状态区实时绘图区方法区序列区仪器状态区实时绘图区方法区序列区质谱轮廓图质谱轮廓图质谱棒图质谱棒图色谱图色谱图14二、软件概览二、软件概览2.数据采集软件数据采集软件MassHunter Workstation选择想要监视的参数选择想要监视的参数15二、软件概览二、软件概览2.数据采集软件数据采集软件MassHunter Workstation在每个模块图标上单击左键可以显示相关的功能菜单在每个模块图标上单击左键可以显示相关的功能菜单灰色表示待机Standby灰色表示待机Standby16二、软件概览二、软件概览2.数据采集软件数据采集软件MassHunter Workstation指示在上一次扫描中参比离子的发现状态指示在上一次扫描中参比离子的发现状态颜色状态绿色：所有的参比离子均找到了黄色：找到了部分参比离子红色：所有的参比离子均未找到颜色状态绿色：所有的参比离子均找到了黄色：找到了部分参比离子红色：所有的参比离子均未找到指示在当前分析或上一次分析中参比离子的发现状态指示在当前序列或上一次序列运行中参比离子的发现状态指示在当前分析或上一次分析中参比离子的发现状态指示在当前序列或上一次序列运行中参比离子的发现状态17二、软件概览二、软件概览3.定性分析软件定性分析软件数据导航区数据导航区方法浏览区方法浏览区方法参数编辑区方法参数编辑区质谱图显示区质谱图显示区色谱图显示区色谱图显示区18二、软件概览二、软件概览4.定量分析软件定量分析软件19二、软件概览二、软件概览5.数据转换软件数据转换软件20二、软件概览二、软件概览6.诊断软件诊断软件QTOF Diagnostics21三、开机三、开机1.如果使用液氮罐，打开自增压阀门。打开如果使用液氮罐，打开自增压阀门。打开N2主阀门，调节分压表压力至主阀门，调节分压表压力至0.6Mpa或或90psi(最大不要超过最大不要超过0.69Mpa或或100psi)。打开高纯氮主阀门，调节分压表压力至。打开高纯氮主阀门，调节分压表压力至0.15Mpa（最大不要超过（最大不要超过0.2Mpa或或30psi）2.打开计算机，打开计算机，LAN Switch电源。电源。3.打开液相各个模块电源，打开质谱前面的开关，等待大约两分钟，直至听到溶剂阀切换的声音，表明质谱自检完成。打开液相各个模块电源，打开质谱前面的开关，等待大约两分钟，直至听到溶剂阀切换的声音，表明质谱自检完成。4.在计算机桌面上双击打开在计算机桌面上双击打开Agilent MassHunter Workstation文件夹，双击文件夹，双击Data Acquisition进入工作站，点击进入工作站，点击Standby按钮，检查前级真空（典型值应按钮，检查前级真空（典型值应2.5Torr）和高真空，等到高真空）和高真空，等到高真空110-6Torr时，在时，在QTOF图标上单击，单击图标上单击，单击 ON，设定干燥气，设定干燥气10L/min和雾化气和雾化气60psi，应该能达到设定值。关闭工作站。打开，应该能达到设定值。关闭工作站。打开Agilent TOF Software文件夹，双击文件夹，双击System Launcher,点击点击Shutdown。等待。等待Status变为变为Terminated后，点击后，点击Close。22三、开机三、开机5.在计算机桌面上双击打开在计算机桌面上双击打开Agilent MassHunter Workstation文件夹，接着打开文件夹，接着打开Acq Tools文件夹，双击文件夹，双击QTOF Diagnostics，进入仪器诊断界面，在菜单上选择，进入仪器诊断界面，在菜单上选择Connection/Connect，输入，输入192.168.254.12，点击，点击OK。6.标签栏显示标签栏显示Instrument ON/OFF界面，选择界面，选择0.6 hour cycle，点击，点击Condition HV。7.当当Condition HV结束后，关闭结束后，关闭QTOF Diagnostics。8.进入进入MassHunter Workstation。23四、调谐和校准四、调谐和校准1.将将TOF-ESI调谐液装入调谐液装入Calibrabt B中。确认安装的离子源为中。确认安装的离子源为Dual ESI源。进入源。进入Agilent Masshunter Workstation，点击，点击File/Open/Method，选择，选择Default.m，点击，点击OK。在。在QTOF图标上单击左键，图标上单击左键，Turn ON QTOF。24四、调谐和校准四、调谐和校准2.