CTAB法提取DNA原理及步骤、制胶、电泳.doc

CTAB法提取DNA的原理及步骤：
冷冻的植物组织，在低温干燥状态下机械磨碎。通常精提DNA，都要加液氮使材料变脆，易于研磨。低温降低了DNase的活性，利用CTAB（十六烷基三甲基溴化铵）去污剂溶解细胞膜，使核蛋白等解聚，使DNA游离出来。
CTAB作为一种阳离子去污剂，可溶解细胞膜，与核酸形成复合物，可使核酸沉淀出来。通过离心将CTAB-核酸复合物语糖类、蛋白质等分离开来。随后将复合物溶于高盐溶液中，再加乙醇使核酸沉淀，而CTAB溶于乙醇，从而去除CTAB 。

1. 研磨
2. 加1000ul预处理液，10-15min，4000r，10min,弃上清（重复）
预处理液：Tris-hcl (PH8.0) 提供缓冲环境，防止核酸被破坏。
EDTA （螯合二价阳离子）0.5M 抑制DNase活性。
Nacl 5M 提供高盐环境，使DNA充分溶解。
β-巯基乙醇 抗氧化剂，去除酚，糖，能与酚形成 络合物，也可与糖结合。
3. 加800ul2×CTBA(预热），10ul β-巯基乙醇 ，65℃ 水浴1-2h。 15min 震荡
4. 冷至室温，离心1000r ,10min ,取上清750ul，加800ul氯仿-异戊醇（24:1），抽提10min，1000r，15min,重复3次。
氯仿：加速有机相与水相分层，去除核酸溶液中残余酚，抽提蛋白质等杂质。
5. 取上清，加2倍体积的无水乙醇，-20℃,1h,沉淀DNA.
无水乙醇：DNA不溶于酒精，CTAB和一些蛋白质可以，低温乙醇可抑制DNase活性，降低分子运动，易于DNA沉淀。
6. 4℃，1000r,10min,倒乙醇，收集DNA.
7. 70％乙醇洗涤2遍，风干（不可太干），溶于40-60ul dd水。

DNA在凝胶中涌动时有电荷效应和分子筛效应，DNA分子在高于等电点的PH溶液中带负电荷，在电场中向正极移动。由于相同数量的双链DNA几乎具有等量的静电荷，因此能以同样的速率向正极移动。在一定电场强度下，DNA分子的歉意速率取决于分子筛效应，即DNA本身的大小。

制胶步骤：1.5％琼脂糖

1.配胶：
0.6g琼脂糖 a
40ml 1×TBE b
4ulEB 剧毒
a、b混合在微波炉中加热，熔化，冷却至60℃以下，后加EB（慢）
加热沸出气泡，将其剥离，加EB（剧毒，小心使用，致癌）后慢摇匀。

2.倒在制胶槽中，插上梳子，待胶凝固后，拔下梳子。

3.将1×TBE(按配方配得5×TBE，再加蒸馏水稀释至1×TBE，即取一份5×TBE，加4份水）倒入电泳槽中，没过凝胶。

4. 将制好的胶放入电泳槽中，点样（2ul溴酚蓝＋10ulDNA),可以点在封口膜上，混匀，上样。
5. 插电极，红黑线自搭。开电源（100v,80mA),溴酚蓝跑到整胶的三分之二时，关闭电泳仪电源，紫外灯下观察。