单核苷酸多态性(SNP).ppt

单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单核苷酸多态性（,SNP,）,张之洞班 叶苗,讲义结构,定义,特点,应用,定义,SNP,（,single nucleotide polymorphism,）,：个体间基因组,DNA,序列同一位置单个核苷酸变异所引起的多态性。,SNP,所表现的多态性只涉及到单个碱基的变异，可由单个碱基转换、颠换、插入或缺失引起，但通常所说的,SNP,是指转换或颠换。,转换：嘌呤被嘌呤或嘧啶被嘧啶替换,CT G A,颠换：嘌呤被嘧啶或嘧啶被嘌呤替换,C A GT,SNP,有,2,、,3,、,4,等位性，但,3,、,4,等位性非常少见，通常所说都是二等位多态性。,同义,SNP,编码序列,SNP,（,cSNP,),SNP,非同义,SNP,非编码序列,SNP,SNP,特点,1,、数量多，分布广泛。,2,、适于快速、规模化筛查。,3,、,SNP,等位基因频率容易估计。,4,、易于基因分型。,SNP,的应用,1,、等位基因特异性杂交（,ASH,）,TaqMan,探针技术,、,DASH,、,分子信标技术,2,、内切酶酶切技术,RFLP,、随机扩增多态,DNA,（,RAPD,）、,引物入侵分析技术,3,、引物延伸法,测序法、等位基因特异性延伸法,4,、寡核苷酸连接分析（,OLA,）,TaqMan,探针法,PCR,扩增时，加入一个引物和一个,TaqMan,探针，探针两端分别有报告荧光基团和淬灭荧光基团，,PCR,扩增时，,Taq,酶,5,核酸酶将探针酶切降解，使报告荧光基团与淬灭荧光集团分开而发出荧光。因为,Taq,酶,5,核酸酶只能降解与目标序列相同的序列，所以可以根据荧光信号来区分等位基因类型。,SNP,位点分析,纯和（,G/G),杂交（,G/T),不需要洗脱或分离等,PCR,后处理过程,分子信标技术检测,SNP,原理,引物入侵分析技术检测,SNP,等温反应，不依赖,PCR,扩增、直接从基因组,DNA,进行,SNP,检测,结语,由于,SNP,检测在后基因组计划中的重要性，高通量检测,SNP,的新技术正在不断发展。从目前已有的报道来讲，检测方法主要集中在综合利用纳米材料技术、多重,PCR,技术、各种荧光探针设计和荧光标记技术。,检测技术方面，,PCR,无疑是最为理想最有发展潜力，但仍然存在问题，如检测成本高、重复性不够好。需要我们的努力来改进。,THANKS,！,