在在Context下拉框中选择下拉框中选择Tune切换到切换到Tune界面，选择极性为界面，选择极性为Positive，选择，选择Autotune标签，等待仪器标签，等待仪器Ready后（后（QTOF图标变为绿色），点击图标变为绿色），点击TOF Tune按钮。按钮。25四、调谐和校准四、调谐和校准初次安装或初次安装或TOF Tune通不过时可以使用通不过时可以使用Initial TOF Tune；一星期可以做一次；一星期可以做一次Quick TOF Tune。一个月可以做一次。一个月可以做一次TOF Tune。检查。检查TOF状态可以使用状态可以使用Check TOF Tune。默认的离子源参数为：默认的离子源参数为：Gas Temp 325；DryingGas 5L/min；Nebulizer 20psig；Vcap 4000V。如果改变了其中的参数，有可能会造成调谐无法通过。如果改变了其中的参数，有可能会造成调谐无法通过。3.根据实验需要选择极性为根据实验需要选择极性为Positive或或Negtive，选择，选择Autotune标签，等待仪器标签，等待仪器Ready后（后（QTOF图标变为绿色），点击图标变为绿色），点击TOF Tune按钮，仪器会自动开始调谐按钮，仪器会自动开始调谐TOF。调谐完成后会自动生成报告，点击。调谐完成后会自动生成报告，点击Print按钮，打印完成后点击按钮，打印完成后点击Close关闭。此时屏幕显示关闭。此时屏幕显示Autotune completed successfully。单击。单击OK关闭。关闭。26四、调谐和校准四、调谐和校准初次安装或初次安装或Quad Tune通不过时可以使用通不过时可以使用Initial Quad Tune；一个月可以做一次；一个月可以做一次Quad Tune。检查。检查Quad状态可以使用状态可以使用Check Quad Tune。默认的离子源参数为：默认的离子源参数为：Gas Temp 325；DryingGas 5L/min；Nebulizer 20psig；Vcap 4000V。如果改变了其中的参数，有可能会造成调谐无法通过。如果改变了其中的参数，有可能会造成调谐无法通过。4.TOF Tune完成后，单击完成后，单击Quad Tune，仪器会自动开始调谐，仪器会自动开始调谐Quad。调谐完成后会自动生成报告，点击。调谐完成后会自动生成报告，点击Print按钮，打印完成后点击按钮，打印完成后点击Close关闭。此时屏幕显示关闭。此时屏幕显示Quad Autotune completed successfully。单击。单击OK关闭。关闭。27四、调谐和校准四、调谐和校准5.TOF Tune和和Quad Tune完成后，点击完成后，点击Instrument State标签，单击标签，单击Save按钮将调谐结果保存到按钮将调谐结果保存到Autotune.tun文件。文件。单击单击Context下拉框，选择下拉框，选择Acquisition即可返回数据采集画面。即可返回数据采集画面。28四、调谐和校准四、调谐和校准校准完成后会显示校准曲线，单击校准完成后会显示校准曲线，单击OK关闭。关闭。Calibrant Bottle选择选择None。在。在Context下拉框中选择下拉框中选择Acquisition返回采集画面，提示保存返回采集画面，提示保存Tune File时，选择时，选择Yes。推荐每天或序列运行前做。推荐每天或序列运行前做Calibrate.6.如果只是为了校准质量轴，则不使用调谐。切换到如果只是为了校准质量轴，则不使用调谐。切换到Tune界面，等待界面，等待QTOF状态状态Ready后后(QTOF图标为绿色图标为绿色)，Calibrant Bottle选择选择B，点击，点击TOF MS Calibration标签，点击标签，点击Calibrate。29四、调谐和校准四、调谐和校准Initial TOF Tune做的项目最多，做的项目最多，TOF Tune次之，次之，Quick TOF Tune最少。最少。Initial Quad Tune较之较之Quad Tune做的参数一致，做的参数一致，Initial Quad Tune会将窗口和参数放的更宽。会将窗口和参数放的更宽。Check TOF Tune和和Check Quad Tune只是检查仪器状态，不会修改任何参数，也会自动生成报告。只是检查仪器状态，不会修改任何参数，也会自动生成报告。Calibrate只是校准只是校准TOF质量轴。质量轴。7.不同调谐和校准的比较不同调谐和校准的比较30五、方法编辑五、方法编辑1.