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生物化学计算题培训资料.doc

上传人:天**** 文档编号:3793398 上传时间:2024-07-18 格式:DOC 页数:8 大小:312KB
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生物化学计算题 精品资料 生物化学计算题: 1、 计算赖氨酸的 20%被解离时的溶液pH。 解答: 80% 20% 2、计算谷氨酸的三分之二被解离时的溶液pH。 解答: 1 2 3、向1 L 1 mol/L 的处于等电点的甘氨酸溶液加入0.3 mol HCl, 问所得溶液的pH值是多少?如果加入0.3 mol NaOH 以代替HCl 时,pH 将是多少? 解答:(1) 1-0.3 0.3 0.3 (2) 0.7 0..3 4、计算0.25 mol/L 的组氨酸溶液在pH 6.4时各种离子形式的浓度(mol/L)。 解答: 同理得: 设解上述方程得: 组氨酸主要以形式存在。 5、分别计算谷氨酸、精氨酸和丙氨酸的等电点。 解答: (1) 根据谷氨酸的解离曲线,其pI应该是它的羧基和侧链羧基的pKa之和的算术平均 值。即:pI=(2.19 + 4.25)/2 =3.22; (2) 精氨酸pI应该是它的氨基和侧链胍基的pKa之和的算术平均值,即 pI=(9.04 + 12.48)/2 =10.76; (3) 丙氨酸pI应该是它的氨基和羧基pKa值之和的算术平均值,即 pI=(2.34 + 9.69)/2 =6.02; 6、计算下列肽的等电点。 (1)天冬氨酰甘氨酸 (2)谷胱甘肽(3)丙氨酰丙氨酰赖氨酰丙氨酸 末端—COOH pK=3.58,末端pK=8.01,pK=10.58 解答: (1) Asp-Gly 二肽的解离情况如下: 两性离子 (2) 谷胱甘肽中Glu的γ—羧基形成γ—肽键,解离情况如下: (3) Ala—Ala—Lys—Ala四肽的解离情况如下: 。 7、 (a)计算一个含有78个氨基酸的α螺旋的轴长。(b)计算此螺旋完全伸展时有多长? 解答: (a)含有78个氨基酸的α螺旋的轴长为l =78×0.15 nm =11.7nm (b)此螺旋完全伸展时的长度为L=78×0.36 nm =28.08nm 8、某一蛋白质的多肽链除一些区段为α螺旋外,其余区段均为β构象。该蛋白质为240 000,多肽链外形的长度为cm。试计算α螺旋占该多肽链的百分数(假设β构象中每氨基酸残基的长度为0.35nm)。 解答:设该多肽链中α螺旋的氨基酸残基数为x,氨基酸残基总数为y。 解得 即α螺旋占该多肽链的百分数为59%。 9、某油脂的碘值为68,皂化值为210。计算该油脂每个分子中含有多少个双键。 解答:该油脂的平均相对分子质量: 根据碘值的定义:100g油脂卤化时所能吸收的碘的克数。在本题中,皂化1mol油脂需要吸收碘的克数为:。的相对分子质量=2×126.9=253.8. g/mol 544/253.8=2.14(mol)。因此平均每分子油脂含有两个双键。 10、从植物种子中提取1g油脂,分成两份,分别测定该油脂的皂化值和碘值。测定皂化值的样品消耗KOH 65 mg,测定碘值的样品消耗510mg。试计算该油脂的平均相对分子质量和碘值。 解答:皂化值:是指皂化1g油脂所需KOH的质量(mg)。 因此该油脂的皂化值:65 mg /0.5g=130; 油脂的平均相对分子质量:。 碘值:指100g油脂卤化时所能吸收的碘的克数。 该油脂的碘值=(100/0.5)×0.51=102。 11、 称取25mg蛋白酶配成25mL溶液,取2mL溶液测得含蛋白氮0.2mg,另取0.1mL溶液测酶活力,结果每小时可以水解酪蛋白产生1500μg酪氨酸,假定1个酶活力单位定义为每分钟产生1μg酪氨酸的酶量,请计算: (1)酶溶液的蛋白浓度及比活力。(2)每克纯酶制剂的总蛋白含量及总活力。 解答:(1)蛋白浓度=0.2×6.25mg/2mL=0.625mg/mL; (2)比活力=(1500/60×1ml/0.1mL)÷0.625mg/mL=400U/mg; (3)总蛋白=0.625mg/mL×1000mL=625mg; (4)总活力=625mg×400U/mg=2.5×105U。 12、 对于一个遵循米氏动力学的酶而言,当[S]=Km时,若V=35μmol/min,Vmax是多少μmol/min?当[S]=2×10 -5mol/L,V=40μmol/min,这个酶的Km是多少?若I表示竞争性抑制剂,KI=4×10-5mol/L,当[S]=3×10-2mol/L和[I]=3×10-5mol/L时,V是多少? 