实用生物信息技术选课考试-答案.doc

实用生物信息技术选课考试1填空1) 瑞典植物学家林奈于_18_世纪首先提出_双名命名法_2) 英国博物学家达尔文于1859年发表物种起源提出了_生物进化论_3) 奥地利学者孟德尔根据_豌豆杂交_实验结果，揭示了_孟德尔遗传定律：分离定律和自由组合定律_4) 美国遗传学家摩尔根以_果蝇_为实验材料，创立了_染色体遗传理论_5) DNA分子双螺旋模型由_沃森_和_克里克_于_1953年提出，论文共_页，发表在_Nature_杂志上。6) 现代智人的英文名为_homo_，拉丁文学名为_Homo sapiens sapiens_，其生物分类学地位为_动物_界_脊索动物_门_哺乳_纲_灵长_目_人_科_人_属_智人_种。7) 拟南芥是二_年生_草_本植物，植株高约_7-40_厘米，其拉丁文学名为_Arabidopsis thaliana_，其生物分类学地位为_植物_界_被子植物_门_双子叶植物_纲_白花菜_目_十字花_科_拟南芥_属_拟南芥_种。8) 人类基因组有_23_对染色体，约含_3*109个碱基对，其中蛋白质编码序列约占_1.5_%，约编码20000-25000个蛋白质；人类基因组计划确定的模式生物包括_酵母、线虫、果蝇、小鼠_。9) 用英文单字符/三字符表示：苏氨酸_T_/_Thr_精氨酸_R_/_Arg_谷氨酰胺_Q_/_Gln_组氨酸_H_/_His_，带负电氨基酸_E_/_Glu_、_D_/_Asp_，带芳香环氨基酸_F_/_Phe_、_W_/_Trp_、_Y_/_Tyr_。10) 蛋白质一级结构指_蛋白质中氨基酸的排列顺序_，二级结构基本单元包括_-螺旋螺旋_，结构域是介于_二_级结构和_三 级结构之间的结构单位；人血红蛋白由_4个亚基组成，人肌肉蛋白由_8_个亚基组成。11) 蛋白质一级结构相邻氨基酸残基之间通过_肽键_连接，而非相邻氨基酸残基之间可通过_氢键_连接；决定蛋白质主链走向的二面角为_和_；二面角取值范围与_肽平面_有关。12) 维系蛋白质分子空间构象的作用力包括_氢键、离子键、范德华力、疏水力_。13) 组成DNA分子的基本单元为_脱氧核苷_，由脱氧核糖核苷和_磷酸_组成。脱氧核糖核苷包括_脱氧核糖_和碱基两部分。碱基分两类，一类为嘌呤，包括_鸟嘌呤_和_腺嘌呤_；另一类为嘧啶，包括_胞嘧啶_和_胸腺嘧啶_。14) 两个单链DNA分子通过_氢键_形成双螺旋，若正链为5-GCCTAGGC-3，则负链为_5-GCCTAGGC-3_；该序列片段具有_发夹_结构。DNA双螺旋中_磷酸_分子是螺旋的骨架，相邻核苷酸通过_磷酸二氢键_基团连接。15) 遗传密码一共有61个，包括3个终止密码子_UAA、_UAG、_UGA_；起始密码子为_AUG_，也可用于编码_甲硫 氨酸；亮氨酸有_6套密码子，丙氨酸有_4套密码子，半胱氨酸有_2套密码子，色氨酸有_1套密码子。16) 常见RNA分子包括_tRNA_、_mRNA_、_rRNA_，其中_mRNA_用来编码蛋白质，_tRNA_在蛋白质合成过程中转运_氨基酸_，_rRNA_与_蛋白质_形成大分子复合物，是蛋白质合成的场所。17) 微小RNA（microRNA）长度约_20_个碱基，其前体双链RNA通常具有_发卡_结构，经_核酸内切酶_剪切分割成为单链，并和RNA诱导产生的_特异性蛋白_结合而最终作用于靶标，抑止基因_表达_。