液相部分液相部分自动进样器在此页面中设定进样方式及体积；自动进样器在此页面中设定进样方式及体积；Option中可以设定进样器的一些辅助参数中可以设定进样器的一些辅助参数31五、方法编辑五、方法编辑1.液相部分液相部分泵在此页面中设定泵的流量和比例以运行时间；泵在此页面中设定泵的流量和比例以运行时间；Timetable用于设定梯度时间表；用于设定梯度时间表；Option用于设定泵的辅助参数，如压缩因子等。用于设定泵的辅助参数，如压缩因子等。运行时间包括后运行时间一般情况下，只在泵的设置页面中设定，其他模块只需要设定成运行时间包括后运行时间一般情况下，只在泵的设置页面中设定，其他模块只需要设定成Same as Pump。32五、方法编辑五、方法编辑1.液相部分液相部分柱温箱在此页面中设定柱子温度；柱温箱在此页面中设定柱子温度；Timetable用于设定温度时间表；用于设定温度时间表；Option用于设定柱温箱的辅助参数。用于设定柱温箱的辅助参数。33五、方法编辑五、方法编辑1.液相部分液相部分检测器在此页面中设定检测器在此页面中设定DAD检测波长、参比波长及相应的波谱带宽和峰宽；检测波长、参比波长及相应的波谱带宽和峰宽；Option用于设定用于设定DAD的辅助参数，如狭缝等。的辅助参数，如狭缝等。Required Lamps如果不选择，可以实现关灯状态下分析。如果不选择，可以实现关灯状态下分析。34在此页面中设定极性，数据存储的类型，液体流向。离子源是自动识别的，不需要人为选择。在此页面中设定极性，数据存储的类型，液体流向。离子源是自动识别的，不需要人为选择。Time Segment相当于时间表，可以对一些参数按时间进行编程。对于可以随时间变化的参数上会标以（相当于时间表，可以对一些参数按时间进行编程。对于可以随时间变化的参数上会标以（Seg）标记。）标记。Experiment相当于相当于Scan，是指同一时间段内并列运行不同的参数，对于可以并行的参数上会标以（，是指同一时间段内并列运行不同的参数，对于可以并行的参数上会标以（Exp）标记。）标记。Profile数据可以提供更多的信息，但同时也会占用相当多的磁盘空间。数据可以提供更多的信息，但同时也会占用相当多的磁盘空间。2.质谱部分质谱部分General五、方法编辑五、方法编辑35五、方法编辑五、方法编辑2.质谱部分质谱部分Source表明这些参数可以随时间片断表明这些参数可以随时间片断Segment变化变化表明这些参数可以随扫描表明这些参数可以随扫描Experiment变化变化离子源参数中干燥气温度、流量、雾化器压力设定主要考虑实际进入质谱的流动相的流速及组成来变化，目的是为了去溶剂化完全。具体设定可以参考附录一。实际实验中需要优化的参数主要是离子源参数中干燥气温度、流量、雾化器压力设定主要考虑实际进入质谱的流动相的流速及组成来变化，目的是为了去溶剂化完全。具体设定可以参考附录一。实际实验中需要优化的参数主要是Fragmentor，此参数一般与待分析物质荷比及稳定程度相关，一般而言，质荷比越大，此参数一般与待分析物质荷比及稳定程度相关，一般而言，质荷比越大，Fragmentor越大。越大。36五、方法编辑五、方法编辑2.质谱部分质谱部分Acquisition，根据具体应用选择使用何种模式，也可以按时间段，根据具体应用选择使用何种模式，也可以按时间段Segment组合使用。组合使用。?TOF Mode（MS Mode）在此页面中主要编辑）在此页面中主要编辑Mass Range（一般应用（一般应用m/z小于小于3200，如果有其他范围需求参见附录），质谱采集速率。，如果有其他范围需求参见附录），质谱采集速率。37五、方法编辑五、方法编辑2.质谱部分质谱部分Acquisition?Auto MS/MS ModeSpectral Parameters在此页面中设定一级、二级质谱在此页面中设定一级、二级质谱Mass Range及采集速率，二级质谱采集速率最大为及采集速率，二级质谱采集速率最大为5spectra/s。四级杆分辨率，一般应用推荐使用。四级杆分辨率，一般应用推荐使用Medium。38五、方法编辑五、方法编辑2.质谱部分质谱部分Acquisition?Auto MS/MS ModeCollision Energy在此页面中设定碰撞能量。可以使用固定数值，也可以使用线性变化数值或使用表格定制。在此页面中设定碰撞能量。可以使用固定数值，也可以使用线性变化数值或使用表格定制。39五、方法编辑五、方法编辑2.质谱部分质谱部分Acquisition?Auto MS/MS ModePrecursor Selection在此页面中设定母离子选择数量及阈值、是否使用动态排除、静态排除。在此页面中设定母离子选择数量及阈值、是否使用动态排除、静态排除。