2012—2017年优势产...果树农家品种资源调查数据集_代国威.pdf

农业大数据学报 2023,5(1):24-28 Journal of Agricultural Big Data DOI:10.19788/j.issn.2096-6369.230109 收稿日期：2023-01-16 基金项目：国家农业科学数据中心(NASDC2022XM00)，农业科学数据融合与自动化挖掘框架(2022YFF0711801)，中国农业科学院院级基本科研业务费(Y2022LM20)作者简介：第一作者代国威，男，硕士生，研究方向：人工智能及农业信息化研究；E-mail:。通信作者樊景超，男，博士，副 研究员，研究方向：农业科学数据管理、农业信息技术研究；E-mail:；通信作者曹尚银，男，博士，研究员，研究方向：果树遗传育种；E-mail:。20122017 年优势产区落叶果树农家品种资源调查数据集 代国威1,2，刘婷婷1,2，李好先3，胡林1,2，樊景超1,2*，曹尚银3*1.中国农业科学院农业信息研究所，北京 100081；2.国家农业科学数据中心，北京 100081；3.中国农业科学院郑州果树研究所，郑州 450009 摘要：果树资源是一种具有较高经济效益和生态效益的种质资源。我国的落叶果树品种资源是国家农业战略性资源，收集和保存落叶果树品种种质资源是开展优良品种选育的基础，可以为果树资源育种工作者选育优良果树品种提供更多优异的原始材料。文章数据集收集了 13 个落叶果树农家品种树种的序号、调查编号、品种名、品种拉丁名、样本类型、所属树种、提供人和调查人的姓名、电话及地址、调查地点、海拔、经纬度、生境信息、植株情况、植物学特性、果实性状、生物学习性与品种评价等数据。果树基本性状按照果树种质资源描述规范和数据标准制表，所有资源的调查结果和数据均由相关树种专家多次实地调查访问农家品种资源所在地获取，果树农家品种资源鉴定信息参考中国植物物种数据库，获取的数据按照指定汇交格式形成规范的数据集，并命名为20122017 年优势产区落叶果树农家品种资源调查数据集。本数据集包含国内濒临灭绝及具有特异农艺性状的落叶果树农家品种资源，可为我国果树资源保存和育种研究提供数据支撑。关键词：落叶果树；种质资源；资源调查；植物学信息 引用格式：代国威,刘婷婷,李好先,等.20122017 年优势产区落叶果树农家品种资源调查数据集J.农业大数据学报,2023,5(1):24-28.DAI Guowei,LIU Tingting,LI Haoxian,et al.20122017 Data set for the survey of deciduous fruit tree farm variety resources in dominant production areasJ.Journal of Agricultural Big Data,2023,5(1):24-28.20122017 Data Set for the Survey of Deciduous Fruit Tree Farm Variety Resources in Dominant Production Areas DAI Guowei1,2,LIU Tingting1,2,LI Haoxian3,HU Lin1,2,FAN Jingchao1,2*,CAO Shangyin3*1.Agricultural Information Institute of Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100081,China;2.National Agriculture Science Data Center,Beijing 100081,China;3.Zhengzhou Fruit Research,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Zhengzhou 450009,China Abstract:Fruit tree resources are a germplasm resource with high economic and ecological benefits.Chinas deciduous fruit tree variety resources are strategic national agricultural resources,and collecting and preserving deciduous fruit tree variety germplasm resources is the basis for carrying out excellent variety selection and breeding,which can provide more excellent primary materials 第 1 期 代国威等：20122017 年优势产区落叶果树农家品种资源调查数据集 25 for fruit tree resource breeders to select and breed excellent fruit tree