解答:(1)当[S]=Km时,V=1/2Vmax,则Vmax=2×35=70μmol/min; (2)因为V=Vmax/(1+Km/[s]),所以Km=(Vmax/V-1)[s]=1.5×10 -5mol/L; (3)因为[S]>>Km,[I],所以V=Vmax=70μmol/min; 13、如果人体有1014个细胞,每个体细胞的DNA含量为6.4×109个碱基对。试计算人体DNA的总长度是多少?是太阳-地球之间距离(2.2×109公里)的多少倍?已知双链DNA每1000个核苷酸对重1×10-18g,求人体的DNA的总质量。 每个体细胞的DNA的总长度为:6.4×109×0.34nm = 2.176×109 nm= 2.176m 人体内所有体细胞的DNA的总长度为: 2.176m×1014 = 2.176×1011km 这个长度与太阳-地球之间距离(2.2×109公里)相比为: 2.176×1011/2.2×109 = 99倍。 每个核苷酸对重:1×10-18g/1000=10-21g 总DNA质量: 6.4×1023×10-21=6.4×102=640g。 14、1mol甘油完全氧化成CO2和H2O时净生成多少mol ATP?假设在线粒体外生成的NADH都通过磷酸甘油穿梭进入线粒体。(要求:有分析步骤,可用简图示出所经历的主要代谢过程) 甘油磷酸化消耗 -1ATP 磷酸甘油脱氢 + NADH +1.5 ATP(NADH穿梭) 磷酸甘油醛脱氢 + NADH +1.5 ATP(NADH穿梭) 1,3-二磷酸甘油酸 + 1ATP 磷酸烯醇式丙酮酸 + 1ATP 丙酮酸氧化生成乙酰CoA + NADH +2.5ATP 乙酰CoA进入三羧酸循环彻底氧化 +10ATP 乙酰CoA+3 NAD+ +FAD+GDP +Pi→2 CO2 +3 NADH +3H++FADH2+GTP 1mol甘油完全氧化成CO2和H2O时净生成ATP +16.5molATP 乙酰CoA进入三羧酸循环彻底氧化涉及能量产生的主要代谢过程: 、 1分子乙酰CoA通过三羧酸循环可直接生成1分子GTP、3分子NADH+H+、1分子。 1分子NADH+H+ 通过氧化磷酸化生成2.5分子ATP,1分子生成1.5分子ATP。 所以1分子乙酰CoA彻底氧化生成1+3×2.5+1×1.5=10分子ATP。 15、1mol乳酸完全氧化成CO2和H2O时净生成多少mol ATP?假设在线粒体外生成的NADH都通过磷酸甘油穿梭进入线粒体。(要求:有分析步骤,可用简图示出所经历的主要代谢过程) 乳酸脱氢酶 乳酸+NAD 丙酮酸+NADH,此反应在细胞溶胶(细胞浆)中进行。在肝脏细胞匀浆体系中,细胞溶胶中生成的NADH是通过磷酸甘油穿梭系统进入线粒体内氧化。 丙酮酸+NAD→乙酰CoA + NADH(线粒体,丙酮酸脱氢酶系) 乙酰CoA进入三羧酸循环 乙酰CoA+3 NAD+ +FAD+GDP +Pi→2 CO2 +3 NADH+3H+ +FADH2+GTP 1摩尔乳酸彻底氧化成CO2和H2O生成ATP的摩尔数为:10+1.5+2.5 =14 ATP 16、试比较硬脂肪酸、油酸、亚油酸以及亚麻酸完全氧化产生的ATP数。 解答:硬脂肪酸为18碳饱和脂肪酸,经8次β—氧化产生8分子NADH+H+、8分子和9分子的乙酰CoA,脂肪酸的激活消耗2个ATP,所以硬脂肪酸完全氧化产生的ATP数: 含有一个或多个不饱和双键的脂肪酸完全氧化除了需要β—氧化的酶以外,还需要△3—顺—△2—反烯脂酰—CoA异构酶、2,4—二烯酰脂—CoA还原酶和2,3—二烯酰脂—CoA异构酶参与。从能量角度看,多1个双键,会少1次酰基CoA脱氢酶催化的脱氢反应,少生成1个,因此亚油酸完全氧化产生的ATP总数应是120—3=117(个),同理,油酸应产生120—1.5=118.5个ATP,亚麻酸应该产生120—4.5=115.5个ATP。 17、试比较1分子软脂肪酸和8分子丙酮酸彻底氧化所生成ATP的数量,并简要写出与能量相关的反应过程。 解答:软脂肪酸氧化时与能量相关的反应过程: 能量过程:, ATP AMP 与产能相关的过程: 1分子软脂酸含16个碳原子,每一次β—氧化生成1分子、1分子NADH+H+,脱下1分子乙酰CoA,最后一次丁酰CoA彻底氧化生产2分子乙酰CoA,故软脂酸彻底氧化共进行7次β—氧化,产生7分子,7分子NADH+H+和8分子乙酰CoA, 1分子NADH通过呼吸链生成2.5分子ATP,1分子通过呼吸链生成1.5分子ATP,故生成总数为: 7×1.5+7×2.5+8×10-2=106分子ATP。 丙酮酸氧化时与能量相关的反应过程: 、 故1分子丙酮酸通过三羧酸循环可直接生成1分子GTP、4分子NADH+H+、1分子。 1分子NADH+H+ 通过氧化磷酸化生成2.5分子ATP,1分子生成1.5分子ATP。 所以1分子丙酮酸彻底氧化生成1+4×2.5+1×1.5=12.5分子ATP。 仅供学习与交流,如有侵权请联系网站删除 谢谢8
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