40五、方法编辑五、方法编辑2.质谱部分质谱部分Acquisition?Auto MS/MS ModePrecursor Selection在此页面中设定母离子优选价态。在此页面中设定母离子优选价态。41五、方法编辑五、方法编辑2.质谱部分质谱部分Acquisition?Auto MS/MS ModePreferred/Exclude在此页面中设定母离子优选在此页面中设定母离子优选m/z、价态、保留时间、碰撞能量。、价态、保留时间、碰撞能量。42五、方法编辑五、方法编辑2.质谱部分质谱部分Acquisition?Target MS/MS ModeSpectral Parameters在此页面中设定一级、二级质谱在此页面中设定一级、二级质谱Mass Range及采集速率，二级质谱采集速率最大为及采集速率，二级质谱采集速率最大为5spectra/s。43五、方法编辑五、方法编辑2.质谱部分质谱部分Acquisition?Target MS/MS ModeCollision Energy在此页面中设定碰撞能量。可以使用固定数值，也可以使用线性变化数值或使用表格定制。在此页面中设定碰撞能量。可以使用固定数值，也可以使用线性变化数值或使用表格定制。44五、方法编辑五、方法编辑2.质谱部分质谱部分Acquisition?Target MS/MS ModeTargeted List在此页面中设定目标母离子及相应参数。在此页面中设定目标母离子及相应参数。45五、方法编辑五、方法编辑2.质谱部分质谱部分Ref.Mass在此页面中选择是否需要内标校准及参比雾化压力，内标离子选择及检测、校准参数。在此页面中选择是否需要内标校准及参比雾化压力，内标离子选择及检测、校准参数。46五、方法编辑五、方法编辑2.质谱部分质谱部分Chromatogram在此页面中设定实时监视的信号，实时信号调整参见附录。在此页面中设定实时监视的信号，实时信号调整参见附录。47五、方法编辑五、方法编辑3.方法信息点击方法信息点击Properties标签此页面显示了方法路径、前运行及后运行脚本。在标签此页面显示了方法路径、前运行及后运行脚本。在Description中可以输入方法说明信息。中可以输入方法说明信息。48五、方法编辑五、方法编辑4.保存方法点击保存方法点击File/Save as/Method方法推荐保存到安装工作站时指定的路径下。（方法推荐保存到安装工作站时指定的路径下。（D:MassHunterMethods）49六、运行样品六、运行样品1.运行单个样品从运行单个样品从FileOpen Method 调用选定的方法，点击仪器状态区右方调用选定的方法，点击仪器状态区右方ON按钮。在方法区中点击按钮。在方法区中点击Sample标签在此页面输入样品名称、样品位置、文件名、路径、项目名后点击工具栏按钮，开始进样。标签在此页面输入样品名称、样品位置、文件名、路径、项目名后点击工具栏按钮，开始进样。(此处如果输入了数值进样量以此处为准，如果是此处如果输入了数值进样量以此处为准，如果是-1则表示使用方法中的设置则表示使用方法中的设置)50六、运行样品六、运行样品2.运行序列样品运行序列样品A.设定序列运行参数设定序列运行参数点击点击Worklist菜单下菜单下Worklist Run Parameters输入操作者名字，指定采集方法和数据分析方法路径，指定数据文件路径，定义脚本，输入序列备注。点击输入操作者名字，指定采集方法和数据分析方法路径，指定数据文件路径，定义脚本，输入序列备注。点击OK。51六、运行样品六、运行样品2.运行序列样品运行序列样品B.编辑序列表编辑序列表样品名称样品位置采集方法数据文件样品类型备注进样标记序列行号样品名称样品位置采集方法数据文件样品类型备注进样标记序列行号在序列表任何一列的标题上单击右键，点击在序列表任何一列的标题上单击右键，点击Show/Hide Column可以定义序列表要显示的列，也可以通过可以定义序列表要显示的列，也可以通过Add Column(s)添加自定义列添加自定义列标样级别（样品类型为标样级别（样品类型为Calibration或或QC时起作用）时起作用）52六、运行样品六、运行样品2.运行序列样品运行序列样品C.添加样品添加样品选中序列表行单击右键，单击选中序列表行单击右键，单击Add Sample可以增加一行，在此行中依次输入各个参数即可完成一个样品的添加；也可以单击可以增加一行，在此行中依次输入各个参数即可完成一个样品的添加；也可以单击Add Multiple Samples，批量添加样品。，批量添加样品。