varieties.The dataset collects data on the serial number,survey number,variety name,variety Latin name,sample type,tree species to which they belong,name,telephone number and address of the provider and surveyor,survey location,altitude,latitude and longitude,habitat information,plant condition,botanical characteristics,fruit traits,biological habits and variety evaluation of 13 deciduous fruit tree farm varieties.The specifications and data standards tabulated the basic traits of fruit trees for the Description of Fruit Tree Germplasm Resources.The survey results and data of all resources were obtained by experts of the relevant tree species who visited the location of the farm variety resources for several field surveys.The information on identifying fruit tree farm variety resources was referred to the Chinese Plant Species Database.The data obtained were formed into a standardized data set by the specified remittance format and named 20122017.The data were collected according to the specified ren-dezvous format to form a standardized dataset named 20122017 National Deciduous Fruit Tree Farm Variety Resource Survey Dataset.This dataset contains the resources of deciduous fruit tree farming varieties that are in danger of extinction and have specific agronomic traits in China,which can provide data support for conserving fruit tree resources and breeding research in China.Key words:deciduous fruit trees;germplasm resources;resource survey;botanical information 数据库(集)基本信息汇总表 数据库(集)名称 数据库(集)名称 20122017 年优势产区落叶果树农家品种资源调查数据集 年优势产区落叶果树农家品种资源调查数据集 数据作者及分工 数据作者及分工 代国威：论文撰写与修订；刘婷婷：数据整理与分类汇总；李好先：特色落叶果树的资源调查和收集、数据整理与分类汇总；胡林，总体 方案设计与组织实施；樊景超：总体方案设计与组织实施；曹尚银：总体方案设计与组织实施 数据通信作者 数据通信作者 樊景超，E-mail：；曹尚银，E-mail：13937192127 数据采集时间 数据采集时间 20122017 年 地理区域 地理区域 全国优势产区 数据量 数据量 15 MB 数据格式 数据格式*.xlsx 数据服务系统网址 数据服务系统网址 https:/dx.doi.org/10.12205/A0002.20230228.00.ds.3476 CSTR:17058.11.A0002.20230228.00.ds.3476 基金项目基金项目 国家农业科学数据中心(NASDC2022XM00)，农业科学数据融合与自动化挖掘框架(2022YFF0711801)，中国农业科学院院级基本科研 业务费(Y2022LM20)数据库(集)组成 数据库(集)组成 本数据集包含石榴、核桃、猕猴桃、李、杏、枣、山楂、葡萄、桃、樱桃、苹果、柿、梨与板栗 13 个树种农家品种资源的名称、品种拉丁名、样本类型、所属树种、提供人和调查人的姓名、电话及地址、调查地点、海拔、经纬度、生境信息、植株情况、植物学特性、果实性状、生物学 习性以及品种评价等调查信息，每个树种形成对应的 13 个 Excel 文件，共计 1683 条记录 1 引言 农业种质资源是国家战略性资源1，也是开展优良品种选育的物质基础。