建立与药品采购“两票制”相应的税款抵扣制度国务院医改办会同国家卫生计生委、国家税务总局等8部门联合印发了关于在公立医疗机构药品采购中推行“两票制”的实施意见（试行）的通知（国医改办发20164号，以下简称通知），各地在积极试点或推行。这项药改的重大意义不仅在于深化对药品领域的改革，加强药品监管，更有助于依法打击虚开增值税专用发票、利用发票偷逃税款等违法犯罪行为，有效遏制当前医药行业虚开发票行为的态势。税务机关是发票的主管部门，如何落实好“两票制”？“两票制”下的发票可追溯链条通知规定，“两票制”是指药品生产企业到流通企业开一次发票，流通企业到医疗机构开一次发票。很显然，通过增值税专用发票和普通发票（以下简称发票）的两次开票，既从环节上控制药品流通次数，又从发票的流向上加强税收的管理。但“两票制”的发票设计链条与当前的以票管税又有所不同，比如发票流向的多向可追溯链条。通常意义上所说的发票流向，指的是发票购销双方的流向，也即发票的开具方如何开具和受票方怎样接受发票。发票接受方对开具方的上游情况是不知情的，也无从知晓，但“两票制”提出了发票的可追溯链条。通知第四条第二款规定，医疗机构“不仅要向配送药品的流通企业索要、验证发票，还应当要求流通企业出具加盖印章的由生产企业提供的进货发票复印件，两张发票的药品流通企业名称、药品批号等
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