指定方法和路径后，点指定方法和路径后，点Sample Position选择样品后，点选择样品后，点OK-1表示使用方法中的设置表示使用方法中的设置53六、运行样品六、运行样品2.运行序列样品运行序列样品D.运行样品运行样品通过进样标记选择需要进样的行通过进样标记选择需要进样的行选中这里表示所有行全部进样选中这里表示所有行全部进样选择好需要进样的行后，点击工具栏上的图标，开始进样。选择好需要进样的行后，点击工具栏上的图标，开始进样。54七、数据分析七、数据分析1.定性分析软件（定性分析软件（Qualitative Analysis）在桌面上双击图标打开定性分析软件）在桌面上双击图标打开定性分析软件A.打开数据文件第一次打开定性分析软件时会自动弹出打开数据文件第一次打开定性分析软件时会自动弹出Open Data File对话框，选择待分析的数据文件，单击对话框，选择待分析的数据文件，单击Open按钮，即可打开。此对话框也可以通过在菜单栏上单击按钮，即可打开。此对话框也可以通过在菜单栏上单击File/Open Data Files或工具栏上的图标打开。或工具栏上的图标打开。55七、数据分析七、数据分析1.定性分析软件（定性分析软件（Qualitative Analysis）B.使用默认窗口设计使用默认窗口设计在菜单栏上单击在菜单栏上单击View Windows Layout Restore Default Layout。56七、数据分析七、数据分析1.定性分析软件（定性分析软件（Qualitative Analysis）C.提取离子流图提取离子流图选择Method Explorer下的Chromatogram功能区，选择Define Chromatograms，此时右边会显示相应的参数窗口选择Method Explorer下的Chromatogram功能区，选择Define Chromatograms，此时右边会显示相应的参数窗口单击图标执行。此时会在色谱图显示区会显现提取到的色谱图。单击图标执行。此时会在色谱图显示区会显现提取到的色谱图。在此窗口内选择恰当的色谱图类型、MS Level、极性，输入要提取的m/z范围。在此窗口内选择恰当的色谱图类型、MS Level、极性，输入要提取的m/z范围。57七、数据分析七、数据分析1.定性分析软件（定性分析软件（Qualitative Analysis）D.积分积分在方法浏览区选择在方法浏览区选择Chromatogram功能区，选择功能区，选择Integrate，右边会显示积分参数，一般情况下可以选择，右边会显示积分参数，一般情况下可以选择MS/MS Intergrator，单击图标执行。，单击图标执行。单击（Integration Peak List）图标可以显示积分结果单击（Integration Peak List）图标可以显示积分结果58七、数据分析七、数据分析1.定性分析软件（定性分析软件（Qualitative Analysis）E.预览质谱图预览质谱图选中图标（选中图标（MS Spectrum Preview），再使用选择范围工具在色谱图上选择一段区域，双击鼠标左键，在），再使用选择范围工具在色谱图上选择一段区域，双击鼠标左键，在MS Spectrum Preview窗口中会显示相应的质谱图。窗口中会显示相应的质谱图。59七、数据分析七、数据分析1.定性分析软件（定性分析软件（Qualitative Analysis）F.提取质谱图提取质谱图在在MS Spectral Preview窗口上点击鼠标右键选择窗口上点击鼠标右键选择Copy to User Spectra，此时会将这张质谱图添加到左侧数据导航区中的用户质谱图中，窗口的标题也改变为，此时会将这张质谱图添加到左侧数据导航区中的用户质谱图中，窗口的标题也改变为MS Spectrum Results60七、数据分析七、数据分析1.定性分析软件（定性分析软件（Qualitative Analysis）G.扣除背景干扰扣除背景干扰在色谱图中使用选择范围工具选择一段背景范围，单击鼠标右键，选择在色谱图中使用选择范围工具选择一段背景范围，单击鼠标右键，选择Extract Spectrum to Background，此时在左侧数据导航区中会出现，此时在左侧数据导航区中会出现Background Spectra，再选中导航区中的，再选中导航区中的User Spectra并单击鼠标右键，选择并单击鼠标右键，选择Subtract Background Spectrum，在右侧，在右侧MS Spectrum Results窗口中会显示扣除背景后的质谱图。窗口中会显示扣除背景后的质谱图。61七、数据分析七、数据分析1.