中国是世界上重要的果树起源中心之一，世界各国广泛种植的梨、桃、核桃和猕猴桃等落叶果树树种多起源于我国。由于我国国土面积较大，各地区环境条件复杂多样2-4，不同树种对于环境的要求也不甚相同，树种在优势产区具有较高的适应性，因此我国资源呈现出多样化特点。种质资源收集是所有植物育种和遗传改良项目的首要原料来源。得益于世界各地的果树种质资源，目前全球水果市场上已有大量新育成品种。保存果树克隆活体种质的果园、苗圃等地作为独特的种质资源库，蕴藏着多种有价值的资源，包括优良品系、商业化栽培品种、传统栽培品种、农家品种以及其他育种材料或野生近缘种5-6。果树活体种质被果树育种专家和其他生物学家广泛应用，生物学家可能感兴趣的是研究植物的特征、行为、驯化历史和进化系统发育，而果树育种专家关注的是直接表观价值的商业特征7。本研究通过对 13 个落叶果树农家品种情况调查，收集和保存了大量落叶果树农家品种资源，采集了相关数据，丰富了我国种质资源库，可为选育优良果树品种提供更多原始材料。2 数据采集与处理方法 通过查阅文献和果树志等途径，大体掌握我国主 26 农 业 大 数 据 学 报 第5卷 要落叶果树优势产区的地域分布，确定科学调查的主要区域和基本范围。在实地走访过程中，通过当地林业站、农业局等单位的协助，以及直接询问当地人等方式，有效地确定调查的主要区域和主要树种。2.1 树种数据调查记录 本研究选择了石榴、核桃、猕猴桃、李、杏、山楂、葡萄、桃、樱桃、苹果、柿、梨和板栗等 13 个树种，其中石榴具有 218 个品种，核桃 206 个品种，猕猴桃 133 个品种，李 110 个品种，杏 151 个品种，山楂 66 个品种，葡萄 60 个品种，桃 86 个品种，樱桃64 个品种，苹果 84 个品种，柿 110 个品种，梨 149个品种与板栗 132 个品种。在 20122017 年间分阶段多次地按照坚果、核果、仁果和浆果 4 类制定“我国优势产区落叶果树农家品种资源调查与收集表”，调查表的制定参考农作物种质资源技术规范丛书系列中“果树种质资源描述规范和数据标准”8-20相关专著标准。现场调查前，通过摸底调查填写当地果树农家品种现有情况摸底调查表和地区果树农家品种所有者登记表，到达现场后根据果树种类分类填写。首先对调查对象进行编号，编号采用唯一性流水线号，即子专题(片区)负责人姓全拼+名拼音首字母+调查者姓名拼音首字母+流水号数字。然后依次填写表格内容，其中树高、冠幅、干高等通过卷尺测量，叶长、叶宽、花冠直径等通过游标卡尺测定。2.2 果实样品调查和特性分析 采集自然成熟果实 2.53.0 kg，通过游标卡尺测定果实横径、纵径等，果实重量通过天平测定，果实可溶性固形物含量、可溶性糖含量、可滴定酸含量和维生素C含量等数据由农业农村部果品及苗木质量监督检验测试中心(郑州)测定。2.3 数据处理及入库 在树种领域专家的带领下多次访问农家品种资源所在地进行数据采集，果树农家品种资源鉴定信息参考中国植物物种数据库，完成填写我国优势产区落叶果树农家品种资源调查与收集表中的全部数据后，请相关领域专家对数据进行审核，然后将审核通过的数据按照数据汇交格式填写到 20122017年优势产区落叶果树农家品种资源调查数据 Excel表中。本数据库为我国优势产区落叶果树农家品种资源的相关数据信息，优势产区包括河南、湖北、湖南、西藏、北京、天津、河北、内蒙古、辽宁、吉林、黑龙江、江苏、广东、广西、重庆、贵州、云南、四川、山东、上海、浙江、安徽、福建、江西、山西、陕西、甘肃、青海、宁夏和新疆等落叶果树重点分布地区，收集数据并设置了 20122017 年间石榴、核桃、猕猴桃、李、杏、枣、山楂、葡萄、桃、樱桃、苹果、柿、梨和板栗 13 个树种的序号、调查编号、品种名、品种拉丁名、样本类型、所属树种、提供人和调查人的姓名、电话及地址、调查地点、海拔、经纬度、生境信息、植株情况、植物学特性、果实性状、生物学习性与品种评价等数据，数据以树种为单元。数据包含 13 个数据表，1569 条记录，主要通过对收集、调查的落叶果树资料规范化测定、整理而成。3 数据样本描述 数据集包含果树序号、调查编号(子专题片区负责人姓全拼+名拼音首字母+调查者姓名拼音首字母+所在地调查流水号)、品种名、品种拉丁名、样本类型、所属树种、提供人和调查人的姓名、电话及地址、调查地点、海拔、经纬度、生境信息、植株情况、植物学特性、果实性状、生物学习性与品种评价，数据样本见表 1。4 数据质量控制与验证 数据调查过程中涉及个人隐私信息的部分尊重个人意愿，在数据共享发布前根据提供者要求进行相应脱敏处理。数据调查根据不同树种特性及当时生长状态采取合适的调查方式。调查表中的数据涉及到树龄、调查地点等需要向至少 3 人核实后并经相关树种专家鉴定后确定。枝条、芽、叶和花等植物学特征测定采用(上下左右中)5 点取样，即采即测，每个样品重复 3次，测定的数据取平均值。花、果实、果肉和种子等颜色性状采用 5 点取样，用比色卡辅助比对后确定，即采即测。果实采集后，5 日内送到检测中心进行可溶性固形物含量、可溶性糖含量、可滴定酸含量和维生素 C 含量等品质指标测定。