18) 基因表达的调控包括_转录水平_调控、_翻译水平_调控、_翻译后_修饰等；转录因子是一类_蛋白质_分子，通过与基因上游_启动子_区域特异结合，_开启_或_关闭_基因转录。19) 常见蛋白酶有_胰蛋白酶、胃蛋白酶_，常见蛋白激素有_胰岛素_，常见防卫蛋白有_免疫球蛋白_，常见储藏蛋白有_铁蛋白_，常见膜蛋白有_胶原蛋白_20) 蛋白质分子中用作辅助因子的常见金属元素包括_Fe、Zn、Cu_21) 国际著名生物信息中心包括_NCBI、EMBL、DDBJ_，其中你经常访问的有_22) 主要生物信息数据库包括_GenBank、Swiss-Prot、BLAST、PRINTS、PDB、VAST_，其中你已经使用过的有_23) 常用生物信息软件包括_Rasmol、Cn3D、BLAST_其中你已经使用过的有_24) 数据库相似性搜索可用来_从数据库中存在的数十万个序列中挑选出可能同目的的序列有关联的序列_25) 通过构建系统发育树可推断_各生物之间的亲缘关系_2. 简述下述生物信息术语含义：Homology：同源性Alignment：校准、比对Phylogeny：系统发育GenBank：GenBank基因数据库，汇集并注释了所有公开的核酸序列，由美国生物技术信息中心（NCBI）建立维护，供公众自由读取。Swiss-Prot：是经过注释的蛋白质序列数据库,由欧洲生物信息学研究所(EBI)维护。数据库由蛋白质序列条目构成,每个条目包含蛋白质序列、引用文献信息、分类学信息、注释等。UniGene：从属于GeneBank一部分，通过计算机程序对GeneBank中的序列数据进行适当处理,剔除冗余部分,将同一基因的序列,包括EST序列片段搜集到一起,以便研究基因的转录图谱。BLAST: 一种快速的局域序列对位排列算法；也指指实现这个算法的软件，这个软件是由NCBI编写。NCBI:美国国立生物信息中心KEGG:京都基因与基因组百科全书ENSEMBL: 是一项生物信息学研究计划，旨在开发一种能够对真核生物基因组进行自动诠释（automatic annotation）并加以维护的软件。该计划由英国Sanger研究所Wellcome基金会及欧洲分子生物学实验室所属分部欧洲生物信息学研究所共同协作运营。3. 简述（或用图示）分子生物学中心法则遗传信息的流动方向叫做信息流。信息流的方向可以用科学家克里克提出的“中心法则”来表示。从“中心法则”可以看出，遗传信息的一般流动方向是：遗传信息可以从DNA流向DNA，即完成DNA的自我复制过程，也可以从DNA流向RNA，进而流向蛋白质，即完成遗传信息的转录和翻译过程。在某些病毒中，RNA也可以自我复制，并且还发现在一些病毒蛋白质的合成过程中，RNA可以在逆转录酶的作用下合成DNA。4. 举例说明蛋白质序列、结构功能关系。蛋白质的结构功能由蛋白质的序列决定，不同种生物其亲缘关系越近同种功能的蛋白质其一级结构越相似。基因突变导致蛋白质的一级结构改变,表现出生理功能的异常,使机体出现病态现象.如镰刀状红细胞贫血.5. 简述（或用图示）真核生物基因结构。在遗传学上通常将能编码蛋白质的基因称为结构基因。真核生物的结构基因是断裂的基因。一个断裂基因能够含有若干段编码序列，这些可以编码的序列称为外显子。在两个外显子之间被一段不编码的间隔序列隔开，这些间隔序列称为内含子。每个断裂基因在第一个和最后一个外显子的外侧各有一段非编码区，有人称其为侧翼序列。在侧翼序列上有一系列调控序列。