定性分析软件（定性分析软件（Qualitative Analysis）H.计算分子式计算分子式设定计算条件设定计算条件在质谱图上按住鼠标右键拖曳可以放大质谱图，在质谱图上按住鼠标左键选择想要计算的质荷比在质谱图上按住鼠标右键拖曳可以放大质谱图，在质谱图上按住鼠标左键选择想要计算的质荷比m/z，单击方法浏览区中的，单击方法浏览区中的Spectrum功能区，选择功能区，选择Calculate Spectrum Formulas，右侧显示分子式计算对话框，设定元素组成，允许偏差，加和离子，同位素计算得分限度等参数。，右侧显示分子式计算对话框，设定元素组成，允许偏差，加和离子，同位素计算得分限度等参数。62七、数据分析七、数据分析1.定性分析软件（定性分析软件（Qualitative Analysis）H.计算分子式计算分子式计算结果计算结果单击执行图标开始计算，计算完成后会显示单击执行图标开始计算，计算完成后会显示MS Formula Results窗口，计算结果包含同位素匹配得分（最高得分为窗口，计算结果包含同位素匹配得分（最高得分为100，其余是相对值）、质量偏差、不饱和度。单击可以显示更详细的信息同时在下方的质谱图上会显示出理论的同位素匹配框。，其余是相对值）、质量偏差、不饱和度。单击可以显示更详细的信息同时在下方的质谱图上会显示出理论的同位素匹配框。63七、数据分析七、数据分析1.定性分析软件（定性分析软件（Qualitative Analysis）I.打印报告打印报告在方法浏览区选择General功能区，选中Choose Report Templates，右侧对话框中选择需要的模板。单击菜单FilePrintAnalysis Report打印分析报告，在弹出的对话框中选择打印预览，设定相应参数，单击OK后显示预览报告，单击Print打印或单击Setup根据需要修改后再单击Print打印报告在方法浏览区选择General功能区，选中Choose Report Templates，右侧对话框中选择需要的模板。单击菜单FilePrintAnalysis Report打印分析报告，在弹出的对话框中选择打印预览，设定相应参数，单击OK后显示预览报告，单击Print打印或单击Setup根据需要修改后再单击Print打印报告64七、数据分析七、数据分析2.定量分析软件（定量分析软件（Quantitative Analysis）参考G3335-90018 Q-TOF Formalization Manual练习用数据存在定量软件光盘Data目录下）参考G3335-90018 Q-TOF Formalization Manual练习用数据存在定量软件光盘Data目录下65八、关机八、关机1.在质谱控制软件在质谱控制软件QTOF图标上单击左键，选择图标上单击左键，选择Vent。出现确认提示时，单击。出现确认提示时，单击Yes按钮。按钮。2.系统开始放空，此过程需要等待大约系统开始放空，此过程需要等待大约30min。如果想监视系统真空，也可以单击。如果想监视系统真空，也可以单击Context下拉框选择下拉框选择Tune切换至切换至Tune画面，单击画面，单击Diagnostics标签观察真空，也可以从此处放空。标签观察真空，也可以从此处放空。30min后关闭工作站。后关闭工作站。66八、关机八、关机3.Shutdown Engine。4.关闭质谱前面的开关。关闭液相各个模块电源开关。关闭质谱前面的开关。关闭液相各个模块电源开关。5.关闭关闭N2总阀门。如果使用液氮罐，同时应关闭自增压阀门。关闭高纯氮主阀门。总阀门。如果使用液氮罐，同时应关闭自增压阀门。关闭高纯氮主阀门。67九、附录九、附录1.不同流量推荐的离子源参数设定不同流量推荐的离子源参数设定68九、附录九、附录2.改变改变QTOF质量测定范围单击质量测定范围单击Context下拉框选择下拉框选择Tune切换到切换到Tune画面，单击画面，单击Instrument State标签，点击标签，点击Mass Range下拉框可以选择不同的下拉框可以选择不同的Mass Range（1700m/z,3200m/z,10000m/z）注意：一旦改变了Mass Range必须运行Calibrate注意：一旦改变了Mass Range必须运行Calibrate69九、附录九、附录3.调整实时绘图调整实时绘图在实时色谱图显示区单击鼠标右键，单击Change，在弹出的对话框中左侧选择想要监视的信号单击Add添加，设定范围后，单击OK。在实时色谱图显示区单击鼠标右键，单击Change，在弹出的对话框中左侧选择想要监视的信号单击Add添加，设定范围后，单击OK。