填写后的数据要经过评估，经纬度、海拔和采集地点通过仪器测定，经实地调查询问后适当修正。现场采样测定的数据，要与参考书籍和专家咨询鉴定相符合，特别是符合“果树种质资源描述规范和数据标准”8-20相关标准，不应超出各地区区域规定阈值。第 1 期 代国威等：20122017 年优势产区落叶果树农家品种资源调查数据集 27 果品尺寸实际数据通过卷尺、游标卡尺、电子天平和折射仪等工具测定，果品成分的分析由第三方检测机构测定。所有资源的调查和采集均由相关树种领域专家的带领，是多次访问农家品种资源所在地获取的，果树农家品种资源鉴定信息参考中国植物物种数据库21。同时组建不同树种领域的联合专家组进行农家品种资源优势产区所在地考察，以保证调查资源的可靠性和唯一性。5 数据价值与使用建议 在国家科技部科技基础性工作专项重点项目“我国优势产区落叶果树农家品种资源调查与收集”支持下，中国农业科学院郑州果树研究所联合全国多家科研单位、大专院校的百余名科技人员，利用现代化的调查手段系统收集、整理和保护了我国主要落叶果树农家品种资源并建立了档案，形成数据库。这项工作摸清了我国果树农家品种的家底，为全国性的果树农家品种鉴定评价、优良基因挖掘和种质创新利用奠定了坚实的基础。我国优势产区落叶果树农家品种资源的原生境调查、植物学、生态适应性和重要农艺性状调查与初步评价是第一手真实详细的资料，这些资料包含原生境生存现状，调查相关植物学性状、生态适应性、栽培性能和果实品质等主要农艺性状(文字、特征数据)，以及对优良农家品种资源进行初步评价、收集，对推动我国果树遗传学研究和新品种选育等科技创新工作有非常重要的价值。数据作者分工职责 代国威代国威(1997)，男，四川省德阳人，硕士，研究生，主要从事人工智能及农业信息化工作研究。本研究主要工作：论文撰写与修订。刘婷婷刘婷婷(1985)，女，北京人，硕士，助理研究员，主要从事农业科学数据获取与研究。本研究主要承担工作：数据整理与分类汇总。李好先李好先(1986)，男，河南省周口市人，硕士，助理研究员，研究方向为果树遗传育种。本研究主要工作：特色落叶果树的资源调查和收集、数据整理与分类汇总。胡林胡林(1967)，男，内蒙古商都县人，博士，研究员，研究方向为科学数据管理。主要承担工作：总体方案设计与组织实施。樊景超樊景超(1980)，男，辽宁沈阳人，博士，副研究员，硕士生导师，主要从事农业科学数据管理、农业信息技术研究。本研究主要工作：总体方案设计与组织实施。曹尚银曹尚银(1961)，男，河南省信阳市人，博士，研究生，研究员，研究方向为果树发育生物学和分子遗传育种学。本研究主要工作：总体方案设计与组织实施。参考文献 1 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and data standard of cherry germplasm resources M.Beijing:China Agriculture Press,2006.13 胡忠荣,陈伟,李坤明.猕猴桃种质资源描述规范和数据标准M.北京:中国农业出版社,1999.Hu Z R,Chen W,Li K M.Descriptive specification and data standard for kiwi germplasm resources M.Beijing:China Agriculture Press,1999.14 刘庆忠.核桃种质资源描述规范和数据标准M.北京:中国农业出版社,1999.Liu Q Z.Descriptive specification and data standard of walnut germplasm resources M.Beijing:China Agriculture Press,1999.15 郁香荷,刘威生.李种质资源描述规范和数据标准M.北京:中国农业出版社,2010.Yu X H,Liu W S.Descriptive specification and data standard of plum germplasm resources M.Beijing:China Agriculture Press,2010.16 刘宁.杏种质资源描述规范和数据标准M.北京:中国农业出版社,1999.Liu N.Description specification and data standard of apricot germplasm resources M.Beijing:China Agriculture Press,1999.17 李登科.枣种质资源描述规范和数据标准M.北京:中国农业出版社,1999.Li D K.Description specification and data standard of jujube germplasm resources M.Beijing:China Agriculture Press,1999.18 吕德国,李作轩.山楂种质资源描述规范和数据标准M.北京:中国农业出版社,2000.Lu D G,Li Z X.Descriptive specification 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