微生物的分子进化与分类学.ppt

,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,*,*,第六章 微生物的分子进化 与分类学,6.1 rRNA序列分析与生物三域理论,1.rRNA分类原则与方法,（1）原核微生物：23SrRNA(2904bp)16SrRNA(1542bp)5SrRNA(120bp),（2）真核微生物：25SSrRNA 18SrRNA 5.8SrRNA 5SrRNA,（3）rRNA特点：广泛性；遗传特性；保守性；易提取测序。,（4）分类方法：酶切和测序,2、生物三域理论,（1）原始五界系统,（2）三域系统：细菌域、古细菌域、真核生物域（Wose 建立在rRNA的研究之上）。,缺点:无非细胞形态生物,6.2 基因机构的进化,包括：启动子区域的进化、编码区的进化、非编码区的进化、内含子的进化等,6.3 分类学与命名法则,1.分类单位：界、门、纲、目、科、属、种（变种、亚种、型）,DNA同源性,70%可定为同一个种。,(G+C)%10-12%,16,SrRNA同源性,95%归为同一个属。,4.细菌数值分类方法,（1）特征的地位等同，数理统计求相似性。相似度80%属于同种。,5.分子分类法,（1）G+C百分含量,（2）核酸杂交,（3）16SrRNA,6.4 细菌的分类系统,1.伯杰氏分类系统（第九版）,2.原核生物分类系统,6.5真核分类系统概要,1.真菌的分类原则和依据,形态学位主、生理生化和生态学为辅的原则。,（1）丝状真菌的分类,根据：孢子产生的方式和孢子本身的特点。,A：形态形状,B:生理,C:生化,D:生态,（2）酵母的分类依据,2.真菌的分类系统,安斯沃思-真菌门：四个亚门,（1）鞭毛菌亚门（2）接合菌亚门（3）子囊菌亚门（4）担子菌亚门（5）半知菌亚门。,